Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3HCH8

Protein Details
Accession A0A0C3HCH8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
243-265IMKTQKVKKTAKQEKKKVERAAQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
248-259KVKKTAKQEKKK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 12.833, cyto 8, cyto_mito 4.999
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040151  Gfd2/YDR514C-like  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Amino Acid Sequences MDKDNKLEALIGDPGVIPASDTWGYNVKARHIYEGTDSEEEEEPEIPLNKSIVAESSRAYDNSGTVYGKSLNDSKAYHLQKGEVAPEPEIFVSWQAVKKYPYYYIGNANRQLVSRHFFDQGKVYNNTWDFFYLNRLSQDINQSPLILVPTNQFESLLKTVNRELGVQLRIPSSATNNDGFRATFPNEGTPRPRYLGRATNRDTADKLHANIPPSTFKPERESSVMKMPSQKSIAAFKAKVDAIMKTQKVKKTAKQEKKKVERAAQEESSRQSIKRVQTYLGIRPPSLAQHAEEIRARLQKKNLQWEEYDEAFRDAMTNLPPPKAFDTEKPVPHHQEESVVFVCVDVEAYERNTRQITEIGIATLDTKDLESLNSGDGGVNWWQMIRARHFRINEYKHLNNTEFVYGCADRFEFGESEFINLKDAPHVVSTCFKPPFSKPGLDACFNEGKKRNIVLVGHDVQSDIRFLKTVGYDVRTLSTLIDMADTSLMWRSFKKESNPRNLATILSELGIIAWNLHNGGNDAVYTLQAMIGIAIRSLTDPNQTDNREEGKYNYAPEPLDQVTTTKAWDIEEGWFSGDNSDGVGIYEAKSPVDATDAQSNVREYLEHLQQPQSEKDWANAITPSYEPMIEDITWKTGQLTAEDTTLTEAGKSTPDW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.12
3 0.11
4 0.09
5 0.07
6 0.12
7 0.12
8 0.12
9 0.15
10 0.2
11 0.22
12 0.26
13 0.28
14 0.29
15 0.35
16 0.36
17 0.41
18 0.36
19 0.37
20 0.39
21 0.4
22 0.39
23 0.33
24 0.32
25 0.28
26 0.28
27 0.26
28 0.22
29 0.19
30 0.15
31 0.17
32 0.19
33 0.17
34 0.17
35 0.17
36 0.16
37 0.16
38 0.16
39 0.17
40 0.16
41 0.17
42 0.16
43 0.19
44 0.21
45 0.21
46 0.22
47 0.19
48 0.17
49 0.19
50 0.21
51 0.18
52 0.16
53 0.18
54 0.19
55 0.19
56 0.22
57 0.23
58 0.23
59 0.26
60 0.26
61 0.3
62 0.36
63 0.39
64 0.4
65 0.37
66 0.36
67 0.37
68 0.38
69 0.36
70 0.33
71 0.31
72 0.28
73 0.27
74 0.27
75 0.22
76 0.2
77 0.17
78 0.12
79 0.13
80 0.15
81 0.18
82 0.19
83 0.23
84 0.25
85 0.27
86 0.3
87 0.31
88 0.33
89 0.34
90 0.35
91 0.41
92 0.48
93 0.52
94 0.52
95 0.51
96 0.47
97 0.43
98 0.43
99 0.37
100 0.32
101 0.28
102 0.27
103 0.3
104 0.29
105 0.3
106 0.34
107 0.35
108 0.37
109 0.37
110 0.35
111 0.37
112 0.37
113 0.36
114 0.31
115 0.27
116 0.22
117 0.19
118 0.24
119 0.2
120 0.21
121 0.21
122 0.21
123 0.21
124 0.24
125 0.32
126 0.27
127 0.28
128 0.26
129 0.25
130 0.24
131 0.23
132 0.22
133 0.14
134 0.12
135 0.11
136 0.15
137 0.16
138 0.16
139 0.16
140 0.14
141 0.19
142 0.2
143 0.23
144 0.2
145 0.21
146 0.22
147 0.26
148 0.26
149 0.22
150 0.21
151 0.22
152 0.23
153 0.22
154 0.22
155 0.19
156 0.19
157 0.19
158 0.18
159 0.15
160 0.17
161 0.18
162 0.19
163 0.19
164 0.2
165 0.2
166 0.2
167 0.18
168 0.19
169 0.18
170 0.18
171 0.18
172 0.25
173 0.26
174 0.29
175 0.32
176 0.32
177 0.32
178 0.32
179 0.33
180 0.3
181 0.33
182 0.39
183 0.41
184 0.47
185 0.48
186 0.53
187 0.53
188 0.51
189 0.46
190 0.4
191 0.39
192 0.33
193 0.3
194 0.28
195 0.28
196 0.29
197 0.3
198 0.29
199 0.26
200 0.25
201 0.31
202 0.28
203 0.28
204 0.32
205 0.33
206 0.34
207 0.36
208 0.37
209 0.33
210 0.4
211 0.4
212 0.35
213 0.4
214 0.37
215 0.36
216 0.35
217 0.34
218 0.27
219 0.3
220 0.32
221 0.3
222 0.29
223 0.25
224 0.28
225 0.26
226 0.26
227 0.22
228 0.19
229 0.19
230 0.25
231 0.26
232 0.28
233 0.34
234 0.35
235 0.42
236 0.47
237 0.48
238 0.52
239 0.62
240 0.66
241 0.72
242 0.78
243 0.81
244 0.85
245 0.88
246 0.84
247 0.8
248 0.77
249 0.71
250 0.68
251 0.62
252 0.54
253 0.47
254 0.42
255 0.38
256 0.32
257 0.27
258 0.24
