Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A0U1M5T3

Protein Details
Accession A0A0U1M5T3    Localization Confidence High Confidence Score 19.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
123-150IGFSSHRKKREAKIKKEIKRGIREPNTEBasic
1078-1099STVSIKSTKQHKRKAGDTAREIHydrophilic
1101-1121DQEVESKIRKKVKKGTEGKRKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
128-144HRKKREAKIKKEIKRGI
1107-1121KIRKKVKKGTEGKRK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11, cyto 4.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000182  GNAT_dom  
IPR007807  Helicase_dom  
IPR033688  NAT10  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR032672  TmcA/NAT10/Kre33  
IPR013562  TmcA_N  
IPR027992  tRNA_bind_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0008080  F:N-acetyltransferase activity  
GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
GO:0000154  P:rRNA modification  
GO:0051391  P:tRNA acetylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF13718  GNAT_acetyltr_2  
PF05127  Helicase_RecD  
PF08351  TmcA_N  
PF13725  tRNA_bind_2  
Amino Acid Sequences MSTIHNSTYSRITWQGGEDGREGNSGGPGDFENVDLHGPPNLVLSGSRQIPDLLQSGKKMPRKAIDSRIPALIRNGVQEKKRSFFVVVGDRAKDAIVNLYHIMSTADVKQNKSVLWAYKKDLIGFSSHRKKREAKIKKEIKRGIREPNTEDPFELFLSLNQIRYVYYKETEKILGNTYGICILQDFEAITPNLLARTIETVEGGGMVLLLLKGMNSLKQLYTLSMDIHSRYRTEAHDDVVARFNERFILSLGSCDSCLVVDDELNVLPISGGKNVKPLPPPDPSDEGKSASKKELQEIKDSLVDTQPVGSLVTLAKTVDQAKALLTFVDAIAEKTLRNTVTLTAGRGRGKSAALGVSIAAAVAHGYSNIFITSPSPENLKTLFEFVFKGFDALGYLDHVDYTILQSTNPAFNKAIVRVNIHRNHRQTIQYIQPQDAYALGQAELLVIDEAAAIPLPLVRKLMGPYLVFMASTINGYEGTGRSLSLKLIQQLREQSRGASLKDTDTDIADRATGKSTKNSEKAIGGRSLREITLSEPIRYAAGDPVEKWLNKVLCLDATLPKSKLNTQGCPHPSQCQLLHVNRDTLFSFHPVSEKFLQQMMALYVASHYKNSPNDLQLMSDAPAHQLFVLVPPIDEDAAKLPEPLCVIQVALEGRISRESVMNSLSRGQRAGGDLIPWLVSQQFQDEDFAGLSGARIVRIATNPEYLNMGYGSRALELLVDFYEGKFTNLSEDASYPSDEMVRITDAELENANLLQDNVQVRDIRSMPPLFGKLSERRPDSLDYVGVSYGLTPSLHKFWKRSSFAPVYLRQTANELTGEHSCVMLRALAAGSNDISWLSAYARDFHKRFLSLLSYQFKEFPSVLSLSICESATAGSKSDPSFSPLPLTKATLDSAFSPFDLKRLDSYANNMLDYHVILDMVPTAAQFYFLGALQGKVSLSGVQQSILLGVGLQRKDMDSLEKELNLPASQLLAMFIKIIRKISTHFRGLLEGAVEAALPERSAVTDVSTAHDDVTDDKFQPLDVDLDEELREGGEEVDQEMKEKQRALIDALPLDRYEINNGPAAWENAEKQIRQGGASTVSIKSTKQHKRKAGDTAREIYDQEVESKIRKKVKKGTEGKRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.32
3 0.31
4 0.32
5 0.3
6 0.29
7 0.27
8 0.26
9 0.24
10 0.18
11 0.17
12 0.15
13 0.13
14 0.13
15 0.13
16 0.14
17 0.14
18 0.15
19 0.13
20 0.13
21 0.14
