Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0U1M8P0

Protein Details
Accession A0A0U1M8P0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
37-57TAEPIRSRKRVRQSVDEIKSEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
559-595QGRARGRGTGGRDRGGPQRGGPQGGQGRGANRGPSTR
Subcellular Location(s) cyto 11.5, cyto_nucl 10.5, nucl 8.5, pero 3, mito 2, cysk 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR025696  rRNA_proc-arch_dom  
IPR016438  SKI2-like  
IPR012961  Ski2/MTR4_C  
IPR040801  Ski2_N  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0006401  P:RNA catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF08148  DSHCT  
PF00271  Helicase_C  
PF13234  rRNA_proc-arch  
PF17911  Ski2_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18795  SF2_C_Ski2  
Amino Acid Sequences MMVDSLSSSLAELQLNADQLTAADFDARLVDQENNATAEPIRSRKRVRQSVDEIKSELENEFLTPSPIFSPDWLNRLQRRWDVSTDYRDLFEIDPTQTRTIIRFNREGLQGRVTGYHEVTVPAASATAKNSTSLLRRPAARADFVRGAAGFFPFSPGGLEGVEAIAEMESEIQASEKERVGGKQGLDRIINFGSEGGLLEIPPGFSRGMKFEEPKSSAAEEDNKDVEETLAREEEGIATESPRVEQEGQVAGDDEDEFMSEDDEQDIDSLLPVEFSAFEPRSQLLAATAQKGGREWAHVVDVNKEITNFHDLVPDMAKEWPFELDTFQKEAVYHLENGDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAAKHMTKAIYTSPIKALSNQKFRDFRNTFDDVGILTGDVQISPESSCLIMTTEILRSMLYRGADLIRDVEFVIFDEVHYVNDMERGVVWEEVIIMLPEHVTLILLSATVPNTYEFASWVGRTKKKDIYVISTAKRPVPLEHYLWAGKSMHKIVDSNKKFIEKGWKEADDILSGRDKVKAQKAADAQAQSQASQRGAPQGRARGRGTGGRDRGGPQRGGPQGGQGRGANRGPSTRGSGNIARTGRGGGRTSAAQDRNVWVHLVQHLRKENLLPGCIFVFSKKRCEENANSLSNQDFCTASEKSAIHMIIEKSLARLKPEDRILPQILRLRELLSRGVAVHHGGLLPIMKEIVEILFAKTLVKVLFATETFAMGLNLPTRTVVFSGFRKHDGKGFRDLLAGEYTQMAGRAGRRGLDTVGSVIIVTSGRDEAPPAGALRRMILGDPTKLRSQFRLTYNMILNLLRVEALKIEEMIKRSFSENATQALLPEHEKQVQLSEASLAKIKREPCSYCDVDLETCHQAAVDYEKLTRDLHLGLLTSPVGKRLFTIKRLVVYRKDGIRTAGVIVREGIGSGEPNIQVLEIGAVSDKRHQSDILPFLPTFRHLFRNLPTKSEGMTLKVLRVPLVDVECVTNTLVKVGGPIWYLNIKKEALKFGDKELSKHCASWEDSTWDELDWARVKELQVRDILNQRQAQAAIAQSCQCLSCPHFLKHFEMQHDEWQVKENISQLRQLMSDQNLQLLPDYQQRVEVLRELGFVDEESRVQLKGKVACEIHSADELVLTELILENVLAEYEPEEIVALLSAFVFQEKTENEPTLTPQLEKGREAIVRIADKVNDFQILHQVILSSEDSNDFTSKPRFGLVEVVYEWAKGMSFNRITDLTDVMEGTIVRTITRLDETCREVKNASKLVGDPTLYTKMQQAQEMIKRDVIFAASLYM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.14
3 0.14
4 0.13
5 0.11
6 0.1
7 0.12
8 0.1
9 0.08
10 0.08
11 0.08
12 0.08
13 0.1
14 0.1
15 0.1
16 0.11
17 0.13
18 0.14
19 0.16
20 0.18
21 0.18
22 0.18
23 0.19
24 0.17
25 0.2
26 0.24
27 0.3
28 0.36
29 0.42
30 0.49
31 0.58
32 0.68
33 0.73
34 0.75
35 0.76
36 0.79
37 0.82
38 0.81
39 0.75
40 0.66
41 0.57
42 0.51
43 0.42
44 0.33
45 0.23
46 0.17
47 0.14
48 0.15
49 0.13
50 0.15
51 0.13
52 0.14
53 0.14
54 0.16
55 0.16
56 0.15
57 0.23
58 0.25
59 0.29
60 0.33
61 0.4
62 0.44
63 0.5
64 0.56
65 0.54
66 0.57
67 0.58
68 0.57
69 0.57
70 0.58
71 0.59
72 0.57
73 0.52
