Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A4D9S5

Protein Details
Accession A4D9S5    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1179-1205IRDPILCPFTPKRKRRRNPATNGIAEPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
1190-1195KRKRRR
Subcellular Location(s) nucl 9.5, cyto_nucl 9, cyto 7.5, plas 6, mito 1, pero 1, golg 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004871  Cleavage/polyA-sp_fac_asu_C  
IPR018846  Cleavage/polyA-sp_fac_asu_N  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005686  C:U2 snRNP  
GO:0030620  F:U2 snRNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
GO:0009266  P:response to temperature stimulus  
KEGG afm:AFUA_1G03992  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03178  CPSF_A  
PF10433  MMS1_N  
Amino Acid Sequences MSPPLSDRGFDASGKRQDMGPMDIEQEGPSTTKPVVGLLSQTLVSSPIIQLILPARLRSKHQNDVVFVGERHIQIKEALSGIHLEDVNSESDFDAYIMAAKVINVSTELPWEAQMKLAASKAAVTDPGSRQELPPQIMVLSLASRELVFLYFSSTSGHFIHHHRPLPNDVSTFERFGRNIAVEPRSRAVAVSASADYFGVFMLKKPPVLQAQMASSHLDPITEERFFRVEGDILFMEFLYPKAEDGDKIILLLLVSQNQVTQAICYEWHADETIRQASPRITKRFLPPEDTLPTMLIPLTKTSSFMLITTTSMAVYKNRLDPRRQPSRYPLPVPDREAKKAPLWTRWARPLRNWSYNQRHDDIYLCREDGRVFYLGIGNEGELENQAHLGQLCCDVDAAFDILDIGHEGGDLLLAAGTTGDGGLFVQKARDQPRCVQKFINWSPVTDSVIVSSGQDSSSSDTARDRLFVCSASSYGRGAIFELRHGLEAQIGLVVSLEDLSSTRDIWTMSDDINGGVYLLISDPVSSILLYLSADFGEEMCAIDEADSGLDFSTQTLAAGCTSSGVLVQITEKAILLGTTTKSTMRARFEFGSDQSVAVAAVHSSASLIASAVRTRHEMHLSLKSINIGQDQLHLSEIGQPLRLPHEPVSILIEVLGTFTLIFVGTGNGKVLIYSFEDSTMLLSEVSIDVENGDDLSKAIESLAVVAIDTDGPSQKYTILCGLRSGIFAPFEMTLGHGNTKCAIEVKPASPRRIGNTSVKIQSRGQFALLTCGHGFWQASCPRKDGVIDPNLHLQRIWVTDQNNPAYHPGNVHSFAMAKTIDPNIDGEADTLFCIADGQLLICTLDHAAKTVPRRIDLPGSASKLAYSNYLRSLIVAYTRAELDTESDPIRRLTRPFIEFVEPDTQHGVSKAVDVSEDGYSAWRPHGAAGEKISCILEWTPKKGDEEYHFIVIGTARKQQQERGRVIFLQASRSSSDSSRIECSVKYIHKFESPVYAIAPYGDFTLMVSTGHEIVPLEPKLSQTRRVRAARYPMLSPAISLSCHEPYVYMSTSRESLMVLKSSEDKLLLHAYDRQKHDGLSHIHIGGEFNLTVTTSRGGRVSILSENGITDNDKMMPVALCEAHLPSSVMKLSSGSKPSPFSRSSQVYYGTAMNGIAYRFLILDEKEWRLLRLLQNLCIRDPILCPFTPKRKRRRNPATNGIAEPQPSHMHIDGDILSRLVMRGPKYLTKMLTTQGFEDAAFPENGTAQATLELFTELSNNLLGESPDQVEKVMRWLEKAVHVEF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.41
3 0.36
4 0.39
5 0.4
6 0.39
7 0.33
8 0.27
9 0.27
10 0.27
11 0.26
12 0.22
13 0.19
14 0.16
15 0.14
16 0.13
17 0.13
18 0.13
19 0.14
20 0.14
21 0.15
22 0.16
23 0.16
24 0.18
25 0.17
26 0.19
27 0.17
28 0.16
29 0.15
30 0.14
31 0.14
32 0.12
33 0.11
34 0.12
35 0.12
36 0.11
37 0.14
38 0.15
39 0.21
40 0.22
41 0.24
42 0.26
43 0.28
44 0.35
45 0.43
46 0.48
47 0.51
48 0.57
49 0.6
50 0.58
51 0.59
52 0.57
53 0.5
54 0.42
55 0.35
56 0.32
57 0.27
58 0.26
59 0.23
60 0.2
61 0.18
62 0.21
63 0.2
64 0.17
65 0.16
66 0.15
67 0.16
68 0.15
69 0.17
70 0.15
71 0.12
72 0.13
73 0.14
74 0.15
75 0.14
76 0.14
77 0.1
78 0.1
79 0.11
80 0.09
81 0.08
82 0.06
83 0.08
84 0.08
85 0.08
86 0.08
87 0.08
88 0.09
