FuNGI

Q4WEX5

Protein Details

Accession

Q4WEX5

Localization Confidence

High

Confidence Score

25.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
16-39	ANKAPPMRFRRPKIADPLVRPKKR	Basic
133-153	ESQFTRPVRLQRRDPRAKTQE	Hydrophilic
417-437	RRILGKKVRKALKKREKNYDY	Basic
518-541	GTDTSRKKAKSKHSSQPTPQPTSR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
22-41	MRFRRPKIADPLVRPKKRVI
410-433	EKREREARRILGKKVRKALKKREK
486-508	PSGRPKHTEPLKKGPGAASRKRL

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005674 C:transcription factor TFIIF complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0016251 F:RNA polymerase II general transcription initiation factor activity GO:0001096 F:TFIIF-class transcription factor complex binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	afm:AFUA_3G04230 -
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MTLPANDANSQTHTSANKAPPMRFRRPKIADPLVRPKKRVIARPAATSAPSVGIAAKPTTRPVISNVTPATQADKAAPGAPQNDFSVNGFSGPLLSETYVDYPIVITKRSLRVGLKHHIARFASKKTIDPRDESQFTRPVRLQRRDPRAKTQELNQDKGQAQKLTPQSSLQLGDAEREELEARKAAREKERAENLAQIAPSMGSAPKRSNIPKQRTQQVSKTDMTPEEVARARIKYEEALPWHLEDFDNKNIWVGNYEAALSETHAVFIPENGRMRMIPVEKWYKFGAKNQFRALTIEEAERFMAKKIKDPRWFMEKQQEQAQRKELEQFARQRKVYAGKQGTPAGVDGLEADEMDFEEDRFADDEEHDDLFNEDEETKAAEKRIKQDQLKANVFDLKDEKDYEEEELREKREREARRILGKKVRKALKKREKNYDYSSGSDANPYSDDESSDDSEAERLREEERKAEEDKNKKDSAPSTRGNVTPSGRPKHTEPLKKGPGAASRKRLGSPNVSDASGTDTSRKKAKSKHSSQPTPQPTSRALSPTAPPGQVGKKRIRNVAGAGSVSDADGGAASGGEMSESGKIKKLKLNPPAATSQGGTPQGSRAGSPTPIGSKGLAASRASSPESLRGKISLEVPCLHRNLSAYRTNFCVQGKLASLHRYLRGL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.29
2	0.35
3	0.38
4	0.42
5	0.44
6	0.48
7	0.54
8	0.61
9	0.68
10	0.69
11	0.71
12	0.75
13	0.76
14	0.8
15	0.8
16	0.82
17	0.79
18	0.78
19	0.82
20	0.82
21	0.8
22	0.74
23	0.69
24	0.68
25	0.67
26	0.68
27	0.66
28	0.66
29	0.65
30	0.69
31	0.68
32	0.61
33	0.54
34	0.46
35	0.37
36	0.28
37	0.23
38	0.17
39	0.14
40	0.13
41	0.14
42	0.15
43	0.17
44	0.17
45	0.2
46	0.24
47	0.24
48	0.24
49	0.27
50	0.33
51	0.32
52	0.38
53	0.36
54	0.33
55	0.33
56	0.32
57	0.32
58	0.24
59	0.23
60	0.18
61	0.19
62	0.18
63	0.19
64	0.2
65	0.18
66	0.21
67	0.21
68	0.22
69	0.22
70	0.22
71	0.21
72	0.21
73	0.21
74	0.18
75	0.17
76	0.15
77	0.13
78	0.12
79	0.11
80	0.11
81	0.08
82	0.09
83	0.09
84	0.1
85	0.12
86	0.13
87	0.12
88	0.11
89	0.1
90	0.14
91	0.15
92	0.15
93	0.14
94	0.19
95	0.25
96	0.28
97	0.32
98	0.31
99	0.37
100	0.43
101	0.49
102	0.52
103	0.52
104	0.52
105	0.53
106	0.51
107	0.52
108	0.51
