Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3HRK7

Protein Details
Accession A0A0C3HRK7    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-42QPFQLPPTKRQRLSPNPPSQPESHydrophilic
477-499EIPEKAPTKKEQKRKAEAKVNEAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
485-491KKEQKRK
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 9.833, mito 9.5, cyto_mito 7.666, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MPPTRTFSPPQSSPSPGTPQPFQLPPTKRQRLSPNPPSQPESPYIQSPYAVSPGASAPQSTGTSPHFSNIQLPPNVYNTPYANGPTTPTLSLPQAQPTPQNLGAQSPLNFPSQIPGVQQSGYNNYMMAPQGGAMGPPSRPAEKKEDGVDPMDVLGGTGIDLREEEQYTFQMHDSSFNSQHSGSQAGSISASHSFTQFPAGDEGSFYGAGPANTAAEAHTKSQNEHHAKAAEKAWRDAAHNLAVSRQRELNNPFLMIMTVHKKMEKVAREHGIGVNTEANGKMGTMKLPGDFPSPTVTTQTAVGPNGAITTTKGAFLPHDSLLVDQLALLSIATKHRLRGMIEDAVKLSRGRQTSSHGLVPEEWADVAAPSKAAHSSIVPEDAPRTGWESAVSPHSNTLKRSLSMANRIPTPISDGAKTPGGLRFVNEAVSAMRAAALKEREAEEARLLKRANRNKTGDVTPRQGSVVPGTPGSVAPEIPEKAPTKKEQKRKAEAKVNEAASHAAANVTTAQFLGGGTGLFGKKKKYSWMTGGGGGGTASGASTPGRIMTQGLPGTPAGGVASAVPERLTADGVRRLGTWREDKEKGRGIQIRDWLMVLESDGREKRALQKAYAWLDQSEPK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.53
3 0.49
4 0.5
5 0.47
6 0.47
7 0.48
8 0.47
9 0.45
10 0.47
11 0.48
12 0.53
13 0.61
14 0.65
15 0.61
16 0.66
17 0.73
18 0.75
19 0.8
20 0.81
21 0.81
22 0.8
23 0.82
24 0.8
25 0.72
26 0.65
27 0.58
28 0.54
29 0.47
30 0.42
31 0.41
32 0.37
33 0.35
34 0.32
35 0.3
36 0.27
37 0.24
38 0.18
39 0.16
40 0.16
41 0.18
42 0.17
43 0.14
44 0.13
45 0.16
46 0.18
47 0.16
48 0.19
49 0.19
50 0.23
51 0.23
52 0.24
53 0.22
54 0.22
55 0.28
56 0.3
57 0.35
58 0.33
59 0.34
60 0.35
61 0.37
62 0.38
63 0.32
64 0.3
65 0.24
66 0.24
67 0.24
68 0.24
69 0.21
70 0.2
71 0.23
72 0.22
73 0.23
74 0.21
75 0.2
76 0.21
77 0.21
78 0.24
79 0.23
80 0.25
81 0.26
82 0.27
83 0.3
84 0.31
85 0.35
86 0.34
87 0.35
88 0.3
89 0.29
90 0.3
91 0.29
92 0.27
93 0.24
94 0.23
95 0.22
96 0.22
97 0.2
98 0.2
99 0.19
100 0.18
101 0.17
102 0.18
103 0.18
104 0.18
105 0.2
106 0.19
107 0.22
108 0.22
109 0.2
110 0.17
111 0.16
112 0.17
113 0.16
114 0.14
115 0.09
116 0.08
117 0.09
118 0.09
119 0.08
120 0.08
121 0.09
122 0.09
123 0.12
124 0.15
125 0.18
126 0.2
127 0.24
128 0.31
129 0.33
130 0.37
131 0.38
132 0.39
133 0.38
134 0.38
135 0.34
136 0.26
137 0.21
138 0.18
139 0.14
140 0.09
141 0.07
142 0.04
143 0.04
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.06
149 0.08
150 0.1
151 0.1
152 0.1
153 0.12
154 0.13
155 0.14
156 0.13
157 0.13
158 0.12
159 0.15
160 0.16
161 0.21
162 0.22
163 0.22
164 0.23
165 0.21
166 0.22
167 0.2
168 0.2
169 0.15
170 0.14
171 0.14
172 0.12
173 0.12
174 0.11
175 0.11
176 0.1
177 0.12
178 0.1
179 0.1
180 0.1
181 0.1
182 0.15
183 0.14
184 0.14
185 0.14
186 0.15
187 0.14
188 0.13
189 0.14
190 0.11
191 0.1
192 0.09
193 0.08
194 0.09
195 0.09
196 0.09
197 0.09
198 0.07
199 0.07
200 0.08
201 0.07
202 0.08
203 0.1
204 0.12
205 0.16
206 0.16
207 0.18
208 0.22
209 0.31
210 0.34
211 0.34
212 0.35
213 0.34
214 0.35
215 0.37
216 0.37
217 0.32
218 0.28
219 0.28
220 0.28
221 0.26
222 0.27
223 0.25
224 0.23
225 0.21
226 0.21
227 0.2
228 0.2
229 0.23
230 0.22
231 0.22
232 0.23
233 0.22
234 0.26
235 0.3
236 0.32
237 0.28
238 0.28
239 0.26
240 0.22
241 0.21
242 0.16
243 0.15
244 0.13
245 0.13