89 0.09
90 0.1
91 0.09
92 0.1
93 0.1
94 0.13
95 0.14
96 0.13
97 0.15
98 0.17
99 0.15
100 0.16
101 0.17
102 0.16
103 0.17
104 0.18
105 0.16
106 0.14
107 0.15
108 0.14
109 0.14
110 0.14
111 0.15
112 0.2
113 0.22
114 0.28
115 0.3
116 0.3
117 0.3
118 0.36
119 0.4
120 0.36
121 0.34
122 0.29
123 0.26
124 0.25
125 0.24
126 0.18
127 0.12
128 0.1
129 0.09
130 0.08
131 0.08
132 0.08
133 0.08
134 0.08
135 0.07
136 0.07
137 0.11
138 0.11
139 0.12
140 0.14
141 0.14
142 0.17
143 0.17
144 0.19
145 0.19
146 0.23
147 0.31
148 0.37
149 0.43
150 0.43
151 0.46
152 0.5
153 0.51
154 0.51
155 0.44
156 0.37
157 0.37
158 0.37
159 0.36
160 0.32
161 0.3
162 0.26
163 0.26
164 0.29
165 0.24
166 0.25
167 0.28
168 0.32
169 0.31
170 0.35
171 0.35
172 0.32
173 0.31
174 0.27
175 0.22
176 0.19
177 0.17
178 0.16
179 0.15
180 0.14
181 0.14
182 0.13
183 0.12
184 0.09
185 0.08
186 0.07
187 0.06
188 0.08
189 0.14
190 0.16
191 0.17
192 0.18
193 0.24
194 0.26
195 0.3
196 0.31
197 0.28
198 0.29
199 0.31
200 0.31
201 0.28
202 0.23
203 0.22
204 0.19
205 0.16
206 0.14
207 0.15
208 0.18
209 0.18
210 0.18
211 0.17
212 0.19
213 0.19
214 0.2
215 0.18
216 0.15
217 0.14
218 0.18
219 0.16
220 0.15
221 0.14
222 0.13
223 0.11
224 0.1
225 0.1
226 0.08
227 0.07
228 0.08
229 0.1
230 0.11
231 0.11
232 0.14
233 0.17
234 0.15
235 0.15
236 0.15
237 0.12
238 0.11
239 0.12
240 0.1
241 0.09
242 0.09
243 0.09
244 0.09
245 0.09
246 0.11
247 0.09
248 0.08
249 0.08
250 0.08
251 0.09
252 0.1
253 0.13
254 0.12
255 0.13
256 0.13
257 0.13
258 0.13
259 0.17
260 0.2
261 0.18
262 0.18
263 0.18
264 0.22
265 0.31
266 0.38
267 0.4
268 0.4
269 0.44
270 0.52
271 0.61
272 0.59
273 0.57
274 0.51
275 0.51
276 0.51
277 0.48
278 0.4
279 0.31
280 0.27
281 0.21
282 0.19
283 0.13
284 0.1
285 0.1
286 0.13
287 0.12
288 0.14
289 0.14
290 0.16
291 0.15
292 0.14
293 0.14
294 0.12
295 0.13
296 0.12
297 0.12
298 0.1
299 0.1
300 0.11
301 0.1
302 0.13
303 0.16
304 0.22
305 0.3
306 0.35
307 0.4
308 0.49
309 0.57
310 0.65
311 0.65
312 0.62
313 0.64
314 0.7
315 0.72
316 0.67
317 0.66
318 0.63
319 0.65
320 0.66
321 0.65
322 0.59
323 0.56
324 0.55
325 0.49
326 0.45
327 0.48
328 0.46
329 0.44
330 0.47
331 0.49
332 0.51
333 0.58
334 0.62
335 0.58
336 0.61
337 0.65
338 0.65
339 0.67
340 0.66
341 0.66
342 0.69
343 0.74
344 0.72
345 0.64
346 0.57
347 0.49
348 0.48
349 0.42
350 0.36
351 0.29
352 0.25
353 0.23
354 0.22
355 0.22
356 0.18
357 0.17
358 0.14
359 0.12
360 0.12
361 0.14
362 0.13
363 0.14
364 0.13
365 0.1
366 0.09
367 0.09
368 0.09
369 0.06
370 0.07
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.07
377 0.07
378 0.09
379 0.09
380 0.08
381 0.08
382 0.08
383 0.07
384 0.08
385 0.07
386 0.05
387 0.05
388 0.05
389 0.04
390 0.04
391 0.05
392 0.04
393 0.03
394 0.03
395 0.03
396 0.03
397 0.03
398 0.03
399 0.03
400 0.02
401 0.02
402 0.02
403 0.02
404 0.02
405 0.02
