Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q4WDC1

Protein Details
Accession Q4WDC1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
262-281AGNQLKKRKKHDRTLSPSELHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
267-271KKRKK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031127  E3_UB_ligase_RBR  
IPR002867  IBR_dom  
IPR047548  Rcat_RBR_RNF14  
IPR006575  RWD-domain  
IPR044066  TRIAD_supradom  
IPR016135  UBQ-conjugating_enzyme/RWD  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR017907  Znf_RING_CS  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000151  C:ubiquitin ligase complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0031624  F:ubiquitin conjugating enzyme binding  
GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0032436  P:positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process  
GO:0000209  P:protein polyubiquitination  
GO:0006511  P:ubiquitin-dependent protein catabolic process  
KEGG afm:AFUA_6G04230  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01485  IBR  
PF05773  RWD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50908  RWD  
PS51873  TRIAD  
PS00518  ZF_RING_1  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd20354  Rcat_RBR_RNF14  
cd23134  RING-HC_ITT1-like  
Amino Acid Sequences MTGSDLSEDERSVELSSITAIYPEIKIDPTSPFKASLDIPVKPSTPLPVCFEQQLDAGFPEVLTPPTSLDASDVELGFATKDDGRDVHTLSYLPPLRLEIDLPEGYPSEKAPIFRLETNPPWLSHSIILRLTEDGNRLWEDCGRDLVVYTYIDHLQQLAETAFSVSDTADQEVRLPRDIKIALLDFNNKAEREKFEQETFECGVCLEPKKGSVCHRLLLCSHVFCVSCLQDFYNNCITEGDVDSVKCLSPDCGKKKNDIAEAGNQLKKRKKHDRTLSPSELLQIPLDQETVQRYVSLKRKKKLESDKSTVYCPRQWCQGAARSKKHPKPIDPMSDDVESSDEEEGFVFDPNGDEAQLPPMADRVAICEDCNYAFCSVCKKGWHGELVRCFPRREAELSAEEKATEEYLRLYTSPCPTCDAPCQKRMGCNHMICFKCRTHFCYLCSSWLSEDNPYRHFNDINSRCYNRLWDLEGGDGIDPEGPEALHRIPNDLVVFDEPSDDEGAPILEFREAEVAHRRRPPPPAPVPPQVNQAAGGHGHRNRGNDANVLDAAGRAAAAERQAQARAIAEVRARPRQHDGPVAVQPPRPGRIHRPGLQRFLDLVQNDREDEWDSDELDDDF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.1
3 0.11
4 0.11
5 0.1
6 0.09
7 0.09
8 0.1
9 0.1
10 0.11
11 0.12
12 0.13
13 0.14
14 0.16
15 0.22
16 0.27
17 0.31
18 0.31
19 0.32
20 0.31
21 0.33
22 0.32
23 0.35
24 0.34
25 0.33
26 0.35
27 0.36
28 0.36
29 0.34
30 0.34
31 0.32
32 0.31
33 0.32
34 0.35
35 0.36
36 0.37
37 0.38
38 0.38
39 0.31
40 0.28
41 0.25
42 0.21
43 0.16
44 0.16
45 0.13
46 0.12
47 0.12
48 0.11
49 0.12
50 0.11
51 0.11
52 0.11
53 0.13
54 0.14
55 0.12
56 0.13
57 0.12
58 0.14
59 0.16
60 0.14
61 0.12
62 0.12
63 0.12
64 0.11
65 0.1
66 0.1
67 0.09
68 0.09
69 0.11
70 0.12
71 0.16
72 0.18
73 0.2
74 0.19
75 0.19
76 0.19
77 0.18
78 0.26
79 0.25
80 0.23
81 0.22
82 0.22
83 0.22
84 0.23
85 0.23
86 0.16
87 0.19
88 0.18
89 0.18
90 0.18
91 0.17
92 0.16
93 0.16
94 0.15
95 0.14
96 0.15
97 0.16
98 0.18
99 0.23
100 0.26
101 0.29
102 0.33
103 0.35
104 0.37
105 0.43
106 0.42
107 0.38
108 0.38
109 0.35
110 0.33
111 0.29
112 0.28
113 0.25
114 0.25
115 0.25
116 0.22
117 0.22
118 0.22
119 0.2
120 0.2
121 0.16
122 0.17
123 0.17
124 0.17
125 0.17
126 0.18
127 0.19
128 0.18
129 0.19
130 0.17
131 0.16
132 0.16
133 0.16
134 0.15
135 0.12
136 0.12
137 0.12
138 0.12
139 0.12
140 0.12
141 0.11
142 0.09
143 0.08
144 0.09
145 0.07
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.05
153 0.07
154 0.08
155 0.09
156 0.1
157 0.1
158 0.13
159 0.18
160 0.19
161 0.21
162 0.21
163 0.2
164 0.25
165 0.25
166 0.23
167 0.21
168 0.21
169 0.19
170 0.2
171 0.23
172 0.18
173 0.21
174 0.24
175 0.2
176 0.21
177 0.22
178 0.24
179 0.28
180 0.32
181 0.33
182 0.32
183 0.35
184 0.34
185 0.37
186 0.33
187 0.27
188 0.21
189 0.17
190 0.16
191 0.16
192 0.17
193 0.14
194 0.13
195 0.16
