Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0U1LXC6

Protein Details
Accession A0A0U1LXC6    Localization Confidence Low Confidence Score 7.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
663-687DSSALKSHIKKGRNKRNSMLNSPPAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto_nucl 10, cyto 9.5, nucl 7.5, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004843  Calcineurin-like_PHP_ApaH  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR034110  LSMD1_Sm  
IPR029052  Metallo-depent_PP-like  
IPR006186  Ser/Thr-sp_prot-phosphatase  
IPR001163  Sm_dom_euk/arc  
IPR031675  STPPase_N  
Gene Ontology GO:0031417  C:NatC complex  
GO:0017018  F:myosin phosphatase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01423  LSM  
PF00149  Metallophos  
PF16891  STPPase_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00125  SER_THR_PHOSPHATASE  
CDD cd06168  LSMD1  
Amino Acid Sequences MASGTIDNYSYLQSLLGRTLRIHTTDKRMFVGTFKCTDMERNVILSTTYEYRFPSQAAVQAAAENAATSTQQQQPGSNFKVDMPSRLIGLVVVPGKHITKIELEENPHECFLPSPLGLKSSLPSSDFPLRAPLPPRTDCLDDYVHAFSPSRIFHITWNAPLIVPVLIEIEGLHFTFRSLFTYTQISAAVSSPSQSKGGGAGDTLQSYPSFSRSDTKESIRSLKGSIRSKIPGSRDKSSDSPRGSTSGFGDDKSDAASVKSTNSSRLPQSPQSDVPGSRTDTPEPPPSPSQSTSLNRGHKDVDAAQQSGEVDLISDAPPSVPPLTPQAPGESILVKPSNQINPVLLDILASTPTETNGSPGMGMGALKSIDLDDMITRLLDAGYSTKVTKAVCLKNAEIVAICTAARELLLTQPALLELAAPVKIVGDVHGQYTDLIRLFEMCGFPPASNYLFLGDYVDRGKQSLETILLLLCYKLKYPENFFLLRGNHECANVTRVYGFYDECKRRCNIKIWKTFVDTFNCLPIAATVAGKIFCVHGGLSPSLSHMDDIRGIARPTDVPDYGLLNDLLWSDPADMEEDWEPNERGVSYCFGKKVIMDFLQRHDFDLVCRAHMVVEDGYEFFQDRILVTVFSAPNYCGEFDNWGAIMSVSGELLCSFELLKPLDSSALKSHIKKGRNKRNSMLNSPPAVVSAQSY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.18
3 0.19
4 0.19
5 0.2
6 0.24
7 0.27
8 0.29
9 0.34
10 0.35
11 0.44
12 0.48
13 0.5
14 0.49
15 0.48
16 0.44
17 0.44
18 0.44
19 0.38
20 0.35
21 0.34
22 0.32
23 0.31
24 0.35
25 0.33
26 0.32
27 0.29
28 0.28
29 0.27
30 0.26
31 0.25
32 0.21
33 0.21
34 0.2
35 0.19
36 0.19
37 0.22
38 0.25
39 0.26
40 0.25
41 0.25
42 0.22
43 0.26
44 0.27
45 0.26
46 0.23
47 0.22
48 0.21
49 0.18
50 0.16
51 0.11
52 0.08
53 0.07
54 0.07
55 0.07
56 0.13
57 0.18
58 0.23
59 0.24
60 0.28
61 0.33
62 0.41
63 0.43
64 0.41
65 0.36
66 0.32
67 0.41
68 0.37
69 0.36
70 0.33
71 0.3
72 0.28
73 0.27
74 0.25
75 0.16
76 0.16
77 0.16
78 0.14
79 0.13
80 0.13
81 0.15
82 0.16
83 0.17
84 0.18
85 0.15
86 0.16
87 0.2
88 0.24
89 0.27
90 0.3
91 0.34
92 0.37
93 0.37
94 0.34
95 0.31
96 0.26
97 0.22
98 0.2
99 0.18
100 0.15
101 0.16
102 0.16
103 0.18
104 0.18
105 0.18
106 0.17
107 0.16
108 0.18
109 0.17
110 0.18
