FuNGI

A0A0C3CKS4

Protein Details

Accession

A0A0C3CKS4

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
13-33	GSSHSTPQPRNERPYMRKLSL	Hydrophilic
332-351	GLEIVKQRRRRENLKRLTDA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 10.5, mito 10, cyto_nucl 9, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039745 Vps54 IPR012501 Vps54_C IPR019515 VPS54_N
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0000938 C:GARP complex GO:0015031 P:protein transport GO:0042147 P:retrograde transport, endosome to Golgi
Pfam	View protein in Pfam PF07928 Vps54 PF10475 Vps54_N

Amino Acid Sequences

MASSSKRASLDSGSSHSTPQPRNERPYMRKLSLQSRRGSVASTTSSIGGTLDTSSYSHGVSESAHNAISTLLQPPIVRTGLLPYTTAPALSIHKAPTARDIPPVTLTNIPTIDPTEFDPYILQVGALYDALQRAKENEEDGGTQLLRRSPRSDSFADIMEEDISSDRPTLSRQASLASLASSVDVPSPRKRSSSSSGRRPLQAPTPLSTVPNVYFDENFHLENPRTFDIVSERSDVVRPAAGAVEERKGVNGNAGAPRKALATNAILQEKLSWYMDTVEVHLISSISTASSSFFAALGSLKDLHSEAAESVSRIKTLRRELRALDKEMADGGLEIVKQRRRRENLKRLTDAVQQLKLVSESVGQCESLVEAGEVEKALDAVDNVERLIAGEEPEPNSYNIVLRDLRGAAALQDVGDDLGAMRFRVGKTFEYRLLNTLLGDLRTHVETTSSSDTLLRWSNSSQRARGGHNREPSVFPTYLAVNEEFRSVLLSHLTGLYRSRHTSPAVTAFRDSVLREIRNIVRRSLPSSNDDDADSMMSASTVGGGRHKSQHEKSSILARNLRAMDPEDAEAMLKKIYIAVGETLRRVSTQAKVLLDVTSTLGDPISPTSSVGSPAIRTPNTPSSAVEGRLTGGSLKGVNGRDLQEELHQTLDMANLLGQAVDTAQDKIVKVLRVRSEQSTHLSVERFLRYFTLNLLFANECEAVSGRSGTPLKNVVNGHIKDFVQHLGESERQCLASGMEADPWNAKDFTDEDKEYLTRILSASTEDAKAWSEGSKVWLPASASPDTLPTTANGTLSVPGAQVNGKSESGASTPALATPTSKAVVRPAVIDSESFLLTVSAVSCLRGLSSFLHLMTGLPSLASDVATSIISYLTLFNSRCTQLILGAGATRSAGLKNITTKHLALAAQALSFISTLIPHVREFVRRHAGTGVSVSNLMGEFDKVRRAYLEHQQSIYDKLVDIMAGRATVHAKAMKTINWEKETKGVNSYMETLTKETNTLHKVLSKHLPEGTVRMIMQPVFKSYREQWGKAFGEVVLVSEEAENRMLRDAEHLSSRIGSLDGAGDTGEFLINLIKEKTIPNAASLAATPATNGKTSSESKRSIGSKEEASKSDGKEGEKAS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.34
2	0.35
3	0.37
4	0.41
5	0.41
6	0.47
7	0.53
8	0.56
9	0.64
10	0.71
11	0.76
12	0.76
13	0.81
14	0.81
15	0.74
16	0.73
17	0.71
18	0.73
19	0.72
20	0.72
21	0.66
22	0.61
23	0.61
24	0.55
25	0.5
26	0.42
27	0.37
28	0.34
29	0.31
30	0.27
31	0.24
32	0.23
33	0.21
34	0.19
35	0.13
36	0.1
37	0.09
38	0.08
39	0.08
40	0.09
41	0.11
42	0.12
43	0.11
44	0.11
45	0.1
46	0.1
47	0.12
48	0.16
49	0.16
50	0.17
51	0.17
52	0.16
53	0.16
54	0.16
55	0.16
56	0.12
57	0.12
58	0.11
59	0.13
60	0.14
61	0.15
62	0.2
63	0.19
64	0.18
65	0.16
66	0.2
67	0.23
68	0.24
69	0.22
70	0.19
71	0.22