109	0.48
110	0.47
111	0.42
112	0.47
113	0.49
114	0.57
115	0.54
116	0.53
117	0.53
118	0.54
119	0.57
120	0.53
121	0.5
122	0.48
123	0.45
124	0.46
125	0.45
126	0.45
127	0.52
128	0.57
129	0.62
130	0.64
131	0.74
132	0.79
133	0.8
134	0.82
135	0.79
136	0.79
137	0.72
138	0.7
139	0.69
140	0.65
141	0.64
142	0.55
143	0.53
144	0.48
145	0.5
146	0.46
147	0.38
148	0.32
149	0.35
150	0.4
151	0.37
152	0.37
153	0.32
154	0.29
155	0.29
156	0.3
157	0.23
158	0.2
159	0.16
160	0.17
161	0.16
162	0.15
163	0.12
164	0.12
165	0.12
166	0.1
167	0.12
168	0.13
169	0.13
170	0.17
171	0.21
172	0.26
173	0.33
174	0.39
175	0.42
176	0.48
177	0.54
178	0.51
179	0.49
180	0.48
181	0.42
182	0.37
183	0.33
184	0.23
185	0.17
186	0.14
187	0.13
188	0.1
189	0.1
190	0.09
191	0.11
192	0.13
193	0.16
194	0.21
195	0.26
196	0.35
197	0.44
198	0.5
199	0.57
200	0.63
201	0.69
202	0.72
203	0.73
204	0.7
205	0.67
206	0.64
207	0.57
208	0.51
209	0.45
210	0.38
211	0.35
212	0.3
213	0.22
214	0.21
215	0.21
216	0.21
217	0.21
218	0.2
219	0.18
220	0.17
221	0.18
222	0.15
223	0.16
224	0.18
225	0.19
226	0.22
227	0.22
228	0.21
229	0.21
230	0.2
231	0.17
232	0.16
233	0.17
234	0.18
235	0.18
236	0.17
237	0.17
238	0.17
239	0.17
240	0.15
241	0.12
242	0.09
243	0.08
244	0.08
245	0.08
246	0.08
247	0.08
248	0.07
249	0.08
250	0.07
251	0.07
252	0.07
253	0.07
254	0.07
255	0.08
256	0.09
257	0.11
258	0.13
259	0.12
260	0.13
261	0.12
262	0.14
263	0.17
264	0.17
265	0.15
266	0.2
267	0.28
268	0.28
269	0.3
270	0.3
271	0.31
272	0.31
273	0.36
274	0.41
275	0.4
276	0.44
277	0.46
278	0.46
279	0.42
280	0.42
281	0.37
282	0.28
283	0.22
284	0.2
285	0.16
286	0.14
287	0.14
288	0.12
289	0.11
290	0.1
291	0.14
292	0.12
293	0.19
294	0.27
295	0.36
296	0.43
297	0.47
298	0.49
299	0.53
300	0.55
301	0.51
302	0.52
303	0.47
304	0.42
305	0.47
306	0.51
307	0.46
308	0.47
309	0.49
310	0.41
311	0.38
312	0.39
313	0.34
314	0.29
315	0.31
316	0.37
317	0.39
318	0.44
319	0.43
320	0.39
321	0.39
322	0.42
323	0.4
324	0.41
325	0.37
326	0.34
327	0.37
328	0.37
329	0.34
330	0.28
331	0.25
332	0.16
333	0.11
334	0.09
335	0.06
336	0.05
337	0.04
338	0.04
339	0.04
340	0.03
341	0.03
342	0.04
343	0.04
344	0.03
345	0.04
346	0.04
347	0.05
348	0.05
349	0.06
350	0.06
351	0.06
352	0.07
353	0.09
354	0.1
355	0.09
356	0.08
357	0.08
358	0.08
359	0.08
360	0.07
361	0.05
362	0.05
363	0.05
364	0.07
365	0.07
366	0.08
367	0.1
368	0.13
369	0.15
370	0.21
371	0.29
372	0.36
373	0.37
374	0.45
375	0.5
376	0.56
377	0.57
378	0.53
379	0.46
380	0.42
381	0.39
