Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

Q4WM29

Protein Details
Accession Q4WM29    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
822-847SSSGADQYKSRKRRLRRGHRGSDITAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
831-841SRKRRLRRGHR
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 11.333, cyto 9, cyto_mito 5.833, extr 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036047  F-box-like_dom_sf  
IPR001810  F-box_dom  
IPR027040  PSMD4  
IPR003903  UIM_dom  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008540  C:proteasome regulatory particle, base subcomplex  
GO:0031593  F:polyubiquitin modification-dependent protein binding  
GO:0043161  P:proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process  
KEGG afm:AFUA_6G11400  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12937  F-box-like  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50181  FBOX  
CDD cd09917  F-box_SF  
Amino Acid Sequences MSSDPLLHSSLAVSGASQYGNDIPQSPSKQADFLSKRANFNAQQRISLGALPNEVLTHILSHLPPPSLSSISLVSRRFHSLVTTPHAWRIAFCRYFPGPYAVENGARLSATDGSDNVASNKRYFSRLTALASWRSEYILRTRLLRSLSRGKPAQFEPSKKYGTVRAANVRNGSAVATYTSQLMYPVSHLGASFGAEDTRKEPHFIHGASEQGIASASDPSTVKVGTWGLSDHQMFRHFADLFPGDAEYGLGSGDLVGQPNCMDVSQPYGMIYGEGCPQGRSYFISTTEQRGRFLGLVESSSQPQQGVPALNPATTSITAVWIAKSAHILKMTGGLVGMLSGSSVGILTAYALGPHPTYEKRFERGQVTAKWAICPGVPIIGIAVDDNYSKNRSSRGRIWATVLNALGEVFYLTEIPRQPDIAAKLSAEEIDQLAWKTGRSVRWELIELSKRTARPDPFNRDPVDGSYSPRSSSDSMKLDEQQIAAETKEIERFLKFRPKHFRKVCKGWDMRRDLKVDFAGDDGLGAGESIMVITRGAGEGEKASISRFTRTMLKSDLPAASGTLPHITGDATFRSLFGGPSHTPIPSSASDASSLPPSRTSSYLSDTVVCSVANTEWRMSDFGFGDRKSIRITTSALDSSTYAVLTADEDPLLGMSGGSGFSSAMSSPLPHLKQSSSNPEIPGSRGRYLAVGTATGLVFVWDIRAPSAKSTDIINSVSPLRIIQTDSPQVSCVALTSLYLVHGGNDGLVQAWDPLASTTRPIRTINSRFSSRARRRLVQAEASMHGVGNNFFACGAICLDPDPTVLRGMVALGTHLRYWAFSSSGADQYKSRKRRLRRGHRGSDITAEGQRFSSSGRGALKEYIEDEKVEIERQKVAEAKERAYLSNRFGIDLLGSDVSEDQLLAYAQLLSEEAFASEALKRGEAVVSSVVSTSPSDTIGRNDSSVAADDYSSSSSPYQDTIDDDLAPDIAEAIRLSLLDEGPSQEKSPYPVKFSRKLQSSYGNISPCELSGAESSRQRELDDLELAIQLSLAESQSVGQPERQQDREYPLLSTFSPASDKGKGKGRAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.11
3 0.1
4 0.1
5 0.1
6 0.11
7 0.13
8 0.14
9 0.15
10 0.17
11 0.25
12 0.29
13 0.3
14 0.33
15 0.33
16 0.34
17 0.34
18 0.42
19 0.39
20 0.41
21 0.48
22 0.49
23 0.51
24 0.53
25 0.58
26 0.54
27 0.58
28 0.62
29 0.54
30 0.51
31 0.48
32 0.47
33 0.41
34 0.38
35 0.33
36 0.24
37 0.23
38 0.21
39 0.2
40 0.17
41 0.16
42 0.13
43 0.1
44 0.09
45 0.09
46 0.12
47 0.12
48 0.15
49 0.18
50 0.18
51 0.18
52 0.19
53 0.22
54 0.21
55 0.21
56 0.21
57 0.21
58 0.24
59 0.31
60 0.31
61 0.29
62 0.3
63 0.35
64 0.34
65 0.31
66 0.31
67 0.3
68 0.34
69 0.39
70 0.42
71 0.38
72 0.41
73 0.44
74 0.4
75 0.36
76 0.35
77 0.37
78 0.35
79 0.33
80 0.36
81 0.35
82 0.38
83 0.38
84 0.38
85 0.29
86 0.28
87 0.32
88 0.28
89 0.27
90 0.25
91 0.24
92 0.2
93 0.18
94 0.17
95 0.14
96 0.15
97 0.14
98 0.14
99 0.13
100 0.15
101 0.16
102 0.16
103 0.17
104 0.2
105 0.21
106 0.22
107 0.27
108 0.27
109 0.29
110 0.3
111 0.31
112 0.33
113 0.35
114 0.38
115 0.39
116 0.42
117 0.44
118 0.43
119 0.4
120 0.34
121 0.31
122 0.28
123 0.24
124 0.27
125 0.27
126 0.28
127 0.3
128 0.31
129 0.34
130 0.37
131 0.38
132 0.38
133 0.42
134 0.46
135 0.5
136 0.53
137 0.51
138 0.53
139 0.52
140 0.55
141 0.53
142 0.54
143 0.53
144 0.55
145 0.56
146 0.51
147 0.51
148 0.48
149 0.48
150 0.48
151 0.48
152 0.51
153 0.53
154 0.57
155 0.56
156 0.49
157 0.41
158 0.35
159 0.29
160 0.2
161 0.15
162 0.12
163 0.11
164 0.11
165 0.11
166 0.11
167 0.1
168 0.1
169 0.1
170 0.09
171 0.09
172 0.11
173 0.1
174 0.1
175 0.1
176 0.11
177 0.1
178 0.1
179 0.1
180 0.08
181 0.09
182 0.09
183 0.11
184 0.12
185 0.17
186 0.17
187 0.19
188 0.19
189 0.23
190 0.29
191 0.28
192 0.3
193 0.27
194 0.28
195 0.27
196 0.27
197 0.21
198 0.14
199 0.14
200 0.11
201 0.09
202 0.09
203 0.08
204 0.09
205 0.1
206 0.1
207 0.11
208 0.11
209 0.11
210 0.11
211 0.12
212 0.11
213 0.11
214 0.12
215 0.12
216 0.17
217 0.18
218 0.17
219 0.19
220 0.22
221 0.22
222 0.22
223 0.26
224 0.21
225 0.2
226 0.24
227 0.21
228 0.19
229 0.18
230 0.18
231 0.12
232 0.11
233 0.11
234 0.06
235 0.05
236 0.04
237 0.04
238 0.03
239 0.03
240 0.04
241 0.05
242 0.06
243 0.06
244 0.07
245 0.07
246 0.08
247 0.08
248 0.07
249 0.07
250 0.06
251 0.11
252 0.12
253 0.12
254 0.12
255 0.12
256 0.12
257 0.12
258 0.11
259 0.07
260 0.09
261 0.11
262 0.11
263 0.11
264 0.12
265 0.12
266 0.13
267 0.14
268 0.15
269 0.16
270 0.18
271 0.24
272 0.25
273 0.32
274 0.39
275 0.38
276 0.35
277 0.33
278 0.32
279 0.27
280 0.26
281 0.21
282 0.14
283 0.14
284 0.15
285 0.16
286 0.15
287 0.15
288 0.15
289 0.12
290 0.11
291 0.12
292 0.13
293 0.13
294 0.12
295 0.17
296 0.18
297 0.17
298 0.18
299 0.17
300 0.17
301 0.15
302 0.16
303 0.1
304 0.1
305 0.11
306 0.11
307 0.1
308 0.1
309 0.1
310 0.1
311 0.13
312 0.13
313 0.15
314 0.16
315 0.16
316 0.14
317 0.18
318 0.17
319 0.14
320 0.12
321 0.09
322 0.08
323 0.08
324 0.07
325 0.03
326 0.03
327 0.02
328 0.02
329 0.02
330 0.02
331 0.02
332 0.02
333 0.02
334 0.03
335 0.03
336 0.03
337 0.04
338 0.04
339 0.05
340 0.06
341 0.06
342 0.09
343 0.11
344 0.15
345 0.22
346 0.26
347 0.29
348 0.32
349 0.35
350 0.36
351 0.38
352 0.41
353 0.37
354 0.4
355 0.41
356 0.39
357 0.36
358 0.32
359 0.28
360 0.21
361 0.19
362 0.13
363 0.09
364 0.09
365 0.08
366 0.07
367 0.07
368 0.07
369 0.06
370 0.05
371 0.04
372 0.05
373 0.06
374 0.08
375 0.09
376 0.1
377 0.11
378 0.17
379 0.21
380 0.27
381 0.33
382 0.41
383 0.44
384 0.45
385 0.47
386 0.44
387 0.41
388 0.37
389 0.3
390 0.21
391 0.16
392 0.15
393 0.11
394 0.07
395 0.06
396 0.03
397 0.03
398 0.04
399 0.04
400 0.07
401 0.08
402 0.11
403 0.11
404 0.12
405 0.12
406 0.15
407 0.18
408 0.18
409 0.17
410 0.15
411 0.15
412 0.15
413 0.15
414 0.11
415 0.09
416 0.06
417 0.06
418 0.07
419 0.06
420 0.07
421 0.07
422 0.07
423 0.09
424 0.13
425 0.16
426 0.2
427 0.23
428 0.24
429 0.26
430 0.27
431 0.26
432 0.3
433 0.33
434 0.29
435 0.29
436 0.3
437 0.29
438 0.3
439 0.35
440 0.32
441 0.34
442 0.42
443 0.48
444 0.5
445 0.55
446 0.53
447 0.49
448 0.46
449 0.39
450 0.36
451 0.27
452 0.25
453 0.25
454 0.23
455 0.22
456 0.22
457 0.22
458 0.18
459 0.21
460 0.24
461 0.22
462 0.23
463 0.24
464 0.26
465 0.24
466 0.24
467 0.21
468 0.15
469 0.13
470 0.12
471 0.1
472 0.09
473 0.08
474 0.08
475 0.09
476 0.1
477 0.09
478 0.1
479 0.12
480 0.15
481 0.25
482 0.26
483 0.32
484 0.43
485 0.49
486 0.59
487 0.66
488 0.72
489 0.71
490 0.79
491 0.77
492 0.76
493 0.77
494 0.73
495 0.72
496 0.69
497 0.66
498 0.61
499 0.56
500 0.46
501 0.42
502 0.36
503 0.28
504 0.2
505 0.15
506 0.11
507 0.09
508 0.08
509 0.05
510 0.04
511 0.03
512 0.03
513 0.02
514 0.02
515 0.02
516 0.02
517 0.02
518 0.02
519 0.02
520 0.02
521 0.02
522 0.03
523 0.03
524 0.03
525 0.03
526 0.04
527 0.04
528 0.04
529 0.04
530 0.05
531 0.08
532 0.09
533 0.1
534 0.11
535 0.12
536 0.19
537 0.2
538 0.22
539 0.22
540 0.22
541 0.21
542 0.23
543 0.22
544 0.16
545 0.15
546 0.13
547 0.1
548 0.09
549 0.09
550 0.07
551 0.07
552 0.06
553 0.06
554 0.05
555 0.05
556 0.07
557 0.07
558 0.08
559 0.08
560 0.08
561 0.09
562 0.09
563 0.09
564 0.08
565 0.13
566 0.11
567 0.14
568 0.15
569 0.13
570 0.13
571 0.13
572 0.16
573 0.12
574 0.15
575 0.13
576 0.13
577 0.14
578 0.14
579 0.15
580 0.15
581 0.15
582 0.12
583 0.13
584 0.15
585 0.15
586 0.16
587 0.19
588 0.17
589 0.2
590 0.22
591 0.21
592 0.2
593 0.19
594 0.18
595 0.15
596 0.13
597 0.09
598 0.08
599 0.08
600 0.09
601 0.1
602 0.09
603 0.09
604 0.1
605 0.11
606 0.11
607 0.12
608 0.1
609 0.13
610 0.16
611 0.16
612 0.18
613 0.17
614 0.18
615 0.18
616 0.18
617 0.15
618 0.14
619 0.15
620 0.13
621 0.16
622 0.16
623 0.14
624 0.14
625 0.13
626 0.12
627 0.11
628 0.1
629 0.06
630 0.06
631 0.06
632 0.06
633 0.07
634 0.06
635 0.06
636 0.06
637 0.05
638 0.05
639 0.05
640 0.04
641 0.03
642 0.03
643 0.03
644 0.03
645 0.03
646 0.03
647 0.03
648 0.03
649 0.04
650 0.04
651 0.05
652 0.05
653 0.05
654 0.07
655 0.13
656 0.14
657 0.14
658 0.16
659 0.17
660 0.23
661 0.27
662 0.34
663 0.33
664 0.35
665 0.35
666 0.35
667 0.35
668 0.31
669 0.33
670 0.28
671 0.26
672 0.23
673 0.23
674 0.21
675 0.21
676 0.21
677 0.15
678 0.1
679 0.09
680 0.1
681 0.09
682 0.08
683 0.08
684 0.06
685 0.05
686 0.05
687 0.06
688 0.05
689 0.06
690 0.06
691 0.09
692 0.09
693 0.11
694 0.14
695 0.13
696 0.13
697 0.14
698 0.16
699 0.16
700 0.16
701 0.15
702 0.14
703 0.15
704 0.14
705 0.13
706 0.11
707 0.1
708 0.09
709 0.11
710 0.12
711 0.16
712 0.21
713 0.22
714 0.22
715 0.22
716 0.21
717 0.19
718 0.17
719 0.12
720 0.08
721 0.06
722 0.06
723 0.06
724 0.06
725 0.06
726 0.07
727 0.06
728 0.06
729 0.07
730 0.07
731 0.06
732 0.05
733 0.05
734 0.05
735 0.05
736 0.04
737 0.04
738 0.04
739 0.04
740 0.04
741 0.05
742 0.06
743 0.07
744 0.09
745 0.14
746 0.16
747 0.19
748 0.2
749 0.24
750 0.32
751 0.38
752 0.44
753 0.45
754 0.46
755 0.46
756 0.52
757 0.59
758 0.58
759 0.61
760 0.59
761 0.58
762 0.6
763 0.65
764 0.64
765 0.59
766 0.54
767 0.47
768 0.42
769 0.39
770 0.34
771 0.26
772 0.22
773 0.16
774 0.12
775 0.11
776 0.09
777 0.07
778 0.07
779 0.07
780 0.06
781 0.06
782 0.08
783 0.07
784 0.07
785 0.08
786 0.09
787 0.09
788 0.1
789 0.1
790 0.09
791 0.1
792 0.1
793 0.09
794 0.08
795 0.08
796 0.08
797 0.07
798 0.07
799 0.07
800 0.09
801 0.09
802 0.09
803 0.09
804 0.09
805 0.11
806 0.11
807 0.11
808 0.11
809 0.14
810 0.16
811 0.23
812 0.23
813 0.23
814 0.23
815 0.32
816 0.41
817 0.45
818 0.52
819 0.53
820 0.62
821 0.72
822 0.81
823 0.83
824 0.85
825 0.89
826 0.89
827 0.9
828 0.86
829 0.77
830 0.7
831 0.61
832 0.52
833 0.45
834 0.36
835 0.27
836 0.22
837 0.2
838 0.15
839 0.14
840 0.15
841 0.12
842 0.16
843 0.19
844 0.2
845 0.22
846 0.25
847 0.25
848 0.22
849 0.23
850 0.23
851 0.2
852 0.19
853 0.17
854 0.17
855 0.18
856 0.2
857 0.2
858 0.18
859 0.21
860 0.21
861 0.24
862 0.25
863 0.27
864 0.33
865 0.33
866 0.34
867 0.36
868 0.37
869 0.36
870 0.36
871 0.38
872 0.32
873 0.35
874 0.33
875 0.28
876 0.27
877 0.25
878 0.2
879 0.17
880 0.16
881 0.1
882 0.09
883 0.09
884 0.09
885 0.09
886 0.08
887 0.07
888 0.05
889 0.05
890 0.06
891 0.05
892 0.06
893 0.05
894 0.05
895 0.06
896 0.06
897 0.05
898 0.06
899 0.06
900 0.06
901 0.06
902 0.06
903 0.07
904 0.08
905 0.11
906 0.11
907 0.12
908 0.12
909 0.12
910 0.14
911 0.12
912 0.13
913 0.12
914 0.11
915 0.12
916 0.12
917 0.11
918 0.11
919 0.11
920 0.11
921 0.09
922 0.11
923 0.12
924 0.13
925 0.17
926 0.21
927 0.22
928 0.2
929 0.2
930 0.2
931 0.19
932 0.2
933 0.18
934 0.13
935 0.12
936 0.12
937 0.13
938 0.15
939 0.13
940 0.13
941 0.13
942 0.13
943 0.14
944 0.15
945 0.15
946 0.14
947 0.17
948 0.2
949 0.21
950 0.2
951 0.19
952 0.18
953 0.16
954 0.15
955 0.11
956 0.08
957 0.06
958 0.07
959 0.06
960 0.06
961 0.07
962 0.07
963 0.08
964 0.09
965 0.09
966 0.1
967 0.11
968 0.13
969 0.15
970 0.17
971 0.17
972 0.17
973 0.18
974 0.22
975 0.29
976 0.29
977 0.35
978 0.41
979 0.48
980 0.55
981 0.62
982 0.66
983 0.66
984 0.67
985 0.65
986 0.66
987 0.64
988 0.63
989 0.61
990 0.55
991 0.47
992 0.45
993 0.4
994 0.31
995 0.27
996 0.2
997 0.16
998 0.17
999 0.21
1000 0.24
1001 0.28
1002 0.31
1003 0.33
1004 0.34
1005 0.32
1006 0.3
1007 0.3
1008 0.29
1009 0.26
1010 0.24
1011 0.2
1012 0.21
1013 0.2
1014 0.17
1015 0.14
1016 0.09
1017 0.07
1018 0.08
1019 0.07
1020 0.06
1021 0.06
1022 0.07
1023 0.11
1024 0.14
1025 0.15
1026 0.18
1027 0.24
1028 0.33
1029 0.41
1030 0.44
1031 0.43
1032 0.45
1033 0.51
1034 0.55
1035 0.5
1036 0.43
1037 0.37
1038 0.37
1039 0.34
1040 0.33
1041 0.26
1042 0.21
1043 0.22
1044 0.22
1045 0.24
1046 0.3
1047 0.33
1048 0.35
1049 0.44