Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2CQJ1

Protein Details
Accession A0A0D2CQJ1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
615-641IEKIENQMPRKVKKRRRIEEDRFEEYIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
624-631RKVKKRRR
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto 8.5, cyto_mito 7, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02184  HAT  
PF14559  TPR_19  
Amino Acid Sequences MDSSRGPPRVKNKAAAPIQISAEQLLREAVDRQEPGLQAPTQRFADLEELHEFQGRKRKEFEDYVRRNRINMNNWMRYAQWELEQKEFRRARSIFERALDVDSTSVQLWIRYIEAEMKTRNINHARNLLDRAVTILPRIDKLWYKYVYMEETLGNVPGTRQVFERWMSWEPDETAWLSYIKLEKRYGEYDRARAIFQRFTVVHPEPRNWIRWAKFEEENGTSQLVRDVFGVAIETLGDDFMDEKLFIAYARYEAKLKEYERARAIYKYALDRLPRSQSVALHKAYTQFEKQFGNREGVEDVILAKRRVQYEEQLKTNPRNYDVWFDLARLEEAGGDVDRIRDVYERAIAQVPPSQEKRHWRRYIYLWIFYALWEEMTNKDVDRARQVYQECLKLIPHKKWTFAKIWLLKAQFEIRQMQLQAARKTLGQAIGMCPKDKLFRGYIELEKQLFEFLRCRTLFEKQIEWNPSNGQSWIQFAELERGLDDLERARAIYELAIEQPTLDMPELVWKAYIDFEEYEEEYDRARALYERLLRKTDHVKVWINYARFEINVPDAEEAEVEGEQSTVSEEAKARARKIFERAHDLFKSKEMKEERVDLLNAWKSFEQTHGSPEDIEKIENQMPRKVKKRRRIEEDRFEEYIDYVFPADDESAAKMSKLLQMAHQWKARQQTNGSAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.67
3 0.61
4 0.55
5 0.52
6 0.47
7 0.41
8 0.32
9 0.29
10 0.22
11 0.19
12 0.16
13 0.13
14 0.12
15 0.14
16 0.15
17 0.19
18 0.2
19 0.21
20 0.25
21 0.25
22 0.26
23 0.28
24 0.28
25 0.27
26 0.3
27 0.34
28 0.31
29 0.31
30 0.28
31 0.26
32 0.3
33 0.26
34 0.27
35 0.25
36 0.25
37 0.26
38 0.3
39 0.28
40 0.26
41 0.34
42 0.35
43 0.35
44 0.39
45 0.42
46 0.45
47 0.54
48 0.6
49 0.61
50 0.68
51 0.74
52 0.78
53 0.76
54 0.7
55 0.69
56 0.68
57 0.64
58 0.65
59 0.64
60 0.61
61 0.62
62 0.61
63 0.53
64 0.47
65 0.44
66 0.35
67 0.32
68 0.33
69 0.35
70 0.41
71 0.48
72 0.46
73 0.52
74 0.53
75 0.48
76 0.5
77 0.48
78 0.47
79 0.49
80 0.55
81 0.49
82 0.47
83 0.49
84 0.41
85 0.43
86 0.36
87 0.27
88 0.2
89 0.16
90 0.16
91 0.12
92 0.12
93 0.1
94 0.1
95 0.1
96 0.1
97 0.1
98 0.09
99 0.1
100 0.15
101 0.17
102 0.22
103 0.23
104 0.25
105 0.28
106 0.29
107 0.36
108 0.38
109 0.4
110 0.41
111 0.46
112 0.47
113 0.47
114 0.5
115 0.43
116 0.35
117 0.31
118 0.28
119 0.24
120 0.21
121 0.18
122 0.17
123 0.17
124 0.18
125 0.18
126 0.19
127 0.22
128 0.26
129 0.33
130 0.31
131 0.32
132 0.33
133 0.35
134 0.34
135 0.3
136 0.27
137 0.19
138 0.19
139 0.18
140 0.17
141 0.14
142 0.11
143 0.1
144 0.14
145 0.14
146 0.13
147 0.14
148 0.15
149 0.19
150 0.21
151 0.22
152 0.22
153 0.24
154 0.26
155 0.26
156 0.26
157 0.24
158 0.23
159 0.23
160 0.19
161 0.16
162 0.15
163 0.14
164 0.11
165 0.12
166 0.17
167 0.18
168 0.22
169 0.23
170 0.24
171 0.28
172 0.34
173 0.35
174 0.4
175 0.41
176 0.41
177 0.44
178 0.44
179 0.4
180 0.39
181 0.38
182 0.32
183 0.28
184 0.3
185 0.25
186 0.25
187 0.32
188 0.31
189 0.35
190 0.34
191 0.35
192 0.36
193 0.38
194 0.4
195 0.36
196 0.4
197 0.35
198 0.4
199 0.42
200 0.41
201 0.41
202 0.4
203 0.41
204 0.36
205 0.35
206 0.29
207 0.26
208 0.21
209 0.18
210 0.18
211 0.14
212 0.12
213 0.1
214 0.1
215 0.08
216 0.08
217 0.09
218 0.06
219 0.06
220 0.05
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.04
228 0.05
229 0.04
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.06
235 0.06
236 0.07
237 0.1
238 0.1
239 0.12
240 0.12
241 0.16
242 0.2
243 0.21
244 0.26
245 0.26
246 0.3
247 0.32
248 0.35
249 0.33
250 0.29
251 0.29
252 0.26
253 0.25
254 0.23
255 0.24
256 0.24
257 0.24
258 0.25
259 0.28
260 0.3
261 0.28
262 0.28
263 0.27
264 0.27
265 0.32
266 0.35
267 0.31
268 0.27
269 0.27
270 0.29
271 0.29
272 0.28
273 0.25
274 0.21
275 0.23
276 0.25
277 0.25
278 0.28
279 0.28
280 0.28
281 0.25
282 0.24
283 0.22
284 0.19
285 0.18
286 0.11
287 0.1
288 0.1
289 0.12
290 0.1
291 0.12
292 0.15
293 0.16
294 0.19
295 0.2
296 0.24
297 0.32
298 0.37
299 0.37
300 0.38
301 0.4
302 0.41
303 0.45
304 0.39
305 0.32
306 0.29
307 0.28
308 0.29
309 0.27
310 0.26
311 0.22
312 0.2
313 0.19
314 0.16
315 0.15
316 0.1
317 0.08
318 0.05
319 0.05
320 0.05
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.04
325 0.04
326 0.04
327 0.05
328 0.05
329 0.06
330 0.07
331 0.09
332 0.09
333 0.1
334 0.12
335 0.12
336 0.12
337 0.14
338 0.14
339 0.16
340 0.19
341 0.19
342 0.22
343 0.32
344 0.39
345 0.47
346 0.52
347 0.5
348 0.53
349 0.56
350 0.63
351 0.56
352 0.51
353 0.41
354 0.37
355 0.34
356 0.29
357 0.25
358 0.14
359 0.1
360 0.07
361 0.08
362 0.07
363 0.08
364 0.09
365 0.07
366 0.11
367 0.13
368 0.14
369 0.19
370 0.21
371 0.21
372 0.26
373 0.27
374 0.29
375 0.31
376 0.32
377 0.27
378 0.25
379 0.25
380 0.28
381 0.32
382 0.32
383 0.38
384 0.37
385 0.43
386 0.46
387 0.49
388 0.45
389 0.45
390 0.49
391 0.44
392 0.46
393 0.45
394 0.42
395 0.38
396 0.36
397 0.34
398 0.27
399 0.24
400 0.24
401 0.2
402 0.21
403 0.21
404 0.21
405 0.23
406 0.27
407 0.26
408 0.25
409 0.24
410 0.22
411 0.23
412 0.23
413 0.19
414 0.14
415 0.13
416 0.15
417 0.21
418 0.22
419 0.21
420 0.19
421 0.19
422 0.21
423 0.21
424 0.22
425 0.18
426 0.19
427 0.23
428 0.27
429 0.3
430 0.3
431 0.31
432 0.28
433 0.26
434 0.24
435 0.22
436 0.18
437 0.15
438 0.16
439 0.14
440 0.21
441 0.21
442 0.24
443 0.24
444 0.29
445 0.35
446 0.34
447 0.38
448 0.34
449 0.41
450 0.43
451 0.42
452 0.38
453 0.34
454 0.33
455 0.3
456 0.26
457 0.21
458 0.16
459 0.17
460 0.16
461 0.14
462 0.12
463 0.12
464 0.16
465 0.15
466 0.14
467 0.12
468 0.12
469 0.11
470 0.11
471 0.11
472 0.08
473 0.08
474 0.08
475 0.08
476 0.08
477 0.08
478 0.09
479 0.08
480 0.08
481 0.07
482 0.09
483 0.09
484 0.09
485 0.08
486 0.08
487 0.08
488 0.08
489 0.07
490 0.06
491 0.05
492 0.13
493 0.13
494 0.13
495 0.13
496 0.12
497 0.13
498 0.14
499 0.15
500 0.1
501 0.1
502 0.11
503 0.14
504 0.14
505 0.15
506 0.16
507 0.16
508 0.14
509 0.14
510 0.13
511 0.1
512 0.1
513 0.1
514 0.1
515 0.17
516 0.24
517 0.31
518 0.34
519 0.37
520 0.37
521 0.41
522 0.48
523 0.48
524 0.46
525 0.45
526 0.48
527 0.46
528 0.54
529 0.54
530 0.47
531 0.41
532 0.38
533 0.33
534 0.27
535 0.27
536 0.2
537 0.17
538 0.18
539 0.18
540 0.16
541 0.16
542 0.15
543 0.14
544 0.12
545 0.1
546 0.08
547 0.07
548 0.06
549 0.06
550 0.05
551 0.05
552 0.06
553 0.06
554 0.06
555 0.09
556 0.1
557 0.14
558 0.22
559 0.26
560 0.28
561 0.32
562 0.36
563 0.39
564 0.46
565 0.51
566 0.48
567 0.54
568 0.55
569 0.58
570 0.57
571 0.55
572 0.48
573 0.47
574 0.49
575 0.4
576 0.45
577 0.42
578 0.44
579 0.45
580 0.5
581 0.46
582 0.44
583 0.44
584 0.37
585 0.4
586 0.4
587 0.36
588 0.33
589 0.3
590 0.27
591 0.27
592 0.3
593 0.27
594 0.21
595 0.26
596 0.26
597 0.26
598 0.26
599 0.26
600 0.29
601 0.25
602 0.25
603 0.21
604 0.23
605 0.28
606 0.31
607 0.32
608 0.33
609 0.4
610 0.48
611 0.58
612 0.63
613 0.68
614 0.75
615 0.83
616 0.86
617 0.89
618 0.91
619 0.92
620 0.92
621 0.9
622 0.86
623 0.76
624 0.67
625 0.57
626 0.46
627 0.36
628 0.26
629 0.18
630 0.12
631 0.1
632 0.09
633 0.1
634 0.1
635 0.09
636 0.1
637 0.11
638 0.13
639 0.14
640 0.14
641 0.13
642 0.15
643 0.19
644 0.21
645 0.2
646 0.22
647 0.33
648 0.39
649 0.46
650 0.49
651 0.47
652 0.48
653 0.57
654 0.57
655 0.54
656 0.52