Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0S6XBE6

Protein Details
Accession A0A0S6XBE6    Localization Confidence High Confidence Score 17.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
174-193DPENRRYDKRFDRRGRDGRGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
182-205KRFDRRGRDGRGGQRNGERRGRPR
293-300RRAARRRS
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 3, pero 2, cyto_mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019416  NCBP3  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000340  F:RNA 7-methylguanosine cap binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10309  NCBP3  
Amino Acid Sequences MDDSMDIDIDLGVDVDYGQPLEEPMLAENAVIASAVHAQPAVDDDIPEAYKDDFDANFPAKEKIFISGLDHVAQPLIEQFIQEHVPEGRYRRLEWIDDNSANIIFYKPEDAADALNRLSVAQDTLPTPLDLRPAKPFAARPDLQFSVRQALVSDKKKPGAKDRSAFYLFNPEWDPENRRYDKRFDRRGRDGRGGQRNGERRGRPRQQEAFTEDMYDDAVPGQTADERELSRRMSTTSLSSDSQETRRRRRYDGDKDLFAGADRRDAGRLRDRSRSPARDEDGRYGFKEDQPQRRAARRRSWTPPSKRAATDNRVSNAGKELFSNRAASSSSTPLSNGSRAVELFPNHSAKRSRELFPHKTAHSNHRRTDALDKQETAEILMPNPRSLADRITGAPDSSAVRGRGTVRADDGFAIRGAGDAQPGFSIRGASKELNPKVKELFPDKVAANNAGKELFPNRGGPRRRAEDLFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.05
2 0.05
3 0.06
4 0.06
5 0.06
6 0.06
7 0.06
8 0.08
9 0.08
10 0.08
11 0.09
12 0.11
13 0.11
14 0.1
15 0.1
16 0.09
17 0.08
18 0.07
19 0.06
20 0.05
21 0.09
22 0.1
23 0.1
24 0.1
25 0.1
26 0.1
27 0.13
28 0.15
29 0.11
30 0.11
31 0.12
32 0.15
33 0.15
34 0.16
35 0.15
36 0.12
37 0.12
38 0.12
39 0.15
40 0.12
41 0.14
42 0.19
43 0.2
44 0.21
45 0.23
46 0.25
47 0.22
48 0.24
49 0.23
50 0.21
51 0.2
52 0.19
53 0.21
54 0.23
55 0.25
56 0.24
57 0.23
58 0.2
59 0.19
60 0.17
61 0.13
62 0.09
63 0.1
64 0.09
65 0.09
66 0.09
67 0.12
68 0.13
69 0.13
70 0.14
71 0.13
72 0.15
73 0.18
74 0.22
75 0.26
76 0.27
77 0.29
78 0.34
79 0.36
80 0.38
81 0.39
82 0.42
83 0.42
84 0.4
85 0.39
86 0.33
87 0.3
88 0.26
89 0.22
90 0.15
91 0.08
92 0.09
93 0.1
94 0.09
95 0.09
96 0.11
97 0.11
98 0.12
99 0.13
100 0.14
101 0.12
102 0.12
103 0.12
104 0.1
105 0.1
106 0.09
107 0.08
108 0.07
109 0.08
110 0.09
111 0.11
112 0.11
113 0.11
114 0.12
115 0.12
116 0.18
117 0.19
118 0.2
119 0.24
120 0.26
121 0.27
122 0.29
123 0.31
124 0.3
125 0.37
126 0.36
127 0.34
128 0.38
129 0.39
130 0.37
131 0.35
132 0.31
133 0.28
134 0.27
135 0.24
136 0.18
137 0.22
138 0.29
139 0.31
140 0.36
141 0.34
142 0.4
143 0.43
144 0.46
145 0.49
146 0.51
147 0.55
148 0.54
149 0.53
150 0.55
151 0.55
152 0.52
153 0.43
154 0.42
155 0.34
156 0.31
157 0.3
158 0.24
159 0.23
160 0.26
161 0.3
162 0.25
163 0.34
164 0.36
165 0.39
166 0.42
167 0.48
168 0.55
169 0.61
170 0.66
171 0.66
172 0.7
173 0.76
174 0.81
175 0.79
176 0.76
177 0.73
178 0.71
179 0.72
180 0.66
181 0.58
182 0.57
183 0.58
184 0.56
185 0.56
186 0.52
187 0.49
188 0.57
189 0.62
190 0.6
191 0.62
192 0.64
193 0.6
194 0.6
195 0.58
196 0.51
197 0.42
198 0.38
199 0.29
200 0.21
201 0.18
202 0.13
203 0.08
204 0.05
205 0.05
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.05
210 0.05
211 0.06
212 0.08
213 0.08
214 0.1
215 0.13
216 0.13
217 0.13
218 0.13
219 0.13
220 0.13
221 0.13
222 0.13
223 0.14
224 0.16
225 0.15
226 0.16
227 0.17
228 0.18
229 0.22
230 0.29
231 0.32
232 0.39
233 0.48
234 0.5
235 0.52
236 0.58
237 0.63
238 0.66
239 0.71
240 0.66
241 0.58
242 0.56
243 0.53
244 0.44
245 0.33
246 0.25
247 0.14
248 0.12
249 0.12
250 0.11
251 0.13
252 0.14
253 0.18
254 0.24
255 0.3
256 0.32
257 0.39
258 0.4
259 0.47
260 0.54
261 0.56
262 0.52
263 0.52
264 0.52
265 0.51
266 0.52
267 0.5
268 0.46
269 0.43
270 0.38
271 0.35
272 0.33
273 0.29
274 0.36
275 0.37
276 0.42
277 0.43
278 0.49
279 0.5
280 0.58
281 0.65
282 0.63
283 0.65
284 0.64
285 0.68
286 0.7
287 0.75
288 0.77
289 0.77
290 0.78
291 0.74
292 0.71
293 0.65
294 0.65
295 0.63
296 0.6
297 0.57
298 0.54
299 0.49
300 0.48
301 0.46
302 0.39
303 0.36
304 0.31
305 0.24
306 0.2
307 0.2
308 0.2
309 0.21
310 0.22
311 0.17
312 0.16
313 0.17
314 0.17
315 0.18
316 0.18
317 0.18
318 0.16
319 0.16
320 0.18
321 0.19
322 0.18
323 0.17
324 0.14
325 0.15
326 0.15
327 0.17
328 0.18
329 0.17
330 0.18
331 0.21
332 0.26
333 0.24
334 0.29
335 0.32
336 0.31
337 0.39
338 0.4
339 0.4
340 0.44
341 0.54
342 0.56
343 0.58
344 0.62
345 0.56
346 0.59
347 0.6
348 0.61
349 0.62
350 0.63
351 0.6
352 0.59
353 0.58
354 0.53
355 0.58
356 0.55
357 0.53
358 0.5
359 0.47
360 0.42
361 0.43
362 0.4
363 0.32
364 0.28
365 0.2
366 0.17
367 0.21
368 0.2
369 0.18
370 0.19
371 0.18
372 0.17
373 0.18
374 0.19
375 0.16
376 0.18
377 0.19
378 0.23
379 0.23
380 0.2
381 0.19
382 0.17
383 0.17
384 0.17
385 0.2
386 0.17
387 0.17
388 0.19
389 0.21
390 0.26
391 0.26
392 0.26
393 0.25
394 0.26
395 0.26
396 0.25
397 0.24
398 0.19
399 0.16
400 0.14
401 0.11
402 0.1
403 0.1
404 0.09
405 0.1
406 0.09
407 0.09
408 0.1
409 0.11
410 0.12
411 0.11
412 0.14
413 0.12
414 0.16
415 0.2
416 0.21
417 0.27
418 0.36
419 0.43
420 0.49
421 0.5
422 0.5
423 0.51
424 0.52
425 0.53
426 0.49
427 0.47
428 0.4
429 0.44
430 0.41
431 0.41
432 0.4
433 0.39
434 0.37
435 0.33
436 0.32
437 0.28
438 0.28
439 0.25
440 0.26
441 0.25
442 0.23
443 0.29
444 0.34
445 0.42
446 0.49
447 0.53
448 0.6
449 0.62
450 0.66