259 0.26
260 0.29
261 0.32
262 0.32
263 0.28
264 0.33
265 0.37
266 0.39
267 0.39
268 0.35
269 0.29
270 0.28
271 0.28
272 0.23
273 0.22
274 0.17
275 0.12
276 0.16
277 0.16
278 0.18
279 0.18
280 0.18
281 0.18
282 0.23
283 0.24
284 0.23
285 0.27
286 0.31
287 0.35
288 0.44
289 0.44
290 0.41
291 0.4
292 0.41
293 0.41
294 0.36
295 0.32
296 0.22
297 0.2
298 0.17
299 0.16
300 0.12
301 0.08
302 0.07
303 0.08
304 0.12
305 0.12
306 0.13
307 0.14
308 0.14
309 0.17
310 0.19
311 0.19
312 0.18
313 0.25
314 0.3
315 0.35
316 0.38
317 0.39
318 0.39
319 0.39
320 0.38
321 0.29
322 0.29
323 0.24
324 0.24
325 0.21
326 0.18
327 0.16
328 0.14
329 0.14
330 0.09
331 0.08
332 0.04
333 0.04
334 0.04
335 0.06
336 0.09
337 0.09
338 0.11
339 0.11
340 0.12
341 0.13
342 0.13
343 0.12
344 0.11
345 0.11
346 0.1
347 0.09
348 0.09
349 0.08
350 0.07
351 0.06
352 0.04
353 0.04
354 0.05
355 0.05
356 0.05
357 0.05
358 0.06
359 0.06
360 0.06
361 0.07
362 0.06
363 0.06
364 0.07
365 0.07
366 0.07
367 0.06
368 0.06
369 0.07
370 0.1
371 0.13
372 0.17
373 0.24
374 0.28
375 0.33
376 0.34
377 0.39
378 0.45
379 0.47
380 0.49
381 0.49
382 0.47
383 0.46
384 0.49
385 0.44
386 0.36
387 0.33
388 0.28
389 0.21
390 0.19
391 0.19
392 0.15
393 0.14
394 0.14
395 0.12
396 0.1
397 0.1
398 0.11
399 0.08
400 0.08
401 0.11
402 0.1
403 0.12
404 0.13
405 0.13
406 0.12
407 0.12
408 0.12
409 0.11
410 0.11
411 0.1
412 0.11
413 0.11
414 0.11
415 0.15
416 0.17
417 0.22
418 0.23
419 0.22
420 0.24
421 0.26
422 0.32
423 0.33
424 0.33
425 0.29
426 0.36
427 0.4
428 0.4
429 0.38
430 0.35
431 0.38
432 0.36
433 0.4
434 0.37
435 0.35
436 0.36
437 0.37
438 0.34
439 0.3
440 0.31
441 0.28
442 0.3
443 0.3
444 0.27
445 0.25
446 0.24
447 0.21
448 0.2
449 0.17
450 0.11
451 0.08
452 0.08
453 0.08
454 0.11
455 0.11
456 0.13
457 0.15
458 0.17
459 0.18
460 0.18
461 0.19
462 0.17
463 0.17
464 0.14
465 0.11
466 0.09
467 0.08
468 0.08
469 0.07
470 0.06
471 0.06
472 0.06
473 0.06
474 0.09
475 0.1
476 0.1
477 0.11
478 0.15
479 0.2
480 0.26
481 0.35
482 0.42
483 0.51
484 0.61
485 0.66
486 0.62
487 0.61
488 0.56
489 0.47
490 0.39
491 0.31
492 0.21
493 0.15
494 0.14
495 0.1
496 0.09
497 0.09
498 0.07
499 0.06
500 0.06
501 0.06
502 0.07
503 0.08
504 0.08
505 0.09
506 0.09
507 0.09
508 0.08
509 0.08
510 0.08
511 0.07
512 0.07
513 0.06
514 0.05
515 0.05
516 0.05
517 0.05
518 0.06
519 0.06
520 0.06
521 0.06
522 0.06
523 0.07
524 0.08
525 0.09
526 0.14
527 0.15
528 0.2
529 0.27
530 0.29
531 0.3
532 0.33
533 0.36
534 0.33
535 0.33
536 0.31
537 0.31
538 0.32
539 0.33
540 0.31
541 0.29
542 0.28
543 0.27
544 0.3
545 0.24
546 0.23
547 0.2
548 0.19
549 0.19
550 0.19
551 0.19
552 0.15
553 0.15
554 0.14
555 0.15
556 0.15
557 0.16
558 0.17
559 0.17
560 0.17
561 0.17
562 0.16
563 0.15
564 0.15
565 0.11
566 0.09
567 0.09
568 0.07
569 0.07
570 0.08
571 0.08
572 0.09
573 0.13
574 0.13
575 0.13
576 0.13
577 0.13
578 0.12
579 0.15
580 0.15
581 0.14
582 0.21
583 0.22
584 0.23
585 0.25
586 0.26
587 0.24
588 0.23
589 0.19
590 0.16
591 0.21
592 0.28
593 0.29
594 0.3
595 0.34
596 0.37
597 0.42
598 0.42
599 0.39
600 0.37
601 0.34
602 0.34
603 0.35
604 0.32
605 0.3
606 0.28
607 0.26
608 0.22
609 0.21
610 0.22
611 0.18
612 0.17
613 0.15
614 0.14
615 0.17
616 0.15
617 0.17
618 0.16
619 0.19
620 0.19
621 0.19
622 0.19
623 0.19
624 0.19
625 0.19
626 0.21
627 0.18
628 0.19
629 0.19
630 0.18
631 0.17
632 0.17
633 0.15
634 0.12
635 0.11
636 0.11