Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2EIE6

Protein Details
Accession A0A0D2EIE6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
403-422GEEARRQKRAKRRAASNVDGHydrophilic
440-461AMESDKKTTKKERKLADSKFSEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
406-415ARRQKRAKRR
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 13, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MAQSQMPPTRPPLPQTQTQFPRDFAAANGRPSPLGPQSPQMGMSYSSPSPQQFSPQAYNQPPAAKRPRLSPDAQSPFSPQSYPPTPSAQPTTPGGNVQMNGTTPSNPRQGLMPPPQRPSDKAEDRNYEDILSGTGINIEEEARMLVRTDYYGTSTPRPPSQSQGPGFQYHINGFNGTDSGAGGVGTQQIQNGGQNQTQAYQASAEEIKQREEARADWEASRHSQHPLWDMFLLGGTLNDKIRSISITEHLVDPQSGVLVNTQKHAPPPTVRVNGLEGASRIIDKGQAILDTGAKGERLSDIMKVISLATKARMTGLVNASARLAQERRQHSKGKVPDEWQDIAATVKPATDGPEGVSSPAGSASLKRTHSQANSEPSFFGDQVPSPALMVETLDKISLAERSGEEARRQKRAKRRAASNVDGAIGTPAVDAAAEAAAAAAMESDKKTTKKERKLADSKFSEQQQHKSANEAARMAFSGLLGNRFGSKKQRTYDWMKGGGGSPAVTPGKPAASTTTSVAGTPGPDRARAVPKEKHFGQWDEDQDAKIQARDVFLVLEGDGRASRSYVRGQSLPEQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.59
3 0.63
4 0.64
5 0.68
6 0.67
7 0.58
8 0.56
9 0.49
10 0.42
11 0.34
12 0.36
13 0.33
14 0.35
15 0.36
16 0.33
17 0.32
18 0.32
19 0.34
20 0.3
21 0.32
22 0.29
23 0.32
24 0.34
25 0.35
26 0.36
27 0.31
28 0.27
29 0.23
30 0.23
31 0.23
32 0.2
33 0.2
34 0.22
35 0.23
36 0.25
37 0.24
38 0.29
39 0.29
40 0.35
41 0.4
42 0.42
43 0.5
44 0.5
45 0.52
46 0.49
47 0.51
48 0.47
49 0.5
50 0.54
51 0.53
52 0.51
53 0.57
54 0.61
55 0.59
56 0.61
57 0.59
58 0.6
59 0.61
60 0.61
61 0.54
62 0.51
63 0.49
64 0.46
65 0.4
66 0.3
67 0.3
68 0.33
69 0.35
70 0.33
71 0.35
72 0.35
73 0.38
74 0.43
75 0.37
76 0.35
77 0.34
78 0.35
79 0.31
80 0.3
81 0.29
82 0.25
83 0.24
84 0.22
85 0.21
86 0.17
87 0.19
88 0.19
89 0.18
90 0.19
91 0.23
92 0.28
93 0.26
94 0.26
95 0.26
96 0.28
97 0.34
98 0.42
99 0.46
100 0.46
101 0.5
102 0.56
103 0.56
104 0.55
105 0.53
106 0.53
107 0.53
108 0.56
109 0.6
110 0.61
111 0.64
112 0.64
113 0.58
114 0.48
115 0.38
116 0.3
117 0.23
118 0.16
119 0.11
120 0.08
121 0.08
122 0.07
123 0.07
124 0.07
125 0.07
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.07
134 0.07
135 0.09
136 0.09
137 0.12
138 0.16
139 0.18
140 0.22
141 0.26
142 0.28
143 0.31
144 0.36
145 0.34
146 0.37
147 0.42
148 0.46
149 0.44
150 0.48
151 0.47
152 0.44
153 0.44
154 0.4
155 0.34
156 0.27
157 0.28
158 0.22
159 0.19
160 0.17
161 0.16
162 0.14
163 0.12
164 0.1
165 0.06
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.04
170 0.04
171 0.05
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.07
176 0.07
177 0.09
178 0.12
179 0.13
180 0.14
181 0.15
182 0.15
183 0.16
184 0.17
185 0.15
186 0.12
187 0.1
188 0.09
189 0.1
190 0.1
191 0.1
192 0.14
193 0.15
194 0.16
195 0.18
196 0.19
197 0.19
198 0.2
199 0.2
200 0.19
201 0.21
202 0.21
203 0.19
204 0.2
205 0.2
206 0.2
207 0.22
208 0.19
209 0.19
210 0.19
211 0.2
212 0.24
213 0.23
214 0.22
215 0.19
216 0.18
217 0.15
218 0.13
219 0.11
220 0.06
221 0.06
222 0.05
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.08
