Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0U1MB52

Protein Details
Accession A0A0U1MB52    Localization Confidence High Confidence Score 22.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
116-136EVDKARLSRKRKRAAADNLEDHydrophilic
147-170QKEEAKRKADSSKKRKAAKSDDDSBasic
425-448LLPRKLRVVRAKKVNKKRDSERRSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
123-128SRKRKR
151-164AKRKADSSKKRKAA
427-469PRKLRVVRAKKVNKKRDSERRSGGRAEGARDTLGGRSSKLLGR
500-519VRTKSRGASKGKRSSRRAAA
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.333, cyto 4, cyto_mito 3.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MGKKSKTQSEHRKGAKAETNGDTEVANQPSFLAGNAPFDPLLASLFEQSAGPVQAPSVKYTELTSAKPSTKHKGSNVPVEGDSDDESDEENQSGNGSDQEMQDVDQEDESDADSSEVDKARLSRKRKRAAADNLEDVYMQKITREEQKEEAKRKADSSKKRKAAKSDDDSNASQDNDSSDDDSAPPMHESLTGDREATELDKSSRTVFLGNVSNTAIKTGSARKTLLKHLSSFLGSLPKSDTPHKVESIRFRSTAYGTKLGVPRRAAFAQKEVKDSTTSSTNAYVVFSTKLAAQKAPGALNGTVVLDRHLRVDSVAHPSAIDNKRCVFVGNLDFVDLENTANEDGEPAKKKPSTPADIEEGLWRTFNSHTGTGGQKNAGGGNVESVRVVRDQATRVGKGFAYVQFFDPNCVEAALLLDGQKFPPLLPRKLRVVRAKKVNKKRDSERRSGGRAEGARDTLGGRSSKLLGRAGAAKLRESANSKSFIFEGQRAVEGTGQLKVRTKSRGASKGKRSSRRAAAYRAAGGRAALSFCIFFLTRYFAGYAMHRSPLARNRNRLVPPAVSQQHSEPETSSKRSGHESQEFYPSLNEVLETRDLLRRMGPGAYGSTMPNEIVDMIIDEAEYWPSVVTSLNTTPFVIGTDGDKECLRTPPLCFSFEEGRQEKIDENENPQKENTSQILLHRGLYPCRKITFDISAHDQGWGGDGAHRGTFNGSWTWFDAYIIPSNKENTAHGDKKDQESVSTETEEENIHEPAPLIPFLPNSTKLQSNRTATRGSTNYHIVWHYKDSIPQDSPEAERIEAEEGRGSATLDGKSVRSMQVGDQLVVWIRARFAGWRNNVDRMSVRIFWAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.73
3 0.67
4 0.63
5 0.58
6 0.55
7 0.47
8 0.45
9 0.36
10 0.3
11 0.31
12 0.27
13 0.22
14 0.18
15 0.17
16 0.18
17 0.18
18 0.16
19 0.13
20 0.11
21 0.16
22 0.17
23 0.18
24 0.17
25 0.17
26 0.17
27 0.14
28 0.14
29 0.1
30 0.11
31 0.1
32 0.11
33 0.11
34 0.1
35 0.11
36 0.13
37 0.12
38 0.12
39 0.1
40 0.11
41 0.16
42 0.17
43 0.19
44 0.18
45 0.18
46 0.19
47 0.2
48 0.27
49 0.25
50 0.27
51 0.3
52 0.34
53 0.37
54 0.42
55 0.47
56 0.49
57 0.53
58 0.58
59 0.59
60 0.63
61 0.66
62 0.7
63 0.68
64 0.62
65 0.55
66 0.5
67 0.43
68 0.35
69 0.3
70 0.2
71 0.16
72 0.13
73 0.13
74 0.12
75 0.13
76 0.11
77 0.1
78 0.09
79 0.1
80 0.1
81 0.1
82 0.09
83 0.1
84 0.12
85 0.12
86 0.15
87 0.14
88 0.14
89 0.16
90 0.17
91 0.16
92 0.14
93 0.14
94 0.12
95 0.12
96 0.12
97 0.1
98 0.09
99 0.08
100 0.08
101 0.08
102 0.12
103 0.13
104 0.12
105 0.14
106 0.17
107 0.26
108 0.34
109 0.42
110 0.48
111 0.58
112 0.68
113 0.73
114 0.77
115 0.78
116 0.81
117 0.82
118 0.78
119 0.73
120 0.64
121 0.57
122 0.49
123 0.39
124 0.3
125 0.21
126 0.15
127 0.11
128 0.11
129 0.14
130 0.23
131 0.28
132 0.3
133 0.36
134 0.46
135 0.54
136 0.6
137 0.65
138 0.6
139 0.57
140 0.59
141 0.61
142 0.6
143 0.62
144 0.66
145 0.69
146 0.74
147 0.8
148 0.81
149 0.81
150 0.82
151 0.81
152 0.79
153 0.77
154 0.74
155 0.7
156 0.65
157 0.58
158 0.49
159 0.39
160 0.31
161 0.22
162 0.18
163 0.16
164 0.16
165 0.15
166 0.13
167 0.13
168 0.13
169 0.14
170 0.14
171 0.12
172 0.12
173 0.1
