FuNGI

A0A0C3DSL8

Protein Details

Accession

A0A0C3DSL8

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
103-123	GSRGRAKESRFKPKNIRRSAS	Hydrophilic
394-417	EEELIPKQKKRHHTRKRSAKFVIQ	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
7-10	RGGR
103-121	GSRGRAKESRFKPKNIRRS
146-162	SRGKGNVFRSRAGRGRG
400-411	KQKKRHHTRKRS
633-638	RRERRK

Subcellular Location(s)

nucl 18, mito 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MAPRRARGGRGRGGSSGPAAPPTTEPDMPVENEPSGPSSAVHGDKSNTTPEKLQDEVVPMDVDPNDSPATQPTETPASTPIRPPPALQMRSAGGSGELTTRGGSRGRAKESRFKPKNIRRSASELKAFADQERDRIAAAAATEARSRGKGNVFRSRAGRGRGDAMGRGRGTAGSIASGPFAVVPDSAKRGGFLAPGSGIKRESGAGTSRSTGVSGPAVKSEPRLTETGAASKPQHADPQYPDEDAGLPRIDIQNINLVSSDEEDEVISATPSQRHKVKSPSSSTKGGLKPIRLDRHEHKERISQVTTAPTVKGMPAEDTRDSDTPMVDEMRSSRAGRESKGANVDGNVQIKDEPVESMDLIGQLEANPPASRPAAESAARQQVVDADEFEETVEEELIPKQKKRHHTRKRSAKFVIQTEEDRGEWERHLEDLEVLREELGGMQDITGKGKAKAGGAEAEKQVDKKEGRLYLFQFPPAMPKLFNPATMPKQDPAKPTEAGEADIRVTGSVNKNIVDLDKVVKPEEEEIIKKEDEEPPKKTRDSLAAEEGYVGKLIVRESGRVELDWGGSRMLVGRGIETTFLSMGVLVDSKGCFDQDGKPTAEGVATGMGKIMGKFVVTPDWESMVDDIERAERRERRK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.5
2	0.44
3	0.38
4	0.3
5	0.27
6	0.25
7	0.24
8	0.23
9	0.26
10	0.29
11	0.26
12	0.26
13	0.27
14	0.29
15	0.3
16	0.32
17	0.29
18	0.24
19	0.24
20	0.24
21	0.22
22	0.2
23	0.18
24	0.15
25	0.15
26	0.2
27	0.22
28	0.23
29	0.23
30	0.24
31	0.27
32	0.29
33	0.35
34	0.33
35	0.33
36	0.34
37	0.37
38	0.39
39	0.37
40	0.37
41	0.31
42	0.32
43	0.3
44	0.28
45	0.24
46	0.18
47	0.2
48	0.18
49	0.18
50	0.14
51	0.16
52	0.15
53	0.15
54	0.16
55	0.16
56	0.22
57	0.2
58	0.2
59	0.21
60	0.25
61	0.25
62	0.26
63	0.27
64	0.26
65	0.28
66	0.32
67	0.35
68	0.37
69	0.38
70	0.38
71	0.43
72	0.48
73	0.48
74	0.45
75	0.42
76	0.36
77	0.37
78	0.36
79	0.26
80	0.16
81	0.14
82	0.14
83	0.12
84	0.11
85	0.09
86	0.1
87	0.1
88	0.12
89	0.13
90	0.17
91	0.24
92	0.31
93	0.38
94	0.44
95	0.49
96	0.57
97	0.64
98	0.71
99	0.69
100	0.7
101	0.74
102	0.77
103	0.83
104	0.83
105	0.8
106	0.73
107	0.76
108	0.76
109	0.73
110	0.69
111	0.59
112	0.51
113	0.5
114	0.45
115	0.37
116	0.37
117	0.29
118	0.27
119	0.28
120	0.27
121	0.22
122	0.22
123	0.21
124	0.13
125	0.13
126	0.12
127	0.11
128	0.12
129	0.12
130	0.13
131	0.14
132	0.14
133	0.15
134	0.17
135	0.24
136	0.29
137	0.36
138	0.45
139	0.47
140	0.5
141	0.52
142	0.54
143	0.52
144	0.5
145	0.46
146	0.37
147	0.38
148	0.37
149	0.36
150	0.33
151	0.3
152	0.31
153	0.28
154	0.26
155	0.22
156	0.19
157	0.18
158	0.15
159	0.13
160	0.08
161	0.08
162	0.08
163	0.08
164	0.08
165	0.07
166	0.06
167	0.06
168	0.05
169	0.05
170	0.06
171	0.08
172	0.11
173	0.13
174	0.13
175	0.13
176	0.13
177	0.14
178	0.14
179	0.12
180	0.1
181	0.11
182	0.13
183	0.14
184	0.14
185	0.14
186	0.13
187	0.13
188	0.12
189	0.12
190	0.12
191	0.14
192	0.15
193	0.15
194	0.17
195	0.17
196	0.16
197	0.16
198	0.14
199	0.12
200	0.13
201	0.13
202	0.13
203	0.13
204	0.14
205	0.14
206	0.17
207	0.18
208	0.17
209	0.17
210	0.18
211	0.17
212	0.21
213	0.21
214	0.24
215	0.22
216	0.23
217	0.21
218	0.23
219	0.24
220	0.21
221	0.25
222	0.21
223	0.24
224	0.25
225	0.31
226	0.3
227	0.28
228	0.27
229	0.22
230	0.22
231	0.19
232	0.17
233	0.11
234	0.09
235	0.1
236	0.11
237	0.11
238	0.1
239	0.1
240	0.14
241	0.14
242	0.14
243	0.13
244	0.13
245	0.12
246	0.13
247	0.13
248	0.07
249	0.07
250	0.07
251	0.07
252	0.07
253	0.06
254	0.05
255	0.05
