Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0S6XQ80

Protein Details
Accession A0A0S6XQ80    Localization Confidence High Confidence Score 15.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
273-296SPAANSIKKQKKTNEPFSRIPKNQHydrophilic
322-345ITKGKGFTKEKNKGKRGSYRGGKIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
120-128GIKRKRGKG
324-344KGKGFTKEKNKGKRGSYRGGK
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 9.5, cyto 6.5, mito 4, extr 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MSSQDSLSTLLRLADAFLSGNGFQKTASQLQKEAKKRGISLEGEKPEAALPSLDSVFSHWQSTHILNESEGSESDAESSVLSSDSEEEDDSEDDSSDSDSSSGDEEISKDAGTKVDSQRGIKRKRGKGASPSSSSSSGGNSDSSSSETSDSDSNSDSDSDSSSESDSDAEATSDVSNEKPAVGKLASGALDNDSSSSDSDSSSSSGDDSDSDSDSDSDGSVGEPQETTLTTPLDDSANSSSTPVESAVPSTSLKRKLSTSADDSSATLGSSESPAANSIKKQKKTNEPFSRIPKNQWVDPKLASNKFVPYDYAQRAHEKLIITKGKGFTKEKNKGKRGSYRGGKIDFAPKGIKFED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.1
3 0.1
4 0.09
5 0.11
6 0.11
7 0.16
8 0.16
9 0.15
10 0.14
11 0.17
12 0.21
13 0.26
14 0.32
15 0.31
16 0.36
17 0.45
18 0.54
19 0.59
20 0.62
21 0.61
22 0.6
23 0.59
24 0.59
25 0.58
26 0.54
27 0.53
28 0.55
29 0.51
30 0.49
31 0.46
32 0.41
33 0.34
34 0.29
35 0.23
36 0.14
37 0.11
38 0.12
39 0.13
40 0.12
41 0.11
42 0.14
43 0.18
44 0.19
45 0.2
46 0.17
47 0.18
48 0.21
49 0.23
50 0.23
51 0.21
52 0.21
53 0.19
54 0.21
55 0.2
56 0.18
57 0.16
58 0.14
59 0.11
60 0.1
61 0.11
62 0.1
63 0.09
64 0.08
65 0.08
66 0.07
67 0.07
68 0.07
69 0.06
70 0.07
71 0.07
72 0.08
73 0.08
74 0.08
75 0.1
76 0.1
77 0.1
78 0.1
79 0.09
80 0.08
81 0.08
82 0.08
83 0.07
84 0.07
85 0.06
86 0.06
87 0.06
88 0.07
89 0.07
90 0.07
91 0.07
92 0.08
93 0.09
94 0.1
95 0.09
96 0.08
97 0.09
98 0.1
99 0.11
100 0.16
101 0.18
102 0.24
103 0.26
104 0.29
105 0.37
106 0.45
107 0.5
108 0.52
109 0.59
110 0.6
111 0.66
112 0.7
113 0.68
114 0.69
115 0.72
116 0.71
117 0.65
118 0.6
119 0.54
120 0.48
121 0.43
122 0.33
123 0.24
124 0.19
125 0.16
126 0.14
127 0.11
128 0.1
129 0.1
130 0.11
131 0.11
132 0.1
133 0.11
134 0.1
135 0.11
136 0.11
137 0.11
138 0.11
139 0.11
140 0.1
141 0.1
142 0.1
143 0.09
144 0.08
145 0.09
146 0.08
147 0.08
148 0.08
149 0.08
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.06
162 0.05
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.08
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.09
173 0.09
174 0.08
175 0.09
176 0.07
177 0.07
178 0.07
179 0.07
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.07
184 0.06
185 0.06
186 0.07
187 0.07
188 0.08
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.06
195 0.07
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.09
203 0.07
204 0.06
205 0.05
206 0.05
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.07
213 0.07
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.09
220 0.09
221 0.08
222 0.1
223 0.1
224 0.11
225 0.11
226 0.11
227 0.1
228 0.1
229 0.11
230 0.09
231 0.08
232 0.07
233 0.09
234 0.09
235 0.11
236 0.11
237 0.15
238 0.2
239 0.25
240 0.27
241 0.28
242 0.29
243 0.33
244 0.38
245 0.4
246 0.39
247 0.36
248 0.36
249 0.35
250 0.33
251 0.28
252 0.23
253 0.17
254 0.12
255 0.09
256 0.07
257 0.07
258 0.08
259 0.07
260 0.07
261 0.09
262 0.11
263 0.13
264 0.17
265 0.27
266 0.36
267 0.42
268 0.49
269 0.56
270 0.65
271 0.73
272 0.8
273 0.8
274 0.78
275 0.8
276 0.82
277 0.84
278 0.77
279 0.73
280 0.71
281 0.65
282 0.64
283 0.65
284 0.59
285 0.53
286 0.52
287 0.55
288 0.54
289 0.51
290 0.48
291 0.41
292 0.43
293 0.4
294 0.39
295 0.33
296 0.29
297 0.35
298 0.37
299 0.39
300 0.37
301 0.4
302 0.41
303 0.4
304 0.4
305 0.33
306 0.32
307 0.37
308 0.4
309 0.37
310 0.41
311 0.45
312 0.47
313 0.52
314 0.53
315 0.53
316 0.58
317 0.66
318 0.7
319 0.75
320 0.78
321 0.79
322 0.83
323 0.84
324 0.81
325 0.82
326 0.82
327 0.8
328 0.79
329 0.75
330 0.68
331 0.62
332 0.63
333 0.54
334 0.48
335 0.45
336 0.37