22 0.13
23 0.13
24 0.13
25 0.13
26 0.12
27 0.13
28 0.12
29 0.12
30 0.12
31 0.15
32 0.19
33 0.22
34 0.22
35 0.21
36 0.21
37 0.22
38 0.24
39 0.24
40 0.23
41 0.24
42 0.26
43 0.32
44 0.4
45 0.45
46 0.47
47 0.5
48 0.53
49 0.57
50 0.63
51 0.66
52 0.67
53 0.68
54 0.66
55 0.66
56 0.59
57 0.54
58 0.49
59 0.45
60 0.36
61 0.36
62 0.39
63 0.38
64 0.42
65 0.49
66 0.51
67 0.49
68 0.5
69 0.46
70 0.42
71 0.38
72 0.41
73 0.41
74 0.43
75 0.44
76 0.42
77 0.4
78 0.38
79 0.35
80 0.28
81 0.2
82 0.19
83 0.15
84 0.16
85 0.17
86 0.17
87 0.17
88 0.17
89 0.16
90 0.11
91 0.12
92 0.15
93 0.22
94 0.25
95 0.27
96 0.31
97 0.33
98 0.32
99 0.34
100 0.34
101 0.35
102 0.4
103 0.42
104 0.43
105 0.48
106 0.5
107 0.47
108 0.44
109 0.36
110 0.34
111 0.35
112 0.41
113 0.45
114 0.48
115 0.5
116 0.55
117 0.61
118 0.65
119 0.71
120 0.71
121 0.71
122 0.77
123 0.83
124 0.86
125 0.9
126 0.88
127 0.87
128 0.86
129 0.83
130 0.83
131 0.81
132 0.78
133 0.74
134 0.76
135 0.71
136 0.62
137 0.55
138 0.46
139 0.39
140 0.33
141 0.28
142 0.18
143 0.13
144 0.19
145 0.2
146 0.19
147 0.17
148 0.17
149 0.16
150 0.18
151 0.22
152 0.18
153 0.21
154 0.24
155 0.25
156 0.28
157 0.31
158 0.32
159 0.3
160 0.3
161 0.28
162 0.24
163 0.23
164 0.21
165 0.19
166 0.16
167 0.13
168 0.1
169 0.09
170 0.08
171 0.08
172 0.08
173 0.07
174 0.11
175 0.11
176 0.11
177 0.1
178 0.1
179 0.1
180 0.1
181 0.1
182 0.07
183 0.11
184 0.11
185 0.11
186 0.11
187 0.11
188 0.1
189 0.1
190 0.09
191 0.05
192 0.04
193 0.03
194 0.04
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.05
200 0.06
201 0.07
202 0.09
203 0.11
204 0.11
205 0.14
206 0.15
207 0.15
208 0.17
209 0.16
210 0.16
211 0.16
212 0.17
213 0.17
214 0.2
215 0.2
216 0.18
217 0.19
218 0.2
219 0.21
220 0.26
221 0.26
222 0.25
223 0.29
224 0.29
225 0.3
226 0.32
227 0.3
228 0.25
229 0.23
230 0.22
231 0.19
232 0.18
233 0.17
234 0.12
235 0.16
236 0.14
237 0.15
238 0.17
239 0.15
240 0.15
241 0.14
242 0.12
243 0.08
244 0.09
245 0.09
246 0.07
247 0.07
248 0.07
249 0.08
250 0.08
251 0.09
252 0.08
253 0.06
254 0.06
255 0.07
256 0.08
257 0.11
258 0.13
259 0.12
260 0.19
261 0.21
262 0.26
263 0.29
264 0.32
265 0.32
266 0.36
267 0.4
268 0.39
269 0.43
270 0.4
271 0.42
272 0.4
273 0.39
274 0.38
275 0.38
276 0.35
277 0.33
278 0.36
279 0.32
280 0.38
281 0.43
282 0.4
283 0.43
284 0.42
285 0.41
286 0.38
287 0.37
288 0.31
289 0.24
290 0.22
291 0.16
292 0.14
293 0.12
294 0.09
295 0.09
296 0.08
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.07
