Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q4WZJ0

Protein Details
Accession Q4WZJ0    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-51AEESKGRLAKRRKTHTRADDLSDHydrophilic
63-84DESKTRLKGKPKSKSQTTERSNHydrophilic
122-151TSSVTSKPTKLKKKPLDKVRPPKKNKTGVIHydrophilic
186-205VPSNSAPRRRSNKRKSYADGHydrophilic
290-315KVLQGIQKKNEEKKKKKGETGTGEGSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
38-39KR
129-147PTKLKKKPLDKVRPPKKNK
297-306KKNEEKKKKK
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039119  ABT1/Esf2  
IPR034353  ABT1/ESF2_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000480  P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000472  P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0034462  P:small-subunit processome assembly  
KEGG afm:AFUA_2G16760  -  
CDD cd12263  RRM_ABT1_like  
Amino Acid Sequences MTTRKRNEFLDVVSDDDEGSDRAYDSEAAEESKGRLAKRRKTHTRADDLSDEESDIGRSESEDESKTRLKGKPKSKSQTTERSNDDDDEDEADDGEKMQVDQYLDATATLSPSQSRSQSPSTSSVTSKPTKLKKKPLDKVRPPKKNKTGVIYLSSLPPYLKPFALKSMLETRGFGPITKVFLTPEVPSNSAPRRRSNKRKSYADGWVEFASKKTAKICAETLNATIVGGKKGGWYHDDVWNMKYLKGFKWADLMEQVQRERSEREAKRRIEDTRARKEDKVFLQGVEQGKVLQGIQKKNEEKKKKKGETGTGEGSADAAANASELKVRRLFKQNEVKMGRDKVKDISALEDDAKRVLSKIF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.25
3 0.21
4 0.19
5 0.12
6 0.11
7 0.09
8 0.08
9 0.09
10 0.1
11 0.11
12 0.1
13 0.13
14 0.13
15 0.13
16 0.14
17 0.15
18 0.15
19 0.19
20 0.21
21 0.21
22 0.29
23 0.37
24 0.46
25 0.55
26 0.65
27 0.71
28 0.75
29 0.84
30 0.85
31 0.85
32 0.8
33 0.76
34 0.69
35 0.61
36 0.57
37 0.47
38 0.37
39 0.27
40 0.23
41 0.17
42 0.13
43 0.11
44 0.08
45 0.08
46 0.1
47 0.11
48 0.14
49 0.16
50 0.17
51 0.22
52 0.26
53 0.28
54 0.32
55 0.35
56 0.42
57 0.49
58 0.58
59 0.64
60 0.7
61 0.78
62 0.8
63 0.83
64 0.83
65 0.84
66 0.8
67 0.77
68 0.7
69 0.66
70 0.59
71 0.52
72 0.45
73 0.36
74 0.3
75 0.24
76 0.21
77 0.15
78 0.13
79 0.12
80 0.1
81 0.08
82 0.08
83 0.06
84 0.05
85 0.06
86 0.08
87 0.08
88 0.09
89 0.09
90 0.09
91 0.09
92 0.09
93 0.09
94 0.07
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.1
100 0.13
101 0.14
102 0.17
103 0.2
104 0.24
105 0.26
106 0.29
107 0.31
108 0.32
109 0.32
110 0.31
111 0.3
112 0.32
113 0.33
114 0.34
115 0.37
116 0.43
117 0.51
118 0.58
119 0.65
120 0.69
121 0.77
122 0.82
123 0.85
124 0.87
125 0.87
126 0.9
127 0.9
128 0.91
129 0.88
130 0.89
131 0.87
132 0.85
133 0.78
134 0.73
135 0.69
136 0.62
137 0.57
138 0.49
139 0.4
140 0.32
141 0.29
142 0.23
143 0.16
144 0.14
145 0.13
146 0.13
147 0.13
148 0.12
149 0.13
150 0.16
151 0.19
152 0.18
153 0.19
154 0.24
155 0.27
156 0.26
157 0.26
158 0.23
159 0.24
160 0.24
161 0.21
162 0.16
163 0.14
164 0.16
165 0.16
166 0.15
167 0.11
168 0.12
169 0.14
170 0.12
171 0.15
172 0.15
173 0.15
174 0.16
175 0.2
176 0.25
177 0.3
178 0.32
179 0.36
180 0.43
181 0.52
182 0.63
183 0.69
184 0.74
185 0.77
186 0.81
187 0.78
188 0.74
189 0.73
190 0.67
191 0.57
192 0.5
193 0.41
194 0.35
195 0.3
196 0.25
197 0.21
198 0.16
199 0.16
200 0.15
201 0.2
202 0.2
203 0.23
204 0.24
205 0.24
206 0.26
207 0.25
208 0.24
209 0.2
210 0.18
211 0.15
212 0.15
213 0.11
214 0.09
215 0.08
216 0.08
217 0.09
218 0.1
219 0.11
220 0.11
221 0.14
222 0.17
223 0.22
224 0.26
225 0.26
226 0.26
227 0.3
228 0.29
229 0.26
230 0.27
231 0.24
232 0.21
233 0.29
234 0.29
235 0.24
236 0.29
237 0.28
238 0.27
239 0.27
240 0.28
241 0.22
242 0.25
243 0.25
244 0.23
245 0.24
246 0.24
247 0.23
248 0.26
249 0.33
250 0.36
251 0.46
252 0.52
253 0.54
254 0.59
255 0.62
256 0.6
257 0.6
258 0.63
259 0.62
260 0.64
261 0.68
262 0.66
263 0.64
264 0.65
265 0.63
266 0.58
267 0.56
268 0.46
269 0.38
270 0.36
271 0.38
272 0.36
273 0.29
274 0.24
275 0.17
276 0.16
277 0.17
278 0.15
279 0.14
280 0.18
281 0.23
282 0.28
283 0.37
284 0.44
285 0.53
286 0.63
287 0.7
288 0.73
289 0.78
290 0.85
291 0.85
292 0.86
293 0.86
294 0.86
295 0.83
296 0.81
297 0.75
298 0.66
299 0.57
300 0.48
301 0.39
302 0.28
303 0.19
304 0.12
305 0.07
306 0.04
307 0.04
308 0.05
309 0.05
310 0.09
311 0.1
312 0.14
313 0.21
314 0.23
315 0.3
316 0.41
317 0.46
318 0.52
319 0.62
320 0.63
321 0.67
322 0.69
323 0.67
324 0.65
325 0.68
326 0.66
327 0.58
328 0.55
329 0.5
330 0.5
331 0.49
332 0.42
333 0.4
334 0.34
335 0.33
336 0.34
337 0.32
338 0.28
339 0.25
340 0.25
341 0.2