72	0.22
73	0.21
74	0.16
75	0.14
76	0.17
77	0.2
78	0.22
79	0.2
80	0.24
81	0.26
82	0.26
83	0.32
84	0.33
85	0.32
86	0.36
87	0.36
88	0.34
89	0.37
90	0.38
91	0.33
92	0.33
93	0.32
94	0.29
95	0.28
96	0.26
97	0.22
98	0.23
99	0.2
100	0.17
101	0.19
102	0.21
103	0.2
104	0.2
105	0.2
106	0.18
107	0.19
108	0.18
109	0.14
110	0.08
111	0.08
112	0.09
113	0.08
114	0.08
115	0.07
116	0.1
117	0.11
118	0.12
119	0.12
120	0.13
121	0.16
122	0.18
123	0.18
124	0.18
125	0.19
126	0.2
127	0.2
128	0.21
129	0.18
130	0.18
131	0.19
132	0.21
133	0.23
134	0.25
135	0.27
136	0.3
137	0.36
138	0.41
139	0.4
140	0.41
141	0.39
142	0.38
143	0.36
144	0.3
145	0.25
146	0.19
147	0.17
148	0.12
149	0.11
150	0.1
151	0.09
152	0.09
153	0.09
154	0.09
155	0.12
156	0.18
157	0.2
158	0.22
159	0.21
160	0.23
161	0.23
162	0.24
163	0.23
164	0.16
165	0.13
166	0.11
167	0.11
168	0.09
169	0.09
170	0.1
171	0.13
172	0.16
173	0.24
174	0.3
175	0.32
176	0.35
177	0.38
178	0.42
179	0.47
180	0.55
181	0.57
182	0.61
183	0.69
184	0.7
185	0.71
186	0.66
187	0.61
188	0.58
189	0.56
190	0.49
191	0.43
192	0.43
193	0.39
194	0.39
195	0.35
196	0.3
197	0.23
198	0.23
199	0.21
200	0.19
201	0.18
202	0.18
203	0.23
204	0.22
205	0.21
206	0.19
207	0.23
208	0.22
209	0.25
210	0.28
211	0.24
212	0.23
213	0.22
214	0.22
215	0.23
216	0.26
217	0.25
218	0.24
219	0.23
220	0.23
221	0.24
222	0.23
223	0.19
224	0.16
225	0.14
226	0.11
227	0.11
228	0.11
229	0.12
230	0.13
231	0.14
232	0.14
233	0.14
234	0.14
235	0.15
236	0.14
237	0.15
238	0.15
239	0.16
240	0.22
241	0.25
242	0.25
243	0.24
244	0.24
245	0.23
246	0.22
247	0.18
248	0.14
249	0.15
250	0.19
251	0.23
252	0.23
253	0.22
254	0.21
255	0.22
256	0.2
257	0.19
258	0.16
259	0.12
260	0.11
261	0.13
262	0.15
263	0.14
264	0.14
265	0.14
266	0.13
267	0.13
268	0.12
269	0.1
270	0.08
271	0.08
272	0.06
273	0.04
274	0.05
275	0.05
276	0.06
277	0.06
278	0.07
279	0.07
280	0.07
281	0.06
282	0.07
283	0.07
284	0.07
285	0.08
286	0.09
287	0.08
288	0.09
289	0.1
290	0.1
291	0.09
292	0.09
293	0.08
294	0.09
295	0.1
296	0.09
297	0.13
298	0.13
299	0.14
300	0.14
301	0.16
302	0.2
303	0.3
304	0.38
305	0.39
306	0.43
307	0.45
308	0.55
309	0.58
310	0.56
311	0.49
312	0.4
313	0.36
314	0.32
315	0.29
316	0.18
317	0.12
318	0.08
319	0.07
320	0.06
321	0.07
322	0.13
323	0.18
324	0.24
325	0.31
326	0.4
327	0.46
328	0.57
329	0.66
330	0.72
331	0.77
332	0.8
333	0.77
334	0.71
335	0.68
336	0.64