196 0.18
197 0.22
198 0.27
199 0.32
200 0.32
201 0.35
202 0.35
203 0.34
204 0.33
205 0.33
206 0.29
207 0.21
208 0.19
209 0.18
210 0.17
211 0.15
212 0.18
213 0.15
214 0.13
215 0.13
216 0.14
217 0.16
218 0.16
219 0.21
220 0.25
221 0.24
222 0.24
223 0.23
224 0.22
225 0.19
226 0.2
227 0.16
228 0.1
229 0.1
230 0.1
231 0.1
232 0.1
233 0.08
234 0.07
235 0.08
236 0.14
237 0.23
238 0.29
239 0.37
240 0.39
241 0.43
242 0.48
243 0.52
244 0.49
245 0.44
246 0.39
247 0.36
248 0.41
249 0.41
250 0.39
251 0.36
252 0.37
253 0.39
254 0.42
255 0.46
256 0.51
257 0.55
258 0.63
259 0.71
260 0.77
261 0.8
262 0.84
263 0.79
264 0.69
265 0.6
266 0.52
267 0.42
268 0.32
269 0.23
270 0.13
271 0.1
272 0.09
273 0.09
274 0.07
275 0.07
276 0.08
277 0.09
278 0.09
279 0.09
280 0.1
281 0.16
282 0.25
283 0.34
284 0.39
285 0.43
286 0.51
287 0.54
288 0.63
289 0.67
290 0.7
291 0.68
292 0.67
293 0.69
294 0.63
295 0.62
296 0.57
297 0.48
298 0.42
299 0.36
300 0.31
301 0.31
302 0.3
303 0.29
304 0.29
305 0.33
306 0.38
307 0.43
308 0.46
309 0.49
310 0.58
311 0.61
312 0.66
313 0.64
314 0.6
315 0.61
316 0.64
317 0.63
318 0.56
319 0.53
320 0.47
321 0.42
322 0.37
323 0.29
324 0.22
325 0.13
326 0.12
327 0.1
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.05
335 0.04
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.07
343 0.08
344 0.07
345 0.07
346 0.07
347 0.07
348 0.07
349 0.07
350 0.08
351 0.11
352 0.11
353 0.11
354 0.11
355 0.12
356 0.12
357 0.13
358 0.11
359 0.09
360 0.09
361 0.09
362 0.14
363 0.16
364 0.18
365 0.19
366 0.2
367 0.23
368 0.26
369 0.32
370 0.3
371 0.34
372 0.38
373 0.42
374 0.46
375 0.45
376 0.43
377 0.38
378 0.37
379 0.34
380 0.3
381 0.28
382 0.26
383 0.28
384 0.3
385 0.3
386 0.27
387 0.24
388 0.21
389 0.18
390 0.15
391 0.1
392 0.07
393 0.07
394 0.08
395 0.09
396 0.09
397 0.1
398 0.13
399 0.2
400 0.22
401 0.21
402 0.24
403 0.25
404 0.27
405 0.35
406 0.42
407 0.4
408 0.43
409 0.49
410 0.46
411 0.51
412 0.52
413 0.51
414 0.48
415 0.47
416 0.46
417 0.49
418 0.48
419 0.44
420 0.45
421 0.4
422 0.38
423 0.38
424 0.39
425 0.4
426 0.43
427 0.43
428 0.48
429 0.47
430 0.45
431 0.43
432 0.38
433 0.3
434 0.3
435 0.29
436 0.26
437 0.31
438 0.29
439 0.32
440 0.34
441 0.34
442 0.32
443 0.31
444 0.29
445 0.33
446 0.36
447 0.39
448 0.43
449 0.43
450 0.42
451 0.42
452 0.43
453 0.36
454 0.33
455 0.3
456 0.26
457 0.25
458 0.24
459 0.24
460 0.2
461 0.17
462 0.13
463 0.1
464 0.09
465 0.07
466 0.06
467 0.06
468 0.05
469 0.06
470 0.09
471 0.1
472 0.13
473 0.14
474 0.16
475 0.16
476 0.2
477 0.2
478 0.18
479 0.17
480 0.15
481 0.16
482 0.13
483 0.13
484 0.1
485 0.11
486 0.13
487 0.11
488 0.09
489 0.09
490 0.09
491 0.08
492 0.08
493 0.07
494 0.06
495 0.06
496 0.07
497 0.11
498 0.1
499 0.13
500 0.24
501 0.27
502 0.33
503 0.41
504 0.44
505 0.45
506 0.54
507 0.56
508 0.56
509 0.62
510 0.66
511 0.65
512 0.71
513 0.72
514 0.66
515 0.67
516 0.59
517 0.49
518 0.41
519 0.34
520 0.27
521 0.23
522 0.23
523 0.24
524 0.25
525 0.3
526 0.31
527 0.33
528 0.35
529 0.39
530 0.39
531 0.36
532 0.34
533 0.31
534 0.29
535 0.26
536 0.22
537 0.17
538 0.14
539 0.1
540 0.09
541 0.05
542 0.05
543 0.06
544 0.08
545 0.11
546 0.13
547 0.15
548 0.16
549 0.17
550 0.18
551 0.17
552 0.19
553 0.17
554 0.19
555 0.2
556 0.25
557 0.3
558 0.38
559 0.39
560 0.4
561 0.47
562 0.5
563 0.52
564 0.54
565 0.52
566 0.5
567 0.55
568 0.57
569 0.52
570 0.48
571 0.48
572 0.45
573 0.47
574 0.44
575 0.43
576 0.48
577 0.55
578 0.62
579 0.63
580 0.69
581 0.71
582 0.76
583 0.72
584 0.65
585 0.57
586 0.5
587 0.48
588 0.39
589 0.36
590 0.33
591 0.32
592 0.31
593 0.29
594 0.28
595 0.26
596 0.26
597 0.27
598 0.23
599 0.22
600 0.21