406 0.02
407 0.02
408 0.02
409 0.02
410 0.03
411 0.04
412 0.04
413 0.06
414 0.08
415 0.13
416 0.2
417 0.26
418 0.28
419 0.36
420 0.47
421 0.5
422 0.51
423 0.48
424 0.45
425 0.5
426 0.5
427 0.53
428 0.42
429 0.39
430 0.4
431 0.39
432 0.37
433 0.28
434 0.24
435 0.14
436 0.15
437 0.14
438 0.11
439 0.09
440 0.07
441 0.07
442 0.07
443 0.07
444 0.09
445 0.11
446 0.11
447 0.11
448 0.12
449 0.14
450 0.14
451 0.15
452 0.13
453 0.14
454 0.14
455 0.14
456 0.14
457 0.13
458 0.13
459 0.13
460 0.13
461 0.11
462 0.11
463 0.11
464 0.1
465 0.1
466 0.13
467 0.11
468 0.11
469 0.13
470 0.12
471 0.12
472 0.13
473 0.12
474 0.09
475 0.09
476 0.08
477 0.06
478 0.05
479 0.05
480 0.04
481 0.04
482 0.03
483 0.03
484 0.03
485 0.03
486 0.03
487 0.05
488 0.05
489 0.06
490 0.06
491 0.07
492 0.07
493 0.08
494 0.1
495 0.1
496 0.09
497 0.1
498 0.1
499 0.09
500 0.09
501 0.08
502 0.06
503 0.04
504 0.04
505 0.03
506 0.03
507 0.04
508 0.03
509 0.03
510 0.04
511 0.04
512 0.05
513 0.04
514 0.04
515 0.04
516 0.04
517 0.04
518 0.04
519 0.04
520 0.04
521 0.04
522 0.04
523 0.04
524 0.04
525 0.04
526 0.05
527 0.04
528 0.05
529 0.05
530 0.05
531 0.05
532 0.04
533 0.04
534 0.04
535 0.03
536 0.03
537 0.04
538 0.03
539 0.03
540 0.04
541 0.04
542 0.04
543 0.04
544 0.05
545 0.05
546 0.05
547 0.05
548 0.04
549 0.04
550 0.04
551 0.04
552 0.04
553 0.04
554 0.04
555 0.04
556 0.05
557 0.05
558 0.05
559 0.05
560 0.05
561 0.05
562 0.05
563 0.05
564 0.06
565 0.06
566 0.07
567 0.08
568 0.08
569 0.11
570 0.14
571 0.18
572 0.21
573 0.22
574 0.25
575 0.26
576 0.27
577 0.27
578 0.25
579 0.24
580 0.19
581 0.18
582 0.14
583 0.13
584 0.11
585 0.08
586 0.07
587 0.03
588 0.03
589 0.03
590 0.03
591 0.03
592 0.03
593 0.03
594 0.03
595 0.03
596 0.03
597 0.04
598 0.05
599 0.06
600 0.07
601 0.09
602 0.1
603 0.13
604 0.14
605 0.16
606 0.18
607 0.23
608 0.24
609 0.23
610 0.22
611 0.2
612 0.19
613 0.17
614 0.15
615 0.1
616 0.08
617 0.1
618 0.11
619 0.1
620 0.1
621 0.09
622 0.08
623 0.12
624 0.14
625 0.11
626 0.11
627 0.11
628 0.11
629 0.14
630 0.15
631 0.12
632 0.12
633 0.14
634 0.14
635 0.14
636 0.16
637 0.13
638 0.12
639 0.1
640 0.09
641 0.07
642 0.07
643 0.06
644 0.03
645 0.03
646 0.03
647 0.03
648 0.03
649 0.03
650 0.03
651 0.03
652 0.04
653 0.04
654 0.04
655 0.05
656 0.05
657 0.05
658 0.05
659 0.05
660 0.06
661 0.07
662 0.07
663 0.07
664 0.08
665 0.08
666 0.08
667 0.07
668 0.06
669 0.05
670 0.04
671 0.04
672 0.04
673 0.05
674 0.05
675 0.04
676 0.04
677 0.04
678 0.04
679 0.04
680 0.04
681 0.03
682 0.03
683 0.04
684 0.04
685 0.04
686 0.04
687 0.04
688 0.04
689 0.04
690 0.05
691 0.04
692 0.04
693 0.04
694 0.04
695 0.04
696 0.04
697 0.04
698 0.04
699 0.05
700 0.06
701 0.06
702 0.08
703 0.08
704 0.09
705 0.14
706 0.15
707 0.14
708 0.15
709 0.16
710 0.15
711 0.15
712 0.14
713 0.1
714 0.09
715 0.09
716 0.09
717 0.08
718 0.08
719 0.07
720 0.08
721 0.08
