Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0U1LUB6

Protein Details
Accession A0A0U1LUB6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
181-203VSKEEFQTRKKRRIEERKEAAKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
189-210RKKRRIEERKEAAKAAPPATPK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, mito_nucl 9.5, cyto 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016827  Ada2/TADA2  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR001005  SANT/Myb  
IPR017884  SANT_dom  
IPR007526  SWIRM  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR000433  Znf_ZZ  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003713  F:transcription coactivator activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0035065  P:regulation of histone acetylation  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF00249  Myb_DNA-binding  
PF04433  SWIRM  
PF00569  ZZ  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50090  MYB_LIKE  
PS51293  SANT  
PS50934  SWIRM  
CDD cd00167  SANT  
Amino Acid Sequences MDPPLQTPCRDSLLQGSACRACRYRAYRSNIDDILCRYSLHHSGFKRALCFRTLPSTSDKPPVVRISCAHSACPEYDLCVPCFAAGESSKTHDPRTHPFHVIEQNSVPIYTEDWGADEELLLLEGAEIYGLGSWADIADHIGGYRTKEEVRDHYVETYIDSPNFPLPSRADPEDKTLQDLVSKEEFQTRKKRRIEERKEAAKAAPPATPKQKPTASVPSCHEVQGYMPGRLEFETEFCNEAEEAVQHMQFEPGNGLNANGEMEPEMELKMTVMEIYNSRLTQRTERKKVLFEHNLLEYRKNTAQEKKRTKEEKDLMNKAKPFSRMMNHDDFEEFCKGLEYEHNLRLAIAQLQEWRQYGITDLKSGEKYEQEKQQRAQRAIPTGSFDRLASARPTKQMQQPEGPSQASLLTTPELPLRFQKAAKPAGPDPNVPLNDFDRAFGDVGTPQPAAKSKYIVQPLNGVVPWKLESEGAPDLHLLAKEEIDLCNALHVQPKPYLVIKETLLKESMKQNGSLKKKDARAICKIDVAKAGRIFDFMVHSGWIIKG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.38
3 0.4
4 0.41
5 0.43
6 0.46
7 0.4
8 0.35
9 0.41
10 0.46
11 0.5
12 0.54
13 0.6
14 0.65
15 0.68
16 0.72
17 0.66
18 0.61
19 0.54
20 0.48
21 0.45
22 0.36
23 0.31
24 0.25
25 0.27
26 0.32
27 0.33
28 0.37
29 0.34
30 0.42
31 0.48
32 0.49
33 0.5
34 0.49
35 0.47
36 0.44
37 0.45
38 0.4
39 0.43
40 0.42
41 0.38
42 0.4
43 0.44
44 0.44
45 0.49
46 0.48
47 0.4
48 0.45
49 0.5
50 0.45
51 0.42
52 0.4
53 0.4
54 0.45
55 0.44
56 0.39
57 0.33
58 0.34
59 0.31
60 0.31
61 0.24
62 0.19
63 0.24
64 0.26
65 0.24
66 0.23
67 0.22
68 0.2
69 0.21
70 0.18
71 0.15
72 0.14
73 0.16
74 0.16
75 0.2
76 0.26
77 0.27
78 0.3
79 0.31
80 0.35
81 0.41
82 0.48
83 0.49
84 0.47
85 0.48
86 0.52
87 0.55
88 0.52
89 0.46
90 0.39
91 0.36
92 0.32
93 0.31
94 0.24
95 0.16
96 0.15
97 0.12
98 0.12
99 0.09
100 0.1
101 0.1
102 0.1
103 0.09
104 0.08
105 0.07
106 0.06
107 0.06
108 0.05
109 0.04
110 0.04
111 0.03
112 0.03
113 0.03
114 0.03
115 0.02
116 0.03
117 0.03
118 0.03
119 0.03
120 0.03
121 0.03
122 0.03
123 0.03
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.05
128 0.07
129 0.08
130 0.09
131 0.11
132 0.12
133 0.13
134 0.17
135 0.2
136 0.24
137 0.3
138 0.31
139 0.32
140 0.31
141 0.31
142 0.27
143 0.26
144 0.23
145 0.18
146 0.15
147 0.14
148 0.14
149 0.15
150 0.17
151 0.15
152 0.16
153 0.16
154 0.2
155 0.24
156 0.26
157 0.27
158 0.27
159 0.33
160 0.37
161 0.35
162 0.33
163 0.3
164 0.26
165 0.25
166 0.25
167 0.23
168 0.19
169 0.19
170 0.17
171 0.24
172 0.26
173 0.29
174 0.4
175 0.43
176 0.5
177 0.56
178 0.64
179 0.68
180 0.77
181 0.81
182 0.81
183 0.83
184 0.82
185 0.78
186 0.71
187 0.61
188 0.55
189 0.49
190 0.4
191 0.33
192 0.26
193 0.29
194 0.35
195 0.39
196 0.35
197 0.38
198 0.39
199 0.38
200 0.42
201 0.48
202 0.42
203 0.42
204 0.43
205 0.39
206 0.38
207 0.35
208 0.29
209 0.18
210 0.16
211 0.21
212 0.2
213 0.18
214 0.17
215 0.17
216 0.18
217 0.18
218 0.18
219 0.09
220 0.09
221 0.1
222 0.1
223 0.11
224 0.1
225 0.11
226 0.1
227 0.1
228 0.09
229 0.07
230 0.08
231 0.08
232 0.08
233 0.07
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.07
243 0.06
244 0.06
245 0.07
246 0.05
247 0.05
248 0.04
249 0.05
250 0.05
251 0.06
252 0.06
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.04
258 0.04
259 0.03
260 0.04
261 0.05
262 0.07
263 0.09
264 0.09
265 0.1
266 0.12
267 0.14
268 0.21
269 0.31
270 0.39
271 0.45
272 0.51
273 0.52
274 0.55
275 0.58
276 0.6
277 0.56
278 0.48
279 0.43
280 0.41
281 0.43
282 0.39
283 0.36
284 0.27
285 0.25
286 0.25
287 0.26
288 0.26
289 0.31
290 0.39
291 0.47
292 0.57
293 0.57
294 0.65
295 0.69
296 0.69
297 0.7
298 0.67
299 0.67
300 0.65
301 0.7
302 0.65
303 0.64
304 0.62
305 0.54
306 0.51
307 0.44
308 0.38
309 0.33
310 0.33
311 0.33
312 0.36
313 0.4
314 0.37
315 0.35
316 0.33
317 0.29
318 0.27
319 0.24
320 0.18
321 0.11
322 0.12
323 0.11
324 0.11
325 0.13
326 0.16
327 0.19
328 0.22
329 0.23
330 0.22
331 0.22
332 0.21
333 0.2
334 0.16
335 0.11
336 0.1
337 0.12
338 0.13
339 0.16
340 0.16
341 0.15
342 0.13
343 0.13
344 0.14
345 0.18
346 0.17
347 0.17
348 0.17
349 0.2
350 0.21
351 0.22
352 0.21
353 0.2
354 0.23
355 0.26
356 0.34
357 0.39
358 0.43
359 0.48
360 0.54
361 0.57
362 0.56
363 0.57
364 0.53
365 0.52
366 0.48
367 0.44
368 0.41
369 0.35
370 0.34
371 0.28
372 0.23
373 0.19
374 0.18
375 0.19
376 0.19
377 0.22
378 0.23
379 0.27
380 0.3
381 0.33
382 0.39
383 0.45
384 0.45
385 0.47
386 0.49
387 0.51
388 0.52
389 0.46
390 0.4
391 0.32
392 0.28
393 0.21
394 0.17
395 0.12
396 0.09
397 0.09
398 0.1
399 0.13
400 0.13
401 0.14
402 0.17
403 0.21
404 0.24
405 0.25
406 0.29
407 0.34
408 0.39
409 0.41
410 0.43
411 0.43
412 0.49
413 0.5
414 0.46
415 0.44
416 0.45
417 0.44
418 0.38
419 0.36
420 0.29
421 0.31
422 0.29
423 0.25
424 0.18
425 0.19
426 0.18
427 0.15
428 0.15
429 0.12
430 0.13
431 0.15
432 0.14
433 0.12
434 0.14
435 0.18
436 0.21
437 0.21
438 0.24
439 0.25
440 0.33
441 0.41
442 0.41
443 0.38
444 0.4
445 0.4
446 0.4
447 0.36
448 0.29
449 0.22
450 0.22
451 0.22
452 0.17
453 0.17
454 0.13
455 0.13
456 0.17
457 0.21
458 0.19
459 0.18
460 0.17
461 0.17
462 0.18
463 0.18
464 0.16
465 0.12
466 0.12
467 0.13
468 0.14
469 0.14
470 0.13
471 0.14
472 0.11
473 0.13
474 0.13
475 0.13
476 0.19
477 0.2
478 0.22
479 0.24
480 0.26
481 0.26
482 0.3
483 0.32
484 0.28
485 0.3
486 0.29
487 0.35
488 0.35
489 0.35
490 0.33
491 0.31
492 0.32
493 0.35
494 0.41
495 0.34
496 0.36
497 0.41
498 0.47
499 0.55
500 0.59
501 0.59
502 0.59
503 0.64
504 0.67
505 0.68
506 0.67
507 0.69
508 0.7
509 0.65
510 0.65
511 0.6
512 0.56
513 0.55
514 0.5
515 0.47
516 0.43
517 0.42
518 0.35
519 0.35
520 0.32
521 0.26
522 0.27
523 0.21
524 0.19
525 0.17
526 0.16