337	0.59
338	0.53
339	0.44
340	0.35
341	0.32
342	0.29
343	0.25
344	0.19
345	0.12
346	0.11
347	0.1
348	0.12
349	0.12
350	0.12
351	0.11
352	0.11
353	0.11
354	0.07
355	0.07
356	0.05
357	0.04
358	0.05
359	0.05
360	0.05
361	0.05
362	0.04
363	0.04
364	0.04
365	0.04
366	0.04
367	0.05
368	0.06
369	0.06
370	0.06
371	0.06
372	0.06
373	0.06
374	0.07
375	0.06
376	0.06
377	0.07
378	0.09
379	0.1
380	0.12
381	0.13
382	0.12
383	0.13
384	0.12
385	0.13
386	0.12
387	0.14
388	0.13
389	0.12
390	0.14
391	0.13
392	0.13
393	0.12
394	0.11
395	0.07
396	0.08
397	0.07
398	0.05
399	0.05
400	0.05
401	0.04
402	0.04
403	0.04
404	0.03
405	0.04
406	0.04
407	0.04
408	0.05
409	0.07
410	0.07
411	0.1
412	0.13
413	0.14
414	0.19
415	0.23
416	0.28
417	0.29
418	0.3
419	0.29
420	0.29
421	0.26
422	0.21
423	0.19
424	0.15
425	0.12
426	0.11
427	0.1
428	0.09
429	0.1
430	0.1
431	0.08
432	0.08
433	0.08
434	0.12
435	0.15
436	0.14
437	0.13
438	0.14
439	0.14
440	0.16
441	0.19
442	0.15
443	0.13
444	0.14
445	0.21
446	0.28
447	0.31
448	0.3
449	0.32
450	0.34
451	0.38
452	0.45
453	0.47
454	0.45
455	0.48
456	0.49
457	0.45
458	0.44
459	0.42
460	0.38
461	0.3
462	0.24
463	0.19
464	0.17
465	0.16
466	0.16
467	0.14
468	0.1
469	0.1
470	0.11
471	0.09
472	0.09
473	0.1
474	0.08
475	0.08
476	0.07
477	0.07
478	0.07
479	0.08
480	0.08
481	0.07
482	0.09
483	0.11
484	0.13
485	0.15
486	0.17
487	0.18
488	0.19
489	0.2
490	0.2
491	0.27
492	0.27
493	0.26
494	0.24
495	0.22
496	0.21
497	0.21
498	0.19
499	0.14
500	0.16
501	0.16
502	0.16
503	0.19
504	0.23
505	0.3
506	0.31
507	0.28
508	0.28
509	0.29
510	0.34
511	0.34
512	0.32
513	0.27
514	0.31
515	0.31
516	0.27
517	0.26
518	0.21
519	0.17
520	0.15
521	0.11
522	0.06
523	0.05
524	0.04
525	0.04
526	0.03
527	0.04
528	0.04
529	0.05
530	0.07
531	0.08
532	0.1
533	0.15
534	0.17
535	0.23
536	0.25
537	0.31
538	0.32
539	0.32
540	0.32
541	0.37
542	0.39
543	0.36
544	0.36
545	0.3
546	0.32
547	0.32
548	0.31
549	0.22
550	0.2
551	0.17
552	0.15
553	0.15
554	0.11
555	0.09
556	0.09
557	0.09
558	0.07
559	0.06
560	0.05
561	0.04
562	0.04
563	0.04
564	0.04
565	0.04
566	0.06
567	0.08
568	0.09
569	0.1
570	0.1
571	0.1
572	0.1
573	0.11
574	0.11
575	0.11
576	0.15
577	0.18
578	0.18
579	0.19
580	0.19
581	0.18
582	0.16
583	0.14
584	0.1
585	0.07
586	0.07
587	0.06
588	0.05
589	0.05
590	0.05
591	0.05
592	0.06
593	0.05
594	0.06
595	0.07
596	0.07
597	0.09