256	0.05
257	0.1
258	0.11
259	0.15
260	0.2
261	0.23
262	0.27
263	0.36
264	0.42
265	0.46
266	0.52
267	0.57
268	0.57
269	0.57
270	0.54
271	0.53
272	0.48
273	0.47
274	0.42
275	0.35
276	0.37
277	0.41
278	0.46
279	0.4
280	0.44
281	0.43
282	0.51
283	0.56
284	0.51
285	0.46
286	0.45
287	0.47
288	0.47
289	0.42
290	0.33
291	0.27
292	0.28
293	0.27
294	0.22
295	0.18
296	0.13
297	0.12
298	0.11
299	0.11
300	0.08
301	0.09
302	0.1
303	0.13
304	0.13
305	0.15
306	0.17
307	0.17
308	0.17
309	0.15
310	0.13
311	0.11
312	0.11
313	0.1
314	0.07
315	0.07
316	0.07
317	0.09
318	0.11
319	0.11
320	0.12
321	0.17
322	0.19
323	0.2
324	0.23
325	0.21
326	0.22
327	0.25
328	0.24
329	0.18
330	0.17
331	0.19
332	0.18
333	0.19
334	0.16
335	0.13
336	0.13
337	0.13
338	0.13
339	0.1
340	0.07
341	0.06
342	0.07
343	0.06
344	0.06
345	0.06
346	0.06
347	0.06
348	0.05
349	0.05
350	0.04
351	0.05
352	0.05
353	0.06
354	0.06
355	0.06
356	0.08
357	0.09
358	0.09
359	0.09
360	0.11
361	0.14
362	0.15
363	0.16
364	0.19
365	0.25
366	0.25
367	0.23
368	0.21
369	0.19
370	0.2
371	0.19
372	0.14
373	0.09
374	0.09
375	0.09
376	0.09
377	0.07
378	0.05
379	0.05
380	0.05
381	0.04
382	0.05
383	0.07
384	0.13
385	0.15
386	0.18
387	0.24
388	0.3
389	0.4
390	0.51
391	0.6
392	0.65
393	0.75
394	0.83
395	0.89
396	0.91
397	0.89
398	0.83
399	0.79
400	0.74
401	0.68
402	0.62
403	0.53
404	0.47
405	0.41
406	0.38
407	0.3
408	0.26
409	0.23
410	0.19
411	0.16
412	0.17
413	0.14
414	0.13
415	0.13
416	0.12
417	0.12
418	0.12
419	0.13
420	0.12
421	0.11
422	0.11
423	0.1
424	0.1
425	0.08
426	0.07
427	0.06
428	0.05
429	0.05
430	0.08
431	0.08
432	0.1
433	0.12
434	0.12
435	0.12
436	0.15
437	0.17
438	0.16
439	0.17
440	0.17
441	0.2
442	0.21
443	0.24
444	0.22
445	0.23
446	0.23
447	0.22
448	0.21
449	0.23
450	0.21
451	0.22
452	0.27
453	0.3
454	0.32
455	0.37
456	0.39
457	0.41
458	0.42
459	0.39
460	0.34
461	0.29
462	0.31
463	0.29
464	0.27
465	0.19
466	0.18
467	0.26
468	0.25
469	0.27
470	0.25
471	0.28
472	0.32
473	0.36
474	0.38
475	0.33
476	0.39
477	0.42
478	0.43
479	0.41
480	0.4
481	0.36
482	0.35
483	0.38
484	0.31
485	0.29
486	0.26
487	0.22
488	0.18
489	0.17
490	0.16
491	0.1
492	0.1
493	0.13
494	0.16
495	0.2
496	0.2
497	0.2
498	0.2
499	0.21
500	0.21
501	0.18
502	0.16
503	0.15
504	0.17
505	0.18
506	0.19
507	0.19
508	0.19
509	0.19
510	0.22
511	0.23
512	0.22
513	0.23
514	0.27
515	0.26
516	0.26
517	0.27
518	0.3
519	0.36
520	0.4
521	0.44
522	0.46
523	0.53
524	0.54
525	0.52
526	0.5
527	0.48
528	0.49
529	0.48
530	0.49
531	0.43
532	0.42
533	0.4
534	0.36
535	0.28
536	0.21
537	0.15
538	0.08
539	0.09
540	0.09
541	0.13
542	0.14
543	0.15
544	0.18
545	0.23
546	0.23
547	0.22
548	0.24
549	0.2
550	0.21
551	0.22
552	0.21
553	0.16
554	0.15
555	0.15
556	0.15
557	0.14
558	0.14
559	0.11
560	0.11
561	0.13
562	0.13
563	0.14
564	0.12
565	0.13
566	0.11
567	0.1
568	0.09
569	0.08
570	0.08
571	0.08
572	0.08
573	0.06
574	0.08
575	0.08
576	0.1
577	0.1
578	0.1
579	0.1
580	0.12
581	0.2
582	0.25
583	0.31
584	0.32
585	0.32
586	0.32
587	0.32
588	0.29
589	0.22
590	0.16
591	0.16
592	0.13
593	0.12
594	0.12
595	0.13
596	0.13
597	0.13
598	0.14
599	0.09
600	0.09
601	0.1
602	0.12
603	0.17
604	0.18
605	0.21
606	0.21
607	0.24
608	0.23
609	0.24
610	0.23
611	0.2
612	0.18
613	0.15
614	0.14
615	0.18
616	0.21
617	0.22
618	0.31

A0A0C3DSL8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer