Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2D6T6

Protein Details
Accession A0A0D2D6T6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
398-421QHRDRDYRQRSPPGRRRRTPTPPSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
371-415RRRSRSPGYDRRRDLSPRRHRDSPAADQHRDRDYRQRSPPGRRRR
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto 7, mito 4, cyto_pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006569  CID_dom  
IPR008942  ENTH_VHS  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04818  CID  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51391  CID  
PS50102  RRM  
CDD cd16984  CID_Nrd1_like  
Amino Acid Sequences MSSAVAELDTILQSMLNLKPPGVSGSKITSITSLCTANIQSESVLIQKIYTHFKKTPGTHKLGVLYVVDSVTRQWVDQARKAGQQIGSGAPDGTFAAGVNRVTELLPVLMNDIIATAPEDQKVKINKLLEIWDRSQTFPAPLLASLKEKLNAPRVSTTPEGSPGPGFVPLGQHSTSNNMPSAAPPQQDTSAILEALKNMAKQNAAAPQPAAAPTQSSLNSLLGAQAGTPLPTSTVNQGPIPTAANAQAVNPLGALLAGMSNGAQSQSPANVPPNPLAAFLPQPQAPVPVPQNPAPINQDVQAQIQLVQLLAAQGVPPDQWGTALQLLNMQSAGGSANALPFQAPMQANNWAAPGAGQSRDAHTRSPPGQYRRRSRSPGYDRRRDLSPRRHRDSPAADQHRDRDYRQRSPPGRRRRTPTPPSLDPSLPPPGPKTITYDKSLPRGHIKVYSRTLFVGGVTSGEPTLRQLFSRFGVVQTCIVNIDKRHAFIKMINRRDAEAARHGMEEYKMGDAQLRTKWGVGFGPRDCSDYATGVSVIPIERLTEADRKWLLTAEYGGTGGKPLEEFMVVEEPDIEIGAGVSSKAMSRRVPTDSGGRRGPQSSRQHGGRDERRRDDDRRMDRDDRPGSANNTGVMPPMGFPMNFGTGMPVFPPGFQFPGIQQNQQE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.13
3 0.18
4 0.18
5 0.18
6 0.19
7 0.21
8 0.25
9 0.24
10 0.23
11 0.2
12 0.25
13 0.29
14 0.29
15 0.29
16 0.27
17 0.25
18 0.26
19 0.25
20 0.21
21 0.17
22 0.19
23 0.19
24 0.19
25 0.19
26 0.17
27 0.14
28 0.14
29 0.15
30 0.14
31 0.15
32 0.12
33 0.11
34 0.14
35 0.18
36 0.27
37 0.3
38 0.35
39 0.37
40 0.44
41 0.52
42 0.56
43 0.63
44 0.63
45 0.66
46 0.63
47 0.63
48 0.6
49 0.52
50 0.47
51 0.37
52 0.28
53 0.22
54 0.18
55 0.14
56 0.11
57 0.1
58 0.13
59 0.13
60 0.12
61 0.16
62 0.23
63 0.3
64 0.35
65 0.42
66 0.41
67 0.45
68 0.47
69 0.47
70 0.41
71 0.37
72 0.35
73 0.3
74 0.28
75 0.24
76 0.22
77 0.16
78 0.15
79 0.13
80 0.1
81 0.08
82 0.06
83 0.07
84 0.09
85 0.1
86 0.1
87 0.1
88 0.1
89 0.1
90 0.11
91 0.1
92 0.09
93 0.09
94 0.08
95 0.09
96 0.09
97 0.08
98 0.08
99 0.07
100 0.06
101 0.06
102 0.07
103 0.08
104 0.09
105 0.11
106 0.13
107 0.13
108 0.2
109 0.25
110 0.28
111 0.31
112 0.32
113 0.31
114 0.33
115 0.4
116 0.39
117 0.39
118 0.38
119 0.39
120 0.39
121 0.38
122 0.38
123 0.32
124 0.27
125 0.24
126 0.23
127 0.18
128 0.17
129 0.18
130 0.18
131 0.19
132 0.19
133 0.2
134 0.19
135 0.22
136 0.26
137 0.32
138 0.33
139 0.33
140 0.36
141 0.35
142 0.39
143 0.37
144 0.34
145 0.27
146 0.28
147 0.25
148 0.22
149 0.21
150 0.17
151 0.15
152 0.14
153 0.13
154 0.1
155 0.13
156 0.13
157 0.16
158 0.15
159 0.16
160 0.15
161 0.19
162 0.21
163 0.19
164 0.18
165 0.16
166 0.16
167 0.16
168 0.21
169 0.21
170 0.2
171 0.19
172 0.21
173 0.21
174 0.22
175 0.22
176 0.2
177 0.17
178 0.16
179 0.15
180 0.13
181 0.12
182 0.14
183 0.13
184 0.11
185 0.11
186 0.12
187 0.12
188 0.13
189 0.15
190 0.19
191 0.2
192 0.19
193 0.18
194 0.17
195 0.18
196 0.19
197 0.16
198 0.1
199 0.1
200 0.09
201 0.13
202 0.12
203 0.12
204 0.13
205 0.13
206 0.13
207 0.12
208 0.12
209 0.09
210 0.08
211 0.06
212 0.07
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.07
218 0.08
219 0.09
220 0.11
221 0.13
222 0.15
223 0.15
224 0.16
225 0.16
226 0.16
227 0.16
228 0.13
229 0.11
230 0.1
231 0.11
232 0.11
233 0.1
234 0.12
235 0.11
236 0.1
237 0.09
238 0.08
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.03
243 0.03
244 0.03
245 0.03
246 0.02
247 0.03
248 0.03
249 0.03
250 0.03
251 0.04
252 0.05
253 0.06
