Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6BXJ4

Protein Details
Accession Q6BXJ4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
58-84GCSKSHGPSIPKRKSKRSKVQIDYVALHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
68-74PKRKSKR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041070  JHD  
IPR003347  JmjC_dom  
IPR019786  Zinc_finger_PHD-type_CS  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0140680  F:histone H3K36me/H3K36me2 demethylase activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
KEGG dha:DEHA2B02464g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17811  JHD  
PF00628  PHD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51184  JMJC  
PS01359  ZF_PHD_1  
PS50016  ZF_PHD_2  
CDD cd15517  PHD_TCF19_like  
Amino Acid Sequences MPDIDTCPICVESPLEDSTTFNNIAWLQCDICNQWFHASCLKIPKIEVNNLHSYHCEGCSKSHGPSIPKRKSKRSKVQIDYVALNDGDVFAVDKSSHPHVDKFLSFEVNANEIDDKINPYIDFRKDITADYALDTRLTRPVLIPRADLDIVDMKLPIEGKEITIDYIANEVGDDTPLDVMDVLTQQGVNPGWNLGKWRDYYNTDELSRDRIRNVISLEISDVDSFGKSFRRPRIVRDMDLVDKVWNDKSPRPKVTKYCLMSVTGSFTDFHIDFSGTSVYYTVCSGSKTFLMYPPTEQNLDIYTSWCLQPDQNYMWFGDFTKAFKGKGCTPSGGFKVTLSPGDLFIIPSGWIHAVFTPEDSLVIGGNFLTLMDLSMHLRIYEIEKVTRVPAKFRFPMFNRVLWLTSWYYYNNKSQFLKDLGQDAHIKNEAHIKSEAHSRGEVHTKTETHAVKDEPQPDQSVQYKTLSCLVSHLQSHYESSKINKVARNTIPAGLIGKDIPGYLAKLQSWLDELSP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.19
3 0.18
4 0.2
5 0.21
6 0.24
7 0.22
8 0.18
9 0.2
10 0.2
11 0.21
12 0.21
13 0.21
14 0.18
15 0.19
16 0.22
17 0.22
18 0.24
19 0.25
20 0.25
21 0.3
22 0.3
23 0.31
24 0.35
25 0.34
26 0.34
27 0.42
28 0.43
29 0.38
30 0.37
31 0.43
32 0.43
33 0.48
34 0.51
35 0.47
36 0.52
37 0.52
38 0.51
39 0.44
40 0.41
41 0.35
42 0.32
43 0.29
44 0.23
45 0.24
46 0.31
47 0.32
48 0.31
49 0.35
50 0.37
51 0.4
52 0.5
53 0.58
54 0.6
55 0.67
56 0.73
57 0.79
58 0.85
59 0.88
60 0.89
61 0.89
62 0.9
63 0.87
64 0.89
65 0.85
66 0.78
67 0.7
68 0.59
69 0.51
70 0.4
71 0.32
72 0.22
73 0.15
74 0.1
75 0.08
76 0.07
77 0.05
78 0.06
79 0.06
80 0.07
81 0.11
82 0.15
83 0.2
84 0.22
85 0.24
86 0.27
87 0.32
88 0.32
89 0.33
90 0.31
91 0.28
92 0.26
93 0.27
94 0.25
95 0.22
96 0.21
97 0.18
98 0.15
99 0.13
100 0.14
101 0.12
102 0.13
103 0.12
104 0.14
105 0.13
106 0.16
107 0.21
108 0.23
109 0.25
110 0.24
111 0.28
112 0.27
113 0.28
114 0.28
115 0.24
116 0.22
117 0.2
118 0.2
119 0.16
120 0.16
121 0.16
122 0.14
123 0.16
124 0.15
125 0.14
126 0.15
127 0.22
128 0.27
129 0.28
130 0.28
131 0.25
132 0.29
133 0.28
134 0.26
135 0.21
136 0.18
137 0.17
138 0.17
139 0.15
140 0.11
141 0.12
142 0.13
143 0.11
144 0.09
145 0.09
146 0.09
147 0.11
148 0.12
149 0.11
150 0.11
151 0.11
152 0.08
153 0.09
154 0.08
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.04
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.08
178 0.08
179 0.09
180 0.12
181 0.11
182 0.15
183 0.16
184 0.18
185 0.21
186 0.24
187 0.29
188 0.31
189 0.33
190 0.29
191 0.3
192 0.28
193 0.31
194 0.31
195 0.27
196 0.23
197 0.21
198 0.22
199 0.23
200 0.23
201 0.19
202 0.16
203 0.15
204 0.15
205 0.14
206 0.13
207 0.1
208 0.09
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.09
214 0.1
215 0.17
216 0.22
217 0.32
218 0.33
219 0.38
220 0.48
221 0.5
222 0.49
223 0.47
224 0.45
225 0.37
226 0.37
227 0.32
228 0.21
229 0.17
230 0.16
231 0.14
232 0.13
233 0.14
234 0.18
235 0.27
236 0.34
237 0.41
238 0.45
239 0.5
240 0.54
241 0.58
242 0.62
243 0.55
244 0.51
245 0.45
246 0.41
247 0.36
248 0.3
249 0.26
250 0.17
251 0.15
252 0.12
253 0.11
254 0.12
255 0.11
256 0.11
257 0.09
258 0.09
259 0.08
260 0.09
261 0.09
262 0.07
263 0.07
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.07
271 0.07
272 0.08
273 0.09
274 0.1
275 0.1
276 0.13
277 0.16
278 0.16
279 0.18
280 0.2
281 0.22
282 0.21
283 0.2
284 0.17
285 0.16
286 0.17
287 0.14
288 0.12
289 0.11
290 0.12
291 0.12
292 0.12
293 0.11
294 0.1
295 0.13
296 0.16
297 0.18
298 0.19
299 0.2
300 0.19
301 0.19
302 0.19
303 0.16
304 0.15
305 0.13
306 0.12
307 0.17
308 0.18
309 0.17
310 0.2
311 0.24
312 0.27
313 0.33
314 0.35
315 0.31
316 0.32
317 0.37
318 0.36
319 0.34
320 0.28
321 0.21
322 0.21
323 0.2
324 0.19
325 0.15
326 0.14
327 0.12
328 0.13
329 0.13
330 0.1
331 0.09
332 0.09
333 0.07
334 0.07
335 0.07
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.07
340 0.08
341 0.08
342 0.09
343 0.09
344 0.08
345 0.09
346 0.08
347 0.07
348 0.06
349 0.06
350 0.05
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.03
355 0.03
356 0.03
357 0.04
358 0.04
359 0.05
360 0.06
361 0.07
362 0.08
363 0.07
364 0.08
365 0.08
366 0.11
367 0.15
368 0.16
369 0.16
370 0.17
371 0.18
372 0.22
373 0.26
374 0.24
375 0.26
376 0.3
377 0.37
378 0.41
379 0.43
380 0.49
381 0.47
382 0.56
383 0.53
384 0.5
385 0.45
386 0.42
387 0.4
388 0.31
389 0.31
390 0.24
391 0.21
392 0.2
393 0.2
394 0.22
395 0.24
396 0.32
397 0.32
398 0.35
399 0.36
400 0.37
401 0.4
402 0.4
403 0.4
404 0.34
405 0.37
406 0.32
407 0.33
408 0.37
409 0.32
410 0.32
411 0.32
412 0.31
413 0.26
414 0.34
415 0.31
416 0.28
417 0.3
418 0.26
419 0.25
420 0.33
421 0.36
422 0.3
423 0.31
424 0.29
425 0.31
426 0.39
427 0.37
428 0.32
429 0.34
430 0.32
431 0.33
432 0.4
433 0.37
434 0.32
435 0.36
436 0.35
437 0.36
438 0.42
439 0.45
440 0.4
441 0.4
442 0.4
443 0.37
444 0.4
445 0.39
446 0.37
447 0.34
448 0.35
449 0.34
450 0.32
451 0.37
452 0.32
453 0.26
454 0.26
455 0.27
456 0.28
457 0.29
458 0.29
459 0.25
460 0.26
461 0.29
462 0.27
463 0.26
464 0.23
465 0.26
466 0.33
467 0.36
468 0.41
469 0.42
470 0.45
471 0.52
472 0.55
473 0.58
474 0.52
475 0.49
476 0.44
477 0.4
478 0.37
479 0.29
480 0.25
481 0.18
482 0.16
483 0.13
484 0.12
485 0.12
486 0.11
487 0.14
488 0.15
489 0.19
490 0.18
491 0.21
492 0.22
493 0.22
494 0.23