Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q4WZJ1

Protein Details
Accession Q4WZJ1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
404-436PDVVLVKKHYARKKNKKTRNWRLKRMAREYEEEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
411-428KHYARKKNKKTRNWRLKR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12, cyto 3.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039768  Nmd3  
IPR007064  Nmd3_N  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0070180  F:large ribosomal subunit rRNA binding  
GO:0043023  F:ribosomal large subunit binding  
GO:0015031  P:protein transport  
GO:0000055  P:ribosomal large subunit export from nucleus  
KEGG afm:AFUA_2G16750  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04981  NMD3  
Amino Acid Sequences MSMDLDAPVPFAAPQEAVSATILCCNCGAPIDGTTSAGALCQDCVRLTVDISQGIPREGVLHFCRDCERWLQPPSGWVSAALESKELLALCLRKLRGLNKVRIIDASFIWTEPHSRRIKVKITIQQEAFQGTIVQQAFEVEYVVHTQQCPDCAKSYTHNTWRASVQVRQKVPHKRTFLYLEQLILKHNAHQDTVNIKEAKDGLDFFFAQRNHAEKMVDFLSSVAPIKVKKSQELISMDIHTSTKSYKFTFSVELVPICKDDLVALPIKLARSLGNISPLALCHRVSTSVNLIDPNTLQTAEVPTAVYWRAPFKNLADVTELVEFIIMDIEPVGRSNGRFHLAEATVARASDLGSNNQTYFTRTHLGGILHVGDSVLGYHLTGTNFNDPNFEAIEASSQYSSTIPDVVLVKKHYARKKNKKTRNWRLKRMAREYEEEALQQQGASISRKQEQERERMEADFEMFLRDVEEDQELRSTLQLYKNKNARPNNRMQVEGGAGGMEMDEDESDDDAPKISMEELLDDFDELNMDDEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.12
3 0.12
4 0.13
5 0.13
6 0.13
7 0.12
8 0.18
9 0.17
10 0.15
11 0.15
12 0.14
13 0.14
14 0.14
15 0.16
16 0.12
17 0.14
18 0.17
19 0.17
20 0.18
21 0.18
22 0.16
23 0.14
24 0.13
25 0.12
26 0.08
27 0.09
28 0.09
29 0.11
30 0.11
31 0.13
32 0.14
33 0.14
34 0.15
35 0.18
36 0.19
37 0.2
38 0.21
39 0.23
40 0.21
41 0.21
42 0.2
43 0.15
44 0.15
45 0.14
46 0.19
47 0.18
48 0.25
49 0.24
50 0.26
51 0.3
52 0.29
53 0.31
54 0.31
55 0.34
56 0.35
57 0.38
58 0.41
59 0.37
60 0.41
61 0.43
62 0.39
63 0.34
64 0.27
65 0.25
66 0.25
67 0.27
68 0.21
69 0.17
70 0.15
71 0.15
72 0.16
73 0.13
74 0.1
75 0.12
76 0.13
77 0.15
78 0.21
79 0.21
80 0.23
81 0.27
82 0.31
83 0.38
84 0.44
85 0.5
86 0.53
87 0.56
88 0.53
89 0.51
90 0.48
91 0.4
92 0.32
93 0.28
94 0.2
95 0.17
96 0.17
97 0.15
98 0.19
99 0.19
100 0.27
101 0.27
102 0.3
103 0.36
104 0.43
105 0.5
106 0.52
107 0.58
108 0.57
109 0.6
110 0.64
111 0.6
112 0.55
113 0.49
114 0.43
115 0.34
116 0.26
117 0.2
118 0.13
119 0.16
120 0.13
121 0.12
122 0.1
123 0.11
124 0.11
125 0.1
126 0.1
127 0.05
128 0.06
129 0.08
130 0.09
131 0.09
132 0.09
133 0.12
134 0.12
135 0.17
136 0.19
137 0.19
138 0.21
139 0.22
140 0.24
141 0.27
142 0.35
143 0.39
144 0.44
145 0.5
146 0.49
147 0.49
148 0.48
149 0.47
150 0.43
151 0.4
152 0.41
153 0.42
154 0.43
155 0.45
156 0.52
157 0.57
158 0.6
159 0.62
160 0.59
161 0.53
162 0.55
163 0.57
164 0.53
165 0.48
166 0.42
167 0.36
168 0.32
169 0.31
170 0.27
171 0.24
172 0.2
173 0.18
174 0.21
175 0.2
176 0.18
177 0.19
178 0.2
179 0.22
180 0.24
181 0.27
182 0.23
183 0.22
184 0.23
185 0.23
186 0.22
187 0.19
188 0.17
189 0.12
190 0.14
191 0.14
192 0.13
193 0.18
194 0.16
195 0.17
196 0.18
197 0.2
198 0.18
199 0.2
200 0.2
201 0.14
202 0.17
203 0.16
204 0.14
205 0.11
206 0.1
207 0.09
208 0.09
209 0.1
210 0.07
211 0.08
212 0.08
213 0.11
214 0.17
215 0.18
216 0.19
217 0.23
218 0.25
219 0.29
220 0.32
221 0.32
222 0.27
223 0.27
224 0.25
225 0.22
226 0.2
227 0.13
228 0.11
229 0.1
230 0.11
231 0.12
232 0.13
233 0.14
234 0.15
235 0.17
236 0.19
237 0.19
238 0.19
239 0.18
240 0.18
241 0.17
242 0.16
243 0.14
244 0.12
245 0.1
246 0.07
247 0.06
248 0.06
249 0.07
250 0.08
251 0.08
252 0.08
253 0.09
254 0.09
255 0.09
256 0.09
257 0.07
258 0.08
259 0.1
260 0.1
261 0.12
262 0.12
263 0.13
264 0.12
265 0.12
266 0.13
267 0.13
268 0.12
269 0.09
270 0.1
271 0.11
272 0.12
273 0.13
274 0.14
275 0.14
276 0.14
277 0.14
278 0.14
279 0.13
280 0.12
281 0.11
282 0.09
283 0.08
284 0.07
285 0.07
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.07
290 0.06
291 0.08
292 0.08
293 0.08
294 0.07
295 0.12
296 0.13
297 0.14
298 0.16
299 0.15
300 0.23
301 0.23
302 0.24
303 0.22
304 0.21
305 0.21
306 0.2
307 0.19
308 0.11
309 0.1
310 0.08
311 0.06
312 0.06
313 0.04
314 0.03
315 0.03
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.05
320 0.06
321 0.07
322 0.09
323 0.12
324 0.15
325 0.15
326 0.15
327 0.19
328 0.19
329 0.2
330 0.18
331 0.18
332 0.15
333 0.15
334 0.14
335 0.09
336 0.09
337 0.12
338 0.13
339 0.13
340 0.15
341 0.16
342 0.16
343 0.18
344 0.18
345 0.16
346 0.15
347 0.16
348 0.17
349 0.16
350 0.17
351 0.19
352 0.19
353 0.17
354 0.17
355 0.15
356 0.12
357 0.12
358 0.1
359 0.07
360 0.06
361 0.06
362 0.05
363 0.04
364 0.04
365 0.04
366 0.07
367 0.08
368 0.09
369 0.11
370 0.18
371 0.19
372 0.2
373 0.21
374 0.19
375 0.2
376 0.19
377 0.18
378 0.11
379 0.09
380 0.12
381 0.11
382 0.11
383 0.1
384 0.09
385 0.09
386 0.09
387 0.1
388 0.09
389 0.09
390 0.08
391 0.1
392 0.13
393 0.14
394 0.17
395 0.18
396 0.22
397 0.27
398 0.35
399 0.41
400 0.49
401 0.59
402 0.67
403 0.77
404 0.83
405 0.88
406 0.91
407 0.94
408 0.95
409 0.95
410 0.94
411 0.94
412 0.94
413 0.92
414 0.92
415 0.9
416 0.88
417 0.81
418 0.76
419 0.7
420 0.63
421 0.55
422 0.45
423 0.36
424 0.28
425 0.23
426 0.17
427 0.13
428 0.11
429 0.12
430 0.14
431 0.16
432 0.2
433 0.25
434 0.31
435 0.34
436 0.41
437 0.45
438 0.51
439 0.54
440 0.56
441 0.52
442 0.47
443 0.46
444 0.38
445 0.34
446 0.26
447 0.21
448 0.17
449 0.15
450 0.14
451 0.13
452 0.13
453 0.11
454 0.11
455 0.14
456 0.12
457 0.13
458 0.15
459 0.14
460 0.14
461 0.15
462 0.15
463 0.17
464 0.25
465 0.31
466 0.35
467 0.44
468 0.52
469 0.57
470 0.64
471 0.7
472 0.71
473 0.73
474 0.78
475 0.78
476 0.74
477 0.7
478 0.62
479 0.56
480 0.48
481 0.4
482 0.29
483 0.19
484 0.15
485 0.12
486 0.1
487 0.07
488 0.04
489 0.04
490 0.04
491 0.05
492 0.06
493 0.07
494 0.07
495 0.09
496 0.09
497 0.09
498 0.1
499 0.09
500 0.09
501 0.09
502 0.11
503 0.1
504 0.13
505 0.13
506 0.15
507 0.15
508 0.15
509 0.14
510 0.12
511 0.12
512 0.09