Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0U1M6B4

Protein Details
Accession A0A0U1M6B4    Localization Confidence High Confidence Score 21.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-32KVIEQPQQYKQPSRKGKKAWRKNVDITEVSHydrophilic
62-88TGDPEVEKTSRKKRKPLRADEILAQRSHydrophilic
268-306YEKPEWLNKKRPERKTQAQRNKIKRRKEAERKARWEAKMBasic
398-422KLESRKPVSQPKKAKRKLTEKWSHKBasic
683-704GDDDDASKAKKKKKTKKKSRKRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
16-21RKGKKA
72-78RKKRKPL
276-307KKRPERKTQAQRNKIKRRKEAERKARWEAKMK
402-415RKPVSQPKKAKRKL
436-460KRKRSANTSVDKKADRPRKFLKPRR
690-704KAKKKKKTKKKSRKR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12, cyto 4.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013520  Exonuclease_RNaseT/DNA_pol3  
IPR011687  Nop53/GLTSCR2  
IPR037431  REX4_DEDDh_dom  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0008408  F:3'-5' exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF07767  Nop53  
PF00929  RNase_T  
CDD cd06144  REX4_like  
Amino Acid Sequences MSKVIEQPQQYKQPSRKGKKAWRKNVDITEVSEGLRVVREEETRGGVVAEKPSEELFTLDVTGDPEVEKTSRKKRKPLRADEILAQRSAIPAVDSRKRANPKVTDGIIEPKTKKQRSDWVSNKEWDRLRQVAKDNKPVAKQDGEIHDPWGDSPEVSNTDNSKFSFLPKTKAKVAPVTLKAAPISLAANGKRIPAVKKPEGGTSYNPSFEEWDSLLVAEGAREVEAEKKRIEEAEKEAERQRLIEEAQGDDGQVKSDDESAWEGFESEYEKPEWLNKKRPERKTQAQRNKIKRRKEAERKARWEAKMKQKEEQAQQIKDIANRVEEQEEIRKQLQINNDSSDEGDDTVLRRRPLGGKNFAPEKPLEVVLPDELQDSLRLLKPEGNLLDDRFRTLIVQGKLESRKPVSQPKKAKRKLTEKWSHKDFQTTEIQSQNGLKRKRSANTSVDKKADRPRKFLKPRRMAEVVGDERVKTPSSSRRSSTTGKEVQRIGQVNEGLSPTAEIGKYVAIDCEMVGVGPNPDKESALARVSIVNWNGDQVYDSFVRPKEMVTDWRTHVSGIEPKHMIDARSFEEVQKDVVKILEGTILVGHAVRNDLKALIYSHPMRDIRDTSKYPAYRKIAGGGSPSLKLLAAQLLGLKIQEGSHSSVEDARATMLLFRRVKQKFEEEHAKKWPARVVPIITAGDDDDASKAKKKKKTKKKSRKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.8
3 0.81
4 0.82
5 0.87
6 0.89
7 0.92
8 0.93
9 0.91
10 0.91
11 0.9
12 0.88
13 0.85
14 0.76
15 0.69
16 0.63
17 0.54
18 0.46
19 0.37
20 0.29
21 0.22
22 0.21
23 0.17
24 0.14
25 0.17
26 0.18
27 0.2
28 0.23
29 0.25
30 0.23
31 0.23
32 0.21
33 0.2
34 0.21
35 0.23
36 0.21
37 0.18
38 0.2
39 0.2
40 0.2
41 0.18
42 0.16
43 0.12
44 0.12
45 0.12
46 0.1
47 0.11
48 0.11
49 0.1
50 0.1
51 0.09
52 0.09
53 0.11
54 0.12
55 0.17
56 0.24
57 0.35
58 0.45
59 0.53
60 0.63
61 0.71
62 0.81
63 0.86
64 0.89
65 0.88
66 0.87
67 0.84
68 0.81
69 0.8
70 0.72
71 0.61
72 0.5
73 0.4
74 0.31
75 0.27
76 0.19
77 0.11
78 0.12
79 0.19
80 0.26
81 0.3
82 0.33
83 0.41
84 0.49
85 0.54
86 0.59
87 0.58
88 0.59
89 0.63
90 0.61
91 0.54
92 0.49
93 0.5
94 0.46
95 0.46
96 0.41
97 0.42
98 0.51
99 0.53
100 0.55
101 0.53
102 0.59
103 0.6
104 0.69
105 0.69
106 0.68
107 0.7
108 0.73
109 0.69
110 0.66
111 0.63
112 0.57
113 0.54
114 0.52
115 0.5
116 0.5
117 0.56
118 0.59
119 0.61
120 0.66
121 0.66
122 0.65
123 0.64
124 0.61
125 0.57
126 0.5
127 0.45
128 0.42
129 0.41
130 0.4
131 0.37
132 0.35
133 0.31
134 0.28
135 0.25
136 0.22
137 0.16
138 0.11
139 0.12
140 0.13
141 0.15
142 0.16
143 0.19
144 0.18
145 0.21
146 0.24
147 0.23
148 0.23
149 0.21
150 0.23
151 0.3
152 0.3
153 0.36
154 0.4
155 0.44
156 0.48
157 0.53
158 0.53
159 0.49
160 0.53
161 0.53
162 0.5
163 0.5
164 0.43
165 0.39
166 0.36
167 0.29
168 0.24
169 0.16
170 0.14
171 0.11
172 0.15
173 0.14
174 0.17
175 0.18
176 0.18
177 0.19
178 0.22
179 0.23
180 0.26
181 0.35
182 0.36
183 0.41
184 0.42
185 0.45
186 0.46
187 0.45
188 0.41
189 0.39
190 0.37
191 0.34
192 0.32
193 0.27
194 0.26
195 0.23
196 0.22
197 0.15
198 0.14
199 0.12
200 0.12
201 0.11
202 0.09
203 0.08
204 0.05
205 0.05
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.05
210 0.12
211 0.15
212 0.17
213 0.18
214 0.19
215 0.2
216 0.22
217 0.24
218 0.21
219 0.24
220 0.31
221 0.32
222 0.34
223 0.37
224 0.37
225 0.35
226 0.31
227 0.26
228 0.19
229 0.18
230 0.18
231 0.15
232 0.13
233 0.15
234 0.14
235 0.13
236 0.12
237 0.11
238 0.09
239 0.08
240 0.08
241 0.06
242 0.08
243 0.08
244 0.08
245 0.11
246 0.1
247 0.1
248 0.09
249 0.09
250 0.08
251 0.08
252 0.1
253 0.08
254 0.09
255 0.1
256 0.1
257 0.1
258 0.17
259 0.25
260 0.29
261 0.39
262 0.45
263 0.56
264 0.65
265 0.74
266 0.77
267 0.77
268 0.81
269 0.83
270 0.86
271 0.85
272 0.86
273 0.88
274 0.89
275 0.91
276 0.88
277 0.86
278 0.84
279 0.82
280 0.83
281 0.84
282 0.84
283 0.84
284 0.86
285 0.84
286 0.83
287 0.82
288 0.74
289 0.72
290 0.69
291 0.69
292 0.69
293 0.64
294 0.6
295 0.58
296 0.62
297 0.57
298 0.58
299 0.54
300 0.45
301 0.44
302 0.43
303 0.39
304 0.33
305 0.31
306 0.22
307 0.16
308 0.16
309 0.16
310 0.13
311 0.12
312 0.13
313 0.17
314 0.17
315 0.19
316 0.19
317 0.2
318 0.2
319 0.23
320 0.27
321 0.25
322 0.26
323 0.25
324 0.26
325 0.24
326 0.23
327 0.2
328 0.14
329 0.1
330 0.08
331 0.06
332 0.06
333 0.11
334 0.14
335 0.13
336 0.13
337 0.14
338 0.2
339 0.26
340 0.32
341 0.33
342 0.33
343 0.37
344 0.41
345 0.4
346 0.36
347 0.3
348 0.25
349 0.2
350 0.19
351 0.15
352 0.11
353 0.11
354 0.1
355 0.1
356 0.08
357 0.07
358 0.06
359 0.07
360 0.06
361 0.06
362 0.07
363 0.09
364 0.09
365 0.09
366 0.12
367 0.12
368 0.15
369 0.15
370 0.16
371 0.15
372 0.16
373 0.2
374 0.17
375 0.18
376 0.15
377 0.14
378 0.12
379 0.12
380 0.18
381 0.15
382 0.16
383 0.16
384 0.22
385 0.24
386 0.25
387 0.27
388 0.23
389 0.26
390 0.29
391 0.39
392 0.42
393 0.49