74 0.46
75 0.41
76 0.39
77 0.31
78 0.28
79 0.23
80 0.21
81 0.24
82 0.27
83 0.28
84 0.28
85 0.29
86 0.27
87 0.33
88 0.38
89 0.39
90 0.4
91 0.42
92 0.46
93 0.52
94 0.54
95 0.48
96 0.45
97 0.4
98 0.36
99 0.36
100 0.32
101 0.29
102 0.25
103 0.22
104 0.19
105 0.18
106 0.18
107 0.15
108 0.13
109 0.1
110 0.1
111 0.09
112 0.1
113 0.11
114 0.14
115 0.14
116 0.15
117 0.16
118 0.2
119 0.25
120 0.29
121 0.34
122 0.35
123 0.38
124 0.4
125 0.47
126 0.47
127 0.48
128 0.44
129 0.45
130 0.44
131 0.41
132 0.4
133 0.32
134 0.29
135 0.23
136 0.22
137 0.15
138 0.11
139 0.14
140 0.12
141 0.12
142 0.12
143 0.12
144 0.12
145 0.11
146 0.11
147 0.08
148 0.08
149 0.07
150 0.06
151 0.05
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.05
160 0.06
161 0.08
162 0.11
163 0.12
164 0.15
165 0.17
166 0.18
167 0.23
168 0.27
169 0.27
170 0.3
171 0.33
172 0.34
173 0.34
174 0.33
175 0.31
176 0.27
177 0.26
178 0.2
179 0.16
180 0.12
181 0.1
182 0.1
183 0.08
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.08
188 0.08
189 0.08
190 0.09
191 0.08
192 0.09
193 0.11
194 0.14
195 0.19
196 0.24
197 0.27
198 0.31
199 0.38
200 0.4
201 0.4
202 0.4
203 0.36
204 0.32
205 0.32
206 0.35
207 0.29
208 0.3
209 0.29
210 0.26
211 0.25
212 0.24
213 0.21
214 0.16
215 0.15
216 0.13
217 0.13
218 0.12
219 0.12
220 0.12
221 0.12
222 0.11
223 0.12
224 0.1
225 0.1
226 0.11
227 0.11
228 0.12
229 0.12
230 0.14
231 0.13
232 0.13
233 0.16
234 0.19
235 0.19
236 0.18
237 0.19
238 0.15
239 0.14
240 0.14
241 0.11
242 0.07
243 0.07
244 0.07
245 0.06
246 0.07
247 0.06
248 0.06
249 0.07
250 0.07
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.06
261 0.06
262 0.07
263 0.14
264 0.14
265 0.15
266 0.17
267 0.17
268 0.18
269 0.17
270 0.16
271 0.1
272 0.16
273 0.17
274 0.18
275 0.19
276 0.19
277 0.19
278 0.2
279 0.21
280 0.16
281 0.17
282 0.16
283 0.15
284 0.18
285 0.21
286 0.21
287 0.22
288 0.23
289 0.22
290 0.21
291 0.19
292 0.16
293 0.16
294 0.19
295 0.17
296 0.15
297 0.17
298 0.16
299 0.18
300 0.19
301 0.17
302 0.14
303 0.16
304 0.16
305 0.13
306 0.13
307 0.13
308 0.12
309 0.12
310 0.14
311 0.16
312 0.19
313 0.21
314 0.2
315 0.2
316 0.19
317 0.2
318 0.2
319 0.18
320 0.17
321 0.15
322 0.15
323 0.14
324 0.14
325 0.13
326 0.1
327 0.07
328 0.06
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.06
335 0.06
336 0.07
337 0.07
338 0.06
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.06
344 0.06
345 0.07
346 0.06
347 0.06
348 0.05
349 0.07
350 0.07
351 0.07
352 0.08
353 0.07
354 0.08
355 0.1
356 0.11
357 0.17
358 0.19
359 0.21
360 0.23
361 0.26
362 0.26
363 0.3
364 0.37
365 0.38
366 0.46
367 0.47
368 0.51
369 0.54
370 0.55
371 0.61
372 0.53
373 0.48
374 0.45
375 0.46
376 0.4
377 0.35
378 0.33
379 0.22
380 0.21
381 0.17
382 0.1
383 0.06
384 0.06
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.05
389 0.05
390 0.06
391 0.06
392 0.06
393 0.06
394 0.06
395 0.06
396 0.07
397 0.06
398 0.07
399 0.08
400 0.09
401 0.09
402 0.09
403 0.09
404 0.08
405 0.09
406 0.11
407 0.1
408 0.09
409 0.1
410 0.11
411 0.11
412 0.11
413 0.11
414 0.09
415 0.09
416 0.09
417 0.08
418 0.07
419 0.07
420 0.09
421 0.07
422 0.06
423 0.08
424 0.08
425 0.08
426 0.09
427 0.09
428 0.07
429 0.09
430 0.09
431 0.07
432 0.07
433 0.08
434 0.09
435 0.08
436 0.08
437 0.06
438 0.06
439 0.06
440 0.06
441 0.05
442 0.04
443 0.04
444 0.04
445 0.04
446 0.03
447 0.03
448 0.03
449 0.03
450 0.03
451 0.03
452 0.03
453 0.04
454 0.05
455 0.05
456 0.05
457 0.06
458 0.06
459 0.07
460 0.07
461 0.07
462 0.07
463 0.09
464 0.1
465 0.1
466 0.16
467 0.22
468 0.26
469 0.29
470 0.33
471 0.37
472 0.39
473 0.45
474 0.41
475 0.41
476 0.44
477 0.47
478 0.44
479 0.43
480 0.41
481 0.37
482 0.37
483 0.31
484 0.25
485 0.25
486 0.27
487 0.25
488 0.24
489 0.26
490 0.24
491 0.23
492 0.23
493 0.18
494 0.16
495 0.16
496 0.17
497 0.15
498 0.15
499 0.17
500 0.21
501 0.31
502 0.32
503 0.33
504 0.33
505 0.34
506 0.33
507 0.34
508 0.4
509 0.31
510 0.35
511 0.37
512 0.36
513 0.35
514 0.37
515 0.35
516 0.26
517 0.24
518 0.18
519 0.15
520 0.14
521 0.14
522 0.15
523 0.16
524 0.18
525 0.25
526 0.3
527 0.28
528 0.33
529 0.35
530 0.36
531 0.38
532 0.34
533 0.28
534 0.26
535 0.26
536 0.2
537 0.2
538 0.18
539 0.15
540 0.14
541 0.14
542 0.18
543 0.19
544 0.22
545 0.24
546 0.3
547 0.33
548 0.37
549 0.38
550 0.32
551 0.32
552 0.33
553 0.35
554 0.35
555 0.33
556 0.3
557 0.3
558 0.3
559 0.35
560 0.34
561 0.29
562 0.22
563 0.27
564 0.27
565 0.28
566 0.25
567 0.25
568 0.26
569 0.26
570 0.26
571 0.2
572 0.2
573 0.21
574 0.22
575 0.17
576 0.15
577 0.15
578 0.15
579 0.16
580 0.19
581 0.17
582 0.17
583 0.2
584 0.22
585 0.23
586 0.27
587 0.26
588 0.22
589 0.21
590 0.21
591 0.18
592 0.18
593 0.17
594 0.11
595 0.12
596 0.12
597 0.14
598 0.19
599 0.19
600 0.18
601 0.17
602 0.19
603 0.18
604 0.18
605 0.16
606 0.11
607 0.11
608 0.14
609 0.19
610 0.19
611 0.23
612 0.25
613 0.25
614 0.26
615 0.25
616 0.26
617 0.22
618 0.21
619 0.16
620 0.14
621 0.14
622 0.14
623 0.13
624 0.1
625 0.16
626 0.16
627 0.23
628 0.24
629 0.26
630 0.27
631 0.33
632 0.35
633 0.38
634 0.43
635 0.39
636 0.37
637 0.35
638 0.33
639 0.29
640 0.25
641 0.17
642 0.1
643 0.08
644 0.12
645 0.12
646 0.12
647 0.15
648 0.14
649 0.14
650 0.16
651 0.16
652 0.12
653 0.15
654 0.15
655 0.12
656 0.13
657 0.12
658 0.1
659 0.14
660 0.14
661 0.12
662 0.14
663 0.14
664 0.19
665 0.22
666 0.24
667 0.22
668 0.27
669 0.28
670 0.25
671 0.29
672 0.28
673 0.26
674 0.24
675 0.23
676 0.2
677 0.19
678 0.2
679 0.16
680 0.12
681 0.12
682 0.1
683 0.1
684 0.09
685 0.08
686 0.07
687 0.06
688 0.06
689 0.05
690 0.05
691 0.05
