Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0S6XEJ5

Protein Details
Accession A0A0S6XEJ5    Localization Confidence High Confidence Score 22
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MARGNQRDKAREKNQKEAAKHydrophilic
56-81AGQHTQPTPRRLQKGRRSDPWVNRGAHydrophilic
321-347GREVWEKRVKNEEKRRRSKAEKLKEMGBasic
406-431EQDVAGEKRKKGRKEKKGTKKARLSTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
299-343ANRRFKAMPRNRLERGQLERPRGREVWEKRVKNEEKRRRSKAEKL
412-429EKRKKGRKEKKGTKKARL
Subcellular Location(s) nucl 19, mito 5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR007513  SERF-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04419  4F5  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MARGNQRDKAREKNQKEAAKAVTTHTTQKSKNSMTGTEFAKAKEDAAAIMRAKQAAGQHTQPTPRRLQKGRRSDPWVNRGAIEPTEVKKRTKVAVLEPTIAEMPAENADTALVGNKKDTSKTTKPAKTPKPVKEVKSSIKDDFAGFSDSESETQEIAADHTNALLAGFSSDSESDGEQVAAVTKIPALPESADLKAELASAAVNPDSVPGTIYVGRVPHGFYEPQMRAYFSQFGTISRLRLSRNKLTGKSKHYAYIEFESSSVAEIAAKTMDKYLMFGHILQVRRLLPEEIHPELFKGANRRFKAMPRNRLERGQLERPRGREVWEKRVKNEEKRRRSKAEKLKEMGYEFEMPTVRKVSSVPKKPEDKVIVEAELPEIADAQQTEEQSEIADVSSAAIEDPSQTGEQDVAGEKRKKGRKEKKGTKKARLST
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.78
3 0.75
4 0.71
5 0.66
6 0.61
7 0.56
8 0.49
9 0.46
10 0.42
11 0.46
12 0.47
13 0.49
14 0.46
15 0.52
16 0.58
17 0.55
18 0.58
19 0.55
20 0.52
21 0.49
22 0.52
23 0.47
24 0.43
25 0.41
26 0.35
27 0.35
28 0.31
29 0.26
30 0.23
31 0.21
32 0.17
33 0.18
34 0.22
35 0.19
36 0.22
37 0.23
38 0.21
39 0.2
40 0.21
41 0.23
42 0.22
43 0.26
44 0.28
45 0.31
46 0.35
47 0.44
48 0.47
49 0.49
50 0.54
51 0.57
52 0.62
53 0.66
54 0.73
55 0.74
56 0.8
57 0.83
58 0.83
59 0.83
60 0.84
61 0.84
62 0.82
63 0.78
64 0.67
65 0.59
66 0.53
67 0.47
68 0.37
69 0.31
70 0.26
71 0.23
72 0.32
73 0.34
74 0.33
75 0.34
76 0.38
77 0.38
78 0.41
79 0.42
80 0.4
81 0.47
82 0.49
83 0.47
84 0.43
85 0.41
86 0.35
87 0.31
88 0.22
89 0.12
90 0.1
91 0.08
92 0.09
93 0.07
94 0.06
95 0.06
96 0.07
97 0.07
98 0.09
99 0.1
100 0.09
101 0.11
102 0.14
103 0.16
104 0.18
105 0.22
106 0.27
107 0.33
108 0.42
109 0.51
110 0.54
111 0.61
112 0.69
113 0.74
114 0.76
115 0.79
116 0.78
117 0.78
118 0.78
119 0.75
120 0.74
121 0.72
122 0.7
123 0.69
124 0.65
125 0.56
126 0.52
127 0.48
128 0.39
129 0.33
130 0.26
131 0.2
132 0.15
133 0.14
134 0.13
135 0.12
136 0.13
137 0.12
138 0.12
139 0.09
140 0.09
141 0.1
142 0.08
143 0.08
144 0.09
145 0.08
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.06
150 0.06
151 0.05
152 0.03
153 0.03
154 0.03
155 0.03
156 0.04
157 0.05
158 0.05
159 0.06
160 0.06
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.05
168 0.05
169 0.04
170 0.04
171 0.05
172 0.05
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.09
177 0.11
178 0.11
179 0.11
180 0.11
181 0.11
182 0.1
183 0.1
184 0.07
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.06
198 0.07
199 0.08
200 0.08
201 0.08
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.08
206 0.09
207 0.09
208 0.09
209 0.16
210 0.16
211 0.19
212 0.19
213 0.19
214 0.18
215 0.21
216 0.23
217 0.16
218 0.19
219 0.16
220 0.16
221 0.2
222 0.2
223 0.18
224 0.17
225 0.19
226 0.19
227 0.24
228 0.3
229 0.32
230 0.39
231 0.44
232 0.48
233 0.54
234 0.59
235 0.59
236 0.57
237 0.52
238 0.49
239 0.45
240 0.42
241 0.37
242 0.34
243 0.29
244 0.25
245 0.24
246 0.18
247 0.17
248 0.15
249 0.11
250 0.07
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.08
259 0.07
260 0.09
261 0.09
262 0.11
263 0.11
264 0.11
265 0.14
266 0.18
267 0.19
268 0.18
269 0.21
270 0.19
271 0.19
272 0.21
273 0.18
274 0.14
275 0.18
276 0.23
277 0.23
278 0.23
279 0.22
280 0.21
281 0.21
282 0.22
283 0.19
284 0.22
285 0.26
286 0.33
287 0.35
288 0.38
289 0.4
290 0.46
291 0.55
292 0.56
293 0.6
294 0.59
295 0.66
296 0.65
297 0.68
298 0.65
299 0.61
300 0.59
301 0.59
302 0.57
303 0.59
304 0.6
305 0.57
306 0.59
307 0.52
308 0.49
309 0.49
310 0.49
311 0.51
312 0.56
313 0.57
314 0.55
315 0.65
316 0.68
317 0.69
318 0.74
319 0.74
320 0.75
321 0.82
322 0.87
323 0.86
324 0.86
325 0.86
326 0.86
327 0.86
328 0.84
329 0.78
330 0.75
331 0.7
332 0.63
333 0.55
334 0.47
335 0.4
336 0.3
337 0.3
338 0.27
339 0.23
340 0.24
341 0.24
342 0.2
343 0.17
344 0.19
345 0.26
346 0.34
347 0.43
348 0.49
349 0.55
350 0.63
351 0.64
352 0.72
353 0.67
354 0.61
355 0.56
356 0.52
357 0.45
358 0.38
359 0.36
360 0.27
361 0.21
362 0.17
363 0.12
364 0.09
365 0.07
366 0.08
367 0.08
368 0.11
369 0.13
370 0.13
371 0.14
372 0.14
373 0.14
374 0.13
375 0.13
376 0.1
377 0.07
378 0.07
379 0.06
380 0.06
381 0.07
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.06
387 0.07
388 0.1
389 0.1
390 0.1
391 0.11
392 0.11
393 0.11
394 0.12
395 0.15
396 0.17
397 0.26
398 0.31
399 0.35
400 0.44
401 0.53
402 0.6
403 0.68
404 0.74
405 0.77
406 0.83
407 0.9
408 0.92
409 0.95
410 0.96
411 0.95