Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0S6XGC9

Protein Details
Accession A0A0S6XGC9    Localization Confidence High Confidence Score 15
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
109-131ATATGGKKEKKGKGKQKLEDALAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
114-124GKKEKKGKGKQ
340-343KKRK
464-502GGKSRRDIGIAPGRKGKRGVHGEGLKELDEIRKGLGKAR
Subcellular Location(s) mito 16, nucl 8, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MPRRQFIDKKSATTFALVHRAQNDPLIHSSDAPQMVFAEIGSSSRQPPGQSKKVKERGDLEEEFGMAFRKNEGQAAEYGVFYDDTEYDYMQHLRDLGSGEGGEVAWVPATATGGKKEKKGKGKQKLEDALAGIGLDDVDDAASEGGISLSSRDTSASQHSLLPDDMLPSEFVKKQTYQDQQDIPDAIAGFQPDMDPRLREVLEALEDDAYVDDEEDIFAELQGDGEEVDEDEFYDQHWDRGRQSDSMARFLQQEQADDDGWESDDTIKADNEPAQPVLPVEGVALPPADPNATPAADPSNGAWMSEFSKFKSTLKDAKGVPSQITGDRSMLSSLAAGRTKKRKGAKTSTTNYSMTSSALARTDPQTLLDARFDKLMESYDAEDYGEEGQLDSISEADDMSLASGVSGISRASRFSKTDSIASGISRTSRISTYSRMTDSEAPQLVRSDFDNIMDSFLGTQTSKGGKSRRDIGIAPGRKGKRGVHGEGLKELDEIRKGLGKARIEQRAG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.38
3 0.42
4 0.37
5 0.36
6 0.35
7 0.37
8 0.35
9 0.38
10 0.34
11 0.28
12 0.3
13 0.31
14 0.29
15 0.27
16 0.29
17 0.29
18 0.29
19 0.25
20 0.22
21 0.19
22 0.18
23 0.17
24 0.14
25 0.09
26 0.07
27 0.09
28 0.11
29 0.12
30 0.13
31 0.16
32 0.19
33 0.2
34 0.3
35 0.39
36 0.47
37 0.54
38 0.61
39 0.69
40 0.77
41 0.79
42 0.76
43 0.73
44 0.71
45 0.7
46 0.63
47 0.55
48 0.46
49 0.4
50 0.34
51 0.27
52 0.21
53 0.13
54 0.12
55 0.1
56 0.13
57 0.14
58 0.17
59 0.18
60 0.18
61 0.19
62 0.23
63 0.22
64 0.18
65 0.18
66 0.15
67 0.14
68 0.12
69 0.13
70 0.08
71 0.09
72 0.1
73 0.1
74 0.1
75 0.13
76 0.14
77 0.13
78 0.14
79 0.13
80 0.12
81 0.14
82 0.15
83 0.12
84 0.12
85 0.11
86 0.11
87 0.1
88 0.1
89 0.08
90 0.06
91 0.06
92 0.04
93 0.04
94 0.04
95 0.04
96 0.05
97 0.07
98 0.09
99 0.14
100 0.22
101 0.24
102 0.31
103 0.39
104 0.47
105 0.55
106 0.65
107 0.7
108 0.74
109 0.82
110 0.82
111 0.83
112 0.81
113 0.73
114 0.65
115 0.55
116 0.44
117 0.34
118 0.27
119 0.16
120 0.1
121 0.07
122 0.05
123 0.03
124 0.03
125 0.02
126 0.03
127 0.03
128 0.03
129 0.03
130 0.03
131 0.03
132 0.03
133 0.03
134 0.03
135 0.04
136 0.05
137 0.05
138 0.06
139 0.07
140 0.07
141 0.1
142 0.15
143 0.16
144 0.17
145 0.18
146 0.19
147 0.2
148 0.19
149 0.18
150 0.13
151 0.12
152 0.11
153 0.1
154 0.1
155 0.09
156 0.13
157 0.14
158 0.15
159 0.17
160 0.19
161 0.21
162 0.29
163 0.36
164 0.38
165 0.41
166 0.43
167 0.42
168 0.43
169 0.4
170 0.31
171 0.24
172 0.19
173 0.14
174 0.12
175 0.1
176 0.07
177 0.07
178 0.07
179 0.06
180 0.08
181 0.09
182 0.08
183 0.09
184 0.13
185 0.13
186 0.13
187 0.13
188 0.12
189 0.12
190 0.12
191 0.11
192 0.08
193 0.07
194 0.07
195 0.07
196 0.06
197 0.05
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.03
212 0.03
213 0.04
214 0.03
215 0.04
216 0.03
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.08
222 0.08
223 0.1
224 0.14
225 0.15
226 0.16
227 0.22
228 0.24
229 0.2
230 0.22
231 0.25
232 0.23
233 0.26
234 0.25
235 0.2
236 0.2
237 0.2
238 0.24
239 0.19
240 0.18
241 0.15
242 0.16
243 0.15
244 0.14
245 0.13
246 0.08
247 0.08
248 0.07
249 0.06
250 0.05
251 0.06
252 0.06
253 0.07
254 0.07
255 0.07
256 0.08
257 0.11
258 0.12
259 0.12
260 0.12
261 0.11
262 0.11
263 0.11
264 0.11
265 0.07
266 0.06
267 0.05
268 0.06
269 0.05
270 0.06
271 0.06
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.04
277 0.06
278 0.07
279 0.08
280 0.08
281 0.08
282 0.1
283 0.1
284 0.11
285 0.09
286 0.13
287 0.13
288 0.13
289 0.13
290 0.11
291 0.13
292 0.18
293 0.18
294 0.14
295 0.18
296 0.19
297 0.2
298 0.25
299 0.28
300 0.32
301 0.34
302 0.38
303 0.35
304 0.4
305 0.43
306 0.38
307 0.34
308 0.28
309 0.27
310 0.23
311 0.24
312 0.2
313 0.16
314 0.15
315 0.15
316 0.14
317 0.12
318 0.09
319 0.08
320 0.07
321 0.1
322 0.13
323 0.14
324 0.2
325 0.29
326 0.32
327 0.38
328 0.46
329 0.51
330 0.57
331 0.66
332 0.7
333 0.72
334 0.75
335 0.74
336 0.7
337 0.62
338 0.54
339 0.46
340 0.36
341 0.26
342 0.22
343 0.16
344 0.13
345 0.13
346 0.12
347 0.12
348 0.13
349 0.15
350 0.14
351 0.14
352 0.16
353 0.17
354 0.18
355 0.21
356 0.2
357 0.18
358 0.19
359 0.18
360 0.16
361 0.15
362 0.15
363 0.12
364 0.13
365 0.14
366 0.13
367 0.14
368 0.13
369 0.12
370 0.11
371 0.11
372 0.09
373 0.07
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.07
378 0.06
379 0.05
380 0.05
381 0.05
382 0.05
383 0.04
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.05
388 0.04
389 0.04
390 0.04
391 0.04
392 0.04
393 0.05
394 0.04
395 0.07
396 0.07
397 0.1
398 0.13
399 0.17
400 0.19
401 0.24
402 0.31
403 0.31
404 0.33
405 0.33
406 0.32
407 0.3
408 0.29
409 0.25
410 0.19
411 0.18
412 0.17
413 0.16
414 0.16
415 0.16
416 0.19
417 0.21
418 0.25
419 0.29
420 0.33
421 0.34
422 0.33
423 0.36
424 0.39
425 0.38
426 0.41
427 0.39
428 0.34
429 0.34
430 0.35
431 0.31
432 0.25
433 0.24
434 0.21
435 0.18
436 0.18
437 0.21
438 0.18
439 0.2
440 0.18
441 0.17
442 0.13
443 0.13
444 0.13
445 0.1
446 0.1
447 0.13
448 0.17
449 0.19
450 0.25
451 0.31
452 0.35
453 0.41
454 0.49
455 0.5
456 0.51
457 0.5
458 0.53
459 0.57
460 0.57
461 0.55
462 0.56
463 0.53
464 0.52
465 0.56
466 0.51
467 0.51
468 0.53
469 0.54
470 0.55
471 0.59
472 0.58
473 0.58
474 0.55
475 0.46
476 0.38
477 0.33
478 0.27
479 0.24
480 0.22
481 0.19
482 0.23
483 0.23
484 0.29
485 0.35
486 0.35
487 0.42
488 0.5