Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q4X237

Protein Details
Accession Q4X237    Localization Confidence Low Confidence Score 5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
74-96TVYNILQKEKKRQKHFINLIPSEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 26.5, cyto_mito 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015424  PyrdxlP-dep_Trfase  
IPR015421  PyrdxlP-dep_Trfase_major  
IPR015422  PyrdxlP-dep_Trfase_small  
IPR001085  Ser_HO-MeTrfase  
IPR019798  Ser_HO-MeTrfase_PLP_BS  
IPR039429  SHMT-like_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0004372  F:glycine hydroxymethyltransferase activity  
GO:0008168  F:methyltransferase activity  
GO:0030170  F:pyridoxal phosphate binding  
GO:0070905  F:serine binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0046655  P:folic acid metabolic process  
GO:0019264  P:glycine biosynthetic process from serine  
GO:0006565  P:L-serine catabolic process  
GO:0032259  P:methylation  
GO:0006730  P:one-carbon metabolic process  
GO:0035999  P:tetrahydrofolate interconversion  
GO:0046653  P:tetrahydrofolate metabolic process  
KEGG afm:AFUA_2G07810  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00464  SHMT  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00096  SHMT  
CDD cd00378  SHMT  
Amino Acid Sequences MSLSRCGRQALRLIPRSGSSSRATTVITTARHPGFQLQTPTAASRNVQWRSVSSSSRDGQQHLLSASLEEQDPTVYNILQKEKKRQKHFINLIPSENFTSQAVLDALGSVMQNKYSEGYPGARYYGGNEFIDESERLCQQRALETFRLDPEEWGVNVQALSGSPANLYAISAVLNTHDRLMGLDLPHGGHLSHGYQTPTKKISFISKYFETLPYRLDESTGLIDYDGAEKLALLYRPKLIIAGTSAYSRLIDYPRMRQIADAAGAYLLSDMAHISGLVAAGVLPSPFPHSDIVTTTTHKSLRGPRGAMIFYRKGVRRTDKKGNKEMYDLENLINASVFPGHQGGPHNHTITALSVALKQAQTPEFKAYQETVLANAKALSERLGGPINNGGLGYNIVSGGTDNHLVLVDLKNRGVDGARVERVLELCGVASNKNTVPGDQSALKPGGLRLGTPAMTTRGFQPEDFRRVADIVDRAVIITQKLDKAAKESAAAKGVKNPNTVKAFLDYVGEGDEISEIVLLRKEVEDWVGTFSLPWDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.52
3 0.53
4 0.47
5 0.42
6 0.35
7 0.31
8 0.3
9 0.3
10 0.29
11 0.24
12 0.27
13 0.28
14 0.26
15 0.25
16 0.31
17 0.3
18 0.3
19 0.3
20 0.33
21 0.32
22 0.36
23 0.4
24 0.35
25 0.36
26 0.37
27 0.38
28 0.33
29 0.31
30 0.25
31 0.26
32 0.34
33 0.34
34 0.36
35 0.35
36 0.35
37 0.41
38 0.45
39 0.42
40 0.37
41 0.41
42 0.4
43 0.45
44 0.46
45 0.4
46 0.4
47 0.38
48 0.37
49 0.3
50 0.3
51 0.22
52 0.21
53 0.19
54 0.16
55 0.14
56 0.11
57 0.1
58 0.1
59 0.11
60 0.12
61 0.12
62 0.11
63 0.13
64 0.18
65 0.26
66 0.32
67 0.37
68 0.47
69 0.55
70 0.65
71 0.71
72 0.77
73 0.78
74 0.82
75 0.86
76 0.83
77 0.83
78 0.77
79 0.72
80 0.64
81 0.56
82 0.49
83 0.4
84 0.33
85 0.22
86 0.2
87 0.15
88 0.15
89 0.13
90 0.1
91 0.09
92 0.08
93 0.07
94 0.07
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.08
99 0.08
100 0.08
101 0.1
102 0.1
103 0.11
104 0.13
105 0.15
106 0.17
107 0.18
108 0.19
109 0.18
110 0.18
111 0.2
112 0.22
113 0.23
114 0.2
115 0.19
116 0.19
117 0.19
118 0.22
119 0.18
120 0.14
121 0.13
122 0.16
123 0.17
124 0.16
125 0.17
126 0.16
127 0.23
128 0.25
129 0.3
130 0.3
131 0.31
132 0.32
133 0.32
134 0.35
135 0.29
136 0.25
137 0.21
138 0.2
139 0.19
140 0.18
141 0.16
142 0.12
143 0.11
144 0.11
145 0.08
146 0.06
147 0.08
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.06
161 0.07
