FuNGI

A0A0U1M006

Protein Details

Accession

A0A0U1M006

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-22	MSSSRLSVGPRRRRRVDDDSES	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027417 P-loop_NTPase IPR003395 RecF/RecN/SMC_N IPR027131 SMC5
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0030915 C:Smc5-Smc6 complex GO:0005524 F:ATP binding GO:0016887 F:ATP hydrolysis activity GO:0000724 P:double-strand break repair via homologous recombination
Pfam	View protein in Pfam PF02463 SMC_N

Amino Acid Sequences

MSSSRLSVGPRRRRRVDDDSESQDERSTRGTTPFSQSSNGSKRPRIEAPDETDTNASQNEDNDEDDAGRPVQKVPLTRAGLPDGYSTHGDFQPGAIVRIKLTDFVTYTSAEFFPGPKLNMVIGPNGTGKSTLVCAICLGLGWGPQHLGRAKEASEFVKHGCKEAVIEIELARGPPFDTNPIIRRTIKHDGNKNTFTINGKEANKNQVLKLAKKFSIQVDNLCQFLPQDKVSEFAALSPVELLHSTQRAAAGSQMIEWHDALKKLRAKQKKLLLDNKGDRDSLTNLENRQELQRADVERMREREQIKNRIELMEFARPVVQYRDHNDSFKKLKARRARLEQELQSLTNELAPALRAVNAKQDYFRKTDDLVKYKRQKFNRAESAATELANRMEAHEDTIKDLTAQIEAEKKTGAIYRQEMSRVQQVMNRITRQMEEEPEDFDLDSYNERIRSLVREIRDLKSKAEDLKRGRSSIFEKRQELQNRIQQAENDLKNLDSHSGQQEARLKKLSSDTYRAYQWIQRNQDQFEAEVFGPALITCSINDPKYADAVESLLQRNDHLAFTTQSTKDFRTLQKALNGELRLHDVSIRNCTSRLNDLEPPLSDNELHDLGFDGWAKDYLTGPEPVVAMLCNEQFLHRTPIVLRDITDQEYTRMEKSTGINSWVSGKRSYKVNRRREYGPGATSTTVKTVRPARVWTNQPVDVSLKQELLEVISGCRDELHEVQRQIDTHRAEVERFGKEYTAKNEEKLRLEQEKSSKQSALVEFRALPERLNQQQEKKRDTERNFENVRARVLEIRSKQDQTAIEKAETAIVYADAVESLRTLHRDLLLAEIRNIEAGSDFENLKSRNVEIQNILESKKKEVEEASVAAAEAAAIGFTIKREAVKVLNVAQNKPDLHELINSRLKDITMDQLDADIDSEKAHLELTHEGSAGLIKEFEDRQKAIEKLRDKLSAYQNELADFEHAIAEIRAEWEPRLDALVEKISSAFSDSFARIGCAGQVTVDKVEDEPGPNGEQGGSDFDQWSIRIQVKFREHENLSVLDSHRQSGGERAVSTIFYLMALQSLSASPFRVVDEINQGMDPRNERMVHERMVDIACAPRTPAEGDADGVGGTGGSQYFLITPKLLSGLVYKPGMKVLCIVSGEHVPSDYTKIDFGRAIQTMSKITGIPVRSTANGTTNDKGKGRAVDNERARPRVGLRA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.81
2	0.82
3	0.82
4	0.8
5	0.78
6	0.76
7	0.74
8	0.68
9	0.59
10	0.53
11	0.44
12	0.36
13	0.31
14	0.27
15	0.24
16	0.28
17	0.32
18	0.33
19	0.4
20	0.44
21	0.42
22	0.42
23	0.42
24	0.47
25	0.51
26	0.55
27	0.54
28	0.55
29	0.58
30	0.62
31	0.66
32	0.63
33	0.61
34	0.6
35	0.61
36	0.63
37	0.59
38	0.55
39	0.49
40	0.42
41	0.37
42	0.3
43	0.24
44	0.17
45	0.18
46	0.2
47	0.19
48	0.2
49	0.19
50	0.19
51	0.18
52	0.17
53	0.18
54	0.15
55	0.16
56	0.16
57	0.17
58	0.21
59	0.24
60	0.27
61	0.31
62	0.39
63	0.41
64	0.42
65	0.44
66	0.43
67	0.41
68	0.38
69	0.34
70	0.25
71	0.24
72	0.24
73	0.22
74	0.22
75	0.21
76	0.21
77	0.19
78	0.18
79	0.22
80	0.21
81	0.22
82	0.21
83	0.2
84	0.2
85	0.23
86	0.24
87	0.19
88	0.2
89	0.21
90	0.18
91	0.2
92	0.21
93	0.19
94	0.19
95	0.19
96	0.18
97	0.16
98	0.15
99	0.14
100	0.18
101	0.21
102	0.22
103	0.2
104	0.22
105	0.21
106	0.25
107	0.25
108	0.23
109	0.2
110	0.21
111	0.21
112	0.2
113	0.2
114	0.16
115	0.15
116	0.13
117	0.14
118	0.16
119	0.14
120	0.14
121	0.13
122	0.13
123	0.13
124	0.11
125	0.11
126	0.07
127	0.09
128	0.09
129	0.1
130	0.11
131	0.11
132	0.16
133	0.19
134	0.2
135	0.2
136	0.23
137	0.23
138	0.25
139	0.28
140	0.26
141	0.27
142	0.27
143	0.27
144	0.32
145	0.31
146	0.3
147	0.28
148	0.25
149	0.24
150	0.25
151	0.25
152	0.18
153	0.19
154	0.16
155	0.17
156	0.17
157	0.16
158	0.13
159	0.1
160	0.1
161	0.11
162	0.13
163	0.14
164	0.18
165	0.23
166	0.28
167	0.31
168	0.36
169	0.36
170	0.38
171	0.42
172	0.48
173	0.51
174	0.55
175	0.6
176	0.65
177	0.71
178	0.71
179	0.65
180	0.56
181	0.51
182	0.46
183	0.4
184	0.34
185	0.33
186	0.34
187	0.4
188	0.42
189	0.47
190	0.49
191	0.48
192	0.44
193	0.44
194	0.45
195	0.45
196	0.49
197	0.48
198	0.45
199	0.45
200	0.48
201	0.46
202	0.49
203	0.45
204	0.42
205	0.43
206	0.42
207	0.4
208	0.37
209	0.32
210	0.23
211	0.24
212	0.22
213	0.15
214	0.17
215	0.16
216	0.18
217	0.18
218	0.2
219	0.17
220	0.14
221	0.16
222	0.12
223	0.12
224	0.11
225	0.1
226	0.09
227	0.09
228	0.1
229	0.1
230	0.12
231	0.12
232	0.12
233	0.14
234	0.14
235	0.13
236	0.14
237	0.13
238	0.12
239	0.12
240	0.13
241	0.12
242	0.13
243	0.12
244	0.13
245	0.13
246	0.16
247	0.18
248	0.24
249	0.29
250	0.35
251	0.44
252	0.52
253	0.56
254	0.62
255	0.7
256	0.72
257	0.75
258	0.77
259	0.75
260	0.76
261	0.76
262	0.74
263	0.67
264	0.58
265	0.49
266	0.43
267	0.38
268	0.3
269	0.26
270	0.23
271	0.22
272	0.25
273	0.25
274	0.23
275	0.24
276	0.25
277	0.22
278	0.21
279	0.25
280	0.24
281	0.27
282	0.29
283	0.3
284	0.32
285	0.37
286	0.38
287	0.38
288	0.4
289	0.45
290	0.51
291	0.57
292	0.54
293	0.55
294	0.52
295	0.49
296	0.46
297	0.4
298	0.36
299	0.33
300	0.3
301	0.25
302	0.25
303	0.22
304	0.24
305	0.24
306	0.24
307	0.21
308	0.25
309	0.33
310	0.34
311	0.37
312	0.38
313	0.41
314	0.41
315	0.43
316	0.47
317	0.44
318	0.51
319	0.57
320	0.65
321	0.67
322	0.73
323	0.74
324	0.73
325	0.76
326	0.7
327	0.66
328	0.58
329	0.49
330	0.4
331	0.33
332	0.26
333	0.19
334	0.16
335	0.09
336	0.07
337	0.07
338	0.07
339	0.07
340	0.09
341	0.09
342	0.1
343	0.18
344	0.2
345	0.2
346	0.24
347	0.29
348	0.3
349	0.32
350	0.34
351	0.28
352	0.29
353	0.36
354	0.4
355	0.43
356	0.45
357	0.52
358	0.6
359	0.67
360	0.72
361	0.71
362	0.73
363	0.72
364	0.77
365	0.77
366	0.7
367	0.62
368	0.56
369	0.55
370	0.46
371	0.38
372	0.28
373	0.19
374	0.16
375	0.16
376	0.14
377	0.09
378	0.1
379	0.1
380	0.13
381	0.15
382	0.15
383	0.16
384	0.16
385	0.15
386	0.13
387	0.14
388	0.11
389	0.09
390	0.09
391	0.08
392	0.13
393	0.13
394	0.14
395	0.13
396	0.13
397	0.13
398	0.16
399	0.17
400	0.16
401	0.18
402	0.2
403	0.22
404	0.24
405	0.24
406	0.24
407	0.28
408	0.25
409	0.23
410	0.23
411	0.25
412	0.3
413	0.34
414	0.32
415	0.27
416	0.26
417	0.26
418	0.28
419	0.26
420	0.22
421	0.22
422	0.21
423	0.21
424	0.21
425	0.2
426	0.16
427	0.14
428	0.12
429	0.08
430	0.09
431	0.09
432	0.1
433	0.1
434	0.1
435	0.1
436	0.11
437	0.13
438	0.18
439	0.21
440	0.21
441	0.27
442	0.31
443	0.33
444	0.41
445	0.38
446	0.34
447	0.34
448	0.35
449	0.35
450	0.37
451	0.41
452	0.38
453	0.47
454	0.48
455	0.45
456	0.43
457	0.4
458	0.4
459	0.43
460	0.48
461	0.44
462	0.45
463	0.47
464	0.55
465	0.57
466	0.56
467	0.52
468	0.48
469	0.46
470	0.44
471	0.43
472	0.34
473	0.33
474	0.36
475	0.3
476	0.26
477	0.21
478	0.2
479	0.19
480	0.19
481	0.17
482	0.09
483	0.11
484	0.11
485	0.15
486	0.15
487	0.18
488	0.25
489	0.25
490	0.27
491	0.29
492	0.27
493	0.25
494	0.3
495	0.33
496	0.29
497	0.33
498	0.33
499	0.32
500	0.33
501	0.32
502	0.29
503	0.28
504	0.3
505	0.32
506	0.35
507	0.38
508	0.4
509	0.41
510	0.42
511	0.37
512	0.31
513	0.24
514	0.22
515	0.16
516	0.13
517	0.11
518	0.08
519	0.07
520	0.07
521	0.07
522	0.05
523	0.05
524	0.05
525	0.08
526	0.11
527	0.11
528	0.12
529	0.12
530	0.12
531	0.12
532	0.12
533	0.09
534	0.07
535	0.08
536	0.09
537	0.11
538	0.11
539	0.11
540	0.11
541	0.11
542	0.12
543	0.12
544	0.1
545	0.09
546	0.09
547	0.09
548	0.11
549	0.16
550	0.15
551	0.16
552	0.18
553	0.19
554	0.2
555	0.24
556	0.24
557	0.26
558	0.29
559	0.29
560	0.31
561	0.31
562	0.3
563	0.31
564	0.29
565	0.22
566	0.2
567	0.21
568	0.16
569	0.15
570	0.16
571	0.14
572	0.14
573	0.19
574	0.2
575	0.17
576	0.17
577	0.18
578	0.18
579	0.19
580	0.21
581	0.2
582	0.21
583	0.22
584	0.23
585	0.22
586	0.22
587	0.18
588	0.16
589	0.12
590	0.1
591	0.1
592	0.1
593	0.09
594	0.08
595	0.08
596	0.07
597	0.08
598	0.08
599	0.06
600	0.06
601	0.07
602	0.07
603	0.06
604	0.07
605	0.07
606	0.08
607	0.09
608	0.09
609	0.09
610	0.09
611	0.09
612	0.08
613	0.07
614	0.06
615	0.06
616	0.06
617	0.05
618	0.06
619	0.06
620	0.07
621	0.09
622	0.13
623	0.12
624	0.13
625	0.13
626	0.18
627	0.2
628	0.19
629	0.17
630	0.16
631	0.18
632	0.19
633	0.21
634	0.16
635	0.15
636	0.17
637	0.17
638	0.15
639	0.14
640	0.12
641	0.14
642	0.15
643	0.18
644	0.17
645	0.18
646	0.17
647	0.16
648	0.22
649	0.22
650	0.22
651	0.22
652	0.22
653	0.23
654	0.3
655	0.38
656	0.42
657	0.49
658	0.58
659	0.61
660	0.64
661	0.65
662	0.63
663	0.63
664	0.57
665	0.49
666	0.41
667	0.36
668	0.32
669	0.3
670	0.24
671	0.21
672	0.17
673	0.15
674	0.17
675	0.21
676	0.25
677	0.26
678	0.3
679	0.32
680	0.37
681	0.42
682	0.43
683	0.42
684	0.4
685	0.37
686	0.35
687	0.33
688	0.27
689	0.25
690	0.21
691	0.16
692	0.14
693	0.15
694	0.13
695	0.1
696	0.1
697	0.08
698	0.07
699	0.07
700	0.07
701	0.06
702	0.07
703	0.06
704	0.08
705	0.11
706	0.15
707	0.2
708	0.2
709	0.22
710	0.23
711	0.24
712	0.23
713	0.26
714	0.23
715	0.19
716	0.22
717	0.22
718	0.2
719	0.24
720	0.27
721	0.22
722	0.22
723	0.21
724	0.18
725	0.2
726	0.24
727	0.24
728	0.28
729	0.27
730	0.29
731	0.35
732	0.37
733	0.38
734	0.37
735	0.38
736	0.36
737	0.37
738	0.39
739	0.41
740	0.44
741	0.44
742	0.44
743	0.39
744	0.34
745	0.38
746	0.37
747	0.35
748	0.28
749	0.26
750	0.24
751	0.25
752	0.28
753	0.23
754	0.2
755	0.18
756	0.22
757	0.26
758	0.33
759	0.35
760	0.39
761	0.46
762	0.53
763	0.54
764	0.53
765	0.56
766	0.58
767	0.59
768	0.59
769	0.58
770	0.6
771	0.58
772	0.58
773	0.56
774	0.48
775	0.45
776	0.37
777	0.32
778	0.27
779	0.28
780	0.3
781	0.27
782	0.31
783	0.34
784	0.34
785	0.33
786	0.33
787	0.34
788	0.32
789	0.35
790	0.32
791	0.28
792	0.27
793	0.26
794	0.24
795	0.21
796	0.16
797	0.1
798	0.07
799	0.07
800	0.06
801	0.06
802	0.04
803	0.04
804	0.04
805	0.03
806	0.05
807	0.06
808	0.08
809	0.09
810	0.1
811	0.11
812	0.12
813	0.12
814	0.17
815	0.2
816	0.19
817	0.19
818	0.18
819	0.17
820	0.17
821	0.16
822	0.1
823	0.06
824	0.06
825	0.08
826	0.09
827	0.09
828	0.09
829	0.14
830	0.15
831	0.16
832	0.17
833	0.16
834	0.22
835	0.23
836	0.25
837	0.23
838	0.24
839	0.27
840	0.28
841	0.28
842	0.25
843	0.25
844	0.25
845	0.28
846	0.26
847	0.24
848	0.24
849	0.26
850	0.25
851	0.25
852	0.23
853	0.17
854	0.17
855	0.15
856	0.13
857	0.09
858	0.05
859	0.04
860	0.02
861	0.02
862	0.02
863	0.03
864	0.03
865	0.05
866	0.05
867	0.06
868	0.07
869	0.1
870	0.12
871	0.14
872	0.17
873	0.2
874	0.25
875	0.27
876	0.27
877	0.27
878	0.3
879	0.27
880	0.27
881	0.24
882	0.2
883	0.19
884	0.23
885	0.24
886	0.27
887	0.33
888	0.31
889	0.3
890	0.29
891	0.28
892	0.24
893	0.23
894	0.23
895	0.19
896	0.19
897	0.18
898	0.18
899	0.18
900	0.16
901	0.15
902	0.08
903	0.06
904	0.06
905	0.07
906	0.06
907	0.06
908	0.06
909	0.06
910	0.08
911	0.11
912	0.15
913	0.16
914	0.16
915	0.15
916	0.15
917	0.16
918	0.14
919	0.11
920	0.07
921	0.07
922	0.09
923	0.12
924	0.15
925	0.19
926	0.18
927	0.21
928	0.27
929	0.29
930	0.32
931	0.38
932	0.39
933	0.4
934	0.45
935	0.48
936	0.43
937	0.49
938	0.52
939	0.52
940	0.53
941	0.52
942	0.47
943	0.43
944	0.41
945	0.34
946	0.26
947	0.19
948	0.14
949	0.09
950	0.08
951	0.08
952	0.07
953	0.07
954	0.06
955	0.08
956	0.09
957	0.1
958	0.1
959	0.11
960	0.12
961	0.12
962	0.13
963	0.11
964	0.11
965	0.13
966	0.17
967	0.15
968	0.15
969	0.15
970	0.14
971	0.13
972	0.15
973	0.13
974	0.1
975	0.13
976	0.14
977	0.15
978	0.15
979	0.16
980	0.13
981	0.13
982	0.12
983	0.1
984	0.1
985	0.09
986	0.11
987	0.12
988	0.12
989	0.13
990	0.12
991	0.11
992	0.14
993	0.14
994	0.15
995	0.15
996	0.16
997	0.17
998	0.16
999	0.16
1000	0.14
1001	0.13
1002	0.12
1003	0.16
1004	0.15
1005	0.14
1006	0.15
1007	0.15
1008	0.16
1009	0.16
1010	0.18
1011	0.16
1012	0.2
1013	0.22
1014	0.24
1015	0.32
1016	0.39
1017	0.42
1018	0.43
1019	0.48
1020	0.45
1021	0.46
1022	0.47
1023	0.39
1024	0.33
1025	0.34
1026	0.32
1027	0.3
1028	0.29
1029	0.26
1030	0.24
1031	0.23
1032	0.22
1033	0.23
1034	0.27
1035	0.24
1036	0.24
1037	0.25
1038	0.24
1039	0.24
1040	0.23
1041	0.18
1042	0.13
1043	0.09
1044	0.09
1045	0.07
1046	0.07
1047	0.07
1048	0.06
1049	0.06
1050	0.07
1051	0.09
1052	0.09
1053	0.1
1054	0.1
1055	0.11
1056	0.12
1057	0.13
1058	0.13
1059	0.14
1060	0.21
1061	0.22
1062	0.22
1063	0.22
1064	0.22
1065	0.23
1066	0.26
1067	0.26
1068	0.22
1069	0.26
1070	0.26
1071	0.28
1072	0.34
1073	0.37
1074	0.37
1075	0.36
1076	0.33
1077	0.3
1078	0.3
1079	0.28
1080	0.22
1081	0.22
1082	0.19
1083	0.17
1084	0.18
1085	0.16
1086	0.17
1087	0.18
1088	0.19
1089	0.19
1090	0.18
1091	0.19
1092	0.18
1093	0.17
1094	0.15
1095	0.13
1096	0.1
1097	0.06
1098	0.05
1099	0.05
1100	0.04
1101	0.05
1102	0.05
1103	0.05
1104	0.07
1105	0.09
1106	0.11
1107	0.11
1108	0.11
1109	0.12
1110	0.14
1111	0.13
1112	0.13
1113	0.15
1114	0.17
1115	0.21
1116	0.24
1117	0.24
1118	0.23
1119	0.28
1120	0.28
1121	0.24
1122	0.24
1123	0.21
1124	0.23
1125	0.23
1126	0.23
1127	0.21
1128	0.24
1129	0.25
1130	0.22
1131	0.2
1132	0.16
1133	0.16
1134	0.2
1135	0.18
1136	0.16
1137	0.18
1138	0.19
1139	0.21
1140	0.21
1141	0.22
1142	0.25
1143	0.25
1144	0.26
1145	0.25
1146	0.27
1147	0.26
1148	0.27
1149	0.26
1150	0.19
1151	0.2
1152	0.23
1153	0.23
1154	0.22
1155	0.24
1156	0.25
1157	0.26
1158	0.29
1159	0.3
1160	0.3
1161	0.34
1162	0.36
1163	0.37
1164	0.4
1165	0.44
1166	0.42
1167	0.42
1168	0.41
1169	0.42
1170	0.41
1171	0.46
1172	0.48
1173	0.52
1174	0.59
1175	0.66
1176	0.67
1177	0.64
1178	0.62
1179	0.56

A0A0U1M006

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer