Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0U1LVD8

Protein Details
Accession A0A0U1LVD8    Localization Confidence Low Confidence Score 9.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
71-97GTSTADGPKKRGRKKKGDKDRDDVSRVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
78-89PKKRGRKKKGDK
Subcellular Location(s) mito 18.5, cyto_mito 11.5, nucl 4, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR045127  TAF11-like  
IPR006809  TAFII28_dom  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0051123  P:RNA polymerase II preinitiation complex assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04719  TAFII28  
CDD cd08048  TAF11  
Amino Acid Sequences MSSPPPTTPNPLNPRKRGSISSTASAAAASKRPRMHPLRQTSFPTGMEPGSSRAASDAGSVTGSFTGSLGGTSTADGPKKRGRKKKGDKDRDDVSRVGGDGRSTRVGSLDPDTMSVRDGAGGGGAAGGGDEAGDEEEEQDVEGELLGATEGFLDLATEKKNLAVLTNSFTPLQADRYEKWNRTRLRKETLRRIVNHALSQSVPQSVVTVINGFTKVFIGELIEKARTVQEEWAEAFDAVARETWEREQAEIEKAAAAKTEAENKAKAEADADKTDIKEEEQKPNGVTRDSQSVTPSRDIPAMLSPAKAPADHQSPYASMTSTGQQINGGSSATVTRREFVPPVNPHRAQLLPDHIREALRRYRRNGEGGGTGMSGLSQPNVGVRGAFTWQIGPGRQRLFR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.77
3 0.75
4 0.7
5 0.67
6 0.67
7 0.62
8 0.59
9 0.53
10 0.45
11 0.4
12 0.34
13 0.28
14 0.21
15 0.23
16 0.23
17 0.28
18 0.32
19 0.36
20 0.45
21 0.51
22 0.58
23 0.62
24 0.69
25 0.7
26 0.72
27 0.75
28 0.71
29 0.67
30 0.58
31 0.5
32 0.42
33 0.34
34 0.3
35 0.24
36 0.22
37 0.21
38 0.2
39 0.18
40 0.16
41 0.16
42 0.15
43 0.15
44 0.13
45 0.09
46 0.1
47 0.1
48 0.1
49 0.09
50 0.09
51 0.08
52 0.07
53 0.07
54 0.06
55 0.06
56 0.06
57 0.06
58 0.07
59 0.07
60 0.1
61 0.13
62 0.17
63 0.18
64 0.23
65 0.3
66 0.4
67 0.49
68 0.57
69 0.64
70 0.72
71 0.82
72 0.88
73 0.91
74 0.93
75 0.91
76 0.87
77 0.86
78 0.82
79 0.74
80 0.63
81 0.54
82 0.44
83 0.37
84 0.31
85 0.24
86 0.18
87 0.16
88 0.18
89 0.18
90 0.17
91 0.17
92 0.16
93 0.16
94 0.16
95 0.18
96 0.17
97 0.15
98 0.16
99 0.17
100 0.17
101 0.16
102 0.14
103 0.11
104 0.08
105 0.08
106 0.06
107 0.05
108 0.05
109 0.04
110 0.04
111 0.03
112 0.03
113 0.02
114 0.02
115 0.02
116 0.02
117 0.02
118 0.02
119 0.02
120 0.03
121 0.03
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.03
131 0.03
132 0.03
133 0.03
134 0.03
135 0.02
136 0.02
137 0.02
138 0.02
139 0.02
140 0.02
141 0.03
142 0.05
143 0.06
144 0.06
145 0.07
146 0.07
147 0.09
148 0.09
149 0.1
150 0.1
151 0.11
152 0.14
153 0.15
154 0.16
155 0.14
156 0.14
157 0.14
158 0.13
159 0.14
160 0.13
161 0.15
162 0.15
163 0.23
164 0.29
165 0.32
166 0.37
167 0.43
168 0.46
169 0.53
170 0.6
171 0.59
172 0.63
173 0.67
174 0.69
175 0.72
176 0.75
177 0.72
178 0.65
179 0.66
180 0.63
181 0.56
182 0.5
183 0.4
184 0.31
185 0.25
186 0.24
187 0.17
188 0.12
189 0.09
190 0.07
191 0.08
192 0.07
193 0.07
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.06
207 0.07
208 0.09
209 0.09
210 0.09
211 0.09
212 0.1
213 0.1
214 0.1
215 0.11
216 0.1
217 0.12
218 0.13
219 0.13
220 0.13
221 0.12
222 0.1
223 0.09
224 0.08
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.08
230 0.09
231 0.13
232 0.13
233 0.14
234 0.15
235 0.17
236 0.19
237 0.18
238 0.17
239 0.14
240 0.13
241 0.13
242 0.11
243 0.09
244 0.08
245 0.09
246 0.17
247 0.19
248 0.21
249 0.22
250 0.22
251 0.25
252 0.24
253 0.23
254 0.18
255 0.18
256 0.2
257 0.2
258 0.22
259 0.2
260 0.2
261 0.21
262 0.19
263 0.17
264 0.22
265 0.25
266 0.32
267 0.33
268 0.35
269 0.35
270 0.4
271 0.4
272 0.32
273 0.3
274 0.23
275 0.28
276 0.27
277 0.27
278 0.26
279 0.28
280 0.3
281 0.31
282 0.3
283 0.24
284 0.24
285 0.23
286 0.21
287 0.2
288 0.21
289 0.19
290 0.19
291 0.17
292 0.19
293 0.2
294 0.18
295 0.16
296 0.18
297 0.22
298 0.22
299 0.23
300 0.22
301 0.22
302 0.24
303 0.23
304 0.17
305 0.13
306 0.14
307 0.15
308 0.17
309 0.17
310 0.16
311 0.16
312 0.15
313 0.16
314 0.15
315 0.12
316 0.08
317 0.08
318 0.11
319 0.12
320 0.17
321 0.17
322 0.18
323 0.19
324 0.23
325 0.24
326 0.25
327 0.33
328 0.36
329 0.44
330 0.52
331 0.51
332 0.49
333 0.52
334 0.49
335 0.42
336 0.39
337 0.41
338 0.37
339 0.37
340 0.39
341 0.36
342 0.37
343 0.37
344 0.38
345 0.37
346 0.41
347 0.47
348 0.51
349 0.58
350 0.62
351 0.65
352 0.62
353 0.56
354 0.5
355 0.45
356 0.4
357 0.31
358 0.25
359 0.19
360 0.16
361 0.12
362 0.09
363 0.08
364 0.07
365 0.07
366 0.09
367 0.11
368 0.11
369 0.1
370 0.11
371 0.12
372 0.14
373 0.16
374 0.14
375 0.14
376 0.17
377 0.21
378 0.24
379 0.26
380 0.31