111 0.22
112 0.29
113 0.28
114 0.28
115 0.31
116 0.31
117 0.34
118 0.37
119 0.38
120 0.38
121 0.39
122 0.42
123 0.4
124 0.42
125 0.38
126 0.37
127 0.33
128 0.26
129 0.27
130 0.26
131 0.23
132 0.2
133 0.2
134 0.16
135 0.18
136 0.18
137 0.19
138 0.18
139 0.18
140 0.2
141 0.29
142 0.3
143 0.28
144 0.3
145 0.27
146 0.24
147 0.24
148 0.22
149 0.13
150 0.1
151 0.08
152 0.07
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.06
161 0.06
162 0.08
163 0.08
164 0.1
165 0.12
166 0.13
167 0.15
168 0.18
169 0.19
170 0.18
171 0.18
172 0.15
173 0.13
174 0.13
175 0.13
176 0.09
177 0.1
178 0.1
179 0.11
180 0.12
181 0.11
182 0.1
183 0.11
184 0.12
185 0.12
186 0.1
187 0.1
188 0.11
189 0.12
190 0.11
191 0.1
192 0.09
193 0.1
194 0.1
195 0.11
196 0.11
197 0.11
198 0.17
199 0.2
200 0.27
201 0.29
202 0.33
203 0.36
204 0.38
205 0.43
206 0.39
207 0.37
208 0.33
209 0.34
210 0.38
211 0.39
212 0.38
213 0.37
214 0.38
215 0.4
216 0.43
217 0.44
218 0.44
219 0.44
220 0.47
221 0.45
222 0.46
223 0.49
224 0.5
225 0.51
226 0.45
227 0.42
228 0.38
229 0.38
230 0.34
231 0.29
232 0.24
233 0.23
234 0.21
235 0.19
236 0.19
237 0.17
238 0.17
239 0.16
240 0.15
241 0.08
242 0.08
243 0.09
244 0.08
245 0.09
246 0.14
247 0.13
248 0.16
249 0.19
250 0.21
251 0.23
252 0.28
253 0.32
254 0.33
255 0.36
256 0.36
257 0.35
258 0.36
259 0.36
260 0.31
261 0.29
262 0.27
263 0.26
264 0.24
265 0.25
266 0.24
267 0.24
268 0.28
269 0.32
270 0.3
271 0.31
272 0.31
273 0.32
274 0.33
275 0.32
276 0.3
277 0.3
278 0.32
279 0.35
280 0.4
281 0.43
282 0.39
283 0.39
284 0.38
285 0.31
286 0.31
287 0.26
288 0.25
289 0.22
290 0.21
291 0.19
292 0.19
293 0.18
294 0.16
295 0.13
296 0.07
297 0.04
298 0.04
299 0.05
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.05
305 0.06
306 0.07
307 0.06
308 0.07
309 0.12
310 0.14
311 0.15
312 0.16
313 0.16
314 0.15
315 0.16
316 0.16
317 0.12
318 0.1
319 0.12
320 0.12
321 0.1
322 0.11
323 0.13
324 0.15
325 0.15
326 0.15
327 0.14
328 0.14
329 0.14
330 0.13
331 0.09
332 0.07
333 0.06
334 0.06
335 0.05
336 0.04
337 0.04
338 0.04
339 0.05
340 0.06
341 0.06
342 0.07
343 0.07
344 0.07
345 0.06
346 0.06
347 0.06
348 0.05
349 0.05
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.04
355 0.04
356 0.03
357 0.04
358 0.04
359 0.03
360 0.04
361 0.04
362 0.04
363 0.04
364 0.04
365 0.04
366 0.03
367 0.04
368 0.04
369 0.05
370 0.07
371 0.07
372 0.07
373 0.1
374 0.1
375 0.13
376 0.19
377 0.22
378 0.26
379 0.29
380 0.29
381 0.3
382 0.3
383 0.27
384 0.19
385 0.16
386 0.12
387 0.09
388 0.09
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.04
393 0.04
394 0.04
395 0.05
396 0.07
397 0.07
398 0.07
399 0.07
400 0.07
401 0.07
402 0.06
403 0.04
404 0.03
405 0.05
406 0.05
407 0.05
408 0.04
409 0.04
410 0.05
411 0.05
412 0.06
413 0.07
414 0.08
415 0.09
416 0.09
417 0.09
418 0.09
419 0.1
420 0.1
421 0.08
422 0.08
423 0.07
424 0.07
425 0.08
426 0.09
427 0.1
428 0.08
429 0.1
430 0.11
431 0.11
432 0.11
433 0.12
434 0.12
435 0.12
436 0.12
437 0.11
438 0.1
439 0.1
440 0.12
441 0.1
442 0.1
443 0.11
444 0.12
445 0.1
446 0.11
447 0.11
448 0.09
449 0.1
450 0.11
451 0.1
452 0.1
453 0.1
454 0.1
455 0.1
456 0.09
457 0.08
458 0.08
459 0.07
460 0.08
461 0.11
462 0.16
463 0.19
464 0.25
465 0.31
466 0.35
467 0.35
468 0.35
469 0.37
470 0.34
471 0.35
472 0.31
473 0.28
474 0.25
475 0.24
476 0.25
477 0.2
478 0.22
479 0.18
480 0.15
481 0.13
482 0.12
483 0.13
484 0.13
485 0.13
486 0.14
487 0.24
488 0.3
489 0.32
490 0.35
491 0.37
492 0.41
493 0.46
494 0.51
495 0.52
496 0.55
497 0.64
498 0.66
499 0.68
500 0.67
501 0.67
502 0.62
503 0.57
504 0.5
505 0.41
506 0.38
507 0.33
508 0.27
509 0.23
510 0.18
511 0.15
512 0.12
513 0.11
514 0.09
515 0.1
516 0.1
517 0.1
518 0.1
519 0.08
520 0.07
521 0.08
522 0.08
523 0.08
524 0.11
525 0.12
526 0.13
527 0.12
528 0.13
529 0.14
530 0.14
531 0.13
532 0.1
533 0.11
534 0.12
535 0.13
536 0.13
537 0.15
538 0.15
539 0.15
540 0.15
541 0.15
542 0.17
543 0.2
544 0.19
545 0.17
546 0.18
547 0.19
548 0.19
549 0.19
550 0.16
551 0.11
552 0.12
553 0.11
554 0.1
555 0.08
556 0.09
557 0.08
558 0.08
559 0.08
560 0.1
561 0.09
562 0.12
563 0.13
564 0.13
565 0.13
566 0.17
567 0.17
568 0.15
569 0.16
570 0.14
571 0.13
572 0.15
573 0.17
574 0.18
575 0.21
576 0.22
577 0.22
578 0.23
579 0.23
580 0.24
581 0.27
582 0.28
583 0.3
584 0.32
585 0.37
586 0.44
587 0.43
588 0.42
589 0.37
590 0.32
591 0.28
592 0.33
593 0.28
594 0.21
595 0.21
596 0.19
597 0.18
598 0.18
599 0.2
600 0.12
601 0.12
602 0.12
603 0.12
604 0.12
605 0.13
606 0.13
607 0.1
608 0.1
609 0.1
610 0.09
611 0.11
612 0.12
613 0.11
614 0.11
615 0.18
616 0.17
617 0.17
618 0.18
619 0.16
620 0.18
621 0.2
622 0.2
623 0.15
624 0.16
625 0.19
626 0.18
627 0.21
628 0.18
629 0.16
630 0.15
631 0.14
632 0.13
633 0.1
634 0.09
635 0.07
636 0.06
637 0.06
638 0.06
639 0.07
640 0.07
641 0.06
642 0.07
643 0.08
644 0.13
645 0.14
646 0.16
647 0.16
648 0.17
649 0.22
650 0.22
651 0.24
652 0.24
653 0.31
654 0.35
655 0.37
656 0.46
657 0.48
658 0.55
659 0.62
660 0.68
661 0.72
662 0.77
663 0.82
664 0.8
665 0.84
666 0.84
667 0.83
668 0.81
669 0.78
670 0.71
671 0.65
672 0.57
673 0.47
674 0.39