598	0.09
599	0.09
600	0.08
601	0.1
602	0.14
603	0.13
604	0.14
605	0.18
606	0.22
607	0.24
608	0.24
609	0.22
610	0.23
611	0.25
612	0.25
613	0.21
614	0.15
615	0.14
616	0.13
617	0.13
618	0.08
619	0.06
620	0.06
621	0.06
622	0.06
623	0.1
624	0.1
625	0.12
626	0.13
627	0.14
628	0.14
629	0.15
630	0.15
631	0.14
632	0.15
633	0.14
634	0.12
635	0.11
636	0.1
637	0.1
638	0.09
639	0.07
640	0.05
641	0.05
642	0.04
643	0.04
644	0.04
645	0.04
646	0.03
647	0.03
648	0.04
649	0.05
650	0.05
651	0.06
652	0.08
653	0.08
654	0.1
655	0.13
656	0.15
657	0.16
658	0.21
659	0.25
660	0.28
661	0.3
662	0.32
663	0.31
664	0.31
665	0.34
666	0.3
667	0.27
668	0.25
669	0.23
670	0.21
671	0.22
672	0.22
673	0.19
674	0.17
675	0.17
676	0.16
677	0.16
678	0.16
679	0.15
680	0.13
681	0.12
682	0.14
683	0.13
684	0.12
685	0.14
686	0.12
687	0.09
688	0.09
689	0.1
690	0.08
691	0.08
692	0.09
693	0.07
694	0.11
695	0.12
696	0.12
697	0.14
698	0.19
699	0.19
700	0.23
701	0.23
702	0.23
703	0.31
704	0.31
705	0.31
706	0.3
707	0.29
708	0.25
709	0.26
710	0.23
711	0.15
712	0.15
713	0.14
714	0.13
715	0.18
716	0.17
717	0.18
718	0.17
719	0.16
720	0.16
721	0.15
722	0.12
723	0.1
724	0.11
725	0.1
726	0.12
727	0.12
728	0.13
729	0.14
730	0.14
731	0.15
732	0.13
733	0.12
734	0.11
735	0.12
736	0.16
737	0.21
738	0.21
739	0.19
740	0.21
741	0.21
742	0.2
743	0.19
744	0.15
745	0.1
746	0.1
747	0.1
748	0.08
749	0.09
750	0.11
751	0.11
752	0.12
753	0.11
754	0.11
755	0.12
756	0.12
757	0.11
758	0.1
759	0.09
760	0.09
761	0.13
762	0.15
763	0.14
764	0.14
765	0.16
766	0.16
767	0.19
768	0.22
769	0.19
770	0.17
771	0.17
772	0.18
773	0.18
774	0.17
775	0.14
776	0.1
777	0.13
778	0.13
779	0.13
780	0.12
781	0.11
782	0.12
783	0.12
784	0.12
785	0.08
786	0.08
787	0.08
788	0.08
789	0.09
790	0.11
791	0.12
792	0.12
793	0.12
794	0.12
795	0.12
796	0.12
797	0.13
798	0.11
799	0.09
800	0.09
801	0.1
802	0.11
803	0.1
804	0.1
805	0.1
806	0.12
807	0.12
808	0.13
809	0.12
810	0.15
811	0.19
812	0.18
813	0.18
814	0.17
815	0.18
816	0.18
817	0.17
818	0.15
819	0.13
820	0.13
821	0.11
822	0.1
823	0.07
824	0.07
825	0.07
826	0.06
827	0.07
828	0.07
829	0.07
830	0.07
831	0.07
832	0.08
833	0.08
834	0.09
835	0.09
836	0.12
837	0.13
838	0.13
839	0.14
840	0.13
841	0.13
842	0.13
843	0.12
844	0.08
845	0.06
846	0.06
847	0.06
848	0.07
849	0.06
850	0.05
851	0.05
852	0.06
853	0.06
854	0.06
855	0.05
856	0.05
857	0.05
858	0.06
859	0.06