246 0.14
247 0.14
248 0.14
249 0.17
250 0.23
251 0.26
252 0.26
253 0.3
254 0.33
255 0.33
256 0.35
257 0.33
258 0.29
259 0.23
260 0.2
261 0.15
262 0.12
263 0.11
264 0.1
265 0.08
266 0.07
267 0.07
268 0.06
269 0.05
270 0.06
271 0.07
272 0.08
273 0.08
274 0.09
275 0.1
276 0.11
277 0.11
278 0.11
279 0.13
280 0.14
281 0.13
282 0.14
283 0.14
284 0.12
285 0.13
286 0.14
287 0.12
288 0.11
289 0.11
290 0.09
291 0.08
292 0.08
293 0.07
294 0.05
295 0.04
296 0.06
297 0.06
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.08
302 0.09
303 0.12
304 0.1
305 0.1
306 0.1
307 0.1
308 0.1
309 0.1
310 0.08
311 0.05
312 0.04
313 0.04
314 0.04
315 0.03
316 0.03
317 0.04
318 0.05
319 0.09
320 0.09
321 0.1
322 0.13
323 0.15
324 0.15
325 0.18
326 0.21
327 0.23
328 0.24
329 0.24
330 0.22
331 0.2
332 0.2
333 0.17
334 0.14
335 0.13
336 0.13
337 0.14
338 0.15
339 0.21
340 0.26
341 0.29
342 0.3
343 0.26
344 0.25
345 0.24
346 0.23
347 0.19
348 0.13
349 0.1
350 0.07
351 0.07
352 0.06
353 0.06
354 0.05
355 0.04
356 0.04
357 0.05
358 0.05
359 0.06
360 0.06
361 0.06
362 0.09
363 0.09
364 0.11
365 0.11
366 0.11
367 0.11
368 0.11
369 0.11
370 0.1
371 0.12
372 0.11
373 0.11
374 0.12
375 0.12
376 0.13
377 0.18
378 0.18
379 0.15
380 0.18
381 0.23
382 0.25
383 0.25
384 0.29
385 0.26
386 0.26
387 0.29
388 0.31
389 0.3
390 0.35
391 0.39
392 0.36
393 0.34
394 0.34
395 0.32
396 0.27
397 0.27
398 0.23
399 0.2
400 0.18
401 0.18
402 0.2
403 0.21
404 0.21
405 0.17
406 0.16
407 0.17
408 0.17
409 0.17
410 0.18
411 0.16
412 0.17
413 0.15
414 0.13
415 0.1
416 0.11
417 0.1
418 0.07
419 0.08
420 0.07
421 0.08
422 0.12
423 0.13
424 0.13
425 0.15
426 0.16
427 0.18
428 0.2
429 0.21
430 0.2
431 0.26
432 0.26
433 0.29
434 0.28
435 0.3
436 0.37
437 0.45
438 0.5
439 0.52
440 0.56
441 0.56
442 0.6
443 0.62
444 0.62
445 0.59
446 0.56
447 0.48
448 0.44
449 0.41
450 0.36
451 0.3
452 0.25
453 0.24
454 0.19
455 0.18
456 0.17
457 0.17
458 0.16
459 0.18
460 0.15
461 0.1
462 0.1
463 0.15
464 0.15
465 0.15
466 0.21
467 0.21
468 0.25
469 0.3
470 0.36
471 0.43
472 0.51
473 0.6
474 0.66
475 0.73
476 0.79
477 0.83
478 0.85
479 0.85
480 0.8
481 0.77
482 0.75
483 0.66
484 0.57
485 0.49
486 0.4
487 0.3
488 0.25
489 0.18
490 0.11
491 0.08
492 0.08
493 0.09
494 0.08
495 0.08
496 0.07
497 0.07
498 0.07
499 0.07
500 0.07
501 0.05
502 0.05
503 0.05
504 0.08
505 0.09
506 0.12
507 0.14
508 0.18
509 0.22
510 0.25
511 0.34
512 0.38
513 0.44
514 0.48
515 0.55
516 0.53
517 0.52
518 0.5
519 0.41
520 0.34
521 0.27
522 0.2
523 0.11
524 0.07
525 0.04
526 0.03
527 0.04
528 0.04
529 0.05
530 0.05
531 0.07
532 0.07
533 0.08
534 0.11
535 0.12
536 0.19
537 0.19
538 0.19
539 0.2
540 0.19
541 0.2
542 0.17
543 0.15
544 0.08
545 0.07
546 0.07
547 0.06
548 0.09
549 0.08
550 0.09
551 0.08
552 0.09
553 0.09
554 0.1
555 0.12
556 0.1
557 0.16
558 0.22
559 0.23
560 0.24
561 0.24
562 0.26
563 0.29
564 0.35
565 0.38
566 0.39
567 0.46
568 0.52
569 0.55
570 0.61
571 0.65
572 0.6
573 0.62
574 0.61
575 0.59
576 0.59
577 0.62
578 0.57
579 0.49
580 0.46
581 0.37
582 0.31
583 0.26
584 0.2
585 0.18
586 0.15
587 0.22
588 0.23
589 0.25
590 0.25
591 0.28
592 0.36
593 0.4
594 0.43
595 0.39
596 0.44
597 0.51
598 0.56
599 0.58
600 0.5
601 0.42