254 0.07
255 0.08
256 0.11
257 0.13
258 0.14
259 0.15
260 0.17
261 0.16
262 0.16
263 0.15
264 0.14
265 0.14
266 0.14
267 0.16
268 0.13
269 0.14
270 0.13
271 0.15
272 0.14
273 0.16
274 0.17
275 0.2
276 0.23
277 0.24
278 0.28
279 0.26
280 0.28
281 0.27
282 0.25
283 0.21
284 0.18
285 0.19
286 0.16
287 0.16
288 0.14
289 0.11
290 0.11
291 0.1
292 0.1
293 0.07
294 0.06
295 0.06
296 0.05
297 0.05
298 0.04
299 0.03
300 0.03
301 0.03
302 0.03
303 0.03
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.05
308 0.07
309 0.09
310 0.1
311 0.09
312 0.11
313 0.12
314 0.11
315 0.11
316 0.09
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.03
321 0.03
322 0.03
323 0.04
324 0.04
325 0.04
326 0.04
327 0.04
328 0.04
329 0.09
330 0.09
331 0.09
332 0.11
333 0.14
334 0.15
335 0.15
336 0.15
337 0.1
338 0.1
339 0.09
340 0.09
341 0.07
342 0.07
343 0.08
344 0.08
345 0.11
346 0.16
347 0.16
348 0.16
349 0.16
350 0.21
351 0.22
352 0.28
353 0.32
354 0.36
355 0.44
356 0.51
357 0.6
358 0.63
359 0.69
360 0.67
361 0.65
362 0.68
363 0.7
364 0.73
365 0.72
366 0.73
367 0.68
368 0.65
369 0.66
370 0.63
371 0.61
372 0.62
373 0.64
374 0.64
375 0.68
376 0.7
377 0.67
378 0.67
379 0.65
380 0.63
381 0.62
382 0.6
383 0.56
384 0.53
385 0.55
386 0.53
387 0.49
388 0.41
389 0.41
390 0.41
391 0.47
392 0.52
393 0.58
394 0.59
395 0.68
396 0.76
397 0.78
398 0.81
399 0.79
400 0.79
401 0.79
402 0.82
403 0.8
404 0.8
405 0.76
406 0.71
407 0.68
408 0.65
409 0.56
410 0.46
411 0.42
412 0.38
413 0.3
414 0.26
415 0.24
416 0.23
417 0.25
418 0.25
419 0.28
420 0.29
421 0.32
422 0.35
423 0.39
424 0.38
425 0.43
426 0.44
427 0.41
428 0.39
429 0.38
430 0.37
431 0.38
432 0.39
433 0.39
434 0.43
435 0.42
436 0.37
437 0.35
438 0.34
439 0.26
440 0.23
441 0.16
442 0.1
443 0.09
444 0.08
445 0.08
446 0.07
447 0.07
448 0.07
449 0.07
450 0.11
451 0.11
452 0.11
453 0.13
454 0.15
455 0.16
456 0.2
457 0.19
458 0.17
459 0.18
460 0.19
461 0.19
462 0.17
463 0.17
464 0.14
465 0.14
466 0.16
467 0.14
468 0.2
469 0.19
470 0.2
471 0.21
472 0.21
473 0.22
474 0.24
475 0.34
476 0.37
477 0.42
478 0.46
479 0.45
480 0.46
481 0.48
482 0.45
483 0.39
484 0.35
485 0.32
486 0.28
487 0.28
488 0.27
489 0.25
490 0.22
491 0.2
492 0.15
493 0.13
494 0.12
495 0.12
496 0.15
497 0.14
498 0.18
499 0.19
500 0.22
501 0.21
502 0.22
503 0.22
504 0.2
505 0.23
506 0.23
507 0.26
508 0.24
509 0.31
510 0.3
511 0.32
512 0.31
513 0.3
514 0.27
515 0.23
516 0.22
517 0.16
518 0.16
519 0.13
520 0.13
521 0.12
522 0.1
523 0.09
524 0.08
525 0.08
526 0.08
527 0.09
528 0.13
529 0.17
530 0.18
531 0.24
532 0.25
533 0.25
534 0.26
535 0.26
536 0.24
537 0.2
538 0.21
539 0.15
540 0.15
541 0.14
542 0.14
543 0.12
544 0.12
545 0.1
546 0.08
547 0.07
548 0.07
549 0.08
550 0.08
551 0.08
552 0.1
553 0.15
554 0.14
555 0.14
556 0.13
557 0.12
558 0.12
559 0.12
560 0.09
561 0.04
562 0.04
563 0.04
564 0.04
565 0.04
566 0.04
567 0.05
568 0.07
569 0.1
570 0.13
571 0.16
572 0.2
573 0.25
574 0.3
575 0.32
576 0.33
577 0.41
578 0.44
579 0.48
580 0.49
581 0.47
582 0.46
583 0.47
584 0.49
585 0.48
586 0.51
587 0.53
588 0.56
589 0.57
590 0.59
591 0.62
592 0.68
593 0.69
594 0.7
595 0.71
596 0.72
597 0.75
598 0.76
599 0.75
600 0.75
601 0.75
602 0.75
603 0.73
604 0.73
605 0.72
606 0.7
607 0.75
608 0.69
609 0.62
610 0.57
611 0.55
612 0.51
613 0.49
614 0.45
615 0.36
616 0.34
617 0.3
618 0.27
619 0.21
620 0.17
621 0.13
622 0.14
623 0.16
624 0.13
625 0.14
626 0.17
627 0.19
628 0.19
629 0.18
630 0.19
631 0.18
632 0.19
633 0.18
634 0.18
635 0.16
636 0.16
637 0.2
638 0.19
639 0.2
640 0.21
641 0.22
642 0.21
643 0.31
644 0.34