Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0U1M5U4

Protein Details
Accession A0A0U1M5U4    Localization Confidence High Confidence Score 16.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
373-400LSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGFIDIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
381-391FTKEKNKKKRG
Subcellular Location(s) nucl 23, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MASKKIQKNAGSSKATKAPKDSASKTKVESPPGPLVAAVASFLSDFGYASASRALLKEEKERNGKDVSSDNKPAAPSLLTLFSTWQASNDKDADKESQSSDSDSSSDSDDSSDSESEAEAKSGSDVEMDDAPALKKEFVDEESTSESSSSDSSSSSDSSSDEESEEDVPPVKSAGVKRKAEDEDETKPLSTKRNKTAKVSKSVSTESSSSESSSSSESSSSSSESDSDSDSDSDSDSDSDSDDSDSAEALKEAAKKPLPESDDSSSESSSDSDDSSSDSSDDESEQKANAGNDSSDSSSTLASTASKSDSKIPKKEIKSESFNSVPLPPDPQIKKKHTGARPTRLAAASALPHDHPSNAYVNYAYAERAYNDLSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGFIDIGPSQHSFKFED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.66
3 0.6
4 0.56
5 0.54
6 0.54
7 0.61
8 0.61
9 0.62
10 0.62
11 0.63
12 0.6
13 0.63
14 0.6
15 0.59
16 0.56
17 0.53
18 0.54
19 0.51
20 0.48
21 0.38
22 0.33
23 0.26
24 0.22
25 0.15
26 0.07
27 0.06
28 0.06
29 0.06
30 0.06
31 0.06
32 0.06
33 0.06
34 0.08
35 0.08
36 0.09
37 0.11
38 0.1
39 0.12
40 0.12
41 0.16
42 0.18
43 0.21
44 0.3
45 0.35
46 0.43
47 0.51
48 0.52
49 0.52
50 0.51
51 0.48
52 0.43
53 0.43
54 0.4
55 0.39
56 0.41
57 0.39
58 0.37
59 0.37
60 0.34
61 0.28
62 0.24
63 0.17
64 0.16
65 0.17
66 0.15
67 0.15
68 0.16
69 0.16
70 0.17
71 0.16
72 0.16
73 0.17
74 0.17
75 0.21
76 0.23
77 0.23
78 0.22
79 0.24
80 0.25
81 0.24
82 0.26
83 0.23
84 0.24
85 0.23
86 0.24
87 0.23
88 0.2
89 0.18
90 0.17
91 0.16
92 0.14
93 0.14
94 0.11
95 0.11
96 0.1
97 0.11
98 0.12
99 0.11
100 0.09
101 0.09
102 0.09
103 0.1
104 0.1
105 0.09
106 0.07
107 0.07
108 0.07
109 0.07
110 0.07
111 0.06
112 0.06
113 0.07
114 0.08
115 0.08
116 0.08
117 0.08
118 0.09
119 0.1
120 0.1
121 0.09
122 0.08
123 0.09
124 0.11
125 0.12
126 0.16
127 0.15
128 0.17
129 0.2
130 0.2
131 0.19
132 0.17
133 0.16
134 0.12
135 0.12
136 0.1
137 0.07
138 0.07
139 0.08
140 0.09
141 0.1
142 0.09
143 0.1
144 0.09
145 0.11
146 0.11
147 0.11
148 0.1
149 0.09
150 0.1
151 0.11
152 0.11
153 0.1
154 0.1
155 0.1
156 0.09
157 0.09
158 0.08
159 0.1
160 0.14
161 0.23
162 0.3
163 0.32
164 0.33
165 0.39
166 0.4
167 0.4
168 0.39
169 0.34
170 0.29
171 0.31
172 0.31
173 0.24
174 0.24
175 0.24
176 0.28
177 0.32
178 0.34
179 0.41
180 0.5
181 0.52
182 0.59
183 0.67
184 0.65
185 0.66
186 0.62
187 0.56
188 0.5
189 0.49
190 0.43
191 0.35
192 0.3
193 0.22
194 0.21
195 0.18
196 0.15
197 0.13
198 0.12
199 0.1
200 0.11
201 0.1
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.09
206 0.09
207 0.1
208 0.09
209 0.09
210 0.09
211 0.09
212 0.1
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.08
220 0.08
221 0.07
222 0.07
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.07
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.07
238 0.11
239 0.12
240 0.17
241 0.19
242 0.2
243 0.21
244 0.27
245 0.27
246 0.26
247 0.3
248 0.28
249 0.29
250 0.31
251 0.31
252 0.25
253 0.22
254 0.2
255 0.15
256 0.13
257 0.11
258 0.08
259 0.07
260 0.07
261 0.09
262 0.09
263 0.09
264 0.09
265 0.08
266 0.08
267 0.09
268 0.1
269 0.1
270 0.11
271 0.11
272 0.11
273 0.11
274 0.13
275 0.13
276 0.13
277 0.12
278 0.11
279 0.12
280 0.14
281 0.14
282 0.12
283 0.13
284 0.12
285 0.11
286 0.11
287 0.1
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.09
292 0.12
293 0.13
294 0.14
295 0.23
296 0.32
297 0.39
298 0.45
299 0.51
300 0.57
301 0.61
302 0.7
303 0.69
304 0.67
305 0.67
306 0.64
307 0.63
308 0.55
309 0.51
310 0.43
311 0.37
312 0.32
313 0.25
314 0.26
315 0.21
316 0.29
317 0.33
318 0.39
319 0.46
320 0.51
321 0.57
322 0.61
323 0.69
324 0.67
325 0.73
326 0.75
327 0.76
328 0.76
329 0.71
330 0.69
331 0.6
332 0.53
333 0.44
334 0.37
335 0.29
336 0.24
337 0.24
338 0.18
339 0.21
340 0.2
341 0.2
342 0.17
343 0.18
344 0.2
345 0.19
346 0.19
347 0.17
348 0.17
349 0.17
350 0.17
351 0.15
352 0.12
353 0.12
354 0.12
355 0.14
356 0.15
357 0.14
358 0.14
359 0.15
360 0.16
361 0.18
362 0.19
363 0.19
364 0.21
365 0.21
366 0.28
367 0.35
368 0.43
369 0.51
370 0.6
371 0.68
372 0.76
373 0.85
374 0.87
375 0.9
376 0.91
377 0.9
378 0.91
379 0.87
380 0.86
381 0.83
382 0.79
383 0.68
384 0.58
385 0.54
386 0.44
387 0.38
388 0.3
389 0.25
390 0.24
391 0.25