Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0S6XCX4

Protein Details
Accession A0A0S6XCX4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
30-51DTIPSKPKKRVSKTTTKGQTRNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
101-138KPVAESKAKGGRGKRKSAASTASPAAAGRAGRPAKKAK
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 5, mito 2, pero 1, cysk 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016197  Chromo-like_dom_sf  
IPR008251  Chromo_shadow_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF01393  Chromo_shadow  
Amino Acid Sequences MEQRPEIRAMRSNGVKGLVQDEESLSEDLDTIPSKPKKRVSKTTTKGQTRNESDEDGETDGADNDVAEAAEDEEDDGSEDGETEEGAADMLEEYHKSIGGKPVAESKAKGGRGKRKSAASTASPAAAGRAGRPAKKAKSNGEGWTPPIGTWEDKVQSIQTICDDNERTNGKDKMTLHVFMQFNDGHRTKFPMELVRQKCPQKVGRIWQASKGHVSDKSQLLDYYEQHLWVEGRHVV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.39
3 0.32
4 0.31
5 0.24
6 0.2
7 0.19
8 0.18
9 0.17
10 0.18
11 0.17
12 0.14
13 0.12
14 0.11
15 0.1
16 0.12
17 0.11
18 0.1
19 0.19
20 0.25
21 0.3
22 0.37
23 0.46
24 0.54
25 0.63
26 0.73
27 0.72
28 0.77
29 0.79
30 0.83
31 0.84
32 0.82
33 0.8
34 0.77
35 0.78
36 0.73
37 0.72
38 0.64
39 0.56
40 0.48
41 0.43
42 0.37
43 0.28
44 0.22
45 0.16
46 0.13
47 0.11
48 0.1
49 0.08
50 0.06
51 0.04
52 0.04
53 0.04
54 0.04
55 0.04
56 0.04
57 0.04
58 0.04
59 0.04
60 0.04
61 0.04
62 0.05
63 0.05
64 0.04
65 0.04
66 0.04
67 0.04
68 0.04
69 0.04
70 0.03
71 0.03
72 0.03
73 0.03
74 0.03
75 0.03
76 0.03
77 0.03
78 0.03
79 0.03
80 0.04
81 0.04
82 0.05
83 0.06
84 0.07
85 0.13
86 0.14
87 0.14
88 0.14
89 0.21
90 0.23
91 0.23
92 0.22
93 0.21
94 0.26
95 0.28
96 0.31
97 0.31
98 0.38
99 0.43
100 0.49
101 0.5
102 0.48
103 0.47
104 0.47
105 0.44
106 0.36
107 0.33
108 0.27
109 0.23
110 0.18
111 0.16
112 0.13
113 0.11
114 0.09
115 0.06
116 0.13
117 0.15
118 0.16
119 0.2
120 0.26
121 0.3
122 0.37
123 0.42
124 0.4
125 0.44
126 0.47
127 0.46
128 0.45
129 0.42
130 0.37
131 0.35
132 0.29
133 0.23
134 0.21
135 0.19
136 0.14
137 0.14
138 0.16
139 0.14
140 0.14
141 0.15
142 0.14
143 0.15
144 0.14
145 0.14
146 0.12
147 0.13
148 0.13
149 0.17
150 0.18
151 0.16
152 0.22
153 0.24
154 0.24
155 0.29
156 0.31
157 0.27
158 0.31
159 0.32
160 0.33
161 0.34
162 0.33
163 0.27
164 0.32
165 0.32
166 0.27
167 0.3
168 0.24
169 0.22
170 0.28
171 0.29
172 0.23
173 0.23
174 0.28
175 0.25
176 0.28
177 0.29
178 0.3
179 0.36
180 0.44
181 0.48
182 0.51
183 0.57
184 0.59
185 0.59
186 0.59
187 0.58
188 0.57
189 0.6
190 0.63
191 0.66
192 0.7
193 0.68
194 0.69
195 0.68
196 0.61
197 0.58
198 0.51
199 0.45
200 0.4
201 0.42
202 0.4
203 0.4
204 0.4
205 0.37
206 0.35
207 0.34
208 0.34
209 0.32
210 0.31
211 0.27
212 0.25
213 0.23
214 0.25
215 0.21
216 0.18