Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3GXC5

Protein Details
Accession A0A0C3GXC5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
287-313EATEEKRKRREYRQARKQQFKRPEPNLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
292-308KRKRREYRQARKQQFKR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 14, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028942  WHIM1_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF15612  WHIM1  
Amino Acid Sequences MSDDDSSDLSSAPSDDELERQLNEKGGILKFLSAAPKPVREASPPRPEREPSPPHEYVLADNPDIAFIVMFRARFTDAFPRSLANFGPQELERGVVDIVPGEHVEHFLCALLGLLLNRKQDIKPGHYNRALEEAIQNHKSQWAKDWEDKNPLSGGATFSSMSPSERLTLLRTLVLWALSSSDIVKGIISTSYKQSRHDDDLNQPLSVQPWGSDGDRRRYFLIEGLDDTHFRVYRESNYTALHKRTWWSVASDIDELKQLAHKLETEDGGQKARVLSGKILAAVPRFEATEEKRKRREYRQARKQQFKRPEPNLSLYEGRTRGKRIKYTYSDDEDDGFSDATTSRRSTRNTGTHTPAEGLGPTVTLSGRQVRSRQGGVYGESMLSGTQTPAVSIGNLDGTSEEPDNGDNNVRRPRRAAAPGRSVNGYGKRGAHIEGYNSVDEMDSDEDDASEQDYGDDEDEEEHVSLESDADDQDEFTDAEDELLEEFKQKSLVVKLPVKTPTPEKKSNVQPQPELEQEPLQPINLPSTNNSGQDQRHSAAQQPASISAASETGNTTQPTSSFTTMSTTPSLLTESSTEPTGTHITGSLDPSPQSQLTLRGSPEKPHSFTPPINVGYGGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.12
3 0.14
4 0.18
5 0.2
6 0.2
7 0.21
8 0.23
9 0.23
10 0.23
11 0.23
12 0.25
13 0.23
14 0.26
15 0.24
16 0.23
17 0.21
18 0.23
19 0.26
20 0.21
21 0.28
22 0.29
23 0.32
24 0.35
25 0.39
26 0.39
27 0.41
28 0.49
29 0.51
30 0.58
31 0.6
32 0.61
33 0.62
34 0.62
35 0.61
36 0.62
37 0.61
38 0.57
39 0.61
40 0.58
41 0.53
42 0.52
43 0.47
44 0.4
45 0.4
46 0.37
47 0.28
48 0.27
49 0.25
50 0.22
51 0.21
52 0.18
53 0.09
54 0.05
55 0.1
56 0.11
57 0.11
58 0.11
59 0.13
60 0.15
61 0.16
62 0.19
63 0.25
64 0.26
65 0.29
66 0.29
67 0.3
68 0.29
69 0.3
70 0.28
71 0.23
72 0.21
73 0.2
74 0.23
75 0.2
76 0.22
77 0.2
78 0.21
79 0.15
80 0.15
81 0.15
82 0.11
83 0.11
84 0.08
85 0.08
86 0.08
87 0.08
88 0.08
89 0.08
90 0.09
91 0.09
92 0.09
93 0.09
94 0.08
95 0.07
96 0.06
97 0.06
98 0.05
99 0.06
100 0.06
101 0.11
102 0.14
103 0.15
104 0.17
105 0.19
106 0.19
107 0.26
108 0.31
109 0.34
110 0.42
111 0.48
112 0.56
113 0.58
114 0.59
115 0.53
116 0.53
117 0.46
118 0.36
119 0.32
120 0.28
121 0.29
122 0.31
123 0.29
124 0.24
125 0.29
126 0.3
127 0.27
128 0.3
129 0.32
130 0.36
131 0.44
132 0.5
133 0.5
134 0.57
135 0.56
136 0.51
137 0.43
138 0.37
139 0.3
140 0.25
141 0.21
142 0.13
143 0.14
144 0.12
145 0.12
146 0.14
147 0.13
148 0.13
149 0.12
150 0.12
151 0.12
152 0.13
153 0.14
154 0.14
155 0.16
156 0.16
157 0.15
158 0.15
159 0.14
160 0.14
161 0.13
162 0.1
163 0.08
164 0.08
165 0.08
166 0.08
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.06
173 0.06
174 0.08
175 0.09
176 0.1
177 0.16
178 0.24
179 0.25
180 0.29
181 0.33
182 0.37
183 0.42
184 0.45
185 0.44
186 0.43
187 0.5
188 0.48
189 0.43
190 0.37
191 0.31
192 0.27
193 0.23
194 0.16
195 0.08
196 0.08
197 0.1
198 0.11
199 0.16
200 0.19
201 0.29
202 0.31
203 0.33
204 0.32
205 0.32
206 0.32
207 0.3
208 0.29
209 0.2
210 0.18
211 0.19
212 0.19
213 0.18
214 0.18
215 0.17
216 0.14
217 0.13
218 0.14
219 0.13
220 0.17
221 0.23
222 0.24
223 0.23
224 0.24
225 0.29
226 0.32
227 0.33
228 0.29
229 0.25
230 0.25
231 0.26
232 0.27
233 0.23
234 0.2
235 0.2
236 0.21
237 0.22
238 0.21
239 0.19
240 0.17
241 0.16
242 0.14
243 0.11
244 0.11
245 0.09
246 0.09
247 0.09
248 0.1
249 0.1
250 0.12
251 0.12
252 0.12
253 0.14
254 0.15
255 0.15
256 0.14
257 0.13
258 0.12
259 0.13
260 0.13
261 0.1
262 0.1
263 0.11
264 0.11
265 0.12
266 0.12
267 0.12
268 0.11
269 0.1
270 0.1
271 0.08
272 0.08
273 0.08
274 0.11
275 0.14
276 0.24
277 0.31
278 0.37
279 0.43
280 0.51
281 0.57
282 0.63
283 0.7
284 0.7
285 0.74
286 0.78
287 0.83
288 0.85
289 0.89
290 0.88
291 0.86
292 0.85
293 0.83
294 0.82
295 0.76
296 0.75
297 0.68
298 0.65
299 0.57
300 0.49
301 0.42
302 0.33
303 0.32
304 0.27
305 0.25
306 0.22
307 0.24
308 0.28
309 0.31
310 0.36
311 0.37
312 0.43
313 0.47
314 0.52
315 0.53
316 0.51
317 0.48
318 0.42
319 0.39
320 0.3
321 0.25
322 0.19
323 0.13
324 0.08
325 0.07
326 0.07
327 0.07
328 0.09
329 0.09
330 0.12
331 0.17
332 0.19
333 0.24
334 0.32
335 0.38
336 0.43
337 0.47
338 0.49
339 0.46
340 0.44
341 0.4
342 0.32
343 0.25
344 0.18
345 0.14
346 0.09
347 0.07
348 0.06
349 0.06
350 0.05
351 0.05
352 0.07
353 0.12
354 0.14
355 0.17
356 0.19
357 0.23
358 0.27
359 0.28
360 0.27
361 0.25
362 0.24
363 0.23
364 0.22
365 0.18
366 0.14
367 0.13
368 0.12
369 0.08
370 0.08
371 0.06
372 0.05
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.07
377 0.07
378 0.07
379 0.06
380 0.07
381 0.06
382 0.06
383 0.06
384 0.05
385 0.06
386 0.08
387 0.08
388 0.08
389 0.07
390 0.08
391 0.09
392 0.1
393 0.14
394 0.14
395 0.19
396 0.28
397 0.3
398 0.31
399 0.33
400 0.36
401 0.38
402 0.46
403 0.5
404 0.48
405 0.56
406 0.59
407 0.58
408 0.55
409 0.48
410 0.44
411 0.4
412 0.34
413 0.27
414 0.25
415 0.25
416 0.25
417 0.25
418 0.23
419 0.19
420 0.19
421 0.2
422 0.21
423 0.2
424 0.18
425 0.17
426 0.13
427 0.12
428 0.12
429 0.1
430 0.07
431 0.08
432 0.08
433 0.08
434 0.08
435 0.08
436 0.07
437 0.06
438 0.05
439 0.05
440 0.05
441 0.06
442 0.06
443 0.07
444 0.06
445 0.07
446 0.07
447 0.08
448 0.08
449 0.07
450 0.07
451 0.07
452 0.07
453 0.06
454 0.06
455 0.06
456 0.06
457 0.06
458 0.06
459 0.06
460 0.06
461 0.08
462 0.07
463 0.07
464 0.08
465 0.07
466 0.07
467 0.07
468 0.07
469 0.06
470 0.07
471 0.07
472 0.08
473 0.09
474 0.09
475 0.1
476 0.1
477 0.14
478 0.18
479 0.23
480 0.29
481 0.35
482 0.36
483 0.41
484 0.45
485 0.44
486 0.43
487 0.47
488 0.49
489 0.51
490 0.57
491 0.56
492 0.6
493 0.68
494 0.75
495 0.75
496 0.71
497 0.67
498 0.63
499 0.64
500 0.59
501 0.51
502 0.43
503 0.37
504 0.31
505 0.32
506 0.28
507 0.23
508 0.21
509 0.19
510 0.23
511 0.22
512 0.22
513 0.2
514 0.27
515 0.3
516 0.3
517 0.31
518 0.3
519 0.3
520 0.35
521 0.38
522 0.32
523 0.34
524 0.33
525 0.37
526 0.39
527 0.39
528 0.36
529 0.32
530 0.32
531 0.29
532 0.27
533 0.21
534 0.14
535 0.14
536 0.11
537 0.1
538 0.11
539 0.12
540 0.16
541 0.16
542 0.17
543 0.16
544 0.17
545 0.2
546 0.23
547 0.23
548 0.2
549 0.2
550 0.23
551 0.23
552 0.26
553 0.23
554 0.19
555 0.17
556 0.18
557 0.19
558 0.15
559 0.16
560 0.15
561 0.16
562 0.17
563 0.18
564 0.17
565 0.15
566 0.19
567 0.2
568 0.18
569 0.15
570 0.15
571 0.17
572 0.2
573 0.23
574 0.22
575 0.21
576 0.22
577 0.23
578 0.26
579 0.23
580 0.23
581 0.21
582 0.26
583 0.29
584 0.33
585 0.34
586 0.39
587 0.4
588 0.44
589 0.52
590 0.53
591 0.51
592 0.51
593 0.55
594 0.54
595 0.54
596 0.56
597 0.54
598 0.48
599 0.45