860	0.07
861	0.11
862	0.12
863	0.13
864	0.18
865	0.19
866	0.19
867	0.2
868	0.19
869	0.16
870	0.17
871	0.16
872	0.12
873	0.12
874	0.12
875	0.1
876	0.09
877	0.08
878	0.07
879	0.07
880	0.09
881	0.09
882	0.12
883	0.18
884	0.21
885	0.24
886	0.26
887	0.26
888	0.25
889	0.27
890	0.25
891	0.19
892	0.2
893	0.17
894	0.14
895	0.14
896	0.13
897	0.09
898	0.09
899	0.09
900	0.05
901	0.05
902	0.06
903	0.1
904	0.11
905	0.11
906	0.15
907	0.17
908	0.24
909	0.27
910	0.34
911	0.41
912	0.39
913	0.41
914	0.41
915	0.4
916	0.34
917	0.34
918	0.26
919	0.17
920	0.17
921	0.15
922	0.13
923	0.11
924	0.11
925	0.08
926	0.08
927	0.1
928	0.11
929	0.17
930	0.17
931	0.18
932	0.18
933	0.22
934	0.26
935	0.34
936	0.43
937	0.4
938	0.41
939	0.43
940	0.43
941	0.43
942	0.39
943	0.3
944	0.2
945	0.16
946	0.16
947	0.14
948	0.13
949	0.1
950	0.09
951	0.08
952	0.08
953	0.09
954	0.11
955	0.11
956	0.14
957	0.16
958	0.16
959	0.2
960	0.23
961	0.24
962	0.31
963	0.38
964	0.42
965	0.44
966	0.45
967	0.42
968	0.46
969	0.48
970	0.42
971	0.39
972	0.33
973	0.3
974	0.3
975	0.33
976	0.28
977	0.25
978	0.25
979	0.23
980	0.23
981	0.22
982	0.21
983	0.2
984	0.25
985	0.26
986	0.26
987	0.26
988	0.28
989	0.29
990	0.34
991	0.41
992	0.38
993	0.38
994	0.38
995	0.39
996	0.36
997	0.38
998	0.35
999	0.3
1000	0.26
1001	0.24
1002	0.24
1003	0.23
1004	0.26
1005	0.23
1006	0.25
1007	0.25
1008	0.26
1009	0.31
1010	0.32
1011	0.41
1012	0.44
1013	0.45
1014	0.42
1015	0.48
1016	0.49
1017	0.44
1018	0.42
1019	0.31
1020	0.27
1021	0.25
1022	0.23
1023	0.14
1024	0.12
1025	0.12
1026	0.12
1027	0.12
1028	0.1
1029	0.13
1030	0.12
1031	0.11
1032	0.15
1033	0.14
1034	0.14
1035	0.18
1036	0.2
1037	0.21
1038	0.25
1039	0.25
1040	0.23
1041	0.24
1042	0.24
1043	0.2
1044	0.17
1045	0.14
1046	0.1
1047	0.11
1048	0.1
1049	0.09
1050	0.09
1051	0.07
1052	0.07
1053	0.08
1054	0.07
1055	0.05
1056	0.05
1057	0.08
1058	0.08
1059	0.11
1060	0.12
1061	0.12
1062	0.14
1063	0.16
1064	0.21
1065	0.25
1066	0.25
1067	0.24
1068	0.25
1069	0.25
1070	0.25
1071	0.23
1072	0.21
1073	0.15
1074	0.14
1075	0.13
1076	0.15
1077	0.17
1078	0.17
1079	0.17
1080	0.16
1081	0.21
1082	0.27
1083	0.36
1084	0.39
1085	0.41
1086	0.42
1087	0.49
1088	0.5
1089	0.48
1090	0.5
1091	0.46
1092	0.46
1093	0.51
1094	0.55
1095	0.49
1096	0.51
1097	0.54
1098	0.49
1099	0.52
1100	0.48
1101	0.42

A0A0C3CKS4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer