Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q4WTD6

Protein Details
Accession Q4WTD6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
263-285ESQEAKRRRRRASHNLVERRRRDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
268-282KRRRRRASHNLVERR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011598  bHLH_dom  
IPR036638  HLH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0046983  F:protein dimerization activity  
GO:0000978  F:RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG afm:AFUA_1G09670  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00010  HLH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50888  BHLH  
CDD cd11387  bHLHzip_USF_MITF  
Amino Acid Sequences MMSQNGYSLNNQFGNSNEAVDPSELTMQNSGFMSYPFGSQQNMSSSFNFGNSGIDTDELLDLEINGQNGLPRDTSMNFMQDHSGAGISMSHPGHMSQMYSNTPEGAPMHSPFIHSFNYDHFRGLNQQQHNPSHLQGSHFEQSYVNSKARPSLQAIDRTSSDGRSPMTPKTPALGALTLGTPESGSFPTQPIRTGLQPRHQKTLSNQWDGTPGSAHSFGMESPISSPGHPSHHAAISEILKSGKHASLPAKVDTHIPGSAQDLESQEAKRRRRRASHNLVERRRRDNINERIQDLSHLVPQHRLEDDKVRKQLVNNSAMSGNGSSSNAATSLLAGGNGRRATAGNITMGLPIEEKEKGPNKGDILNGAVGWMRDLMWALHVKLQQESELAELITSLGGTWPFEQTEEEKRMRSEILDALEKNDPSTFTYSRGPGSGLRVPKHTNLAGEPISQNGALSPQSLSPSYNSGGSSNGGNSGQAQYWNSSGHAGMSFKEEDEYAMEMQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.25
3 0.25
4 0.2
5 0.18
6 0.2
7 0.19
8 0.18
9 0.14
10 0.2
11 0.18
12 0.19
13 0.21
14 0.19
15 0.21
16 0.2
17 0.2
18 0.14
19 0.14
20 0.16
21 0.15
22 0.16
23 0.16
24 0.17
25 0.18
26 0.18
27 0.22
28 0.24
29 0.27
30 0.28
31 0.27
32 0.29
33 0.28
34 0.28
35 0.26
36 0.2
37 0.18
38 0.16
39 0.16
40 0.13
41 0.13
42 0.12
43 0.12
44 0.12
45 0.1
46 0.09
47 0.08
48 0.07
49 0.08
50 0.1
51 0.09
52 0.08
53 0.08
54 0.1
55 0.12
56 0.13
57 0.12
58 0.11
59 0.14
60 0.15
61 0.2
62 0.2
63 0.22
64 0.21
65 0.22
66 0.22
67 0.19
68 0.19
69 0.16
70 0.14
71 0.1
72 0.09
73 0.09
74 0.08
75 0.13
76 0.12
77 0.12
78 0.12
79 0.12
80 0.14
81 0.14
82 0.15
83 0.12
84 0.16
85 0.18
86 0.2
87 0.2
88 0.19
89 0.18
90 0.18
91 0.17
92 0.16
93 0.17
94 0.16
95 0.19
96 0.18
97 0.2
98 0.2
99 0.23
100 0.21
101 0.2
102 0.19
103 0.22
104 0.27
105 0.25
106 0.24
107 0.21
108 0.22
109 0.27
110 0.32
111 0.34
112 0.33
113 0.39
114 0.45
115 0.47
116 0.49
117 0.45
118 0.4
119 0.37
120 0.34
121 0.3
122 0.25
123 0.29
124 0.3
125 0.28
126 0.27
127 0.22
128 0.23
129 0.27
130 0.28
131 0.23
132 0.21
133 0.21
134 0.24
135 0.26
136 0.27
137 0.25
138 0.28
139 0.32
140 0.39
141 0.4
142 0.39
143 0.37
144 0.38
145 0.35
146 0.29
147 0.24
148 0.18
149 0.18
150 0.19
151 0.21
152 0.21
153 0.25
154 0.26
155 0.25
156 0.25
157 0.24
158 0.21
159 0.21
160 0.18
161 0.13
162 0.12
163 0.12
164 0.1
165 0.09
166 0.08
167 0.05
168 0.05
169 0.06
170 0.06
171 0.07
172 0.08
173 0.1
174 0.14
175 0.14
176 0.15
177 0.16
