Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3H0E0

Protein Details
Accession A0A0C3H0E0    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MTEPPQKRRRPDSRQMWDASDHydrophilic
37-69RDRAQRDDRDRGRDRRRYRSRSPRDSKGRGIRDBasic
98-136RDSRDYRDRPRERSRERDRRRTHSRSPRREKDRERAKDEBasic
253-276NDVYAVRKEKKTQYRQYMNRVGGFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
39-70RAQRDDRDRGRDRRRYRSRSPRDSKGRGIRDD
75-91DRDERGGRNSKGERRAM
98-135RDSRDYRDRPRERSRERDRRRTHSRSPRREKDRERAKD
199-212SKSKSGGKGSKKNK
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MTEPPQKRRRPDSRQMWDASDRHAPLPSREHNEPPSRDRAQRDDRDRGRDRRRYRSRSPRDSKGRGIRDDYRYGDRDERGGRNSKGERRAMGLDDAGRDSRDYRDRPRERSRERDRRRTHSRSPRREKDRERAKDEDDRDHDGRRNRDSEKGKQKDLNSDRPEYLSSRSATPPVSFKVGGTPQPLEYEKMDIDGTTAKSKSKSGGKGSKKNKPEEESLEDNDIVVEDDGMAAMQAMMGFGGFGTTQQKKVAGNDVYAVRKEKKTQYRQYMNRVGGFNRPLSPGRD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.87
2 0.82
3 0.77
4 0.73
5 0.65
6 0.58
7 0.55
8 0.46
9 0.39
10 0.41
11 0.37
12 0.34
13 0.41
14 0.44
15 0.44
16 0.46
17 0.51
18 0.54
19 0.61
20 0.62
21 0.59
22 0.6
23 0.59
24 0.61
25 0.6
26 0.61
27 0.62
28 0.67
29 0.69
30 0.71
31 0.72
32 0.76
33 0.79
34 0.8
35 0.8
36 0.8
37 0.8
38 0.81
39 0.85
40 0.84
41 0.86
42 0.87
43 0.87
44 0.89
45 0.89
46 0.88
47 0.87
48 0.85
49 0.84
50 0.83
51 0.79
52 0.73
53 0.71
54 0.68
55 0.64
56 0.63
57 0.57
58 0.53
59 0.48
60 0.47
61 0.45
62 0.38
63 0.38
64 0.38
65 0.38
66 0.36
67 0.41
68 0.39
69 0.42
70 0.48
71 0.5
72 0.51
73 0.5
74 0.46
75 0.43
76 0.45
77 0.38
78 0.33
79 0.27
80 0.21
81 0.19
82 0.19
83 0.16
84 0.13
85 0.12
86 0.12
87 0.15
88 0.21
89 0.24
90 0.31
91 0.42
92 0.48
93 0.56
94 0.65
95 0.7
96 0.71
97 0.77
98 0.8
99 0.8
100 0.83
101 0.86
102 0.83
103 0.82
104 0.85
105 0.82
106 0.82
107 0.82
108 0.84
109 0.84
110 0.87
111 0.87
112 0.86
113 0.88
114 0.85
115 0.84
116 0.84
117 0.81
118 0.77
119 0.71
120 0.66
121 0.63
122 0.59
123 0.56
124 0.48
125 0.46
126 0.41
127 0.4
128 0.4
129 0.38
130 0.39
131 0.35
132 0.36
133 0.32
134 0.39
135 0.42
136 0.47
137 0.53
138 0.53
139 0.53
140 0.54
141 0.54
142 0.56
143 0.56
144 0.57
145 0.5
146 0.48
147 0.45
148 0.41
149 0.41
150 0.32
151 0.29
152 0.23
153 0.2
154 0.2
155 0.2
156 0.21
157 0.21
158 0.2
159 0.2
160 0.17
161 0.2
162 0.17
163 0.16
164 0.2
165 0.21
166 0.23
167 0.23
168 0.23
169 0.2
170 0.23
171 0.24
172 0.21
173 0.19
174 0.18
175 0.15
176 0.16
177 0.15
178 0.11
179 0.11
180 0.13
181 0.14
182 0.15
183 0.16
184 0.16
185 0.17
186 0.18
187 0.23
188 0.27
189 0.32
190 0.38
191 0.47
192 0.55
193 0.64
194 0.71
195 0.75
196 0.74
197 0.76
198 0.75
199 0.7
200 0.67
201 0.64
202 0.62
203 0.59
204 0.54
205 0.49
206 0.41
207 0.36
208 0.29
209 0.22
210 0.16
211 0.11
212 0.08
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.02
227 0.03
228 0.03
229 0.04
230 0.11
231 0.13
232 0.15
233 0.17
234 0.2
235 0.21
236 0.24
237 0.32
238 0.28
239 0.27
240 0.3
241 0.34
242 0.35
243 0.36
244 0.39
245 0.35
246 0.38
247 0.44
248 0.49
249 0.55
250 0.62
251 0.7
252 0.75
253 0.81
254 0.85
255 0.88
256 0.87
257 0.82
258 0.77
259 0.7
260 0.61
261 0.58
262 0.54
263 0.47
264 0.4
265 0.39