Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q4X105

Protein Details
Accession Q4X105    Localization Confidence High Confidence Score 19.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
188-216DPPEKEPEIKSKKKKGKTRKSDRDWSEGSBasic
893-917VSASDYEPPSRRRRTRNSGQRTRGKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
179-208KRWRIASGLDPPEKEPEIKSKKKKGKTRKS
468-471KTKG
473-473R
477-486EKIPVPGRKR
903-917RRRRTRNSGQRTRGK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018327  BHD_2  
IPR004583  DNA_repair_Rad4  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR018325  Rad4/PNGase_transGLS-fold  
IPR018326  Rad4_beta-hairpin_dom1  
IPR018328  Rad4_beta-hairpin_dom3  
IPR042488  Rad4_BHD3_sf  
IPR036985  Transglutaminase-like_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000111  C:nucleotide-excision repair factor 2 complex  
GO:0071942  C:XPC complex  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0003697  F:single-stranded DNA binding  
GO:0006298  P:mismatch repair  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
KEGG afm:AFUA_2G11660  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10403  BHD_1  
PF10404  BHD_2  
PF10405  BHD_3  
PF03835  Rad4  
Amino Acid Sequences MPPFVPRKRVSSEDPPTAKRQNATPIVEIADFDEDSDSESSLSDAPSFDDEPLAKRDLQKQKKQASDGSESESESDDDDEVDWEDAIDSKLTSTSISTPAPAVQDLELTLDKNEVHLADIADGKKGPSKIERQIRIATHCLHVQFLLYHNAVRNAWANDTKVHEILRQKIPAGIHKEVKRWRIASGLDPPEKEPEIKSKKKKGKTRKSDRDWSEGSSRVEPGKPDMSRGDPIISLLRILAAYWRKQFKITVPGLRKGGYRPMARLEAEISSFQKDGHDPERHGERIRDIEEFRSAAERMEGSRDLGAQLFTALVRALGMEARLVANLQPLGFGWTKAEAYTPRPKVDEGPVEENGGSEPIVGLESDSTDSESDPAHKYNPRKYDKDLPFPIYWTEVASPVTHEIIPVDPLILSNPVATTPELQAAFEPRGAKAEKAKQVICYVVAYSSDKTAKDVTTRYLRRRTWPGKTKGYRIPVEKIPVPGRKRKFFEYDWFRTILRVYERSEENRTKVDEIEDTTDLRPNQPEKKQVKEGDTLQSLRSSTEFVLERFLRREEALRPGAQPVRTFVSGKGDKAKEEKVYRRADVLKCLSAESWHKEGRRIKMGEAPLKLVPIRAVTLLRKREVDEMERETGEKPKQGLYAKYQTEYIIPPPIRDGIIPKNEYGNIDCFVPSMVPRGAVHIPWPGTVRICKELGIDYAEAVTGFEFGSKMAVPVIQGVVVASENEDLVKDAWRAEDAEKRKKEQLKAEKRILQTWRKFLFGLRIAERVREEYGAEDGDMERESHNPFASRQARSQARPPAVPEALHDWHGEPADRGGGFLLPGDDDGDDGDLVVEDHHPRQAHPPVQQTEALSQDEGEEGTGYDAVSISSDGPGDLSSPQQISDSEETEPSVSASDYEPPSRRRRTRNSGQRTRGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.67
3 0.68
4 0.69
5 0.65
6 0.57
7 0.54
8 0.54
9 0.56
10 0.56
11 0.5
12 0.46
13 0.45
14 0.42
15 0.36
16 0.28
17 0.23
18 0.18
19 0.16
20 0.15
21 0.12
22 0.14
23 0.15
24 0.13
25 0.1
26 0.1
27 0.11
28 0.11
29 0.12
30 0.1
31 0.1
32 0.11
33 0.15
34 0.16
35 0.15
36 0.18
37 0.18
38 0.2
39 0.24
40 0.25
41 0.24
42 0.28
43 0.38
44 0.45
45 0.55
46 0.61
47 0.67
48 0.74
49 0.79
50 0.79
51 0.75
52 0.71
53 0.69
54 0.61
55 0.58
56 0.5
57 0.43
58 0.39
59 0.34
60 0.27
61 0.21
62 0.19
63 0.13
64 0.11
65 0.11
66 0.11
67 0.11
68 0.11
69 0.09
70 0.08
71 0.08
72 0.09
73 0.09
74 0.09
75 0.08
76 0.08
77 0.09
78 0.09
79 0.09
80 0.1
81 0.12
82 0.16
83 0.17
84 0.17
85 0.17
86 0.19
87 0.21
88 0.19
89 0.17
90 0.13
91 0.14
92 0.13
93 0.15
94 0.14
95 0.13
96 0.13
97 0.13
98 0.13
99 0.12
100 0.14
101 0.1
102 0.11
103 0.12
104 0.12
105 0.13
106 0.18
107 0.17
108 0.17
109 0.18
110 0.17
111 0.2
112 0.21
113 0.23
114 0.25
115 0.33
116 0.41
117 0.51
118 0.56
119 0.56
120 0.62
121 0.62
122 0.6
123 0.58
124 0.51
125 0.44
126 0.41
127 0.36
128 0.31
129 0.26
130 0.22
131 0.18
132 0.18
133 0.21
134 0.18
135 0.19
136 0.2
137 0.24
138 0.22
139 0.23
140 0.25
141 0.21
142 0.25
143 0.26
144 0.26
145 0.26
146 0.31
147 0.32
148 0.29
149 0.28
150 0.29
151 0.31
152 0.37
153 0.41
154 0.38
155 0.36
156 0.37
157 0.38
158 0.41
159 0.42
160 0.41
161 0.42
162 0.44
163 0.51
164 0.55
165 0.58
166 0.58
167 0.52
168 0.47
169 0.45
170 0.43
171 0.4
172 0.43
173 0.46
174 0.43
175 0.43
176 0.43
177 0.42
178 0.41
179 0.37
180 0.29
181 0.31
182 0.38
183 0.46
184 0.55
185 0.61
186 0.69
187 0.78
188 0.86
189 0.87
190 0.88
191 0.89
192 0.91
193 0.92
194 0.91
195 0.92
196 0.87
197 0.83
198 0.74
199 0.68
200 0.61
201 0.56
202 0.5
203 0.42
204 0.39
205 0.33
206 0.33
207 0.29
208 0.28
209 0.31
210 0.28
211 0.29
212 0.3
213 0.3
214 0.31
215 0.31
216 0.28
217 0.2
218 0.21
219 0.21
220 0.18
221 0.14
222 0.12
223 0.11
224 0.09
225 0.09
226 0.13
227 0.15
228 0.19
229 0.25
230 0.3
231 0.3
232 0.32
233 0.34
234 0.33
235 0.39
236 0.41
237 0.44
238 0.45
239 0.5
240 0.5
241 0.49
242 0.45
243 0.38
244 0.4
245 0.38
246 0.35
247 0.32
248 0.35
249 0.37
250 0.36
251 0.35
252 0.28
253 0.22
254 0.21
255 0.21
256 0.17
257 0.16
258 0.15
259 0.14
260 0.14
261 0.14
262 0.17
263 0.23
264 0.26
265 0.25
266 0.3
267 0.36
268 0.37
269 0.38
270 0.35
271 0.31
272 0.32
273 0.32
274 0.31
275 0.26
276 0.26
277 0.26
278 0.24
279 0.21
280 0.19
281 0.17
282 0.14
283 0.14
284 0.12
285 0.11
286 0.14
287 0.14
288 0.12
289 0.13
290 0.13
291 0.12
292 0.12
293 0.11
294 0.07
295 0.07
296 0.06
297 0.05
298 0.06
299 0.05
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.06
313 0.07
314 0.07
315 0.06
316 0.06
317 0.1
318 0.1
319 0.1
320 0.09
321 0.1
322 0.11
323 0.11
324 0.13
325 0.11
326 0.17
327 0.26
328 0.28
329 0.28
330 0.3
331 0.3
332 0.31
333 0.35
334 0.36
335 0.31
336 0.33
337 0.32
338 0.32
339 0.31
340 0.28
341 0.22
342 0.15
343 0.11
344 0.05
345 0.05
346 0.04
347 0.04
348 0.04
349 0.04
350 0.03
351 0.04
352 0.05
353 0.05
354 0.06
355 0.06
356 0.06
357 0.07
358 0.07
359 0.09
360 0.1
361 0.11
362 0.14
363 0.19
364 0.24
365 0.31
366 0.41
367 0.44
368 0.46
369 0.5
370 0.58
371 0.59
372 0.63
373 0.61
374 0.56
375 0.5
376 0.47
377 0.43
378 0.34
379 0.27
380 0.19
381 0.15
382 0.11
383 0.11
384 0.1
385 0.1
386 0.1
387 0.11
388 0.09
389 0.08
390 0.08
391 0.07
392 0.08
393 0.07
394 0.06
395 0.05
396 0.05
397 0.06
398 0.06
399 0.06
400 0.05
401 0.05
402 0.05
403 0.06
404 0.07
405 0.07
406 0.07
407 0.1
408 0.1
409 0.1
410 0.1
411 0.12
412 0.12
413 0.13
414 0.13
415 0.09
416 0.13
417 0.13
418 0.14
419 0.18
420 0.25
421 0.28
422 0.32
423 0.33
424 0.31
425 0.32
426 0.31
427 0.26
428 0.19
429 0.13
430 0.1
431 0.1
432 0.1
433 0.09
434 0.11
435 0.12
436 0.11
437 0.12
438 0.14
439 0.13
440 0.14
441 0.15
442 0.17
443 0.25
444 0.3
445 0.35
446 0.42
447 0.43
448 0.46
449 0.55
450 0.57
451 0.58
452 0.63
453 0.64
454 0.66
455 0.68
456 0.69
457 0.65
458 0.66
459 0.6
460 0.53
461 0.5
462 0.43
463 0.43
464 0.38
465 0.36
466 0.35
467 0.38
468 0.39
469 0.43
470 0.46
471 0.49
472 0.51
473 0.51
474 0.51
475 0.47
476 0.53
477 0.54
478 0.54
479 0.49
480 0.47
481 0.42
482 0.37
483 0.34
484 0.28
485 0.22
486 0.19
487 0.19
488 0.22
489 0.24
490 0.27
491 0.33
492 0.32
493 0.31
494 0.31
495 0.3
496 0.27
497 0.25
498 0.23
499 0.18
500 0.17
501 0.18
502 0.16
503 0.16
504 0.15
505 0.18
506 0.17
507 0.16
508 0.18
509 0.19
510 0.25
511 0.28
512 0.38
513 0.38
514 0.44
515 0.51
516 0.52
517 0.52
518 0.49
519 0.48
520 0.44
521 0.43
522 0.38
523 0.3
524 0.28
525 0.24
526 0.2
527 0.17
528 0.13
529 0.1
530 0.13
531 0.14
532 0.12
533 0.18
534 0.18
535 0.19
536 0.2
537 0.21
538 0.18
539 0.17
540 0.2
541 0.17
542 0.23
543 0.25
544 0.24
545 0.24
546 0.27
547 0.3
548 0.28
549 0.26
550 0.21
551 0.22
552 0.22
553 0.23
554 0.19
555 0.25
556 0.25
557 0.26
558 0.32
559 0.29
560 0.29
561 0.32
562 0.35
563 0.32
564 0.38
565 0.44
566 0.45
567 0.49
568 0.48
569 0.49
570 0.53
571 0.47
572 0.48
573 0.44
574 0.38
575 0.34
576 0.33
577 0.28
578 0.24
579 0.27
580 0.24
581 0.25
582 0.27
583 0.27
584 0.34
585 0.4
586 0.43
587 0.48
588 0.44
589 0.41
590 0.44
591 0.49
592 0.48
593 0.43
594 0.39
595 0.31
596 0.31
597 0.29
598 0.23
599 0.18
600 0.13
601 0.13
602 0.11
603 0.13
604 0.17
605 0.25
606 0.28
607 0.3
608 0.3
609 0.31
610 0.35
611 0.35
612 0.35
613 0.33
614 0.33
615 0.33
616 0.32
617 0.32
618 0.27
619 0.3
620 0.28
621 0.25
622 0.21
623 0.22
624 0.27
625 0.29
626 0.32
627 0.33
628 0.4
629 0.39
630 0.39
631 0.37
632 0.32
633 0.31
634 0.29
635 0.24
636 0.23
637 0.21
638 0.21
639 0.21
640 0.22
641 0.21
642 0.19
643 0.22
644 0.22
645 0.29
646 0.3
647 0.29
648 0.3
649 0.31
650 0.32
651 0.3
652 0.24
653 0.17
654 0.17
655 0.16
656 0.13
657 0.12
658 0.12
659 0.1
660 0.11
661 0.11
662 0.12
663 0.12
664 0.16
665 0.18
666 0.17
667 0.19
668 0.19
669 0.2
670 0.19
671 0.22
672 0.18
673 0.2
674 0.23
675 0.25
676 0.23
677 0.23
678 0.22
679 0.22
680 0.22
681 0.21
682 0.21
683 0.17
684 0.13
685 0.13
686 0.12
687 0.11
688 0.09
689 0.07
690 0.05
691 0.04
692 0.05
693 0.05
694 0.05
695 0.06
696 0.06
697 0.06
698 0.06
699 0.07
700 0.07
701 0.08
702 0.08
703 0.07
704 0.07
705 0.06
706 0.07
707 0.06
708 0.06
709 0.05
710 0.05
711 0.05
712 0.06
713 0.06
714 0.06
715 0.07
716 0.09
717 0.09
718 0.1
719 0.11
720 0.12
721 0.14
722 0.16
723 0.24
724 0.29
725 0.39
726 0.42
727 0.46
728 0.54
729 0.59
730 0.63
731 0.65
732 0.69
733 0.7
734 0.74
735 0.79
736 0.78
737 0.73
738 0.73
739 0.71
740 0.7
741 0.66
742 0.67
743 0.6
744 0.55
745 0.53
746 0.48
747 0.48
748 0.44
749 0.44
750 0.37
751 0.41
752 0.4
753 0.43
754 0.42
755 0.36
756 0.31
757 0.25
758 0.23
759 0.18
760 0.19
761 0.17
762 0.15
763 0.13
764 0.11
765 0.12
766 0.12
767 0.11
768 0.1
769 0.11
770 0.14
771 0.15
772 0.17
773 0.17
774 0.18
775 0.27
776 0.34
777 0.35
778 0.37
779 0.44
780 0.49
781 0.52
782 0.59
783 0.58
784 0.56
785 0.55
786 0.54
787 0.53
788 0.48
789 0.44
790 0.39
791 0.37
792 0.34
793 0.33
794 0.3
795 0.23
796 0.24
797 0.25
798 0.23
799 0.16
800 0.16
801 0.18
802 0.17
803 0.16
804 0.14
805 0.13
806 0.12
807 0.12
808 0.11
809 0.07
810 0.08
811 0.08
812 0.07
813 0.07
814 0.07
815 0.08
816 0.07
817 0.06
818 0.06
819 0.05
820 0.06
821 0.06
822 0.08
823 0.1
824 0.12
825 0.16
826 0.17
827 0.18
828 0.26
829 0.35
830 0.39
831 0.43
832 0.51
833 0.5
834 0.53
835 0.55
836 0.49
837 0.44
838 0.41
839 0.36
840 0.27
841 0.23
842 0.2
843 0.18
844 0.16
845 0.12
846 0.09
847 0.07
848 0.08
849 0.08
850 0.07
851 0.07
852 0.07
853 0.06
854 0.07
855 0.07
856 0.07
857 0.07
858 0.08
859 0.07
860 0.08
861 0.08
862 0.08
863 0.09
864 0.1
865 0.13
866 0.13
867 0.14
868 0.15
869 0.15
870 0.21
871 0.23
872 0.23
873 0.22
874 0.22
875 0.23
876 0.22
877 0.22
878 0.16
879 0.13
880 0.11
881 0.11
882 0.11
883 0.17
884 0.2
885 0.27
886 0.33
887 0.39
888 0.48
889 0.58
890 0.66
891 0.69
892 0.77
893 0.8
894 0.85
895 0.89
896 0.91
897 0.91