Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q4WHP6

Protein Details
Accession Q4WHP6    Localization Confidence Low Confidence Score 8.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
386-405HYAPNPKKTRRYQVENTRALHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 12, cyto 9.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013520  Exonuclease_RNaseT/DNA_pol3  
IPR030843  PAN2  
IPR028881  PAN2_UCH_dom  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR028889  USP_dom  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000932  C:P-body  
GO:0031251  C:PAN complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0004535  F:poly(A)-specific ribonuclease activity  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0000289  P:nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening  
KEGG afm:AFUA_2G04650  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00929  RNase_T  
PF13423  UCH_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50235  USP_3  
CDD cd06143  PAN2_exo  
Amino Acid Sequences MEADWDELSRIPVPPPSPHGLPTVATTIAFDDVSELLWAGNEFGRITSFYGPELQRYTSVRAHPVSDGPVRQILFHERGVISLSPKSVHMITRRGLTQWHISHEEMTDLYCMSFTAQLNKIIVAGCQRAMFTIDIDKGIIVDKLHTDHNYTMMKKSRYLCAATDTGSVNALSLTDFRVVKSWKSHGTAINDMDARNDLLVTCGFSVRHLGSPIVDPLANVYDLKTLSPLPPIPFHAGAAYVRMHPKLSTTSFVASQTGQLQVVDLMNPNAINLRQANVSFMLGIDISPSGEALAINDAECSIHLWGSPSKIHFNEMSKEVEFADVVPRPPPLDWSPDTPLNMIGMPYYRERLLSAWPSHLVFEVGSPPAPIDQSLIPYLRPAEMGHYAPNPKKTRRYQVENTRALTTAEPALIAPKFLSEKAREQSKFKSEASVSDTAEALAGAKLNGEAEDDPLLKYSNVEIKYSRFGVDDFDFSFSGLETHIANSFTNALLQLLKFIPLVRNLALHHAASTCIYETCLLCEMGYLFDMLEKANGQNCQATNLLKTFSSYREASNLGLLEENLTTKSLSSAIQSVNRFFLNQIAHDFRMIVPSSDDLDHRLSTIASESIRCMFCQNEIVRPGNSLANELIYPTIDIKQARRNPAFRFSSILRASIERETQNRGWCNYCRRYQQVTIRKSIHRMPLVLILNAALSNAICRRLWSIPGWLPEEVGIAVDNGQVMCFEGDELKTQLQNKLPNLVVYELVGLVSEIDIPEHQKPHLVSFINVSISSREPEAKNRWHLFNDFLVTEVDKDEALRFNQPWKSPCILAYQVKDARHAVDDSWKNVLDTTLLFRDWSLNGGRAVETRQTLTEEEKPTPGTPVALDTEFVDLEKAEIDVKADGSQEIVRPSKSGLARVSVLRGSGVHEGVPFIDDYITIKEPIVDYVTQYSGIKPGDLDPRTSQHNLVPLKVAYKKLWLLLNLGCVFVGHGLASDFRKINIQVPKSQTVDTQYLYFHPGKNRRLSLRYLAWAVFKEYIQEEPADNNQGHDSIEDARMALRLWKKFQEYEDAGIVNQILEEIFREGSKLGFRPPPRNGVATVLSRPGTAVTMQNSSGRNTPSTPDVGGAATATATTSAPATPRQAFRRSIALTPSNGTFSGPGAGDFFGGSPLK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.33
3 0.37
4 0.37
5 0.38
6 0.39
7 0.36
8 0.34
9 0.32
10 0.29
11 0.23
12 0.21
13 0.19
14 0.17
15 0.17
16 0.15
17 0.12
18 0.1
19 0.1
20 0.1
21 0.1
22 0.09
23 0.07
24 0.08
25 0.08
26 0.08
27 0.09
28 0.1
29 0.1
30 0.1
31 0.12
32 0.12
33 0.15
34 0.17
35 0.17
36 0.17
37 0.24
38 0.25
39 0.28
40 0.3
41 0.29
42 0.3
43 0.33
44 0.37
45 0.36
46 0.4
47 0.42
48 0.4
49 0.41
50 0.39
51 0.38
52 0.39
53 0.38
54 0.36
55 0.32
56 0.35
57 0.33
58 0.31
59 0.31
60 0.33
61 0.31
62 0.3
63 0.32
64 0.27
65 0.27
66 0.3
67 0.28
68 0.24
69 0.23
70 0.23
71 0.19
72 0.2
73 0.22
74 0.21
75 0.25
76 0.28
77 0.32
78 0.33
79 0.38
80 0.39
81 0.37
82 0.37
83 0.35
84 0.39
85 0.36
86 0.4
87 0.38
88 0.38
89 0.38
90 0.36
91 0.34
92 0.24
93 0.22
94 0.16
95 0.12
96 0.11
97 0.1
98 0.09
99 0.08
100 0.13
101 0.13
102 0.19
103 0.22
104 0.25
105 0.26
106 0.26
107 0.26
108 0.22
109 0.22
110 0.2
111 0.19
112 0.17
113 0.17
114 0.17
115 0.17
116 0.19
117 0.18
118 0.14
119 0.17
120 0.17
121 0.17
122 0.17
123 0.16
124 0.14
125 0.15
126 0.15
127 0.09
128 0.1
129 0.11
130 0.13
131 0.17
132 0.18
133 0.21
134 0.2
135 0.26
136 0.31
137 0.31
138 0.36
139 0.41
140 0.42
141 0.44
142 0.46
143 0.47
144 0.46
145 0.47
146 0.41
147 0.39
148 0.38
149 0.34
150 0.34
151 0.28
152 0.24
153 0.22
154 0.2
155 0.14
156 0.12
157 0.1
158 0.08
159 0.07
160 0.08
161 0.12
162 0.12
163 0.12
164 0.19
165 0.21
166 0.24
167 0.3
168 0.34
169 0.36
170 0.4
171 0.44
172 0.44
173 0.48
174 0.5
175 0.45
176 0.44
177 0.4
178 0.35
179 0.32
180 0.27
181 0.22
182 0.16
183 0.14
184 0.09
185 0.09
186 0.09
187 0.1
188 0.09
189 0.1
190 0.1
191 0.1
192 0.15
193 0.15
194 0.17
195 0.17
196 0.17
197 0.17
198 0.19
199 0.2
200 0.18
201 0.16
202 0.13
203 0.14
204 0.15
205 0.14
206 0.12
207 0.11
208 0.12
209 0.13
210 0.13
211 0.13
212 0.12
213 0.13
214 0.17
215 0.2
216 0.2
217 0.22
218 0.25
219 0.29
220 0.28
221 0.28
222 0.24
223 0.22
224 0.2
225 0.2
226 0.17
227 0.15
228 0.17
229 0.18
230 0.18
231 0.16
232 0.19
233 0.22
234 0.23
235 0.23
236 0.23
237 0.24
238 0.25
239 0.26
240 0.25
241 0.19
242 0.19
243 0.17
244 0.16
245 0.14
246 0.12
247 0.12
248 0.11
249 0.11
250 0.1
251 0.1
252 0.08
253 0.09
254 0.09
255 0.09
256 0.09
257 0.09
258 0.11
259 0.11
260 0.12
261 0.13
262 0.14
263 0.15
264 0.15
265 0.15
266 0.12
267 0.11
268 0.1
269 0.08
270 0.08
271 0.06
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.04
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.07
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.07
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.09
292 0.1
293 0.13
294 0.16
295 0.17
296 0.22
297 0.22
298 0.25
299 0.26
300 0.28
301 0.29
302 0.29
303 0.31
304 0.26
305 0.26
306 0.23
307 0.2
308 0.16
309 0.13
310 0.15
311 0.13
312 0.14
313 0.14
314 0.14
315 0.15
316 0.15
317 0.19
318 0.16
319 0.21
320 0.22
321 0.27
322 0.31
323 0.33
324 0.34
325 0.3
326 0.28
327 0.23
328 0.21
329 0.15
330 0.11
331 0.09
332 0.1
333 0.11
334 0.12
335 0.12
336 0.12
337 0.13
338 0.13
339 0.17
340 0.22
341 0.23
342 0.23
343 0.24
344 0.24
345 0.24
346 0.23
347 0.18
348 0.11
349 0.1
350 0.1
351 0.09
352 0.09
353 0.09
354 0.08
355 0.09
356 0.09
357 0.08
358 0.08
359 0.08
360 0.1
361 0.12
362 0.13
363 0.12
364 0.13
365 0.13
366 0.12
367 0.12
368 0.1
369 0.11
370 0.14
371 0.15
372 0.16
373 0.19
374 0.24
375 0.26
376 0.35
377 0.37
378 0.4
379 0.48
380 0.53
381 0.6
382 0.63
383 0.69
384 0.7
385 0.76
386 0.81
387 0.77
388 0.72
389 0.63
390 0.55
391 0.47
392 0.37
393 0.27
394 0.18
395 0.12
396 0.1
397 0.08
398 0.1
399 0.09
400 0.09
401 0.07
402 0.08
403 0.09
404 0.1
405 0.14
406 0.15
407 0.21
408 0.26
409 0.35
410 0.36
411 0.38
412 0.43
413 0.46
414 0.48
415 0.42
416 0.42
417 0.34
418 0.35
419 0.37
420 0.35
421 0.28
422 0.24
423 0.24
424 0.18
425 0.18
426 0.14
427 0.09
428 0.05
429 0.05
430 0.04
431 0.04
432 0.04
433 0.04
434 0.04
435 0.05
436 0.05
437 0.06
438 0.08
439 0.09
440 0.09
441 0.09
442 0.1
443 0.08
444 0.09
445 0.09
446 0.14
447 0.14
448 0.16
449 0.16
450 0.18
451 0.21
452 0.22
453 0.21
454 0.15
455 0.14
456 0.17
457 0.17
458 0.16
459 0.14
460 0.15
461 0.14
462 0.14
463 0.14
464 0.1
465 0.08
466 0.07
467 0.07
468 0.05
469 0.06
470 0.07
471 0.08
472 0.08
473 0.08
474 0.09
475 0.08
476 0.08
477 0.07
478 0.06
479 0.06
480 0.06
481 0.08
482 0.07
483 0.08
484 0.08
485 0.09
486 0.1
487 0.11
488 0.13
489 0.11
490 0.12
491 0.12
492 0.15
493 0.16
494 0.14
495 0.13
496 0.12
497 0.12
498 0.1
499 0.1
500 0.07
501 0.06
502 0.07
503 0.07
504 0.07
505 0.08
506 0.09
507 0.08
508 0.08
509 0.08
510 0.08
511 0.07
512 0.07
513 0.06
514 0.04
515 0.04
516 0.05
517 0.05
518 0.05
519 0.05
520 0.06
521 0.08
522 0.09
523 0.09
524 0.11
525 0.12
526 0.14
527 0.14
528 0.14
529 0.13
530 0.14
531 0.14
532 0.11
533 0.12
534 0.11
535 0.12
536 0.15
537 0.15
538 0.14
539 0.16
540 0.17
541 0.16
542 0.16
543 0.14
544 0.1
545 0.1
546 0.09
547 0.08
548 0.07
549 0.07
550 0.05
551 0.06
552 0.05
553 0.05
554 0.06
555 0.06
556 0.06
557 0.07
558 0.09
559 0.1
560 0.15
561 0.16
562 0.16
563 0.17
564 0.16
565 0.16
566 0.13
567 0.16
568 0.12
569 0.12
570 0.14
571 0.15
572 0.16
573 0.15
574 0.16
575 0.12
576 0.14
577 0.14
578 0.11
579 0.08
580 0.09
581 0.1
582 0.11
583 0.11
584 0.1
585 0.11
586 0.11
587 0.11
588 0.1
589 0.09
590 0.08
591 0.09
592 0.08
593 0.07
594 0.07
595 0.08
596 0.11
597 0.11
598 0.11
599 0.11
600 0.1
601 0.11
602 0.17
603 0.17
604 0.18
605 0.21
606 0.22
607 0.22
608 0.22
609 0.22
610 0.18
611 0.17
612 0.14
613 0.11
614 0.1
615 0.1
616 0.09
617 0.08
618 0.06
619 0.06
620 0.06
621 0.07
622 0.09
623 0.1
624 0.12
625 0.21
626 0.26
627 0.33
628 0.37
629 0.4
630 0.41
631 0.48
632 0.49
633 0.41
634 0.4
635 0.34
636 0.38
637 0.34
638 0.33
639 0.25
640 0.23
641 0.24
642 0.22
643 0.24
644 0.18
645 0.19
646 0.23
647 0.25
648 0.3
649 0.3
650 0.29
651 0.31
652 0.33
653 0.4
654 0.41
655 0.44
656 0.44
657 0.47
658 0.51
659 0.54
660 0.59
661 0.6
662 0.58
663 0.59
664 0.59
665 0.54
666 0.53
667 0.51
668 0.48
669 0.4
670 0.37
671 0.31
672 0.34
673 0.33
674 0.29
675 0.24
676 0.17
677 0.15
678 0.14
679 0.12
680 0.05
681 0.03
682 0.05
683 0.05
684 0.07
685 0.07
686 0.08
687 0.12
688 0.13
689 0.15
690 0.16
691 0.21
692 0.23
693 0.26
694 0.28
695 0.25
696 0.23
697 0.21
698 0.2
699 0.14
700 0.1
701 0.07
702 0.05
703 0.05
704 0.05
705 0.05
706 0.04
707 0.04
708 0.04
709 0.04
710 0.04
711 0.04
712 0.04
713 0.05
714 0.06
715 0.07
716 0.09
717 0.09
718 0.12
719 0.14
720 0.17
721 0.2
722 0.25
723 0.24
724 0.28
725 0.27
726 0.26
727 0.26
728 0.23
729 0.19
730 0.14
731 0.13
732 0.08
733 0.08
734 0.07
735 0.05
736 0.04
737 0.04
738 0.04
739 0.03
740 0.03
741 0.04
742 0.07
743 0.1
744 0.11
745 0.11
746 0.14
747 0.15
748 0.17
749 0.22
750 0.21
751 0.19
752 0.2
753 0.22
754 0.2
755 0.19
756 0.17
757 0.14
758 0.14
759 0.14
760 0.13
761 0.15
762 0.15
763 0.22
764 0.29
765 0.34
766 0.42
767 0.45
768 0.47
769 0.46
770 0.47
771 0.42
772 0.38
773 0.33
774 0.24
775 0.21
776 0.18
777 0.16
778 0.15
779 0.12
780 0.1
781 0.07
782 0.08
783 0.08
784 0.1
785 0.11
786 0.15
787 0.15
788 0.21
789 0.26
790 0.3
791 0.31
792 0.33
793 0.35
794 0.32
795 0.32
796 0.32
797 0.33
798 0.34
799 0.34
800 0.37
801 0.39
802 0.38
803 0.39
804 0.34
805 0.3
806 0.27
807 0.25
808 0.18
809 0.23
810 0.25
811 0.25
812 0.27
813 0.26
814 0.23
815 0.23
816 0.22
817 0.14
818 0.12
819 0.14
820 0.13
821 0.13
822 0.13
823 0.12
824 0.15
825 0.14
826 0.16
827 0.13
828 0.14
829 0.14
830 0.15
831 0.15
832 0.14
833 0.16
834 0.17
835 0.16
836 0.15
837 0.16
838 0.17
839 0.17
840 0.21
841 0.26
842 0.26
843 0.26
844 0.27
845 0.28
846 0.26
847 0.28
848 0.24
849 0.17
850 0.14
851 0.15
852 0.16
853 0.14
854 0.14
855 0.12
856 0.14
857 0.13
858 0.12
859 0.1
860 0.07
861 0.07
862 0.07
863 0.06
864 0.06
865 0.06
866 0.07
867 0.07
868 0.08
869 0.09
870 0.09
871 0.09
872 0.1
873 0.11
874 0.12
875 0.16
876 0.17
877 0.17
878 0.17
879 0.18
880 0.23
881 0.23
882 0.26
883 0.23
884 0.25
885 0.27
886 0.27
887 0.29
888 0.23
889 0.22
890 0.18
891 0.16
892 0.16
893 0.16
894 0.15
895 0.13
896 0.12
897 0.13
898 0.12
899 0.13
900 0.09
901 0.07
902 0.07
903 0.06
904 0.08
905 0.12
906 0.13
907 0.12
908 0.12
909 0.13
910 0.14
911 0.15
912 0.16
913 0.12
914 0.12
915 0.15
916 0.15
917 0.16
918 0.16
919 0.15
920 0.16
921 0.16
922 0.15
923 0.13
924 0.17
925 0.25
926 0.26
927 0.29
928 0.28
929 0.31
930 0.36
931 0.37
932 0.34
933 0.28
934 0.35
935 0.32
936 0.3
937 0.31
938 0.26
939 0.3
940 0.33
941 0.34
942 0.27
943 0.31
944 0.32
945 0.32
946 0.35
947 0.3
948 0.3
949 0.28
950 0.34
951 0.29
952 0.27
953 0.23
954 0.19
955 0.18
956 0.14
957 0.13
958 0.05
959 0.05
960 0.06
961 0.09
962 0.1
963 0.14
964 0.14
965 0.14
966 0.18
967 0.19
968 0.26
969 0.32
970 0.35
971 0.38
972 0.44
973 0.5
974 0.48
975 0.48
976 0.43
977 0.4
978 0.4
979 0.34
980 0.29
981 0.24
982 0.23
983 0.28
984 0.28
985 0.26
986 0.32
987 0.4
988 0.45
989 0.53
990 0.59
991 0.61
992 0.62
993 0.64
994 0.62
995 0.6
996 0.57
997 0.51
998 0.46
999 0.42
1000 0.39
1001 0.36
1002 0.3
1003 0.24
1004 0.22
1005 0.2
1006 0.21
1007 0.19
1008 0.19
1009 0.17
1010 0.18
1011 0.22
1012 0.24
1013 0.22
1014 0.22
1015 0.22
1016 0.21
1017 0.2
1018 0.16
1019 0.15
1020 0.13
1021 0.15
1022 0.14
1023 0.12
1024 0.12
1025 0.13
1026 0.13
1027 0.18
1028 0.22
1029 0.26
1030 0.31
1031 0.37
1032 0.41
1033 0.45
1034 0.47
1035 0.5
1036 0.47
1037 0.45
1038 0.44
1039 0.38
1040 0.33
1041 0.29
1042 0.27
1043 0.17
1044 0.13
1045 0.09
1046 0.05
1047 0.05
1048 0.06
1049 0.08
1050 0.08
1051 0.08
1052 0.09
1053 0.1
1054 0.12
1055 0.17
1056 0.17
1057 0.22
1058 0.29
1059 0.36
1060 0.44
1061 0.49
1062 0.55
1063 0.54
1064 0.55
1065 0.5
1066 0.48
1067 0.47
1068 0.43
1069 0.4
1070 0.36
1071 0.33
1072 0.3
1073 0.29
1074 0.24
1075 0.2
1076 0.17
1077 0.19
1078 0.18
1079 0.2
1080 0.22
1081 0.26
1082 0.27
1083 0.28
1084 0.31
1085 0.3
1086 0.29
1087 0.28
1088 0.3
1089 0.29
1090 0.3
1091 0.28
1092 0.24
1093 0.23
1094 0.2
1095 0.19
1096 0.16
1097 0.11
1098 0.08
1099 0.08
1100 0.07
1101 0.06
1102 0.06
1103 0.06
1104 0.07
1105 0.08
1106 0.1
1107 0.14
1108 0.19
1109 0.25
1110 0.33
1111 0.39
1112 0.45
1113 0.48
1114 0.49
1115 0.55
1116 0.52
1117 0.5
1118 0.5
1119 0.49
1120 0.45
1121 0.44
1122 0.43
1123 0.36
1124 0.33
1125 0.29
1126 0.22
1127 0.18
1128 0.19
1129 0.16
1130 0.14
1131 0.14
1132 0.14
1133 0.13
1134 0.13
1135 0.12