Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0S6XS27

Protein Details
Accession A0A0S6XS27    Localization Confidence Low Confidence Score 7.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-50QDSPNAKRSKQRYDNNTLRPVTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto_nucl 12.833, nucl 11.5, cyto 11, cyto_pero 6.999
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR004365  NA-bd_OB_tRNA  
IPR040260  RFA2-like  
IPR014646  Rfa2/RPA32  
IPR014892  RPA_C  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF08784  RPA_C  
PF01336  tRNA_anti-codon  
CDD cd04478  RPA2_DBD_D  
Amino Acid Sequences MSYGGDYSTTSYGAQGGANGGGFMPGGSQDSPNAKRSKQRYDNNTLRPVTIKQIHVAELPDPDADAYILDGSECTQVTFVGQIMNISQQTTNVTYKVDDGTSQVEVKIWVDPERLDVEDPNSMVGKLKENAYVRCWGKIKNFGKRHVVAHVVRPITDMNEVNYHLLEATAVHLQLSRGAPGEKQTNGANGHGQTSASYGGGGADKLGNVSGGAKKVYQCIQNTPQTNEGLHMQDIAMRTGMEVPEVLKAGDELQGMGLIYTTVDDHTWAVLEM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.09
3 0.1
4 0.09
5 0.09
6 0.09
7 0.08
8 0.07
9 0.07
10 0.06
11 0.05
12 0.05
13 0.07
14 0.08
15 0.09
16 0.12
17 0.21
18 0.24
19 0.31
20 0.35
21 0.36
22 0.44
23 0.51
24 0.58
25 0.61
26 0.67
27 0.69
28 0.75
29 0.81
30 0.81
31 0.82
32 0.72
33 0.63
34 0.57
35 0.5
36 0.47
37 0.44
38 0.37
39 0.32
40 0.33
41 0.33
42 0.31
43 0.31
44 0.24
45 0.19
46 0.19
47 0.15
48 0.13
49 0.11
50 0.1
51 0.08
52 0.07
53 0.06
54 0.05
55 0.05
56 0.04
57 0.04
58 0.05
59 0.07
60 0.07
61 0.06
62 0.06
63 0.07
64 0.07
65 0.08
66 0.07
67 0.06
68 0.06
69 0.06
70 0.06
71 0.09
72 0.09
73 0.09
74 0.09
75 0.08
76 0.11
77 0.14
78 0.14
79 0.13
80 0.13
81 0.13
82 0.14
83 0.14
84 0.13
85 0.1
86 0.1
87 0.11
88 0.12
89 0.12
90 0.11
91 0.1
92 0.1
93 0.1
94 0.1
95 0.09
96 0.09
97 0.1
98 0.1
99 0.12
100 0.13
101 0.13
102 0.12
103 0.11
104 0.12
105 0.12
106 0.12
107 0.11
108 0.09
109 0.09
110 0.1
111 0.1
112 0.11
113 0.11
114 0.12
115 0.16
116 0.18
117 0.2
118 0.2
119 0.27
120 0.25
121 0.27
122 0.28
123 0.26
124 0.27
125 0.36
126 0.39
127 0.42
128 0.47
129 0.47
130 0.53
131 0.52
132 0.5
133 0.43
134 0.44
135 0.35
136 0.35
137 0.35
138 0.29
139 0.26
140 0.26
141 0.23
142 0.18
143 0.19
144 0.15
145 0.11
146 0.13
147 0.13
148 0.13
149 0.12
150 0.11
151 0.08
152 0.08
153 0.06
154 0.04
155 0.05
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.07
161 0.1
162 0.11
163 0.1
164 0.1
165 0.11
166 0.11
167 0.14
168 0.18
169 0.15
170 0.17
171 0.17
172 0.2
173 0.21
174 0.22
175 0.22
176 0.18
177 0.19
178 0.18
179 0.17
180 0.12
181 0.12
182 0.12
183 0.09
184 0.08
185 0.06
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.05
195 0.05
196 0.08
197 0.1
198 0.11
199 0.12
200 0.13
201 0.15
202 0.19
203 0.23
204 0.26
205 0.26
206 0.33
207 0.39
208 0.46
209 0.49
210 0.49
211 0.48
212 0.44
213 0.42
214 0.36
215 0.32
216 0.26
217 0.22
218 0.19
219 0.15
220 0.16
221 0.16
222 0.15
223 0.12
224 0.1
225 0.1
226 0.12
227 0.12
228 0.1
229 0.1
230 0.09
231 0.11
232 0.12
233 0.11
234 0.09
235 0.09
236 0.1
237 0.12
238 0.12
239 0.1
240 0.09
241 0.1
242 0.1
243 0.09
244 0.08
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.07
252 0.08
253 0.08