174 0.1
175 0.11
176 0.13
177 0.15
178 0.18
179 0.17
180 0.17
181 0.16
182 0.16
183 0.15
184 0.14
185 0.12
186 0.11
187 0.12
188 0.14
189 0.15
190 0.16
191 0.17
192 0.16
193 0.16
194 0.15
195 0.18
196 0.22
197 0.22
198 0.21
199 0.21
200 0.21
201 0.2
202 0.2
203 0.16
204 0.1
205 0.13
206 0.18
207 0.22
208 0.24
209 0.26
210 0.3
211 0.33
212 0.41
213 0.46
214 0.42
215 0.39
216 0.38
217 0.39
218 0.35
219 0.31
220 0.25
221 0.23
222 0.2
223 0.19
224 0.21
225 0.21
226 0.23
227 0.27
228 0.31
229 0.3
230 0.35
231 0.37
232 0.38
233 0.4
234 0.47
235 0.5
236 0.48
237 0.42
238 0.39
239 0.38
240 0.37
241 0.39
242 0.34
243 0.31
244 0.28
245 0.33
246 0.36
247 0.38
248 0.4
249 0.35
250 0.32
251 0.33
252 0.35
253 0.33
254 0.3
255 0.34
256 0.38
257 0.37
258 0.4
259 0.36
260 0.35
261 0.33
262 0.32
263 0.27
264 0.22
265 0.21
266 0.19
267 0.19
268 0.18
269 0.17
270 0.17
271 0.14
272 0.11
273 0.11
274 0.09
275 0.09
276 0.11
277 0.14
278 0.14
279 0.14
280 0.14
281 0.16
282 0.18
283 0.18
284 0.17
285 0.16
286 0.15
287 0.15
288 0.15
289 0.12
290 0.1
291 0.09
292 0.1
293 0.09
294 0.09
295 0.1
296 0.1
297 0.09
298 0.09
299 0.11
300 0.12
301 0.18
302 0.18
303 0.17
304 0.16
305 0.17
306 0.26
307 0.29
308 0.29
309 0.24
310 0.24
311 0.25
312 0.25
313 0.26
314 0.17
315 0.17
316 0.18
317 0.18
318 0.17
319 0.16
320 0.16
321 0.16
322 0.15
323 0.11
324 0.08
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.06
332 0.1
333 0.14
334 0.14
335 0.19
336 0.2
337 0.21
338 0.29
339 0.35
340 0.36
341 0.36
342 0.38
343 0.38
344 0.37
345 0.37
346 0.32
347 0.26
348 0.21
349 0.18
350 0.15
351 0.12
352 0.11
353 0.15
354 0.15
355 0.13
356 0.14
357 0.16
358 0.19
359 0.2
360 0.2
361 0.17
362 0.15
363 0.14
364 0.14
365 0.12
366 0.09
367 0.07
368 0.08
369 0.09
370 0.08
371 0.08
372 0.07
373 0.08
374 0.08
375 0.08
376 0.09
377 0.1
378 0.12
379 0.18
380 0.21
381 0.21
382 0.21
383 0.22
384 0.19
385 0.18
386 0.19
387 0.15
388 0.15
389 0.15
390 0.15
391 0.17
392 0.18
393 0.18
394 0.16
395 0.15
396 0.12
397 0.11
398 0.1
399 0.06
400 0.06
401 0.05
402 0.05
403 0.05
404 0.05
405 0.05
406 0.06
407 0.06
408 0.06
409 0.05
410 0.13
411 0.18
412 0.23
413 0.27
414 0.31
415 0.38
416 0.43
417 0.5
418 0.52
419 0.55
420 0.57
421 0.63
422 0.7
423 0.72
424 0.78
425 0.81
426 0.78
427 0.77
428 0.8
429 0.8
430 0.78
431 0.76
432 0.73
433 0.69
434 0.65
435 0.6
436 0.51
437 0.45
438 0.39
439 0.34
440 0.27
441 0.22
442 0.18
443 0.17
444 0.16
445 0.11
446 0.13
447 0.1
448 0.09
449 0.1
450 0.12
451 0.13
452 0.14
453 0.15
454 0.12
455 0.13
456 0.16
457 0.16
458 0.17
459 0.16
460 0.15
461 0.15
462 0.16
463 0.17
464 0.18
465 0.2
466 0.2
467 0.23
468 0.22
469 0.21
470 0.21
471 0.21
472 0.19
473 0.17
474 0.16
475 0.14
476 0.15
477 0.14
478 0.14
479 0.13
480 0.12
481 0.11
482 0.12
483 0.12
484 0.12
485 0.16
486 0.17
487 0.2
488 0.23
489 0.24
490 0.26
491 0.34
492 0.43
493 0.47
494 0.55
495 0.61
496 0.68
497 0.75
498 0.79
499 0.76
500 0.74
501 0.74
502 0.73
