Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0S6XFJ6

Protein Details
Accession A0A0S6XFJ6    Localization Confidence High Confidence Score 18.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
100-127EGEDGEKKRRKREKKPRDPNAPKRPLTABasic
336-381DKEKEAPKAKKAKKDDKEADTAAAGTPKDKKRSHKKRKSTAAGATEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
105-123EKKRRKREKKPRDPNAPKR
266-276KPAAKKAAAPA
301-305AKKGK
322-374SRKRKSTSGPAGAADKEKEAPKAKKAKKDDKEADTAAAGTPKDKKRSHKKRKS
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd00084  HMG-box_SF  
Amino Acid Sequences MAKQSSAAPVAPAQKKIAIDEAEFIRTRDAVITSWSRLHGALQNAIHTYIEHSNAVLSGERALDSAGLSALMSLASQSAPVAPLAGIADAAAAAGDVKFEGEDGEKKRRKREKKPRDPNAPKRPLTAYLLYLEDMRPIIQNDLGPGQRRGDISAEGTKRWNLLDPQSKEVYKNRYKAAWETYSHELAAYKAAGGEIAPDDDEVEDVEALVGAPPATAPKSKAAAAKAKPNGTAEDAESSVVSTSSSDPDTDSTSSPATASKSAAAKPAAKKAAAPATKAAKAAAVDSSAAALSSPAPRSAAKKGKETPAAAAATNGTATPTSRKRKSTSGPAGAADKEKEAPKAKKAKKDDKEADTAAAGTPKDKKRSHKKRKSTAAGATE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.36
3 0.36
4 0.38
5 0.31
6 0.28
7 0.31
8 0.31
9 0.32
10 0.31
11 0.29
12 0.24
13 0.22
14 0.21
15 0.19
16 0.17
17 0.13
18 0.18
19 0.22
20 0.23
21 0.25
22 0.26
23 0.24
24 0.23
25 0.26
26 0.25
27 0.25
28 0.28
29 0.27
30 0.28
31 0.28
32 0.28
33 0.25
34 0.2
35 0.2
36 0.18
37 0.19
38 0.17
39 0.16
40 0.15
41 0.16
42 0.16
43 0.13
44 0.1
45 0.09
46 0.09
47 0.09
48 0.09
49 0.09
50 0.08
51 0.07
52 0.07
53 0.06
54 0.05
55 0.05
56 0.05
57 0.05
58 0.04
59 0.04
60 0.03
61 0.04
62 0.04
63 0.04
64 0.04
65 0.05
66 0.06
67 0.06
68 0.06
69 0.05
70 0.06
71 0.07
72 0.06
73 0.06
74 0.05
75 0.05
76 0.04
77 0.04
78 0.03
79 0.02
80 0.02
81 0.02
82 0.03
83 0.03
84 0.03
85 0.03
86 0.03
87 0.04
88 0.06
89 0.12
90 0.17
91 0.28
92 0.34
93 0.38
94 0.48
95 0.58
96 0.66
97 0.72
98 0.79
99 0.8
100 0.86
101 0.94
102 0.94
103 0.95
104 0.96
105 0.95
106 0.95
107 0.93
108 0.83
109 0.75
110 0.68
111 0.6
112 0.53
113 0.45
114 0.35
115 0.27
116 0.26
117 0.23
118 0.21
119 0.17
120 0.13
121 0.11
122 0.09
123 0.09
124 0.09
125 0.09
126 0.1
127 0.1
128 0.1
129 0.13
130 0.15
131 0.16
132 0.16
133 0.17
134 0.18
135 0.18
136 0.18
137 0.17
138 0.16
139 0.16
140 0.22
141 0.22
142 0.2
143 0.22
144 0.21
145 0.2
146 0.19
147 0.19
148 0.14
149 0.21
150 0.29
151 0.3
152 0.34
153 0.36
154 0.37
155 0.36
156 0.39
157 0.41
158 0.38
159 0.4
160 0.38
161 0.38
162 0.39
163 0.4
164 0.41
165 0.37
166 0.32
167 0.32
168 0.33
169 0.3
170 0.29
171 0.25
172 0.19
173 0.14
174 0.14
175 0.09
176 0.06
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.04
181 0.05
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.04
202 0.05
203 0.06
204 0.08
205 0.1
206 0.12
207 0.15
208 0.19
209 0.22
210 0.29
211 0.3
212 0.38
213 0.4
214 0.39
215 0.39
216 0.37
217 0.34
218 0.28
219 0.27
220 0.2
221 0.17
222 0.15
223 0.14
224 0.12
225 0.11
226 0.08
227 0.07
228 0.06
229 0.05
230 0.06
231 0.07
232 0.08
233 0.08
234 0.09
235 0.1
236 0.13
237 0.13
238 0.13
239 0.13
240 0.13
241 0.13
242 0.13
243 0.13
244 0.13
245 0.12
246 0.12
247 0.14
248 0.17
249 0.17
250 0.21
251 0.22
252 0.26
253 0.29
254 0.36
255 0.35
256 0.33
257 0.32
258 0.33
259 0.4
260 0.36
261 0.34
262 0.32
263 0.34
264 0.36
265 0.36
266 0.31
267 0.23
268 0.22
269 0.21
270 0.16
271 0.12
272 0.1
273 0.1
274 0.1
275 0.08
276 0.07
277 0.06
278 0.05
279 0.06
280 0.1
281 0.11
282 0.11
283 0.13
284 0.15
285 0.19
286 0.28
287 0.35
288 0.36
289 0.43
290 0.48
291 0.55
292 0.6
293 0.57
294 0.51
295 0.49
296 0.46
297 0.38
298 0.33
299 0.25
300 0.19
301 0.17
302 0.14
303 0.08
304 0.07
305 0.09
306 0.16
307 0.24
308 0.34
309 0.4
310 0.46
311 0.5
312 0.59
313 0.66
314 0.7
315 0.71
316 0.7
317 0.66
318 0.63
319 0.62
320 0.54
321 0.5
322 0.4
323 0.31
324 0.27
325 0.27
326 0.31
327 0.37
328 0.4
329 0.46
330 0.56
331 0.61
332 0.67
333 0.75
334 0.8
335 0.79
336 0.85
337 0.85
338 0.81
339 0.81
340 0.73
341 0.64
342 0.54
343 0.46
344 0.36
345 0.3
346 0.24
347 0.19
348 0.27
349 0.32
350 0.4
351 0.46
352 0.55
353 0.63
354 0.74
355 0.82
356 0.85
357 0.88
358 0.9
359 0.95
360 0.95
361 0.93