230 0.08
231 0.09
232 0.1
233 0.12
234 0.13
235 0.13
236 0.13
237 0.13
238 0.12
239 0.1
240 0.08
241 0.06
242 0.05
243 0.05
244 0.06
245 0.09
246 0.1
247 0.11
248 0.12
249 0.12
250 0.15
251 0.16
252 0.17
253 0.16
254 0.21
255 0.27
256 0.29
257 0.29
258 0.28
259 0.29
260 0.28
261 0.26
262 0.2
263 0.13
264 0.11
265 0.1
266 0.09
267 0.07
268 0.06
269 0.06
270 0.05
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.07
276 0.07
277 0.06
278 0.07
279 0.06
280 0.06
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.06
285 0.07
286 0.07
287 0.08
288 0.07
289 0.08
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.08
296 0.08
297 0.09
298 0.09
299 0.1
300 0.1
301 0.14
302 0.15
303 0.18
304 0.17
305 0.18
306 0.17
307 0.17
308 0.16
309 0.14
310 0.13
311 0.14
312 0.22
313 0.29
314 0.35
315 0.39
316 0.45
317 0.45
318 0.53
319 0.54
320 0.53
321 0.5
322 0.46
323 0.48
324 0.47
325 0.46
326 0.37
327 0.31
328 0.24
329 0.2
330 0.18
331 0.13
332 0.08
333 0.07
334 0.07
335 0.07
336 0.1
337 0.1
338 0.1
339 0.1
340 0.13
341 0.13
342 0.13
343 0.13
344 0.1
345 0.09
346 0.09
347 0.08
348 0.05
349 0.06
350 0.1
351 0.16
352 0.18
353 0.19
354 0.21
355 0.26
356 0.28
357 0.33
358 0.35
359 0.38
360 0.38
361 0.38
362 0.36
363 0.32
364 0.32
365 0.26
366 0.21
367 0.14
368 0.12
369 0.13
370 0.14
371 0.12
372 0.1
373 0.1
374 0.09
375 0.07
376 0.08
377 0.07
378 0.07
379 0.07
380 0.07
381 0.07
382 0.07
383 0.08
384 0.08
385 0.08
386 0.08
387 0.08
388 0.12
389 0.17
390 0.19
391 0.24
392 0.31
393 0.35
394 0.43
395 0.47
396 0.51
397 0.58
398 0.66
399 0.71
400 0.72
401 0.77
402 0.78
403 0.82
404 0.79
405 0.73
406 0.64
407 0.54
408 0.45
409 0.35
410 0.25
411 0.16
412 0.12
413 0.06
414 0.05
415 0.04
416 0.04
417 0.03
418 0.03
419 0.03
420 0.03
421 0.03
422 0.03
423 0.03
424 0.03
425 0.03
426 0.02
427 0.03
428 0.04
429 0.05
430 0.07
431 0.11
432 0.14
433 0.2
434 0.31
435 0.41
436 0.51
437 0.59
438 0.65
439 0.72
440 0.81
441 0.82
442 0.81
443 0.77
444 0.72
445 0.7
446 0.65
447 0.64
448 0.58
449 0.57
450 0.54
451 0.54
452 0.5
453 0.48
454 0.49
455 0.45
456 0.44
457 0.39
458 0.32
459 0.27
460 0.27
461 0.23
462 0.17
463 0.13
464 0.13
465 0.12
466 0.14
467 0.13
468 0.13
469 0.16
470 0.18
471 0.21
472 0.27
473 0.34
474 0.4
475 0.44
476 0.5
477 0.53
478 0.61
479 0.68
480 0.65
481 0.62
482 0.55
483 0.53
484 0.47
485 0.41
486 0.33
487 0.24
488 0.16
489 0.18
490 0.19
491 0.17
492 0.17
493 0.17
494 0.19
495 0.18
496 0.19
497 0.18
498 0.2
499 0.22
500 0.22
501 0.25
502 0.22
503 0.22
504 0.22
505 0.17
506 0.16
507 0.16
508 0.21
509 0.18
510 0.19
511 0.22
512 0.27
513 0.35
514 0.4
515 0.47
516 0.49
517 0.54
518 0.62
519 0.62
520 0.64
521 0.6
522 0.58
523 0.55
524 0.54
525 0.52
526 0.48
527 0.48
528 0.4
529 0.36
530 0.37
531 0.33
532 0.26
533 0.25
534 0.22
535 0.22
536 0.22
537 0.21
538 0.18
539 0.17
540 0.16
541 0.13
542 0.13
543 0.11
544 0.12
545 0.11
546 0.12
547 0.12
548 0.12
549 0.15
550 0.16
551 0.24
552 0.28
553 0.33
554 0.34