Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3GVM5

Protein Details
Accession A0A0C3GVM5    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-43NQHVRSSSVHKRPSRPPSQCQNLLQHydrophilic
157-197YVNSRKCKRCHSQETRARTQECTFHLYKRNKWNQERPYKCCHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto_nucl 10, cyto 6, mito 4, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013520  Exonuclease_RNaseT/DNA_pol3  
IPR047021  REXO1/3/4-like  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR022755  Znf_C2H2_jaz  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0004527  F:exonuclease activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00929  RNase_T  
PF12171  zf-C2H2_jaz  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
CDD cd06137  DEDDh_RNase  
Amino Acid Sequences MSAYCSLCRRSFKEQEDLNQHVRSSSVHKRPSRPPSQCQNLLQVKPPRIKPGRQEQPGSSHFKLAEPPQNPQSSRHTHTTAEHRPEAPQNAATSSRYPLHTTRPTAKNVPQDVRPRWSVVSESEYTAVLNALSSNCHSLGELEQNRYLIHPYDPVDYVNSRKCKRCHSQETRARTQECTFHLYKRNKWNQERPYKCCSADDRGCMTLATHDFQLPLRATKHEDYLQTPAASAKDPKFCAVALDCEMAGIASGASEAILLCVTDYITGALLLSRFVHPSGKITQMRTSIHGISKSTLDTAVSEGRALSGWEGARSELWKYIDGNTILVGHALQHDLDALRIIHPNIVDSGILSRKAVGIHRIQWGLHTLCSELLNLEIRNNKGGIHDCLEDVMATREVVLFCTRNKERFQSWAKAKRIEELCLEKEREIARQKRQNEQVEKNVGKAECDTGSHTYFDLEEEGGVILS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.69
3 0.71
4 0.71
5 0.67
6 0.6
7 0.54
8 0.45
9 0.4
10 0.33
11 0.32
12 0.36
13 0.4
14 0.46
15 0.54
16 0.62
17 0.71
18 0.79
19 0.82
20 0.8
21 0.8
22 0.81
23 0.84
24 0.84
25 0.77
26 0.77
27 0.75
28 0.69
29 0.69
30 0.66
31 0.64
32 0.64
33 0.64
34 0.64
35 0.63
36 0.67
37 0.67
38 0.7
39 0.73
40 0.72
41 0.74
42 0.67
43 0.69
44 0.68
45 0.68
46 0.58
47 0.51
48 0.44
49 0.4
50 0.42
51 0.4
52 0.42
53 0.36
54 0.41
55 0.44
56 0.5
57 0.5
58 0.49
59 0.51
60 0.5
61 0.52
62 0.53
63 0.49
64 0.44
65 0.49
66 0.55
67 0.56
68 0.55
69 0.54
70 0.49
71 0.5
72 0.53
73 0.51
74 0.44
75 0.37
76 0.31
77 0.3
78 0.31
79 0.29
80 0.25
81 0.25
82 0.25
83 0.24
84 0.27
85 0.27
86 0.34
87 0.39
88 0.43
89 0.49
90 0.5
91 0.54
92 0.56
93 0.6
94 0.6
95 0.6
96 0.58
97 0.56
98 0.6
99 0.6
100 0.59
101 0.55
102 0.48
103 0.42
104 0.39
105 0.34
106 0.27
107 0.28
108 0.24
109 0.23
110 0.22
111 0.2
112 0.19
113 0.17
114 0.14
115 0.08
116 0.06
117 0.06
118 0.05
119 0.06
120 0.07
121 0.09
122 0.09
123 0.09
124 0.09
125 0.1
126 0.12
127 0.2
128 0.23
129 0.24
130 0.24
131 0.25
132 0.25
133 0.24
134 0.24
135 0.15
136 0.13
137 0.14
138 0.15
139 0.17
140 0.18
141 0.17
142 0.18
143 0.18
144 0.22
145 0.26
146 0.32
147 0.34
148 0.4
149 0.43
150 0.5
151 0.58
152 0.63
153 0.68
154 0.69
155 0.76
156 0.78
157 0.83
158 0.83
159 0.8
160 0.71
161 0.62
162 0.54
163 0.49
164 0.43
165 0.4
166 0.33
167 0.32
168 0.4
169 0.43
170 0.48
171 0.54
172 0.61
173 0.64
174 0.71
175 0.75
176 0.76
177 0.81
178 0.81
179 0.77
180 0.74
181 0.68
182 0.61
183 0.55
184 0.5
185 0.47
186 0.44
187 0.42
188 0.38
189 0.35
190 0.34
191 0.29
192 0.25
193 0.2
194 0.17
195 0.14
196 0.11
197 0.11
198 0.11
199 0.11
200 0.15
201 0.12
202 0.13
203 0.14
204 0.15
205 0.18
206 0.19
207 0.22
208 0.21
209 0.22
210 0.22
211 0.24
212 0.24
213 0.2
214 0.19
215 0.17
216 0.14
217 0.14
218 0.15
219 0.15
220 0.18
221 0.18
222 0.19
223 0.18
224 0.17
225 0.18
226 0.16
227 0.15
228 0.12
229 0.12
230 0.11
231 0.1
232 0.1
233 0.08
234 0.07
235 0.05
236 0.03
237 0.02
238 0.02
239 0.02
240 0.02
241 0.02
242 0.02
243 0.02
244 0.02
245 0.02
246 0.02
247 0.03
248 0.03
249 0.03
250 0.03
251 0.03
252 0.03
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.05
259 0.06
260 0.06
261 0.07
262 0.09
263 0.09
264 0.12
265 0.15
266 0.22
267 0.24
268 0.26
269 0.3
270 0.32
271 0.33
272 0.33
273 0.33
274 0.28
275 0.28
276 0.27
277 0.24
278 0.21
279 0.21
280 0.18
281 0.15
282 0.13
283 0.1
284 0.09
285 0.1
286 0.11
287 0.1
288 0.1
289 0.09
290 0.09
291 0.09
292 0.09
293 0.07
294 0.08
295 0.08
296 0.08
297 0.09
298 0.09
299 0.1
300 0.11
301 0.12
302 0.13
303 0.14
304 0.15
305 0.16
306 0.18
307 0.22
308 0.22
309 0.21
310 0.17
311 0.17
312 0.15
313 0.14
314 0.11
315 0.06
316 0.07
317 0.07
318 0.06
319 0.05
320 0.06
321 0.06
322 0.07
323 0.07
324 0.07
325 0.08
326 0.1
327 0.11
328 0.12
329 0.12
330 0.12
331 0.12
332 0.12
333 0.1
334 0.08
335 0.12
336 0.13
337 0.13
338 0.12
339 0.12
340 0.13
341 0.15
342 0.17
343 0.18
344 0.2
345 0.24
346 0.29
347 0.31
348 0.29
349 0.28
350 0.32
351 0.28
352 0.24
353 0.21
354 0.16
355 0.16
356 0.17
357 0.16
358 0.11
359 0.11
360 0.13
361 0.13
362 0.16
363 0.2
364 0.21
365 0.22
366 0.22
367 0.21
368 0.22
369 0.26
370 0.26
371 0.25
372 0.24
373 0.22
374 0.23
375 0.22
376 0.18
377 0.15
378 0.14
379 0.11
380 0.1
381 0.1
382 0.11
383 0.11
384 0.13
385 0.16
386 0.15
387 0.16
388 0.26
389 0.3
390 0.33
391 0.38
392 0.42
393 0.41
394 0.49
395 0.55
396 0.56
397 0.62
398 0.66
399 0.68
400 0.7
401 0.67
402 0.67
403 0.63
404 0.56
405 0.53
406 0.51
407 0.5
408 0.49
409 0.51
410 0.42
411 0.44
412 0.42
413 0.43
414 0.45
415 0.49
416 0.52
417 0.59
418 0.63
419 0.68
420 0.76
421 0.78
422 0.77
423 0.77
424 0.76
425 0.78
426 0.74
427 0.67
428 0.64
429 0.54
430 0.45
431 0.39
432 0.33
433 0.25
434 0.25
435 0.27
436 0.25
437 0.27
438 0.26
439 0.24
440 0.21
441 0.2
442 0.2
443 0.17
444 0.13
445 0.11
446 0.1