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.08
166 0.08
167 0.1
168 0.11
169 0.1
170 0.11
171 0.11
172 0.11
173 0.11
174 0.11
175 0.09
176 0.07
177 0.08
178 0.08
179 0.09
180 0.1
181 0.12
182 0.15
183 0.17
184 0.21
185 0.23
186 0.22
187 0.22
188 0.22
189 0.29
190 0.32
191 0.33
192 0.35
193 0.33
194 0.35
195 0.36
196 0.39
197 0.33
198 0.27
199 0.26
200 0.21
201 0.22
202 0.2
203 0.18
204 0.14
205 0.12
206 0.13
207 0.12
208 0.1
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.07
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.08
219 0.09
220 0.09
221 0.1
222 0.11
223 0.12
224 0.12
225 0.12
226 0.09
227 0.08
228 0.09
229 0.09
230 0.09
231 0.09
232 0.09
233 0.09
234 0.09
235 0.08
236 0.09
237 0.09
238 0.14
239 0.15
240 0.2
241 0.25
242 0.27
243 0.26
244 0.24
245 0.25
246 0.21
247 0.2
248 0.14
249 0.09
250 0.08
251 0.08
252 0.07
253 0.06
254 0.04
255 0.03
256 0.03
257 0.02
258 0.03
259 0.03
260 0.03
261 0.03
262 0.03
263 0.03
264 0.03
265 0.03
266 0.02
267 0.02
268 0.03
269 0.03
270 0.02
271 0.03
272 0.05
273 0.05
274 0.07
275 0.08
276 0.08
277 0.09
278 0.11
279 0.15
280 0.14
281 0.16
282 0.16
283 0.18
284 0.18
285 0.18
286 0.21
287 0.25
288 0.31
289 0.34
290 0.34
291 0.33
292 0.36
293 0.36
294 0.34
295 0.31
296 0.25
297 0.22
298 0.27
299 0.27
300 0.27
301 0.33
302 0.4
303 0.43
304 0.49
305 0.59
306 0.62
307 0.67
308 0.73
309 0.72
310 0.65
311 0.6
312 0.55
313 0.48
314 0.43
315 0.36
316 0.28
317 0.23
318 0.21
319 0.18
320 0.14
321 0.1
322 0.07
323 0.06
324 0.05
325 0.05
326 0.06
327 0.06
328 0.08
329 0.12
330 0.15
331 0.19
332 0.23
333 0.23
334 0.22
335 0.22
336 0.21
337 0.18
338 0.17
339 0.13
340 0.09
341 0.09
342 0.1
343 0.12
344 0.11
345 0.11
346 0.13
347 0.15
348 0.17
349 0.18
350 0.22
351 0.21
352 0.21
353 0.23
354 0.21
355 0.19
356 0.19
357 0.17
358 0.16
359 0.18
360 0.17
361 0.15
362 0.15
363 0.14
364 0.12
365 0.12
366 0.11
367 0.09
368 0.09
369 0.11
370 0.14
371 0.13
372 0.14
373 0.16
374 0.15
375 0.14
376 0.13
377 0.11
378 0.08
379 0.09
380 0.08
381 0.06
382 0.05
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.06
387 0.07
388 0.08
389 0.07
390 0.08
391 0.08
392 0.08
393 0.1
394 0.12
395 0.15
396 0.15
397 0.16
398 0.16
399 0.16
400 0.16
401 0.15
402 0.14
403 0.15
404 0.2
405 0.21
406 0.21
407 0.22
408 0.23
409 0.22
410 0.21
411 0.16
412 0.1
413 0.08
414 0.1
415 0.11
416 0.1
417 0.11
418 0.13
419 0.13
420 0.19
421 0.19
422 0.17
423 0.2
424 0.21
425 0.25
426 0.25
427 0.25
428 0.25
429 0.25
430 0.25
431 0.22
432 0.2
433 0.22
434 0.19
435 0.18
436 0.17
437 0.2
438 0.2
439 0.19
440 0.21
441 0.18
442 0.19
443 0.19
444 0.2
445 0.23
446 0.24
447 0.24
448 0.31
449 0.36
450 0.41
451 0.42
452 0.39
453 0.34
454 0.33
455 0.33
456 0.3
457 0.24
458 0.19
459 0.19
460 0.18
461 0.16
462 0.17
463 0.17
464 0.13
465 0.13
466 0.15
467 0.16
468 0.2
469 0.22
470 0.21
471 0.25
472 0.28
473 0.27
474 0.28
475 0.28
476 0.28
477 0.33
478 0.34
479 0.3
480 0.35
481 0.42
482 0.43
483 0.47
484 0.47
485 0.48
486 0.51
487 0.52
488 0.45
489 0.4
490 0.37
491 0.31
492 0.3
493 0.22
494 0.18
495 0.18
496 0.16
497 0.11
498 0.1
499 0.09
500 0.07
501 0.07
502 0.07
503 0.05
504 0.07
505 0.09
506 0.09
507 0.1
508 0.11
509 0.12
510 0.13
511 0.15
512 0.16
513 0.15
514 0.19
515 0.18
516 0.17
517 0.17