FuNGI

A0A0U1LWC2

Protein Details

Accession

A0A0U1LWC2

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
340-360	GGTPIRKKKRKGAMTNPSAYS	Hydrophilic
445-472	LSGWQDRSKQTKHKGAKAKRGKNGNEAI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
124-124	K
345-350	RKKKRK
454-466	QTKHKGAKAKRGK

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 12, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPPRRQWIDKKSAAKFQLFHRSQHDPLIHDPQADDRVLHQISGPKSANKTLDSSASTTSHKSARHLADLAHEFQAESIRKNEGEAANYGVFYDDTKYDYMQHLRELGTGGGNAYFVEATAKKGKGKEKAVKLEDALRDFNIDDNNDSKSQIAGGGASVYGSQYAPSAMSSYSRQPTYQDQQNIPDAIAGFQPNMDPRLRETLEALEDEAFVDDEDDDDIFGELVNNAEEMHPGDWEDTLYDYAEEDDGWESDVTEKAFPQTNTSKEPTQSDSKDSNAQTHDPSEMPNHDQPVPDMAPENSDWMNEFAKFKKDAKSSSNVPAVGPEASERRTAASTMFTVGGTPIRKKKRKGAMTNPSAYSMTSSSLARTDGLRLLDDRFDKVEAMYALDEEDEYDDTSFADGASMVSGMTGASATSSQAPSLVSRRDYSDVPLRSDFDNVMDDFLSGWQDRSKQTKHKGAKAKRGKNGNEAIGMAMLDEVRQGLGPARISSKSRA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.71
2	0.64
3	0.62
4	0.65
5	0.58
6	0.56
7	0.53
8	0.54
9	0.51
10	0.55
11	0.51
12	0.43
13	0.46
14	0.51
15	0.46
16	0.4
17	0.39
18	0.35
19	0.36
20	0.33
21	0.27
22	0.2
23	0.26
24	0.25
25	0.25
26	0.22
27	0.25
28	0.26
29	0.34
30	0.35
31	0.32
32	0.35
33	0.4
34	0.42
35	0.37
36	0.4
37	0.34
38	0.36
39	0.34
40	0.33
41	0.31
42	0.3
43	0.3
44	0.28
45	0.29
46	0.29
47	0.29
48	0.3
49	0.35
50	0.37
51	0.4
52	0.39
53	0.36
54	0.39
55	0.41
56	0.4
57	0.33
58	0.28
59	0.23
60	0.22
61	0.28
62	0.22
63	0.2
64	0.2
65	0.21
66	0.21
67	0.22
68	0.28
69	0.23
70	0.24
71	0.23
72	0.26
73	0.23
74	0.23
75	0.22
76	0.16
77	0.14
78	0.12
79	0.13
80	0.09
81	0.11
82	0.12
83	0.12
84	0.14
85	0.19
86	0.23
87	0.23
88	0.24
89	0.25
90	0.24
91	0.24
92	0.23
93	0.19
94	0.15
95	0.14
96	0.12
97	0.09
98	0.09
99	0.08
100	0.07
101	0.06
102	0.05
103	0.09
104	0.09
105	0.12
106	0.19
107	0.21
108	0.24
109	0.29
110	0.36
111	0.41
112	0.5
113	0.55
114	0.58
115	0.66
116	0.66
117	0.63
118	0.59
119	0.57
120	0.51
121	0.45
122	0.38
123	0.28
124	0.26
125	0.23
126	0.24
127	0.19
128	0.16
129	0.15
130	0.15
131	0.18
132	0.17
133	0.17
134	0.15
135	0.13
136	0.12
137	0.11
138	0.1
139	0.07
140	0.06
141	0.06
142	0.06
143	0.06
144	0.05
145	0.04
146	0.05
147	0.05
148	0.05
149	0.05
150	0.05
151	0.05
152	0.05
153	0.06
154	0.06
155	0.08
156	0.1
157	0.15
158	0.19
159	0.19
160	0.2
161	0.21
162	0.28
163	0.33
164	0.39
165	0.39
166	0.37
167	0.4
168	0.42
169	0.4
170	0.33
171	0.27
172	0.2
173	0.15
174	0.14
175	0.11
176	0.08
177	0.07
178	0.08
179	0.08
180	0.11
181	0.1
182	0.1
183	0.11
184	0.19
185	0.19
186	0.19
187	0.19
188	0.19
189	0.2
190	0.2
191	0.18
192	0.11
193	0.1
194	0.1
195	0.09
196	0.06
197	0.05
198	0.05
199	0.04
200	0.04
201	0.04
202	0.04
203	0.04
204	0.04
205	0.04
206	0.04
207	0.04
208	0.04
209	0.03
210	0.04
211	0.04
212	0.03
213	0.04
214	0.04
215	0.04
216	0.05
217	0.06
218	0.05
219	0.06
220	0.06
221	0.06
222	0.06
223	0.06
224	0.05
225	0.05
226	0.05
227	0.05
228	0.05
229	0.05
230	0.05
231	0.05
232	0.04
233	0.04
234	0.04
235	0.05
236	0.05
237	0.05
238	0.06
239	0.07
240	0.07
241	0.07
242	0.07
243	0.08
244	0.12
245	0.12
246	0.16
247	0.2
248	0.22
249	0.26
250	0.29
251	0.29
252	0.27
253	0.3
254	0.28
255	0.31
256	0.3
257	0.3
258	0.29
259	0.29
260	0.33
261	0.31
262	0.31
263	0.27
264	0.27
265	0.23
266	0.23
267	0.22
268	0.16
269	0.17
270	0.15
271	0.15
272	0.18
273	0.19
274	0.2
275	0.2
276	0.2
277	0.2
278	0.22
279	0.2
280	0.16
281	0.15
282	0.13
283	0.13
284	0.13
285	0.15
286	0.1
287	0.1
288	0.11
289	0.11
290	0.12
291	0.12
292	0.13
293	0.13
294	0.17
295	0.2
296	0.22
297	0.28
298	0.31
299	0.34
300	0.37
301	0.41
302	0.41
303	0.45
304	0.47
305	0.39
306	0.35
307	0.32
308	0.28
309	0.23
310	0.18
311	0.13
312	0.11
313	0.12
314	0.13
315	0.13
316	0.13
317	0.14
318	0.14
319	0.13
320	0.13
321	0.12
322	0.13
323	0.13
324	0.11
325	0.1
326	0.1
327	0.14
328	0.14
329	0.18
330	0.25
331	0.35
332	0.42
333	0.47
334	0.56
335	0.63
336	0.71
337	0.76
338	0.79
339	0.79
340	0.81
341	0.82
342	0.73
343	0.65
344	0.55
345	0.44
346	0.35
347	0.25
348	0.18
349	0.14
350	0.13
351	0.12
352	0.13
353	0.13
354	0.12
355	0.12
356	0.12
357	0.14
358	0.15
359	0.15
360	0.15
361	0.17
362	0.2
363	0.21
364	0.2
365	0.19
366	0.18
367	0.18
368	0.16
369	0.18
370	0.14
371	0.15
372	0.13
373	0.12
374	0.11
375	0.11
376	0.1
377	0.07
378	0.08
379	0.07
380	0.07
381	0.08
382	0.07
383	0.07
384	0.08
385	0.08
386	0.06
387	0.06
388	0.05
389	0.05
390	0.05
391	0.05
392	0.04
393	0.04
394	0.04
395	0.04
396	0.04
397	0.03
398	0.03
399	0.04
400	0.04
401	0.05
402	0.08
403	0.09
404	0.09
405	0.1
406	0.11
407	0.13
408	0.19
409	0.23
410	0.22
411	0.24
412	0.28
413	0.3
414	0.31
415	0.33
416	0.37
417	0.36
418	0.38
419	0.39
420	0.37
421	0.35
422	0.36
423	0.31
424	0.24
425	0.24
426	0.19
427	0.18
428	0.16
429	0.15
430	0.13
431	0.14
432	0.15
433	0.11
434	0.13
435	0.14
436	0.18
437	0.23
438	0.31
439	0.38
440	0.45
441	0.54
442	0.63
443	0.69
444	0.75
445	0.81
446	0.83
447	0.86
448	0.88
449	0.88
450	0.86
451	0.87
452	0.83
453	0.81
454	0.79
455	0.72
456	0.64
457	0.54
458	0.47
459	0.37
460	0.31
461	0.22
462	0.14
463	0.1
464	0.07
465	0.07
466	0.06
467	0.05
468	0.06
469	0.06
470	0.09
471	0.13
472	0.16
473	0.18
474	0.22
475	0.26

A0A0U1LWC2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer