Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H9CJQ7

Protein Details
Accession H9CJQ7    Localization Confidence High Confidence Score 19.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-27MLNIIKSKLKNTYKKKSLNNLNVVIRNHydrophilic
67-96FNSYNWKIEKQLRKERLRHRLRKLSTNRIFHydrophilic
123-143YLLKLKKRYIRLFKRVKFVRKHydrophilic
249-288FTQPLVLKLRKKRKPLKYLKALVRKAKIKKIKLNERSKYFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
80-86KERLRHR
256-281KLRKKRKPLKYLKALVRKAKIKKIKL
Subcellular Location(s) nucl 14.5, mito 11, cyto_nucl 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007980  Ribosomal_VAR1  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05316  VAR1  
Amino Acid Sequences MLNIIKSKLKNTYKKKSLNNLNVVIRNKDFVPAVRDWKNSIYVYNKNALSLIPVASRLVMKLIKGYFNSYNWKIEKQLRKERLRHRLRKLSTNRIFVSDGEFKHTNDKVNITLYVYNRQKLNYLLKLKKRYIRLFKRVKFVRKLQLIRNIGLNILKKQQEKSKILTNILPNYSSKISRIQNFYYKKFIIKSFKRLKYYMFYKQLLYINKAKFENSYLQGLINLIKKIYKKNVEFNIINLKYFYFNSDIFTQPLVLKLRKKRKPLKYLKALVRKAKIKKIKLNERSKYFFELNNLFTVNNLDTTNNLLNNLIEENKTSSKYLKKIVLNNIKYKRVSGVRIEAAGRLTRRYTASRSQHKVRYKGNLVNAYSSIKGYPSSVIRGNYKPNLQYTKLNSKSRIGSFGVKGWVSGT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.87
3 0.88
4 0.89
5 0.89
6 0.87
7 0.84
8 0.81
9 0.79
10 0.73
11 0.67
12 0.57
13 0.49
14 0.41
15 0.36
16 0.3
17 0.27
18 0.29
19 0.29
20 0.36
21 0.4
22 0.42
23 0.42
24 0.43
25 0.46
26 0.4
27 0.4
28 0.39
29 0.39
30 0.42
31 0.45
32 0.42
33 0.37
34 0.36
35 0.31
36 0.27
37 0.22
38 0.2
39 0.14
40 0.14
41 0.14
42 0.15
43 0.15
44 0.12
45 0.15
46 0.14
47 0.13
48 0.18
49 0.21
50 0.24
51 0.24
52 0.3
53 0.29
54 0.32
55 0.4
56 0.37
57 0.42
58 0.41
59 0.42
60 0.42
61 0.48
62 0.54
63 0.55
64 0.63
65 0.66
66 0.73
67 0.8
68 0.84
69 0.86
70 0.87
71 0.87
72 0.87
73 0.87
74 0.83
75 0.84
76 0.83
77 0.83
78 0.8
79 0.78
80 0.69
81 0.62
82 0.58
83 0.47
84 0.45
85 0.4
86 0.33
87 0.32
88 0.32
89 0.28
90 0.34
91 0.36
92 0.34
93 0.3
94 0.32
95 0.27
96 0.28
97 0.28
98 0.23
99 0.26
100 0.23
101 0.3
102 0.31
103 0.32
104 0.31
105 0.31
106 0.3
107 0.31
108 0.37
109 0.36
110 0.42
111 0.48
112 0.55
113 0.62
114 0.67
115 0.67
116 0.68
117 0.7
118 0.71
119 0.74
120 0.76
121 0.78
122 0.77
123 0.82
124 0.81
125 0.8
126 0.76
127 0.74
128 0.73
129 0.71
130 0.71
131 0.67
132 0.69
133 0.63
134 0.56
135 0.52
136 0.43
137 0.35
138 0.33
139 0.28
140 0.21
141 0.23
142 0.26
143 0.25
144 0.28
145 0.34
146 0.39
147 0.41
148 0.42
149 0.45
150 0.45
151 0.45
152 0.46
153 0.44
154 0.4
155 0.37
156 0.34
157 0.26
158 0.26
159 0.25
160 0.21
161 0.18
162 0.2
163 0.23
164 0.27
165 0.32
166 0.32
167 0.39
168 0.43
169 0.44
170 0.43
171 0.4
172 0.37
173 0.36
174 0.38
175 0.39
176 0.39
177 0.47
178 0.52
179 0.57
180 0.59
181 0.57
182 0.54
183 0.52
184 0.53
185 0.52
186 0.48
187 0.43
188 0.39
189 0.42
190 0.44
191 0.38
192 0.36
193 0.35
194 0.29
195 0.32
196 0.31
197 0.27
198 0.24
199 0.24
200 0.25
201 0.2
202 0.21
203 0.17
204 0.17
205 0.16
206 0.16
207 0.16
208 0.14
209 0.12
210 0.11
211 0.13
212 0.15
213 0.19
214 0.26
215 0.31
216 0.31
217 0.39
218 0.44
219 0.48
220 0.47
221 0.45
222 0.48
223 0.41
224 0.38
225 0.3
226 0.25
227 0.2
228 0.2
229 0.2
230 0.12
231 0.12
232 0.14
233 0.16
234 0.17
235 0.16
236 0.17
237 0.16
238 0.13
239 0.17
240 0.18
241 0.2
242 0.26
243 0.34
244 0.45
245 0.5
246 0.61
247 0.67
248 0.73
249 0.81
250 0.85
251 0.86
252 0.86
253 0.88
254 0.87
255 0.87
256 0.84
257 0.8
258 0.76
259 0.74
260 0.7
261 0.7
262 0.7
263 0.68
264 0.7
265 0.73
266 0.76
267 0.78
268 0.83
269 0.81
270 0.8
271 0.76
272 0.7
273 0.66
274 0.57
275 0.49
276 0.44
277 0.4
278 0.34
279 0.31
280 0.29
281 0.23
282 0.21
283 0.21
284 0.16
285 0.13
286 0.12
287 0.1
288 0.1
289 0.15
290 0.18
291 0.15
292 0.15
293 0.14
294 0.13
295 0.14
296 0.15
297 0.12
298 0.1
299 0.11
300 0.15
301 0.17
302 0.19
303 0.19
304 0.23
305 0.28
306 0.33
307 0.38
308 0.41
309 0.45
310 0.51
311 0.6
312 0.66
313 0.65
314 0.71
315 0.71
316 0.7
317 0.64
318 0.58
319 0.55
320 0.5
321 0.48
322 0.44
323 0.45
324 0.41
325 0.43
326 0.42
327 0.37
328 0.34
329 0.33
330 0.28
331 0.24
332 0.22
333 0.23
334 0.26
335 0.29
336 0.33
337 0.38
338 0.47
339 0.55
340 0.62
341 0.67
342 0.72
343 0.76
344 0.78
345 0.75
346 0.75
347 0.73
348 0.72
349 0.72
350 0.71
351 0.65
352 0.6
353 0.55
354 0.47
355 0.4
356 0.34
357 0.26
358 0.18
359 0.17
360 0.15
361 0.18
362 0.18
363 0.22
364 0.26
365 0.3
366 0.35
367 0.39
368 0.46
369 0.48
370 0.51
371 0.51
372 0.54
373 0.57
374 0.55
375 0.58
376 0.58
377 0.63
378 0.66
379 0.69
380 0.64
381 0.63
382 0.68
383 0.63
384 0.6
385 0.53
386 0.51
387 0.47
388 0.48
389 0.47
390 0.39