302 0.07
303 0.09
304 0.11
305 0.11
306 0.11
307 0.11
308 0.11
309 0.13
310 0.13
311 0.1
312 0.09
313 0.08
314 0.07
315 0.08
316 0.08
317 0.07
318 0.08
319 0.09
320 0.08
321 0.09
322 0.12
323 0.1
324 0.11
325 0.11
326 0.11
327 0.17
328 0.18
329 0.19
330 0.2
331 0.24
332 0.26
333 0.25
334 0.25
335 0.21
336 0.2
337 0.19
338 0.17
339 0.14
340 0.12
341 0.11
342 0.1
343 0.08
344 0.08
345 0.07
346 0.05
347 0.03
348 0.03
349 0.03
350 0.03
351 0.03
352 0.03
353 0.03
354 0.04
355 0.04
356 0.04
357 0.04
358 0.05
359 0.09
360 0.11
361 0.11
362 0.13
363 0.13
364 0.15
365 0.16
366 0.17
367 0.15
368 0.16
369 0.16
370 0.14
371 0.15
372 0.14
373 0.15
374 0.13
375 0.12
376 0.1
377 0.09
378 0.09
379 0.08
380 0.07
381 0.06
382 0.07
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.05
387 0.05
388 0.06
389 0.08
390 0.08
391 0.08
392 0.09
393 0.11
394 0.16
395 0.17
396 0.18
397 0.15
398 0.18
399 0.2
400 0.22
401 0.25
402 0.21
403 0.25
404 0.27
405 0.36
406 0.4
407 0.44
408 0.48
409 0.47
410 0.49
411 0.5
412 0.48
413 0.42
414 0.41
415 0.42
416 0.41
417 0.39
418 0.36
419 0.33
420 0.3
421 0.27
422 0.22
423 0.15
424 0.09
425 0.08
426 0.07
427 0.06
428 0.06
429 0.05
430 0.05
431 0.04
432 0.04
433 0.03
434 0.03
435 0.03
436 0.03
437 0.03
438 0.03
439 0.02
440 0.02
441 0.04
442 0.04
443 0.05
444 0.06
445 0.06
446 0.07
447 0.09
448 0.11
449 0.13
450 0.13
451 0.13
452 0.14
453 0.13
454 0.12
455 0.11
456 0.1
457 0.07
458 0.07
459 0.06
460 0.05
461 0.05
462 0.05
463 0.06
464 0.06
465 0.07
466 0.07
467 0.07
468 0.08
469 0.08
470 0.08
471 0.11
472 0.12
473 0.15
474 0.19
475 0.21
476 0.23
477 0.3
478 0.32
479 0.33
480 0.32
481 0.28
482 0.28
483 0.29
484 0.27
485 0.22
486 0.2
487 0.17
488 0.18
489 0.18
490 0.13
491 0.12
492 0.12
493 0.1
494 0.09
495 0.08
496 0.08
497 0.08
498 0.1
499 0.12
500 0.12
501 0.16
502 0.21
503 0.27
504 0.3
505 0.31
506 0.29
507 0.31
508 0.33
509 0.31
510 0.3
511 0.25
512 0.22
513 0.22
514 0.22
515 0.18
516 0.16
517 0.14
518 0.1
519 0.17
520 0.17
521 0.16
522 0.15
523 0.15
524 0.15
525 0.14
526 0.14
527 0.08
528 0.09
529 0.09
530 0.09
531 0.12
532 0.14
533 0.14
534 0.14
535 0.17
536 0.16
537 0.16
538 0.17
539 0.14
540 0.11
541 0.13
542 0.13
543 0.13
544 0.15
545 0.17
546 0.17
547 0.18
548 0.19
549 0.2
550 0.27
551 0.26
552 0.29
553 0.28
554 0.36
555 0.38
556 0.4
557 0.39
558 0.35
559 0.33
560 0.31
561 0.3
562 0.27
563 0.3
564 0.28
565 0.32
566 0.29
567 0.3
568 0.27
569 0.28
570 0.23
571 0.19
572 0.17
573 0.14
574 0.14
575 0.11
576 0.13
577 0.12
578 0.16
579 0.17
580 0.17
581 0.16
582 0.16
583 0.16
584 0.14
585 0.14
586 0.1
587 0.09
588 0.08
589 0.07
590 0.06
591 0.08
592 0.08
593 0.07
594 0.08
595 0.11
596 0.12
597 0.16
598 0.18
599 0.17
600 0.2
601 0.19
602 0.19
603 0.16
604 0.16
605 0.13
606 0.11
607 0.1
608 0.09
609 0.08
610 0.08
611 0.07
612 0.07
613 0.06
614 0.06
615 0.08
616 0.07
617 0.06
618 0.07
619 0.07
620 0.07
621 0.07
622 0.07
623 0.07
624 0.09
625 0.09
626 0.09
627 0.09
628 0.1
629 0.11
630 0.11
631 0.09
632 0.07
633 0.07
634 0.07
635 0.09
636 0.08
637 0.07
638 0.07
639 0.07
640 0.07
641 0.08
642 0.08
643 0.07
644 0.09
645 0.09
646 0.09
647 0.11
648 0.11
649 0.11
650 0.16
651 0.17
652 0.16
653 0.16
654 0.15
655 0.14
656 0.15
657 0.17
658 0.12
659 0.11
660 0.1
661 0.1
662 0.1
663 0.08
664 0.07
665 0.06
666 0.06
667 0.05
668 0.07
669 0.08
670 0.08
671 0.09
672 0.09
673 0.09
674 0.09
675 0.09
676 0.07
677 0.06
678 0.05
679 0.06
680 0.06
681 0.05
682 0.05
683 0.05
684 0.07
685 0.08
686 0.12
687 0.12
688 0.15
689 0.15
690 0.16
691 0.17
692 0.15
693 0.15
694 0.12
695 0.1
696 0.07
697 0.08
698 0.08
699 0.07
700 0.07
701 0.06
702 0.06
703 0.06
704 0.06
705 0.05
706 0.06
707 0.06
708 0.06
709 0.09
710 0.09
711 0.09
712 0.09
713 0.09
714 0.1
715 0.11
716 0.12
717 0.1
718 0.11
719 0.12
720 0.13
721 0.14
722 0.11
723 0.1
724 0.1
725 0.1
726 0.09
727 0.08
728 0.08
729 0.08
730 0.08
731 0.11
732 0.11
733 0.12
734 0.12
735 0.11
736 0.1
737 0.1
738 0.09
739 0.06
740 0.06
741 0.05
742 0.08
743 0.09
744 0.1
745 0.12
746 0.13
747 0.13
748 0.18
749 0.19
750 0.17
751 0.21
752 0.2
753 0.19
754 0.21
755 0.22
756 0.19
757 0.2
758 0.23
759 0.25
760 0.32
761 0.39
762 0.38
763 0.38
764 0.4
765 0.41
766 0.38
767 0.34
768 0.27
769 0.21
770 0.19
771 0.17
772 0.15
773 0.11
774 0.09
775 0.07
776 0.07
777 0.06
778 0.06
779 0.09
780 0.13
781 0.18
782 0.21
783 0.23
784 0.31
785 0.41
786 0.44
787 0.44
788 0.48
789 0.48
790 0.51
791 0.55
792 0.52
793 0.48
794 0.5
795 0.48
796 0.4
797 0.37
798 0.33
799 0.28
800 0.23
801 0.18
802 0.15
803 0.15
804 0.16
805 0.14
806 0.13
807 0.11
808 0.1
809 0.1
810 0.08
811 0.07
812 0.06
813 0.06
814 0.07
815 0.08
816 0.08
817 0.08
818 0.07
819 0.08
820 0.07
821 0.07
822 0.05
823 0.06
824 0.06
825 0.08
826 0.09
827 0.13
828 0.17
829 0.25
830 0.26
831 0.29
832 0.33
833 0.31
834 0.32
835 0.31
836 0.32
837 0.28
838 0.35
839 0.37
840 0.34
