Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0U1LVZ4

Protein Details
Accession A0A0U1LVZ4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
302-334LARLGKGLRKKPKWQSKQKNKNKKAKNGLDNGEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
305-327LGKGLRKKPKWQSKQKNKNKKAK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039905  CD2BP2/Lin1  
IPR003169  GYF  
IPR035445  GYF-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005682  C:U5 snRNP  
Pfam View protein in Pfam  
PF02213  GYF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50829  GYF  
Amino Acid Sequences MSRSFRPKRAGEDYSRTHHGLEEEADGPSSKKARFDLRNPSALAPDELEDDAVLDADEIGRRGQGVRRNAVNLDGYQSDSDNEGYDVRAEARARAKKQQQEDEDEDMFADLKDDDDENGAAEPLDEDEAYRQNKKTVHFMKNEQIEGQVESSRGGRAVRVDLSDRLNESKLRAEEAESESESEVDDEERARVDTEIDEEVGAGGKKTHAPLIDAFNMRTEQEEGRFDDQGNYIRKAVDPDAIHDTWLDGLSKKDIRRAREAADKRETERREKDKENDSLLTGDLLGTLISHLQRGETVLEALARLGKGLRKKPKWQSKQKNKNKKAKNGLDNGEPANDVEMTEENPEELARKQAIEKVTGAADLLLTRGQTDIYDSEREILTRQFLRETGEEWVDPPKVEETQAPEAALGVSNTWEYRWSDARDGGETHGPYDSAMMQSWSDAGYFGEGVEFRRVGDSQHSWSRVTTFS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.68
3 0.6
4 0.51
5 0.46
6 0.39
7 0.32
8 0.28
9 0.25
10 0.21
11 0.2
12 0.21
13 0.19
14 0.18
15 0.2
16 0.23
17 0.2
18 0.23
19 0.27
20 0.37
21 0.45
22 0.52
23 0.58
24 0.61
25 0.65
26 0.64
27 0.61
28 0.54
29 0.47
30 0.41
31 0.31
32 0.25
33 0.21
34 0.18
35 0.17
36 0.13
37 0.12
38 0.1
39 0.08
40 0.07
41 0.05
42 0.05
43 0.06
44 0.07
45 0.07
46 0.07
47 0.07
48 0.08
49 0.11
50 0.16
51 0.22
52 0.29
53 0.35
54 0.38
55 0.41
56 0.41
57 0.42
58 0.4
59 0.33
60 0.29
61 0.23
62 0.21
63 0.19
64 0.19
65 0.16
66 0.15
67 0.15
68 0.12
69 0.12
70 0.1
71 0.1
72 0.1
73 0.1
74 0.1
75 0.14
76 0.14
77 0.18
78 0.26
79 0.34
80 0.37
81 0.46
82 0.53
83 0.56
84 0.64
85 0.69
86 0.65
87 0.66
88 0.67
89 0.64
90 0.56
91 0.49
92 0.4
93 0.31
94 0.26
95 0.17
96 0.12
97 0.06
98 0.06
99 0.07
100 0.07
101 0.07
102 0.08
103 0.09
104 0.08
105 0.09
106 0.08
107 0.07
108 0.06
109 0.06
110 0.05
111 0.06
112 0.05
113 0.05
114 0.08
115 0.13
116 0.16
117 0.2
118 0.21
119 0.24
120 0.28
121 0.3
122 0.39
123 0.42
124 0.48
125 0.49
126 0.54
127 0.57
128 0.59
129 0.57
130 0.47
131 0.39
132 0.32
133 0.28
134 0.24
135 0.17
136 0.12
137 0.12
138 0.12
139 0.11
140 0.11
141 0.1
142 0.1
143 0.1
144 0.13
145 0.14
146 0.15
147 0.17
148 0.19
149 0.21
150 0.21
151 0.21
152 0.2
153 0.2
154 0.19
155 0.19
156 0.21
157 0.19
158 0.2
159 0.19
160 0.18
161 0.21
162 0.23
163 0.24
164 0.18
165 0.19
166 0.17
167 0.16
168 0.15
169 0.1
170 0.08
171 0.06
172 0.06
173 0.05
174 0.06
175 0.06
176 0.07
177 0.07
178 0.07
179 0.07
180 0.07
181 0.09
182 0.09
183 0.08
184 0.08
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.05
190 0.04
191 0.05
192 0.06
193 0.07
194 0.09
195 0.09
196 0.1
197 0.12
198 0.17
199 0.21
200 0.21
201 0.2
202 0.2
203 0.2
204 0.18
205 0.17
206 0.14
207 0.1
208 0.12
209 0.14
210 0.15
211 0.17
212 0.17
213 0.17
214 0.17
215 0.17
216 0.21
217 0.22
218 0.21
219 0.19
220 0.19
221 0.19
222 0.2
223 0.19
224 0.18
225 0.15
226 0.16
227 0.21
228 0.2
229 0.2
230 0.18
231 0.17
232 0.12
233 0.13
234 0.11
235 0.06
236 0.06
237 0.1
238 0.14
239 0.14
240 0.21
241 0.24
242 0.28
243 0.34
244 0.37
245 0.37
246 0.43
247 0.47
248 0.48
249 0.51
250 0.49
251 0.45
252 0.5
253 0.49
254 0.47
255 0.51
256 0.51
257 0.51
258 0.55
259 0.58
260 0.58
261 0.6
262 0.56
263 0.48
264 0.42
265 0.35
266 0.3
267 0.24
268 0.15
269 0.11
270 0.06
271 0.05
272 0.04
273 0.03
274 0.03
275 0.05
276 0.05
277 0.06
278 0.05
279 0.06
280 0.06
281 0.07
282 0.08
283 0.07
284 0.07
285 0.07
286 0.07
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.06
291 0.06
292 0.07
293 0.1
294 0.17
295 0.26
296 0.36
297 0.41
298 0.51
299 0.61
300 0.71
301 0.79
302 0.83
303 0.86
304 0.88
305 0.92
306 0.94
307 0.95
308 0.94
309 0.94
310 0.92
311 0.91
312 0.9
313 0.89
314 0.87
315 0.83
316 0.77
317 0.71
318 0.64
319 0.55
320 0.45
321 0.35
322 0.26
323 0.19
324 0.15
325 0.1
326 0.09
327 0.08
328 0.08
329 0.09
330 0.09
331 0.08
332 0.08
333 0.08
334 0.09
335 0.09
336 0.12
337 0.11
338 0.12
339 0.14
340 0.18
341 0.2
342 0.21
343 0.21
344 0.19
345 0.18
346 0.17
347 0.16
348 0.12
349 0.1
350 0.08
351 0.08
352 0.06
353 0.06
354 0.06
355 0.06
356 0.06
357 0.06
358 0.08
359 0.1
360 0.12
361 0.15
362 0.15
363 0.17
364 0.17
365 0.17
366 0.16
367 0.16
368 0.19
369 0.2
370 0.21
371 0.21
372 0.21
373 0.25
374 0.25
375 0.25
376 0.23
377 0.23
378 0.21
379 0.2
380 0.24
381 0.21
382 0.2
383 0.2
384 0.18
385 0.17
386 0.18
387 0.2
388 0.23
389 0.28
390 0.29
391 0.28
392 0.25
393 0.24
394 0.23
395 0.21
396 0.14
397 0.08
398 0.08
399 0.09
400 0.09
401 0.09
402 0.12
403 0.12
404 0.17
405 0.23
406 0.26
407 0.3
408 0.34
409 0.36
410 0.36
411 0.36
412 0.35
413 0.35
414 0.31
415 0.27
416 0.24
417 0.22
418 0.19
419 0.19
420 0.17
421 0.12
422 0.13
423 0.13
424 0.12
425 0.12
426 0.13
427 0.11
428 0.1
429 0.08
430 0.08
431 0.08
432 0.08
433 0.08
434 0.1
435 0.1
436 0.13
437 0.17
438 0.17
439 0.16
440 0.19
441 0.19
442 0.19
443 0.26
444 0.29
445 0.31
446 0.4
447 0.42
448 0.4
449 0.41