Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0U1M0S6

Protein Details
Accession A0A0U1M0S6    Localization Confidence Low Confidence Score 8.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-25VSKPASQPPKVKRPPPSFTQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 10.5, cyto_nucl 9.333, cyto_mito 7.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MMATAVSKPASQPPKVKRPPPSFTQPAVNGIKQSPSASSSPSVTSKRLPGANQPSSTNSVAGPVANGVNNRPINKMRKEIQKPGDPPIRQQRPSTRNSVVETDRRSNKIPPEPFVKTTSYILKRYAKAQPSLIIHLHPTHFRFEQQDGSFPYNSEMKVIIEHIRSQTVPHDMLEELLRAGVKFYEVKVVDHKSVSAQTSKSTIQSSDEKNTPFSIHNYNQHVTPSPYIPYPKQNQVRPEKLESPKPESSAKETGANAAEASSTGQDGTANGISADESSAKQPSPKPKVFTTVLHPTSLSIQAELTYLSTTPHPLANASSNANKKQPTTSQGSSKSSTTTSPVAPPPPKRQKMLVDPEDLPEFEAKLIRAVAPPLYLDPVDSFESAQQLLHLMESPLHRDKPPSSKTRKRTVAELAADEALAAEEERFMLIMDERLEPATSSASGGAKSAVDDTAGAVPFEPRFSRFKTIENIRIQHEEKAKREHEKQVQQEHLKRQQQQEQERERRRNMEQRQAEELAKEERRQQLAAQQQAHAQLAAQQQQRLANGLAQASQGQMSSPIVRNQTPHNTSSPVVGNNVGVATGGLPMNVTASTQGAGSPPRPPSTMQHAHPGVMSHPMAASRSQQSQSRNGTPQMTQGTPAMGHATPIMRNVTPTQRMGHSSPPNSSMAQTPVMNQALMGTPQMGGTGMGLTPQQQQQILLQQRQQQLLSQGLNPQHIAQMQAQQTIQNHHQQQQQLLHQQQQLQQQNQQQLQQSVHPQHSYQAQLLRTQMAQMQMAQQKQGGQQPGGMQMTPQQQHQQQMLLAASQQNGGQVTQGPVQWSPRHQQMYQQRVISLRQDIVRRYGQQYGAPQNFPAPLAQQYGSGVEKSARAYVMEMMRKEQAAIRHAAVMQHQQQQQQMMANGMGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.7
3 0.76
4 0.78
5 0.8
6 0.81
7 0.79
8 0.79
9 0.76
10 0.7
11 0.71
12 0.63
13 0.62
14 0.61
15 0.55
16 0.48
17 0.42
18 0.42
19 0.34
20 0.33
21 0.27
22 0.25
23 0.25
24 0.25
25 0.26
26 0.24
27 0.27
28 0.33
29 0.34
30 0.33
31 0.36
32 0.39
33 0.43
34 0.45
35 0.43
36 0.47
37 0.54
38 0.58
39 0.57
40 0.54
41 0.51
42 0.52
43 0.5
44 0.41
45 0.3
46 0.25
47 0.23
48 0.2
49 0.16
50 0.13
51 0.14
52 0.15
53 0.16
54 0.15
55 0.23
56 0.27
57 0.28
58 0.31
59 0.38
60 0.44
61 0.49
62 0.55
63 0.55
64 0.62
65 0.69
66 0.74
67 0.75
68 0.76
69 0.73
70 0.75
71 0.76
72 0.66
73 0.67
74 0.68
75 0.69
76 0.62
77 0.67
78 0.68
79 0.67
80 0.71
81 0.7
82 0.65
83 0.6
84 0.61
85 0.6
86 0.56
87 0.55
88 0.56
89 0.57
90 0.58
91 0.56
92 0.56
93 0.55
94 0.58
95 0.6
96 0.58
97 0.54
98 0.56
99 0.58
100 0.58
101 0.55
102 0.5
103 0.42
104 0.41
105 0.46
106 0.43
107 0.41
108 0.45
109 0.49
110 0.47
111 0.51
112 0.56
113 0.52
114 0.51
115 0.51
116 0.5
117 0.46
118 0.49
119 0.44
120 0.37
121 0.33
122 0.33
123 0.32
124 0.31
125 0.28
126 0.28
127 0.28
128 0.29
129 0.31
130 0.3
131 0.36
132 0.33
133 0.37
134 0.36
135 0.39
136 0.37
137 0.33
138 0.33
139 0.28
140 0.27
141 0.22
142 0.19
143 0.15
144 0.15
145 0.17
146 0.2
147 0.18
148 0.22
149 0.22
150 0.23
151 0.23
152 0.23
153 0.24
154 0.24
155 0.23
156 0.2
157 0.2
158 0.18
159 0.19
160 0.19
161 0.16
162 0.11
163 0.1
164 0.1
165 0.08
166 0.09
167 0.08
168 0.09
169 0.09
170 0.1
171 0.17
172 0.18
173 0.2
174 0.25
175 0.29
176 0.3
177 0.29
178 0.29
179 0.24
180 0.27
181 0.27
182 0.25
183 0.22
184 0.21
185 0.24
186 0.25
187 0.25
188 0.23
189 0.21
190 0.21
191 0.28
192 0.31
193 0.33
194 0.37
195 0.35
196 0.35
197 0.36
198 0.34
199 0.29
200 0.28
201 0.3
202 0.31
203 0.37
204 0.41
205 0.41
206 0.4
207 0.39
208 0.38
209 0.33
210 0.3
211 0.25
212 0.21
213 0.23
214 0.26
215 0.27
216 0.33
217 0.36
218 0.43
219 0.49
220 0.52
221 0.58
222 0.63
223 0.68
224 0.66
225 0.66
226 0.66
227 0.63
228 0.67
229 0.63
230 0.61
231 0.56
232 0.53
233 0.51
234 0.45
235 0.46
236 0.43
237 0.39
238 0.35
239 0.32
240 0.33
241 0.29
242 0.27
243 0.2
244 0.15
245 0.13
246 0.09
247 0.09
248 0.07
249 0.06
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.07
258 0.08
259 0.07
260 0.08
261 0.08
262 0.06
263 0.07
264 0.08
265 0.1
266 0.1
267 0.14
268 0.19
269 0.29
270 0.37
271 0.41
272 0.44
273 0.45
274 0.51
275 0.5
276 0.48
277 0.45
278 0.45
279 0.42
280 0.38
281 0.36
282 0.3
283 0.29
284 0.3
285 0.23
286 0.13
287 0.12
288 0.11
289 0.12
290 0.11
291 0.09
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.07
296 0.08
297 0.09
298 0.09
299 0.09
300 0.09
301 0.11
302 0.13
303 0.15
304 0.16
305 0.21
306 0.24
307 0.27
308 0.3
309 0.3
310 0.28
311 0.3
312 0.32
313 0.31
314 0.35
315 0.36
316 0.4
317 0.44
318 0.47
319 0.44
320 0.41
321 0.37
322 0.3
323 0.28
324 0.23
325 0.2
326 0.17
327 0.19
328 0.21
329 0.26
330 0.31
331 0.36
332 0.43
333 0.52
334 0.54
335 0.53
336 0.56
337 0.56
338 0.6
339 0.64
340 0.58
341 0.52
342 0.48
343 0.47
344 0.43
345 0.36
346 0.27
347 0.17
348 0.13
349 0.09
350 0.1
351 0.08
352 0.08
353 0.09
354 0.09
355 0.09
356 0.09
357 0.09
358 0.08
359 0.09
360 0.08
361 0.09
362 0.08
363 0.08
364 0.07
365 0.1
366 0.11
367 0.1
368 0.1
369 0.09
370 0.11
371 0.1
372 0.1
373 0.07
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.05
379 0.08
380 0.08
381 0.13
382 0.15
383 0.17
384 0.17
385 0.19
386 0.23
387 0.3
388 0.36
389 0.41
390 0.48
391 0.56
392 0.62
393 0.7
394 0.75
395 0.67
396 0.65
397 0.62
398 0.59
399 0.52
400 0.45
401 0.37
402 0.28
403 0.26
404 0.21
405 0.14
406 0.07
407 0.05
408 0.04
409 0.03
410 0.02
411 0.03
412 0.03
413 0.03
414 0.03
415 0.03
416 0.03
417 0.05
418 0.07
419 0.07
420 0.07
421 0.08
422 0.08
423 0.07
424 0.08
425 0.07
426 0.06
427 0.05
428 0.06
429 0.07
430 0.07
431 0.07
432 0.07
433 0.06
434 0.06
435 0.06
436 0.05
437 0.05
438 0.05
439 0.05
440 0.07
441 0.07
442 0.07
443 0.06
444 0.07
445 0.07
446 0.08
447 0.08
448 0.08
449 0.11
450 0.14
451 0.2
452 0.21
453 0.24
454 0.3
455 0.35
456 0.41
457 0.43
458 0.42
459 0.38
460 0.42
461 0.4
462 0.38
463 0.4
464 0.37
465 0.35
466 0.4
467 0.41
468 0.42
469 0.46
470 0.5
471 0.51
472 0.54
473 0.57
474 0.57
475 0.61
476 0.62
477 0.63
478 0.62
479 0.62
480 0.6
481 0.59
482 0.57
483 0.56
484 0.58
485 0.6
486 0.62
487 0.64
488 0.68
489 0.72
490 0.73
491 0.69
492 0.66
493 0.64
494 0.64
495 0.6
496 0.6
497 0.56
498 0.53
499 0.55
500 0.53
501 0.47
502 0.38
503 0.33
504 0.29
505 0.25
506 0.23
507 0.23
508 0.25
509 0.27
510 0.27
511 0.26
512 0.27
513 0.31
514 0.37
515 0.33
516 0.29
517 0.29
518 0.3
519 0.29
520 0.22
521 0.15
522 0.14
523 0.16
524 0.21
525 0.21
526 0.2
527 0.22
528 0.23
529 0.24
530 0.21
531 0.18
532 0.13
533 0.13
534 0.13
535 0.12
536 0.1
537 0.1
538 0.09
539 0.08
540 0.07
541 0.06
542 0.06
543 0.06
544 0.09
545 0.11
546 0.14
547 0.16
548 0.17
549 0.19
550 0.23
551 0.31
552 0.31
553 0.31
554 0.3
555 0.3
556 0.3
557 0.31
558 0.29
559 0.21
560 0.19
561 0.17
562 0.15
563 0.12
564 0.12
565 0.09
566 0.06
567 0.05
568 0.04
569 0.05
570 0.05
571 0.04
572 0.04
573 0.04
574 0.05
575 0.05
576 0.05
577 0.04
578 0.05
579 0.05
580 0.05
581 0.06
582 0.06
583 0.08
584 0.09
585 0.14
586 0.16
587 0.17
588 0.19
589 0.2
590 0.23
591 0.31
592 0.38
593 0.35
594 0.41
595 0.4
596 0.39
597 0.38
598 0.34
599 0.25
600 0.22
601 0.2
602 0.12
603 0.12
604 0.12
605 0.12
606 0.12
607 0.15
608 0.14
609 0.18
610 0.21
611 0.25
612 0.27
613 0.34
614 0.4
615 0.42
616 0.43
617 0.41
618 0.42
619 0.38
620 0.4
621 0.36
622 0.3
623 0.25
624 0.22
625 0.2
626 0.18
627 0.17
628 0.15
629 0.11
630 0.1
631 0.11
632 0.12
633 0.11
634 0.13
635 0.16
636 0.12
637 0.14
638 0.18
639 0.23
640 0.25
641 0.27
642 0.27
643 0.27
644 0.31
645 0.32
646 0.37
647 0.38
648 0.37
649 0.37
650 0.38
651 0.37
652 0.34
653 0.32
654 0.26
655 0.21
656 0.22
657 0.2
658 0.19
659 0.22
660 0.22
661 0.21
662 0.18
663 0.16
664 0.14
665 0.14
666 0.13
667 0.08
668 0.07
669 0.07
670 0.08
671 0.07
672 0.05
673 0.05
674 0.05
675 0.05
676 0.05
677 0.06
678 0.07
679 0.11
680 0.13
681 0.14
682 0.14
683 0.15
684 0.17
685 0.26
686 0.31
687 0.31
688 0.34
689 0.39
690 0.43
691 0.45
692 0.43
693 0.37
694 0.33
695 0.35
696 0.32
697 0.26
698 0.27
699 0.27
700 0.28
701 0.26
702 0.23
703 0.2
704 0.19
705 0.2
706 0.17
707 0.22
708 0.22
709 0.24
710 0.24
711 0.24
712 0.26
713 0.28
714 0.3
715 0.31
716 0.33
717 0.36
718 0.41
719 0.41
720 0.45
721 0.46
722 0.49
723 0.49
724 0.49
725 0.5
726 0.48
727 0.5
728 0.49
729 0.52
730 0.54
731 0.48
732 0.51
733 0.5
734 0.55
735 0.54
736 0.53
737 0.48
738 0.44
739 0.42
740 0.4
741 0.42
742 0.4
743 0.42
744 0.39
745 0.35
746 0.34
747 0.37
748 0.36
749 0.32
750 0.31
751 0.28
752 0.3
753 0.31
754 0.3
755 0.25
756 0.24
757 0.23
758 0.2
759 0.19
760 0.17
761 0.23
762 0.26
763 0.27
764 0.27
765 0.25
766 0.26
767 0.29
768 0.34
769 0.3
770 0.26
771 0.27
772 0.29
773 0.34
774 0.32
775 0.28
776 0.22
777 0.24
778 0.32
779 0.31
780 0.31
781 0.32
782 0.34
783 0.39
784 0.41
785 0.38
786 0.3
787 0.32
788 0.3
789 0.23
790 0.22
791 0.19
792 0.18
793 0.16
794 0.15
795 0.14
796 0.14
797 0.13
798 0.13
799 0.13
800 0.15
801 0.17
802 0.18
803 0.18
804 0.2
805 0.26
806 0.29
807 0.31
808 0.34
809 0.4
810 0.44
811 0.43
812 0.5
813 0.55
814 0.6
815 0.62
816 0.58
817 0.52
818 0.49
819 0.52
820 0.47
821 0.41
822 0.36
823 0.35
824 0.37
825 0.38
826 0.41
827 0.44
828 0.44
829 0.44
830 0.45
831 0.43
832 0.43
833 0.48
834 0.52
835 0.51
836 0.48
837 0.45
838 0.41
839 0.4
840 0.35
841 0.29
842 0.21
843 0.19
844 0.22
845 0.22
846 0.2
847 0.2
848 0.22
849 0.22
850 0.2
851 0.18
852 0.15
853 0.17
854 0.18
855 0.2
856 0.17
857 0.16
858 0.18
859 0.23
860 0.29
861 0.33
862 0.32
863 0.33
864 0.35
865 0.35
866 0.34
867 0.32
868 0.3
869 0.28
870 0.31
871 0.29
872 0.3
873 0.31
874 0.32
875 0.32
876 0.35
877 0.37
878 0.41
879 0.44
880 0.43
881 0.46
882 0.47
883 0.45
884 0.41
885 0.37
886 0.3