841 0.33
842 0.35
843 0.32
844 0.3
845 0.26
846 0.2
847 0.18
848 0.17
849 0.17
850 0.15
851 0.15
852 0.13
853 0.15
854 0.14
855 0.1
856 0.09
857 0.09
858 0.12
859 0.12
860 0.11
861 0.1
862 0.13
863 0.14
864 0.17
865 0.17
866 0.18
867 0.2
868 0.2
869 0.25
870 0.24
871 0.27
872 0.26
873 0.28
874 0.24
875 0.24
876 0.25
877 0.2
878 0.18
879 0.17
880 0.18
881 0.16
882 0.15
883 0.16
884 0.15
885 0.17
886 0.18
887 0.17
888 0.16
889 0.19
890 0.22
891 0.21
892 0.26
893 0.3
894 0.3
895 0.29
896 0.27
897 0.24
898 0.22
899 0.21
900 0.16
901 0.09
902 0.07
903 0.07
904 0.07
905 0.07
906 0.06
907 0.06
908 0.05
909 0.06
910 0.06
911 0.07
912 0.07
913 0.07
914 0.08
915 0.08
916 0.1
917 0.09
918 0.1
919 0.09
920 0.1
921 0.1
922 0.09
923 0.1
924 0.09
925 0.09
926 0.12
927 0.12
928 0.11
929 0.12
930 0.11
931 0.11
932 0.1
933 0.09
934 0.05
935 0.08
936 0.14
937 0.14
938 0.14
939 0.15
940 0.15
941 0.17
942 0.18
943 0.21
944 0.18
945 0.23
946 0.25
947 0.26
948 0.26
949 0.26
950 0.27
951 0.21
952 0.18
953 0.14
954 0.12
955 0.11
956 0.1
957 0.1
958 0.09
959 0.08
960 0.09
961 0.1
962 0.13
963 0.15
964 0.17
965 0.17
966 0.18
967 0.22
968 0.31
969 0.36
970 0.37
971 0.39
972 0.37
973 0.39
974 0.38
975 0.36
976 0.26
977 0.19
978 0.15
979 0.11
980 0.1
981 0.07
982 0.07
983 0.06
984 0.05
985 0.05
986 0.05
987 0.06
988 0.08
989 0.08
990 0.09
991 0.12
992 0.12
993 0.16
994 0.18
995 0.17
996 0.16
997 0.16
998 0.15
999 0.15
1000 0.2
1001 0.19
1002 0.18
1003 0.19
1004 0.19
1005 0.18
1006 0.19
1007 0.18
1008 0.15
1009 0.12
1010 0.14
1011 0.14
1012 0.15
1013 0.15
1014 0.14
1015 0.12
1016 0.1
1017 0.1
1018 0.07
1019 0.07
1020 0.07
1021 0.07
1022 0.09
1023 0.14
1024 0.14
1025 0.15
1026 0.19
1027 0.23
1028 0.25
1029 0.27
1030 0.28
1031 0.28
1032 0.31
1033 0.35
1034 0.36
1035 0.35
1036 0.36
1037 0.35
1038 0.34
1039 0.28
1040 0.29
1041 0.25
1042 0.21
1043 0.23
1044 0.22
1045 0.23
1046 0.25
1047 0.25
1048 0.25
1049 0.26
1050 0.27
1051 0.23
1052 0.23
1053 0.22
1054 0.27
1055 0.32
1056 0.29
1057 0.29
1058 0.33
1059 0.31
1060 0.29
1061 0.29
1062 0.24
1063 0.23
1064 0.25
1065 0.26
1066 0.21
1067 0.23
1068 0.24
1069 0.23
1070 0.27
1071 0.34
1072 0.42
1073 0.49
1074 0.59
1075 0.65
1076 0.72
1077 0.78
1078 0.83
1079 0.83
1080 0.82
1081 0.79
1082 0.76
1083 0.7
1084 0.64
1085 0.58
1086 0.48
1087 0.42
1088 0.33
1089 0.28
1090 0.25
1091 0.23
1092 0.28
1093 0.34
1094 0.39
1095 0.44
1096 0.5
1097 0.57
1098 0.64
1099 0.72
1100 0.77
1101 0.81