178 0.17
179 0.21
180 0.28
181 0.31
182 0.36
183 0.45
184 0.47
185 0.52
186 0.5
187 0.49
188 0.45
189 0.52
190 0.51
191 0.47
192 0.44
193 0.37
194 0.41
195 0.38
196 0.34
197 0.24
198 0.16
199 0.13
200 0.13
201 0.12
202 0.08
203 0.09
204 0.08
205 0.1
206 0.09
207 0.07
208 0.07
209 0.1
210 0.11
211 0.1
212 0.13
213 0.12
214 0.16
215 0.17
216 0.18
217 0.18
218 0.2
219 0.2
220 0.18
221 0.19
222 0.17
223 0.16
224 0.15
225 0.12
226 0.1
227 0.11
228 0.12
229 0.1
230 0.09
231 0.12
232 0.14
233 0.19
234 0.22
235 0.23
236 0.21
237 0.21
238 0.22
239 0.2
240 0.19
241 0.14
242 0.12
243 0.1
244 0.11
245 0.12
246 0.11
247 0.11
248 0.1
249 0.11
250 0.13
251 0.13
252 0.18
253 0.24
254 0.31
255 0.37
256 0.44
257 0.5
258 0.58
259 0.67
260 0.71
261 0.75
262 0.78
263 0.81
264 0.82
265 0.84
266 0.83
267 0.78
268 0.73
269 0.67
270 0.6
271 0.56
272 0.56
273 0.58
274 0.59
275 0.57
276 0.53
277 0.5
278 0.47
279 0.41
280 0.32
281 0.23
282 0.16
283 0.16
284 0.15
285 0.17
286 0.18
287 0.19
288 0.18
289 0.19
290 0.18
291 0.26
292 0.33
293 0.37
294 0.4
295 0.4
296 0.4
297 0.41
298 0.47
299 0.44
300 0.43
301 0.36
302 0.34
303 0.31
304 0.3
305 0.28
306 0.2
307 0.14
308 0.09
309 0.09
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.07
315 0.06
316 0.05
317 0.06
318 0.05
319 0.06
320 0.06
321 0.06
322 0.1
323 0.1
324 0.1
325 0.09
326 0.1
327 0.11
328 0.14
329 0.15
330 0.11
331 0.12
332 0.12
333 0.13
334 0.12
335 0.11
336 0.08
337 0.07
338 0.09
339 0.09
340 0.09
341 0.16
342 0.22
343 0.25
344 0.28
345 0.31
346 0.31
347 0.34
348 0.34
349 0.28
350 0.25
351 0.22
352 0.19
353 0.16
354 0.15
355 0.11
356 0.1
357 0.09
358 0.06
359 0.06
360 0.07
361 0.06
362 0.09
363 0.11
364 0.12
365 0.17
366 0.18
367 0.19
368 0.2
369 0.21
370 0.18
371 0.17
372 0.17
373 0.13
374 0.12
375 0.11
376 0.08
377 0.08
378 0.07
379 0.06
380 0.05
381 0.04
382 0.04
383 0.05
384 0.06
385 0.07
386 0.09
387 0.09
388 0.1
389 0.12
390 0.15
391 0.22
392 0.28
393 0.29
394 0.3
395 0.31
396 0.32
397 0.31
398 0.28
399 0.24
400 0.21
401 0.23
402 0.27
403 0.26
404 0.27
405 0.31
406 0.3
407 0.27
408 0.24
409 0.21
410 0.19
411 0.25
412 0.22
413 0.21
414 0.26
415 0.28
416 0.28
417 0.28
418 0.27
419 0.23
420 0.29
421 0.32
422 0.33
423 0.34
424 0.38
425 0.4
426 0.42
427 0.46
428 0.42
429 0.38
430 0.33
431 0.37
432 0.33
433 0.33
434 0.3
435 0.25
436 0.24
437 0.21
438 0.19
439 0.13
440 0.14
441 0.11
442 0.12
443 0.11
444 0.12
445 0.15
446 0.16
447 0.17
448 0.16
449 0.2
450 0.2
451 0.21
452 0.2
453 0.18
454 0.19
455 0.19
456 0.19
457 0.16
458 0.17
459 0.15
460 0.14
461 0.16
462 0.17
463 0.17
464 0.19
465 0.2
466 0.19
467 0.21
468 0.22
469 0.21
470 0.19
471 0.18
472 0.17
473 0.18
474 0.17
475 0.16
476 0.19
477 0.2
478 0.19
479 0.2
480 0.18
481 0.15
482 0.17