382	0.33
383	0.28
384	0.2
385	0.19
386	0.18
387	0.18
388	0.15
389	0.16
390	0.16
391	0.17
392	0.15
393	0.17
394	0.19
395	0.21
396	0.25
397	0.25
398	0.28
399	0.33
400	0.38
401	0.41
402	0.48
403	0.52
404	0.57
405	0.61
406	0.62
407	0.63
408	0.66
409	0.65
410	0.65
411	0.66
412	0.65
413	0.7
414	0.75
415	0.76
416	0.8
417	0.8
418	0.83
419	0.8
420	0.78
421	0.75
422	0.73
423	0.64
424	0.56
425	0.51
426	0.42
427	0.37
428	0.33
429	0.26
430	0.18
431	0.16
432	0.14
433	0.14
434	0.12
435	0.12
436	0.12
437	0.14
438	0.15
439	0.15
440	0.14
441	0.12
442	0.14
443	0.14
444	0.13
445	0.1
446	0.1
447	0.12
448	0.18
449	0.19
450	0.23
451	0.26
452	0.29
453	0.32
454	0.39
455	0.45
456	0.49
457	0.54
458	0.55
459	0.53
460	0.5
461	0.51
462	0.5
463	0.5
464	0.49
465	0.45
466	0.43
467	0.45
468	0.45
469	0.43
470	0.41
471	0.35
472	0.35
473	0.39
474	0.41
475	0.39
476	0.41
477	0.43
478	0.48
479	0.55
480	0.57
481	0.56
482	0.6
483	0.66
484	0.64
485	0.62
486	0.57
487	0.56
488	0.56
489	0.56
490	0.53
491	0.5
492	0.51
493	0.52
494	0.52
495	0.47
496	0.47
497	0.44
498	0.44
499	0.41
500	0.39
501	0.37
502	0.32
503	0.33
504	0.27
505	0.23
506	0.21
507	0.23
508	0.25
509	0.32
510	0.36
511	0.36
512	0.43
513	0.53
514	0.59
515	0.65
516	0.73
517	0.77
518	0.83
519	0.83
520	0.86
521	0.83
522	0.8
523	0.73
524	0.66
525	0.59
526	0.54
527	0.5
528	0.42
529	0.36
530	0.32
531	0.32
532	0.35
533	0.36
534	0.32
535	0.29
536	0.3
537	0.37
538	0.39
539	0.44
540	0.46
541	0.51
542	0.56
543	0.63
544	0.62
545	0.57
546	0.54
547	0.54
548	0.48
549	0.39
550	0.34
551	0.28
552	0.24
553	0.2
554	0.16
555	0.09
556	0.06
557	0.05
558	0.05
559	0.04
560	0.03
561	0.03
562	0.03
563	0.03
564	0.03
565	0.03
566	0.04
567	0.08
568	0.11
569	0.12
570	0.19
571	0.22
572	0.26
573	0.33
574	0.41
575	0.47
576	0.54
577	0.64
578	0.61
579	0.63
580	0.63
581	0.59
582	0.52
583	0.43
584	0.36
585	0.32
586	0.31
587	0.28
588	0.24
589	0.24
590	0.26
591	0.25
592	0.23
593	0.19
594	0.2
595	0.2
596	0.21
597	0.22
598	0.21
599	0.23
600	0.24
601	0.22
602	0.2
603	0.21
604	0.24
605	0.24
606	0.21
607	0.22
608	0.23
609	0.26
610	0.27
611	0.26
612	0.24
613	0.29
614	0.33
615	0.32
616	0.31
617	0.3
618	0.3
619	0.31
620	0.35
621	0.31
622	0.31
623	0.33
624	0.37
625	0.4
626	0.4
627	0.38
628	0.34
629	0.32
630	0.33
631	0.35
632	0.38
633	0.36
634	0.37
635	0.41
636	0.41
637	0.43
638	0.38
639	0.37
640	0.3
641	0.32
642	0.34
643	0.32
644	0.35
645	0.35
646	0.38
647	0.39

Q4WEX5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer