Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q4WWM9

Protein Details
Accession Q4WWM9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-44LPPKDIRERVREKEKNNPKFSFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045146  SF3A1  
IPR022030  SF3A1_dom  
IPR000061  Surp  
IPR035967  SWAP/Surp_sf  
Gene Ontology GO:0071013  C:catalytic step 2 spliceosome  
GO:0005686  C:U2 snRNP  
GO:0071004  C:U2-type prespliceosome  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
KEGG afm:AFUA_3G06440  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12230  PRP21_like_P  
PF01805  Surp  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50128  SURP  
Amino Acid Sequences MASNGNTPTLPDEVNKPPEGVVLPPKDIRERVREKEKNNPKFSFLNPGDAYASFYQWRLNEIKEGRGTAVAAGRPGESTAAPEPEKPKGPAQPPEFHFSARMPIINAQDLEVVKLTALYVAKRGKSFMTALSQREARNFQFDFLRPQHSLYQFFTRLVDQYTILLRAEGIDESTSEKRRIAELENNVKNKFHILERAKQRAEWVKYQEQQKQKKEEEEEQERIAYAQIDWHDFVVVETVLFTEADDQADLPPPTSLNDLQSASLEQKAMMSLNPLRIEEAMPTDQGAQVYYNAYPPTQPEPVAHPAPPSVSPYPPQAPVPQPYPMASAAAQEEEQRIRERMEAREQAAAAQAAAKAGPGQQPMRIRSDYVPRAQARRLNPSGATALCPNCHQQIPVAELDQHMRIELLDPRWKEQRAKAESRSATTNLSTADVVNNLKRLASQRSDVFDSSLTAGLDPEEEARKKRMAYENPPGAGPTPPMVGPAGGPPNPQSLNIEEQIRQIHERYKQG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.36
3 0.33
4 0.31
5 0.33
6 0.32
7 0.3
8 0.31
9 0.29
10 0.33
11 0.35
12 0.38
13 0.41
14 0.45
15 0.47
16 0.48
17 0.52
18 0.57
19 0.66
20 0.7
21 0.69
22 0.75
23 0.8
24 0.8
25 0.8
26 0.74
27 0.68
28 0.65
29 0.62
30 0.62
31 0.53
32 0.51
33 0.43
34 0.42
35 0.39
36 0.34
37 0.37
38 0.27
39 0.28
40 0.2
41 0.2
42 0.21
43 0.19
44 0.24
45 0.22
46 0.23
47 0.29
48 0.3
49 0.36
50 0.35
51 0.36
52 0.33
53 0.31
54 0.3
55 0.23
56 0.25
57 0.19
58 0.18
59 0.17
60 0.16
61 0.15
62 0.15
63 0.14
64 0.1
65 0.13
66 0.15
67 0.19
68 0.2
69 0.24
70 0.27
71 0.31
72 0.35
73 0.34
74 0.37
75 0.4
76 0.46
77 0.52
78 0.55
79 0.58
80 0.57
81 0.6
82 0.55
83 0.48
84 0.43
85 0.35
86 0.34
87 0.27
88 0.25
89 0.2
90 0.23
91 0.25
92 0.26
93 0.25
94 0.2
95 0.22
96 0.21
97 0.2
98 0.16
99 0.13
100 0.1
101 0.1
102 0.09
103 0.08
104 0.09
105 0.09
106 0.15
107 0.19
108 0.22
109 0.23
110 0.24
111 0.22
112 0.24
113 0.25
114 0.22
115 0.26
116 0.28
117 0.3
118 0.33
119 0.35
120 0.33
121 0.36
122 0.37
123 0.3
124 0.32
125 0.3
126 0.28
127 0.3
128 0.3
129 0.34
130 0.32
131 0.36
132 0.3
133 0.33
134 0.37
135 0.35
136 0.38
137 0.33
138 0.37
139 0.33
140 0.33
141 0.32
142 0.26
143 0.24
144 0.22
145 0.2
146 0.13
147 0.14
148 0.14
149 0.14
150 0.13
151 0.12
152 0.09
153 0.09
154 0.09
155 0.07
156 0.07
157 0.06
158 0.06
159 0.1
160 0.14
161 0.17
162 0.17
163 0.18
164 0.18
165 0.2
166 0.22
167 0.23
168 0.27
169 0.33
170 0.42
171 0.47
172 0.49
173 0.48
174 0.46
175 0.41
176 0.35
177 0.28
178 0.2
179 0.23
180 0.25
181 0.33
182 0.41
183 0.49
184 0.48
185 0.46
186 0.5
187 0.49
188 0.48
189 0.46
190 0.44
191 0.43
192 0.48
193 0.54
194 0.56
195 0.57
196 0.62
197 0.63
198 0.65
199 0.61
200 0.62
201 0.6
202 0.61
203 0.6
204 0.58
205 0.53
206 0.45
207 0.42
208 0.36
209 0.31
210 0.24
211 0.16
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.1
216 0.1
217 0.1
218 0.09
219 0.09
220 0.09
221 0.07
222 0.06
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.06
235 0.09
236 0.09
237 0.08
238 0.08
239 0.08
240 0.09
241 0.11
242 0.11
243 0.09
244 0.11
245 0.12
246 0.12
247 0.12
248 0.12
249 0.1
250 0.11
251 0.09
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.07
256 0.06
257 0.08
258 0.09
259 0.12
260 0.13
261 0.13
262 0.13
263 0.13
264 0.14
265 0.11
266 0.13
267 0.1
268 0.09
269 0.1
270 0.1
271 0.1
272 0.1
273 0.09
274 0.07
275 0.07
276 0.08
277 0.08
278 0.09
279 0.09
280 0.09
281 0.09
282 0.11
283 0.14
284 0.15
285 0.15
286 0.14
287 0.19
288 0.24
289 0.26
290 0.24
291 0.2
292 0.2
293 0.21
294 0.2
295 0.2
296 0.17
297 0.16
298 0.18
299 0.22
300 0.24
301 0.24
302 0.24
303 0.24
304 0.26
305 0.28
306 0.29
307 0.27
308 0.25
309 0.24
310 0.25
311 0.21
312 0.19
313 0.16
314 0.14
315 0.12
316 0.12
317 0.12
318 0.1
319 0.12
320 0.11
321 0.13
322 0.14
323 0.15
324 0.15
325 0.19
326 0.22
327 0.24
328 0.32
329 0.34
330 0.33
331 0.35
332 0.34
333 0.3
334 0.28
335 0.23
336 0.15
337 0.12
338 0.1
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.05
343 0.08
344 0.11
345 0.13
346 0.14
347 0.19
348 0.25
349 0.27
350 0.32
351 0.31
352 0.3
353 0.31
354 0.39
355 0.4
356 0.39
357 0.44
358 0.42
359 0.45
360 0.47
361 0.5
362 0.45
363 0.49
364 0.47
365 0.42
366 0.39
367 0.38
368 0.37
369 0.31
370 0.28
371 0.23
372 0.22
373 0.2
374 0.21
375 0.21
376 0.21
377 0.22
378 0.2
379 0.2
380 0.22
381 0.24
382 0.24
383 0.23
384 0.2
385 0.2
386 0.22
387 0.2
388 0.17
389 0.13
390 0.12
391 0.1
392 0.12
393 0.16
394 0.19
395 0.24
396 0.26
397 0.3
398 0.37
399 0.4
400 0.43
401 0.45
402 0.5
403 0.52
404 0.59
405 0.6
406 0.63
407 0.62
408 0.6
409 0.58
410 0.49
411 0.43
412 0.36
413 0.32
414 0.23
415 0.22
416 0.19
417 0.15
418 0.15
419 0.15
420 0.17
421 0.18
422 0.19
423 0.17
424 0.17
425 0.19
426 0.22
427 0.27
428 0.28
429 0.31
430 0.33
431 0.39
432 0.43
433 0.41
434 0.38
435 0.31
436 0.29
437 0.25
438 0.23
439 0.18
440 0.14
441 0.13
442 0.12
443 0.12
444 0.1
445 0.12
446 0.16
447 0.19
448 0.22
449 0.26
450 0.3
451 0.3
452 0.38
453 0.45
454 0.48
455 0.55
456 0.62
457 0.66
458 0.64
459 0.63
460 0.56
461 0.47
462 0.39
463 0.32
464 0.23
465 0.17
466 0.16
467 0.17
468 0.16
469 0.15
470 0.14
471 0.19
472 0.23
473 0.22
474 0.24
475 0.24
476 0.3
477 0.31
478 0.32
479 0.29
480 0.26
481 0.31
482 0.33
483 0.35
484 0.3
485 0.33
486 0.36
487 0.36
488 0.35
489 0.32
490 0.35