394 0.58
395 0.65
396 0.73
397 0.76
398 0.81
399 0.79
400 0.82
401 0.81
402 0.81
403 0.82
404 0.79
405 0.8
406 0.78
407 0.72
408 0.62
409 0.61
410 0.5
411 0.44
412 0.44
413 0.38
414 0.35
415 0.34
416 0.33
417 0.27
418 0.31
419 0.31
420 0.3
421 0.32
422 0.31
423 0.35
424 0.41
425 0.44
426 0.46
427 0.48
428 0.49
429 0.55
430 0.6
431 0.59
432 0.58
433 0.55
434 0.54
435 0.56
436 0.58
437 0.52
438 0.52
439 0.55
440 0.61
441 0.71
442 0.75
443 0.77
444 0.77
445 0.77
446 0.76
447 0.72
448 0.61
449 0.53
450 0.53
451 0.44
452 0.37
453 0.34
454 0.27
455 0.25
456 0.26
457 0.23
458 0.14
459 0.17
460 0.23
461 0.29
462 0.34
463 0.35
464 0.38
465 0.43
466 0.47
467 0.48
468 0.48
469 0.49
470 0.48
471 0.51
472 0.47
473 0.45
474 0.46
475 0.43
476 0.36
477 0.32
478 0.29
479 0.24
480 0.24
481 0.22
482 0.15
483 0.13
484 0.12
485 0.08
486 0.09
487 0.08
488 0.07
489 0.07
490 0.07
491 0.08
492 0.08
493 0.08
494 0.06
495 0.07
496 0.06
497 0.07
498 0.06
499 0.05
500 0.05
501 0.06
502 0.07
503 0.09
504 0.1
505 0.1
506 0.11
507 0.12
508 0.12
509 0.15
510 0.17
511 0.16
512 0.16
513 0.15
514 0.16
515 0.17
516 0.21
517 0.19
518 0.16
519 0.15
520 0.16
521 0.15
522 0.14
523 0.13
524 0.09
525 0.12
526 0.12
527 0.12
528 0.16
529 0.17
530 0.19
531 0.19
532 0.19
533 0.19
534 0.21
535 0.29
536 0.28
537 0.33
538 0.33
539 0.37
540 0.37
541 0.32
542 0.3
543 0.27
544 0.28
545 0.25
546 0.28
547 0.25
548 0.25
549 0.3
550 0.31
551 0.27
552 0.24
553 0.25
554 0.22
555 0.27
556 0.27
557 0.23
558 0.25
559 0.24
560 0.25
561 0.24
562 0.21
563 0.17
564 0.17
565 0.17
566 0.13
567 0.13
568 0.13
569 0.1
570 0.1
571 0.09
572 0.09
573 0.08
574 0.08
575 0.08
576 0.06
577 0.09
578 0.09
579 0.1
580 0.11
581 0.11
582 0.11
583 0.13
584 0.15
585 0.15
586 0.2
587 0.22
588 0.23
589 0.29
590 0.31
591 0.31
592 0.34
593 0.37
594 0.36
595 0.42
596 0.44
597 0.42
598 0.5
599 0.53
600 0.51
601 0.55
602 0.55
603 0.52
604 0.5
605 0.5
606 0.44
607 0.41
608 0.41
609 0.36
610 0.33
611 0.29
612 0.28
613 0.23
614 0.19
615 0.17
616 0.15
617 0.12
618 0.1
619 0.1
620 0.11
621 0.12
622 0.12
623 0.12
624 0.11
625 0.09
626 0.09
627 0.1
628 0.12
629 0.15
630 0.16
631 0.17
632 0.18
633 0.2
634 0.21
635 0.2
636 0.17
637 0.14
638 0.13
639 0.13
640 0.16
641 0.18
642 0.25
643 0.27
644 0.3
645 0.39
646 0.41
647 0.45
648 0.47
649 0.53
650 0.51
651 0.57
652 0.65
653 0.61
654 0.65
655 0.7
656 0.72
657 0.64
658 0.62
659 0.6
660 0.54
661 0.54
662 0.54
663 0.5
664 0.45
665 0.49
666 0.45
667 0.38
668 0.34
669 0.28
670 0.23
671 0.18
672 0.15
673 0.11
674 0.13
675 0.15
676 0.23
677 0.3
678 0.37
679 0.46
680 0.57
681 0.67
682 0.75
683 0.84
684 0.88