Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q4WEB6

Protein Details
Accession Q4WEB6    Localization Confidence Low Confidence Score 7.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
783-806EACITLPLQPRKRRRLTENHASNVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto_nucl 10, nucl 9.5, cyto 9.5, mito 2, extr 2, E.R. 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012310  DNA_ligase_ATP-dep_cent  
IPR012308  DNA_ligase_ATP-dep_N  
IPR036599  DNA_ligase_N_sf  
IPR018247  EF_Hand_1_Ca_BS  
IPR029710  LIG4  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Gene Ontology GO:0032807  C:DNA ligase IV complex  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003910  F:DNA ligase (ATP) activity  
GO:0051103  P:DNA ligation involved in DNA repair  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006260  P:DNA replication  
GO:0006303  P:double-strand break repair via nonhomologous end joining  
GO:0006297  P:nucleotide-excision repair, DNA gap filling  
KEGG afm:AFUA_5G02430  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01068  DNA_ligase_A_M  
PF04675  DNA_ligase_A_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50160  DNA_LIGASE_A3  
PS00018  EF_HAND_1  
CDD cd08039  Adenylation_DNA_ligase_Fungal  
Amino Acid Sequences MDAPTVCLASFSFAQETSKILLIERNHPRGMWLPSCTNLSRVIGRCLLLGSDRRQELEQWRVAGGADLGQCVENVMRQAEFDINSGQEVTVEEIDLALNKIASRCRFSGSRVRRQHSAVDVEDTLRPLYRRMSSRDAKWLTRMILKSYHPVVLPAKLTMKSFHFLLPHLLLFQDSFDSALKMLASEPLCHYPPNPIPELAKDLCIQALQHLKPRIGIKIGRPEYHKARSIKHCCQMIGRRRMSVERKYDGEYCQIHIDLTKRPNPIQIFSKSGKDSTDDRAGIHAVVKDSLSIGKSECKFSRQCILEGELVVWNDNHGRIADFHKLRKFIARSGTYIGIDNDSPPQPYEHLMIVFFDILLLDDDICLRKPHRERRLLLKNVVKVIDGYADIAEQHIVEFSHPSGRSRLETIFSKAVTERWEGLVLKGCEDPYVSIFPGSENGSGGRWIKLKKDYIPGLGDTVDLTLIGARYDSRDAAALYSSTKIFWTHFYIGCLVNKDAVLQSAAEPRFLVMDVIDCNSMSLKNMQILNQFGQFGACGLDSGHGFRIEFGKDSLSDMNTVFKKPFVVEMLGGGFEKPSGARYFTLRFPRIQKIFLDRSFEEAASYQELQLSAEEARMVPAEDLHHEEEWRRQLQQGQVSSYYIVTKSQTTSSGTSSCPMTASSPSKGPSSEAIATTVIRTQPQHLSGDSIQQWNRVNDERVPADAISIFVDDSMATVSSPESSEPPRKLLRSNDNLSSIQGSSKKRNQESSSNPSKGNSASYGEENGTTFPSNDSNASIELEACITLPLQPRKRRRLTENHASNVAPVVPSSCSNQPRCVKAPLTMIPLYFRQDLDRGDSTNTLIPPNSSNLAGDLQTFLQNQQYPKTLSGDFFSKSANRSQQPSNPTDIKLHEAARFSSLMPNSSLSRQD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.18
3 0.2
4 0.19
5 0.2
6 0.18
7 0.17
8 0.22
9 0.24
10 0.33
11 0.4
12 0.44
13 0.42
14 0.42
15 0.44
16 0.45
17 0.49
18 0.45
19 0.41
20 0.38
21 0.4
22 0.46
23 0.43
24 0.39
25 0.35
26 0.33
27 0.35
28 0.34
29 0.37
30 0.34
31 0.34
32 0.33
33 0.29
34 0.27
35 0.25
36 0.28
37 0.27
38 0.32
39 0.33
40 0.34
41 0.35
42 0.39
43 0.42
44 0.45
45 0.44
46 0.38
47 0.37
48 0.35
49 0.34
50 0.29
51 0.22
52 0.17
53 0.13
54 0.12
55 0.12
56 0.12
57 0.12
58 0.12
59 0.12
60 0.09
61 0.1
62 0.12
63 0.11
64 0.11
65 0.14
66 0.16
67 0.17
68 0.17
69 0.17
70 0.16
71 0.16
72 0.17
73 0.14
74 0.11
75 0.11
76 0.12
77 0.11
78 0.1
79 0.09
80 0.09
81 0.09
82 0.1
83 0.1
84 0.07
85 0.07
86 0.08
87 0.11
88 0.17
89 0.2
90 0.25
91 0.25
92 0.3
93 0.32
94 0.37
95 0.45
96 0.49
97 0.56
98 0.61
99 0.64
100 0.65
101 0.65
102 0.66
103 0.62
104 0.58
105 0.49
106 0.44
107 0.4
108 0.37
109 0.35
110 0.3
111 0.24
112 0.2
113 0.19
114 0.17
115 0.21
116 0.26
117 0.3
118 0.35
119 0.44
120 0.48
121 0.53
122 0.61
123 0.61
124 0.57
125 0.56
126 0.54
127 0.48
128 0.48
129 0.46
130 0.39
131 0.4
132 0.39
133 0.41
134 0.39
135 0.38
136 0.31
137 0.33
138 0.32
139 0.3
140 0.29
141 0.25
142 0.27
143 0.26
144 0.27
145 0.26
146 0.27
147 0.25
148 0.25
149 0.25
150 0.22
151 0.22
152 0.25
153 0.25
154 0.22
155 0.2
156 0.18
157 0.16
158 0.14
159 0.14
160 0.1
161 0.07
162 0.08
163 0.08
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.09
168 0.08
169 0.08
170 0.12
171 0.13
172 0.14
173 0.17
174 0.21
175 0.22
176 0.22
177 0.22
178 0.25
179 0.3
180 0.33
181 0.32
182 0.3
183 0.3
184 0.32
185 0.39
186 0.31
187 0.28
188 0.24
189 0.22
190 0.2
191 0.19
192 0.17
193 0.15
194 0.22
195 0.22
196 0.28
197 0.31
198 0.31
199 0.34
200 0.37
201 0.35
202 0.32
203 0.34
204 0.34
205 0.42
206 0.46
207 0.45
208 0.47
209 0.51
210 0.53
211 0.55
212 0.56
213 0.49
214 0.53
215 0.6
216 0.65
217 0.67
218 0.66
219 0.63
220 0.57
221 0.61
222 0.63
223 0.62
224 0.64
225 0.58
226 0.53
227 0.52
228 0.59
229 0.58
230 0.57
231 0.54
232 0.48
233 0.48
234 0.5
235 0.5
236 0.44
237 0.43
238 0.36
239 0.3
240 0.28
241 0.26
242 0.22
243 0.21
244 0.22
245 0.21
246 0.26
247 0.29
248 0.3
249 0.31
250 0.37
251 0.38
252 0.4
253 0.4
254 0.37
255 0.38
256 0.37
257 0.42
258 0.37
259 0.36
260 0.32
261 0.28
262 0.28
263 0.27
264 0.32
265 0.27
266 0.26
267 0.26
268 0.26
269 0.23
270 0.22
271 0.19
272 0.12
273 0.12
274 0.12
275 0.1
276 0.1
277 0.11
278 0.09
279 0.08
280 0.09
281 0.15
282 0.16
283 0.22
284 0.23
285 0.26
286 0.27
287 0.29
288 0.37
289 0.33
290 0.33
291 0.3
292 0.32
293 0.29
294 0.27
295 0.25
296 0.19
297 0.16
298 0.15
299 0.12
300 0.1
301 0.09
302 0.09
303 0.09
304 0.07
305 0.07
306 0.09
307 0.13
308 0.21
309 0.23
310 0.28
311 0.32
312 0.33
313 0.33
314 0.39
315 0.38
316 0.33
317 0.39
318 0.36
319 0.34
320 0.36
321 0.37
322 0.3
323 0.29
324 0.25
325 0.17
326 0.15
327 0.14
328 0.14
329 0.12
330 0.12
331 0.11
332 0.12
333 0.11
334 0.13
335 0.14
336 0.12
337 0.12
338 0.12
339 0.11
340 0.11
341 0.1
342 0.08
343 0.06
344 0.04
345 0.04
346 0.05
347 0.04
348 0.04
349 0.04
350 0.05
351 0.06
352 0.06
353 0.07
354 0.08
355 0.15
356 0.24
357 0.34
358 0.43
359 0.51
360 0.54
361 0.63
362 0.73
363 0.71
364 0.69
365 0.65
366 0.58
367 0.53
368 0.5
369 0.39
370 0.29
371 0.24
372 0.18
373 0.12
374 0.1
375 0.07
376 0.06
377 0.06
378 0.06
379 0.05
380 0.04
381 0.04
382 0.04
383 0.04
384 0.04
385 0.05
386 0.05
387 0.11
388 0.12
389 0.13
390 0.15
391 0.16
392 0.17
393 0.19
394 0.2
395 0.17
396 0.19
397 0.21
398 0.22
399 0.2
400 0.2
401 0.18
402 0.18
403 0.17
404 0.17
405 0.14
406 0.13
407 0.15
408 0.14
409 0.15
410 0.2
411 0.17
412 0.17
413 0.17
414 0.16
415 0.14
416 0.14
417 0.13
418 0.08
419 0.1
420 0.09
421 0.08
422 0.08
423 0.08
424 0.1
425 0.1
426 0.09
427 0.07
428 0.08
429 0.08
430 0.1
431 0.1
432 0.1
433 0.12
434 0.13
435 0.16
436 0.21
437 0.24
438 0.26
439 0.32
440 0.32
441 0.31
442 0.32
443 0.29
444 0.24
445 0.21
446 0.18
447 0.11
448 0.09
449 0.06
450 0.05
451 0.04
452 0.03
453 0.03
454 0.03
455 0.03
456 0.03
457 0.05
458 0.06
459 0.06
460 0.06
461 0.06
462 0.07
463 0.07
464 0.07
465 0.06
466 0.06
467 0.08
468 0.07
469 0.07
470 0.07
471 0.07
472 0.08
473 0.1
474 0.14
475 0.17
476 0.17
477 0.18
478 0.2
479 0.21
480 0.21
481 0.21
482 0.16
483 0.14
484 0.13
485 0.12
486 0.11
487 0.09
488 0.08
489 0.06
490 0.07
491 0.13
492 0.13
493 0.13
494 0.13
495 0.12
496 0.12
497 0.12
498 0.11
499 0.04
500 0.05
501 0.06
502 0.07
503 0.07
504 0.06
505 0.06
506 0.07
507 0.07
508 0.06
509 0.07
510 0.07
511 0.11
512 0.12
513 0.13
514 0.15
515 0.17
516 0.17
517 0.17
518 0.17
519 0.13
520 0.12
521 0.1
522 0.08
523 0.07
524 0.05
525 0.04
526 0.04
527 0.06
528 0.06
529 0.07
530 0.08
531 0.08
532 0.08
533 0.08
534 0.11
535 0.1
536 0.11
537 0.1
538 0.1
539 0.1
540 0.12
541 0.13
542 0.11
543 0.12
544 0.11
545 0.16
546 0.16
547 0.17
548 0.15
549 0.14
550 0.15
551 0.14
552 0.16
553 0.12
554 0.13
555 0.12
556 0.12
557 0.12
558 0.12
559 0.12
560 0.09
561 0.07
562 0.05
563 0.06
564 0.05
565 0.06
566 0.07
567 0.09
568 0.1
569 0.14
570 0.17
571 0.23
572 0.31
573 0.31
574 0.34
575 0.37
576 0.45
577 0.44
578 0.43
579 0.4
580 0.39
581 0.45
582 0.43
583 0.44
584 0.36
585 0.38
586 0.38
587 0.35
588 0.27
589 0.21
590 0.2
591 0.16
592 0.16
593 0.11
594 0.11
595 0.11
596 0.11
597 0.1
598 0.1
599 0.07
600 0.07
601 0.07
602 0.06
603 0.07
604 0.07
605 0.07
606 0.06
607 0.07
608 0.08
609 0.09
610 0.13
611 0.14
612 0.15
613 0.15
614 0.16
615 0.2
616 0.25
617 0.25
618 0.22
619 0.22
620 0.26
621 0.31
622 0.37
623 0.35
624 0.32
625 0.32
626 0.31
627 0.3
628 0.26
629 0.22
630 0.15
631 0.13
632 0.11
633 0.12
634 0.13
635 0.14
636 0.15
637 0.17
638 0.19
639 0.2
640 0.21
641 0.2
642 0.2
643 0.2
644 0.18
645 0.15
646 0.14
647 0.13
648 0.17
649 0.2
650 0.21
651 0.23
652 0.24
653 0.25
654 0.25
655 0.25
656 0.21
657 0.23
658 0.23
659 0.2
660 0.2
661 0.2
662 0.2
663 0.19
664 0.19
665 0.14
666 0.14
667 0.14
668 0.16
669 0.2
670 0.22
671 0.24
672 0.21
673 0.26
674 0.24
675 0.3
676 0.29
677 0.31
678 0.29
679 0.32
680 0.35
681 0.31
682 0.35
683 0.32
684 0.32
685 0.29
686 0.34
687 0.31
688 0.28
689 0.29
690 0.25
691 0.21
692 0.19
693 0.16
694 0.11
695 0.1
696 0.09
697 0.06
698 0.07
699 0.05
700 0.05
701 0.06
702 0.05
703 0.04
704 0.05
705 0.05
706 0.06
707 0.07
708 0.08
709 0.1
710 0.15
711 0.23
712 0.25
713 0.3
714 0.35
715 0.37
716 0.42
717 0.48
718 0.53
719 0.54
720 0.58
721 0.57
722 0.56
723 0.54
724 0.49
725 0.43
726 0.33
727 0.28
728 0.3
729 0.3
730 0.34
731 0.4
732 0.48
733 0.5
734 0.58
735 0.59
736 0.63
737 0.67
738 0.68
739 0.71
740 0.66
741 0.62
742 0.54
743 0.51
744 0.43
745 0.37
746 0.3
747 0.23
748 0.22
749 0.23
750 0.25
751 0.23
752 0.22
753 0.2
754 0.18
755 0.16
756 0.15
757 0.13
758 0.13
759 0.14
760 0.15
761 0.15
762 0.16
763 0.15
764 0.16
765 0.17
766 0.15
767 0.13
768 0.12
769 0.11
770 0.1
771 0.08
772 0.07
773 0.06
774 0.1
775 0.18
776 0.27
777 0.36
778 0.45
779 0.55
780 0.65
781 0.75
782 0.79
783 0.81
784 0.83
785 0.83
786 0.85
787 0.84
788 0.79
789 0.72
790 0.64
791 0.55
792 0.46
793 0.37
794 0.26
795 0.16
796 0.13
797 0.12
798 0.13
799 0.17
800 0.23
801 0.3
802 0.33
803 0.43
804 0.47
805 0.52
806 0.55
807 0.58
808 0.52
809 0.49
810 0.54
811 0.49
812 0.5
813 0.45
814 0.41
815 0.37
816 0.37
817 0.37
818 0.31
819 0.27
820 0.24
821 0.25
822 0.27
823 0.3
824 0.3
825 0.27
826 0.28
827 0.29
828 0.28
829 0.29
830 0.28
831 0.24
832 0.21
833 0.21
834 0.21
835 0.24
836 0.24
837 0.2
838 0.19
839 0.19
840 0.2
841 0.19
842 0.17
843 0.15
844 0.14
845 0.17
846 0.18
847 0.16
848 0.21
849 0.24
850 0.26
851 0.29
852 0.33
853 0.32
854 0.34
855 0.37
856 0.33
857 0.31
858 0.32
859 0.32
860 0.28
861 0.26
862 0.27
863 0.26
864 0.27
865 0.33
866 0.39
867 0.39
868 0.43
869 0.5
870 0.53
871 0.58
872 0.59
873 0.59
874 0.54
875 0.52
876 0.52
877 0.48
878 0.46
879 0.43
880 0.43
881 0.39
882 0.37
883 0.36
884 0.34
885 0.32
886 0.28
887 0.3
888 0.28
889 0.26
890 0.25
891 0.27
892 0.27