Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q4WJB1

Protein Details
Accession Q4WJB1    Localization Confidence High Confidence Score 21.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-55GEDGSDQWKRKKQTKEQAREAKRAKLDHydrophilic
132-172EEAEARKKLREEKKAQKKAAQKEKKKAKEALKKDKKSEKSEBasic
448-518TSLLKKALKRKESAKKKSEREWKERLEAVKKGKDARQQKREENLRKRREEKGNKGKKPAAGKKKARPGFEGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
37-53KRKKQTKEQAREAKRAK
72-73KR
108-115RGDAKSKK
135-176EARKKLREEKKAQKKAAQKEKKKAKEALKKDKKSEKSESKPA
297-334GKPARNRQELIEARRQKAEQRKAHKKLLRQKAKEEEQR
436-528KKRAHGEKVRDDTSLLKKALKRKESAKKKSEREWKERLEAVKKGKDARQQKREENLRKRREEKGNKGKKPAAGKKKARPGFEGSFKAKVGGKK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 12.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029190  Rrp14/SURF6_C  
IPR029188  Rrp14_N  
IPR007019  SURF6  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0042273  P:ribosomal large subunit biogenesis  
GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
KEGG afm:AFUA_1G06600  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF15459  RRP14  
PF04935  SURF6  
Amino Acid Sequences MDDIEERLRSHAQAFDGLLSLIPAKYYYGEDGSDQWKRKKQTKEQAREAKRAKLDPDSAKTAKDVMDENARKRKRGEEEEEEEEEQNGSESSEEEELGSELPKEGLKRGDAKSKKQKQAATEQPDATAAKLEEAEARKKLREEKKAQKKAAQKEKKKAKEALKKDKKSEKSESKPASDKGEEQKPSKVENSDDEIEQEGAVPEEGLSLEFNPEPAEQSSSPSSTPNSPGFDASNDHSGSSSISSIAPPPASTDANDASRKSSSEPKPLKPTPEELKQRLQKRLDELRAARHADGFNGKPARNRQELIEARRQKAEQRKAHKKLLRQKAKEEEQRAKDEAMAKRFSPGGSGSLLASPRSPADSIGSNVNFSFGRVVFADGQVADPSLTNVREQPKRHGPQDPATALKAAEAKKARLAEMDEEKRADIEQKDMWLNAKKRAHGEKVRDDTSLLKKALKRKESAKKKSEREWKERLEAVKKGKDARQQKREENLRKRREEKGNKGKKPAAGKKKARPGFEGSFKAKVGGKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.23
3 0.21
4 0.2
5 0.17
6 0.14
7 0.13
8 0.1
9 0.09
10 0.08
11 0.08
12 0.1
13 0.12
14 0.14
15 0.15
16 0.16
17 0.17
18 0.21
19 0.27
20 0.33
21 0.38
22 0.43
23 0.48
24 0.55
25 0.62
26 0.69
27 0.73
28 0.76
29 0.81
30 0.84
31 0.87
32 0.91
33 0.9
34 0.9
35 0.84
36 0.81
37 0.76
38 0.71
39 0.64
40 0.61
41 0.62
42 0.59
43 0.6
44 0.6
45 0.55
46 0.51
47 0.47
48 0.42
49 0.35
50 0.29
51 0.25
52 0.21
53 0.3
54 0.35
55 0.41
56 0.49
57 0.5
58 0.51
59 0.52
60 0.57
61 0.56
62 0.6
63 0.61
64 0.6
65 0.65
66 0.68
67 0.69
68 0.62
69 0.53
70 0.43
71 0.35
72 0.25
73 0.19
74 0.12
75 0.08
76 0.06
77 0.07
78 0.08
79 0.09
80 0.09
81 0.08
82 0.09
83 0.09
84 0.1
85 0.09
86 0.08
87 0.07
88 0.08
89 0.1
90 0.1
91 0.13
92 0.15
93 0.19
94 0.25
95 0.29
96 0.38
97 0.43
98 0.52
99 0.6
100 0.68
101 0.73
102 0.73
103 0.73
104 0.69
105 0.73
106 0.73
107 0.7
108 0.66
109 0.58
110 0.51
111 0.49
112 0.44
113 0.33
114 0.26
115 0.18
116 0.12
117 0.12
118 0.12
119 0.15
120 0.18
121 0.22
122 0.24
123 0.26
124 0.27
125 0.31
126 0.4
127 0.44
128 0.51
129 0.57
130 0.63
131 0.72
132 0.8
133 0.81
134 0.79
135 0.79
136 0.79
137 0.8
138 0.8
139 0.78
140 0.78
141 0.84
142 0.86
143 0.84
144 0.82
145 0.81
146 0.81
147 0.82
148 0.83
149 0.84
150 0.82
151 0.83
152 0.84
153 0.82
154 0.79
155 0.79
156 0.78
157 0.75
158 0.78
159 0.74
160 0.7
161 0.68
162 0.62
163 0.58
164 0.49
165 0.46
166 0.43
167 0.46
168 0.45
169 0.42
170 0.44
171 0.4
172 0.41
173 0.39
174 0.35
175 0.28
176 0.28
177 0.32
178 0.28
179 0.26
180 0.24
181 0.22
182 0.2
183 0.18
184 0.14
185 0.08
186 0.07
187 0.06
188 0.05
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.07
199 0.07
200 0.09
201 0.09
202 0.13
203 0.12
204 0.15
205 0.16
206 0.16
207 0.17
208 0.16
209 0.17
210 0.15
211 0.19
212 0.19
213 0.19
214 0.19
215 0.2
216 0.19
217 0.19
218 0.19
219 0.16
220 0.18
221 0.16
222 0.15
223 0.14
224 0.13
225 0.13
226 0.11
227 0.1
228 0.06
229 0.06
230 0.07
231 0.07
232 0.08
233 0.08
234 0.07
235 0.09
236 0.1
237 0.1
238 0.11
239 0.12
240 0.13
241 0.17
242 0.19
243 0.17
244 0.17
245 0.17
246 0.17
247 0.17
248 0.24
249 0.24
250 0.33
251 0.38
252 0.41
253 0.5
254 0.51
255 0.53
256 0.46
257 0.48
258 0.44
259 0.48
260 0.5
261 0.45
262 0.51
263 0.54
264 0.57
265 0.59
266 0.56
267 0.5
268 0.5
269 0.55
270 0.5
271 0.49
272 0.45
273 0.43
274 0.44
275 0.43
276 0.36
277 0.31
278 0.27
279 0.23
280 0.25
281 0.2
282 0.21
283 0.23
284 0.24
285 0.25
286 0.31
287 0.36
288 0.35
289 0.35
290 0.3
291 0.37
292 0.42
293 0.44
294 0.48
295 0.47
296 0.46
297 0.48
298 0.47
299 0.44
300 0.48
301 0.52
302 0.5
303 0.56
304 0.65
305 0.68
306 0.77
307 0.75
308 0.73
309 0.74
310 0.76
311 0.76
312 0.7
313 0.7
314 0.71
315 0.76
316 0.75
317 0.72
318 0.7
319 0.64
320 0.65
321 0.59
322 0.5
323 0.43
324 0.43
325 0.4
326 0.36
327 0.33
328 0.28
329 0.29
330 0.29
331 0.26
332 0.21
333 0.17
334 0.13
335 0.12
336 0.13
337 0.11
338 0.13
339 0.14
340 0.12
341 0.11
342 0.1
343 0.1
344 0.11
345 0.11
346 0.09
347 0.11
348 0.13
349 0.14
350 0.19
351 0.19
352 0.18
353 0.18
354 0.19
355 0.16
356 0.14
357 0.16
358 0.1
359 0.11
360 0.11
361 0.14
362 0.13
363 0.13
364 0.14
365 0.11
366 0.12
367 0.1
368 0.1
369 0.08
370 0.07
371 0.08
372 0.1
373 0.1
374 0.1
375 0.15
376 0.22
377 0.29
378 0.31
379 0.39
380 0.47
381 0.53
382 0.57
383 0.59
384 0.58
385 0.59
386 0.65
387 0.59
388 0.51
389 0.45
390 0.42
391 0.34
392 0.31
393 0.28
394 0.21
395 0.25
396 0.25
397 0.26
398 0.3
399 0.31
400 0.3
401 0.27
402 0.29
403 0.28
404 0.35
405 0.38
406 0.36
407 0.35
408 0.35
409 0.32
410 0.3
411 0.29
412 0.2
413 0.19
414 0.19
415 0.22
416 0.23
417 0.24
418 0.28
419 0.32
420 0.34
421 0.39
422 0.42
423 0.41
424 0.48
425 0.55
426 0.6
427 0.6
428 0.66
429 0.67
430 0.69
431 0.68
432 0.61
433 0.54
434 0.51
435 0.5
436 0.49
437 0.4
438 0.39
439 0.41
440 0.49
441 0.58
442 0.57
443 0.56
444 0.59
445 0.68
446 0.74
447 0.8
448 0.81
449 0.81
450 0.83
451 0.87
452 0.87
453 0.86
454 0.84
455 0.83
456 0.81
457 0.78
458 0.75
459 0.73
460 0.7
461 0.67
462 0.67
463 0.65
464 0.62
465 0.61
466 0.62
467 0.64
468 0.67
469 0.7
470 0.72
471 0.74
472 0.77
473 0.81
474 0.86
475 0.87
476 0.88
477 0.88
478 0.88
479 0.89
480 0.86
481 0.85
482 0.85
483 0.86
484 0.86
485 0.86
486 0.87
487 0.84
488 0.89
489 0.84
490 0.8
491 0.8
492 0.79
493 0.79
494 0.79
495 0.81
496 0.82
497 0.87
498 0.87
499 0.8
500 0.75
501 0.72
502 0.7
503 0.69
504 0.68
505 0.61
506 0.6
507 0.55
508 0.54