692 0.05
693 0.04
694 0.04
695 0.04
696 0.04
697 0.04
698 0.04
699 0.05
700 0.05
701 0.05
702 0.06
703 0.06
704 0.07
705 0.06
706 0.08
707 0.07
708 0.07
709 0.06
710 0.06
711 0.08
712 0.08
713 0.09
714 0.08
715 0.08
716 0.08
717 0.08
718 0.07
719 0.06
720 0.07
721 0.07
722 0.07
723 0.07
724 0.07
725 0.07
726 0.07
727 0.07
728 0.08
729 0.1
730 0.12
731 0.18
732 0.19
733 0.24
734 0.25
735 0.25
736 0.29
737 0.31
738 0.31
739 0.34
740 0.34
741 0.3
742 0.3
743 0.29
744 0.26
745 0.22
746 0.19
747 0.11
748 0.09
749 0.09
750 0.08
751 0.08
752 0.06
753 0.06
754 0.07
755 0.1
756 0.1
757 0.11
758 0.11
759 0.12
760 0.12
761 0.12
762 0.11
763 0.09
764 0.09
765 0.08
766 0.07
767 0.06
768 0.06
769 0.05
770 0.04
771 0.04
772 0.05
773 0.05
774 0.05
775 0.06
776 0.06
777 0.07
778 0.08
779 0.08
780 0.08
781 0.09
782 0.09
783 0.09
784 0.1
785 0.09
786 0.09
787 0.12
788 0.13
789 0.15
790 0.17
791 0.19
792 0.21
793 0.24
794 0.25
795 0.24
796 0.28
797 0.32
798 0.33
799 0.37
800 0.36
801 0.38
802 0.38
803 0.36
804 0.32
805 0.25
806 0.22
807 0.15
808 0.13
809 0.09
810 0.07
811 0.06
812 0.05
813 0.06
814 0.06
815 0.07
816 0.09
817 0.11
818 0.13
819 0.14
820 0.14
821 0.15
822 0.16
823 0.18
824 0.17
825 0.2
826 0.2
827 0.2
828 0.21
829 0.2
830 0.19
831 0.17
832 0.17
833 0.15
834 0.15
835 0.15
836 0.16
837 0.16
838 0.16
839 0.17
840 0.17
841 0.14
842 0.12
843 0.12
844 0.11
845 0.12
846 0.15
847 0.13
848 0.14
849 0.18
850 0.2
851 0.23
852 0.28
853 0.29
854 0.29
855 0.37
856 0.37
857 0.35
858 0.33
859 0.3
860 0.25
861 0.24
862 0.24
863 0.18
864 0.16
865 0.14
866 0.12
867 0.11
868 0.1
869 0.14
870 0.12
871 0.12
872 0.13
873 0.14
874 0.15
875 0.16
876 0.16
877 0.13
878 0.11
879 0.12
880 0.11
881 0.11
882 0.1
883 0.11
884 0.1
885 0.1
886 0.1
887 0.12
888 0.12
889 0.11
890 0.12
891 0.2
892 0.25
893 0.27
894 0.33
895 0.31
896 0.37
897 0.42
898 0.46
899 0.42
900 0.43
901 0.46
902 0.44
903 0.44
904 0.4
905 0.37
906 0.34
907 0.29
908 0.26
909 0.23
910 0.18
911 0.16
912 0.15
913 0.13
914 0.11
915 0.1
916 0.08
917 0.06
918 0.06
919 0.07
920 0.09
921 0.08
922 0.09
923 0.09
924 0.08
925 0.08
926 0.07
927 0.06
928 0.04
929 0.04
930 0.05
931 0.06
932 0.07
933 0.13
934 0.15
935 0.16
936 0.17
937 0.18
938 0.2
939 0.26
940 0.31
941 0.28
942 0.29
943 0.27
944 0.27
945 0.27
946 0.27
947 0.23
948 0.2
949 0.23
950 0.22
951 0.26
952 0.31
953 0.4
954 0.39
955 0.39
956 0.39
957 0.35
958 0.34
959 0.35
960 0.3
961 0.23
962 0.28
963 0.25
964 0.25
965 0.26
966 0.25
967 0.2
968 0.2
969 0.17
970 0.15
971 0.16
972 0.14
973 0.12
974 0.14
975 0.13
976 0.14
977 0.13
978 0.11
979 0.09
980 0.09
981 0.09
982 0.08
983 0.08
984 0.08
985 0.1
986 0.09
987 0.1
988 0.11
989 0.17
990 0.18
991 0.19
992 0.22
993 0.21
994 0.24
995 0.27
996 0.3
997 0.29
998 0.34
999 0.34
1000 0.35
1001 0.42
1002 0.39
1003 0.39
1004 0.37
1005 0.38
1006 0.34
1007 0.33
1008 0.3
1009 0.27
1010 0.29
1011 0.31
1012 0.3
1013 0.28
1014 0.28
1015 0.29
1016 0.28
1017 0.22
1018 0.2
1019 0.16
1020 0.17
1021 0.17
1022 0.17
1023 0.17
1024 0.19
1025 0.2
1026 0.26
1027 0.28
1028 0.27
1029 0.27
1030 0.28
1031 0.31
1032 0.37
1033 0.4
1034 0.39
1035 0.39
1036 0.36
1037 0.35
1038 0.33
1039 0.3
1040 0.24
1041 0.24
1042 0.19
1043 0.18
1044 0.18
1045 0.16
1046 0.16
1047 0.16
1048 0.14
1049 0.14
1050 0.15
1051 0.22
1052 0.27
1053 0.3
1054 0.35
1055 0.38
1056 0.43
1057 0.48
1058 0.51
1059 0.46
1060 0.47
1061 0.46
1062 0.47
1063 0.49
1064 0.43
1065 0.35
1066 0.34
1067 0.32
1068 0.27
1069 0.25
1070 0.24
1071 0.26
1072 0.27
1073 0.3
1074 0.26
1075 0.27
1076 0.26
1077 0.27
1078 0.27
1079 0.24
1080 0.28
1081 0.25
1082 0.27
1083 0.25
1084 0.25
1085 0.24
1086 0.2
1087 0.19
1088 0.2
1089 0.23
1090 0.2
1091 0.22
1092 0.23
1093 0.24
1094 0.25
1095 0.25
1096 0.21
1097 0.18
1098 0.19
1099 0.17
1100 0.17
1101 0.15
1102 0.13
1103 0.12
1104 0.1
1105 0.1
1106 0.12
1107 0.12
1108 0.12
1109 0.13
1110 0.17
1111 0.21
1112 0.26
1113 0.27
1114 0.31
1115 0.31
1116 0.32
1117 0.35
1118 0.33
1119 0.3
1120 0.25
1121 0.24
1122 0.17
1123 0.17
1124 0.16
1125 0.13
1126 0.11
1127 0.09
1128 0.07
1129 0.07
1130 0.07
1131 0.06
1132 0.05
1133 0.04
1134 0.04
1135 0.05
1136 0.04
1137 0.04
1138 0.05
1139 0.06
1140 0.06
1141 0.06
1142 0.06
1143 0.06
1144 0.06
1145 0.06
1146 0.06
1147 0.04
1148 0.04
1149 0.05
1150 0.05
1151 0.05
1152 0.06
1153 0.05
1154 0.1
1155 0.11
1156 0.17
1157 0.21
1158 0.23
1159 0.24
1160 0.25
1161 0.29
1162 0.31
1163 0.32
1164 0.27
1165 0.29
1166 0.35
1167 0.37
1168 0.37
1169 0.34
1170 0.33
1171 0.32
1172 0.33
1173 0.31
1174 0.3
1175 0.29
1176 0.31
1177 0.32
1178 0.28
1179 0.29
1180 0.29
1181 0.27
1182 0.25
1183 0.23
1184 0.21
1185 0.27
1186 0.26
1187 0.24
1188 0.22
1189 0.2
1190 0.16
1191 0.19
1192 0.2
1193 0.12
1194 0.11
1195 0.13
1196 0.14
1197 0.16
1198 0.17
1199 0.15
1200 0.18
1201 0.23
1202 0.24
1203 0.23
1204 0.25
1205 0.23
1206 0.23
1207 0.3
1208 0.27
1209 0.27
1210 0.26
1211 0.28
1212 0.25
1213 0.24
1214 0.23
1215 0.15
1216 0.14
1217 0.1
1218 0.12
1219 0.18
1220 0.21
1221 0.22
1222 0.25
1223 0.26
1224 0.28
1225 0.28
1226 0.28
1227 0.2
1228 0.18
1229 0.17
1230 0.14
1231 0.14
1232 0.12
1233 0.11
1234 0.13
1235 0.11
1236 0.1
1237 0.11
1238 0.12
1239 0.13
1240 0.19
1241 0.2
1242 0.22
1243 0.28
1244 0.34
1245 0.4
1246 0.42
1247 0.42
1248 0.38
1249 0.43
1250 0.47
1251 0.47
1252 0.43
1253 0.39
1254 0.38
1255 0.4
1256 0.43
1257 0.37
1258 0.3
1259 0.29
1260 0.33
1261 0.3
1262 0.29
1263 0.3
1264 0.33
1265 0.35
1266 0.36
1267 0.35
1268 0.38
1269 0.45
1270 0.51
1271 0.48
1272 0.45
1273 0.42
1274 0.4
1275 0.38
1276 0.3
1277 0.23