Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A4DA84

Protein Details
Accession A4DA84    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
82-108SQPGIPKLRRTAKKKLRFKGKGHEFSDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
86-103IPKLRRTAKKKLRFKGKG
Subcellular Location(s) nucl 11, cyto_nucl 9.5, cyto 6, pero 5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012923  Csm3  
IPR040038  TIPIN/Csm3/Swi3  
Gene Ontology GO:0031298  C:replication fork protection complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0000076  P:DNA replication checkpoint signaling  
GO:0051321  P:meiotic cell cycle  
GO:0043111  P:replication fork arrest  
GO:0031297  P:replication fork processing  
KEGG afm:AFUA_4G04745  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07962  Swi3  
Amino Acid Sequences MENEGTLQDDRPASPKHAGDLFDYDFALDELWQETPNMPNNGAPMQASARDESGLGLGLDEEVKVTKKRQPVAKLDESRLLSQPGIPKLRRTAKKKLRFKGKGHEFSDAARLLNFYQLWLDDLFPRAKFADGLAIIERLGHSKRLQAMRKEWIDEEKPKDASENHNDVLKASESSGSQSDDPVVAFGGLNMADTKRSKGDIAGDYTSDAERMRVEVNLNPSGQRKLDEGLFMTDNDDVAQQPDNLGAPDDDELDALLKEQELLLMNNASA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.32
3 0.33
4 0.35
5 0.36
6 0.33
7 0.36
8 0.34
9 0.29
10 0.27
11 0.23
12 0.19
13 0.17
14 0.14
15 0.08
16 0.07
17 0.07
18 0.08
19 0.08
20 0.09
21 0.1
22 0.14
23 0.21
24 0.22
25 0.22
26 0.22
27 0.24
28 0.25
29 0.24
30 0.2
31 0.15
32 0.15
33 0.17
34 0.18
35 0.16
36 0.16
37 0.15
38 0.15
39 0.13
40 0.12
41 0.1
42 0.08
43 0.07
44 0.06
45 0.06
46 0.06
47 0.05
48 0.05
49 0.05
50 0.08
51 0.1
52 0.13
53 0.18
54 0.24
55 0.31
56 0.38
57 0.45
58 0.52
59 0.59
60 0.66
61 0.66
62 0.63
63 0.63
64 0.57
65 0.52
66 0.44
67 0.37
68 0.27
69 0.24
70 0.27
71 0.27
72 0.31
73 0.3
74 0.31
75 0.38
76 0.48
77 0.54
78 0.55
79 0.6
80 0.64
81 0.74
82 0.8
83 0.81
84 0.83
85 0.83
86 0.82
87 0.81
88 0.81
89 0.8
90 0.73
91 0.68
92 0.57
93 0.49
94 0.48
95 0.38
96 0.27
97 0.18
98 0.16
99 0.13
100 0.15
101 0.13
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.09
106 0.08
107 0.09
108 0.07
109 0.1
110 0.11
111 0.1
112 0.12
113 0.11
114 0.11
115 0.1
116 0.09
117 0.11
118 0.09
119 0.1
120 0.1
121 0.1
122 0.09
123 0.09
124 0.09
125 0.07
126 0.08
127 0.09
128 0.09
129 0.11
130 0.17
131 0.25
132 0.3
133 0.33
134 0.36
135 0.42
136 0.43
137 0.42
138 0.38
139 0.35
140 0.34
141 0.36
142 0.36
143 0.32
144 0.31
145 0.3
146 0.31
147 0.28
148 0.3
149 0.32
150 0.32
151 0.29
152 0.3
153 0.3
154 0.28
155 0.29
156 0.23
157 0.16
158 0.11
159 0.12
160 0.1
161 0.12
162 0.13
163 0.12
164 0.12
165 0.12
166 0.12
167 0.11
168 0.1
169 0.09
170 0.07
171 0.06
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.06
178 0.06
179 0.08
180 0.09
181 0.12
182 0.12
183 0.14
184 0.14
185 0.15
186 0.21
187 0.22
188 0.26
189 0.26
190 0.24
191 0.23
192 0.24
193 0.22
194 0.17
195 0.13
196 0.09
197 0.08
198 0.1
199 0.1
200 0.1
201 0.12
202 0.15
203 0.2
204 0.23
205 0.23
206 0.24
207 0.26
208 0.28
209 0.27
210 0.25
211 0.21
212 0.21
213 0.22
214 0.22
215 0.21
216 0.22
217 0.22
218 0.2
219 0.2
220 0.17
221 0.15
222 0.13
223 0.12
224 0.09
225 0.09
226 0.11
227 0.1
228 0.1
229 0.11
230 0.11
231 0.11
232 0.12
233 0.1
234 0.1
235 0.11
236 0.12
237 0.11
238 0.1
239 0.1
240 0.09
241 0.09
242 0.09
243 0.08
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.09
248 0.1
249 0.11
250 0.13