503 0.68
504 0.63
505 0.6
506 0.52
507 0.51
508 0.44
509 0.36
510 0.27
511 0.23
512 0.17
513 0.13
514 0.11
515 0.07
516 0.06
517 0.06
518 0.05
519 0.07
520 0.07
521 0.07
522 0.07
523 0.12
524 0.11
525 0.12
526 0.13
527 0.11
528 0.12
529 0.13
530 0.17
531 0.15
532 0.16
533 0.15
534 0.16
535 0.2
536 0.28
537 0.37
538 0.38
539 0.43
540 0.45
541 0.53
542 0.55
543 0.54
544 0.49
545 0.41
546 0.39
547 0.42
548 0.41
549 0.34
550 0.33
551 0.31
552 0.32
553 0.3
554 0.27
555 0.19
556 0.23
557 0.26
558 0.28
559 0.3
560 0.27
561 0.27
562 0.33
563 0.37
564 0.38
565 0.41
566 0.42
567 0.4
568 0.46
569 0.44
570 0.39
571 0.34
572 0.27
573 0.2
574 0.15
575 0.14
576 0.07
577 0.09
578 0.1
579 0.1
580 0.11
581 0.15
582 0.15
583 0.15
584 0.16
585 0.15
586 0.16
587 0.16
588 0.14
589 0.11
590 0.12
591 0.13
592 0.13
593 0.12
594 0.11
595 0.11
596 0.11
597 0.1
598 0.08
599 0.07
600 0.06
601 0.06
602 0.05
603 0.05
604 0.05
605 0.04
606 0.04
607 0.05
608 0.05
609 0.05
610 0.05
611 0.04
612 0.04
613 0.05
614 0.06
615 0.06
616 0.09
617 0.12
618 0.14
619 0.15
620 0.15
621 0.15
622 0.14
623 0.14
624 0.11
625 0.09
626 0.09
627 0.13
628 0.13
629 0.14
630 0.14
631 0.15
632 0.16
633 0.2
634 0.21
635 0.19
636 0.21
637 0.29
638 0.32
639 0.32
640 0.31
641 0.33
642 0.36
643 0.38
644 0.44
645 0.36
646 0.36
647 0.35
648 0.35
649 0.32
650 0.28
651 0.32
652 0.26
653 0.32
654 0.38
655 0.39
656 0.4
657 0.38
658 0.38
659 0.32
660 0.35
661 0.29
662 0.24
663 0.24
664 0.24
665 0.31
666 0.29
667 0.3
668 0.29
669 0.29
670 0.32
671 0.37
672 0.39
673 0.37
674 0.38
675 0.39
676 0.37
677 0.39
678 0.41
679 0.37
680 0.36
681 0.38
682 0.4
683 0.38
684 0.36
685 0.31
686 0.23
687 0.21
688 0.18
689 0.12
690 0.11
691 0.12
692 0.13
693 0.14
694 0.14
695 0.13
696 0.14
697 0.14
698 0.14
699 0.15
700 0.15
701 0.16
702 0.18
703 0.2
704 0.18
705 0.18
706 0.18
707 0.18
708 0.24
709 0.25
710 0.26
711 0.25
712 0.27
713 0.29
714 0.28
715 0.27
716 0.27
717 0.34
718 0.37
719 0.37
720 0.43
721 0.45
722 0.49
723 0.54
724 0.47
725 0.39
726 0.38
727 0.4
728 0.35
729 0.32
730 0.28
731 0.21
732 0.22
733 0.21
734 0.19
735 0.17
736 0.15
737 0.13
738 0.13
739 0.14
740 0.14
741 0.16
742 0.14
743 0.12
744 0.13
745 0.14
746 0.17
747 0.21
748 0.22
749 0.24
750 0.27
751 0.34
752 0.35
753 0.41
754 0.46
755 0.49
756 0.51
757 0.51
758 0.51
759 0.45
760 0.51
761 0.47
762 0.42
763 0.4
764 0.39
765 0.36
766 0.36
767 0.37
768 0.32
769 0.32
770 0.34
771 0.33
772 0.3
773 0.35
774 0.36
775 0.4
776 0.4
777 0.38
778 0.37
779 0.35
780 0.36
781 0.36
782 0.33
783 0.26
784 0.24
785 0.24
786 0.25
787 0.22
788 0.21
789 0.19
790 0.16
791 0.17
792 0.17
793 0.16
794 0.14
795 0.16
796 0.16
797 0.15
798 0.17
799 0.16
800 0.19
801 0.21
802 0.21
803 0.19
804 0.2
805 0.21
806 0.28
807 0.29
808 0.26
809 0.24
810 0.24
811 0.23
812 0.24
813 0.23
814 0.16
815 0.14
816 0.15
817 0.15
818 0.19
819 0.24
820 0.31
821 0.37
822 0.45
823 0.49
824 0.55
825 0.55
826 0.54
827 0.5
828 0.46
829 0.45
830 0.38