722 0.08
723 0.11
724 0.1
725 0.1
726 0.11
727 0.12
728 0.11
729 0.11
730 0.11
731 0.13
732 0.15
733 0.17
734 0.26
735 0.29
736 0.31
737 0.33
738 0.34
739 0.35
740 0.36
741 0.37
742 0.35
743 0.37
744 0.39
745 0.41
746 0.41
747 0.39
748 0.38
749 0.38
750 0.35
751 0.3
752 0.26
753 0.22
754 0.21
755 0.25
756 0.22
757 0.2
758 0.16
759 0.16
760 0.15
761 0.14
762 0.14
763 0.08
764 0.15
765 0.18
766 0.24
767 0.25
768 0.27
769 0.26
770 0.27
771 0.27
772 0.24
773 0.26
774 0.27
775 0.28
776 0.27
777 0.35
778 0.34
779 0.33
780 0.29
781 0.22
782 0.18
783 0.19
784 0.2
785 0.15
786 0.17
787 0.2
788 0.26
789 0.29
790 0.27
791 0.25
792 0.25
793 0.23
794 0.22
795 0.2
796 0.17
797 0.17
798 0.18
799 0.17
800 0.15
801 0.15
802 0.14
803 0.15
804 0.13
805 0.09
806 0.1
807 0.11
808 0.11
809 0.1
810 0.1
811 0.09
812 0.1
813 0.1
814 0.08
815 0.07
816 0.07
817 0.07
818 0.06
819 0.05
820 0.04
821 0.04
822 0.04
823 0.04
824 0.04
825 0.04
826 0.04
827 0.05
828 0.05
829 0.04
830 0.05
831 0.05
832 0.06
833 0.06
834 0.07
835 0.08
836 0.11
837 0.15
838 0.21
839 0.21
840 0.21
841 0.23
842 0.25
843 0.29
844 0.26
845 0.28
846 0.27
847 0.29
848 0.29
849 0.27
850 0.25
851 0.22
852 0.21
853 0.2
854 0.17
855 0.16
856 0.17
857 0.19
858 0.18
859 0.17
860 0.18
861 0.14
862 0.14
863 0.13
864 0.12
865 0.11
866 0.12
867 0.12
868 0.11
869 0.1
870 0.11
871 0.11
872 0.12
873 0.12
874 0.13
875 0.14
876 0.15
877 0.18
878 0.18
879 0.19
880 0.23
881 0.29
882 0.3
883 0.31
884 0.33
885 0.34
886 0.32
887 0.33
888 0.35
889 0.28
890 0.27
891 0.26
892 0.24
893 0.2
894 0.2
895 0.18
896 0.1
897 0.11
898 0.11
899 0.09
900 0.09
901 0.08
902 0.1
903 0.09
904 0.09
905 0.08
906 0.08
907 0.09
908 0.1
909 0.1
910 0.09
911 0.09
912 0.1
913 0.15
914 0.16
915 0.18
916 0.21
917 0.23
918 0.22
919 0.22
920 0.22
921 0.15
922 0.15
923 0.14
924 0.19
925 0.19
926 0.24
927 0.27
928 0.28
929 0.31
930 0.3
931 0.35
932 0.31
933 0.36
934 0.35
935 0.33
936 0.31
937 0.29
938 0.28
939 0.24
940 0.23
941 0.17
942 0.19
943 0.21
944 0.25
945 0.27
946 0.34
947 0.4
948 0.45
949 0.49
950 0.48
951 0.48
952 0.44
953 0.45
954 0.42
955 0.35
956 0.32
957 0.28
958 0.25
959 0.23
960 0.24
961 0.25
962 0.21
963 0.26
964 0.22
965 0.23
966 0.25
967 0.26
968 0.26
969 0.23
970 0.26
971 0.27
972 0.31
973 0.33
974 0.32
975 0.33
976 0.36
977 0.37
978 0.35
979 0.36
980 0.32
981 0.28
982 0.26
983 0.23
984 0.19
985 0.19
986 0.18
987 0.1
988 0.09
989 0.08
990 0.07
991 0.06
992 0.07
993 0.07
994 0.07
995 0.07
996 0.07
997 0.08
998 0.08
999 0.08
1000 0.08
1001 0.09
1002 0.15
1003 0.15
1004 0.15
1005 0.14
1006 0.17
1007 0.25
1008 0.28
1009 0.36
1010 0.38
1011 0.45
1012 0.54
1013 0.59
1014 0.61
1015 0.59
1016 0.66
1017 0.64
1018 0.6
1019 0.54
1020 0.47
1021 0.45
1022 0.41
1023 0.34
1024 0.27
1025 0.21
1026 0.18
1027 0.17
1028 0.18
1029 0.16
1030 0.16
1031 0.16
1032 0.13
1033 0.14
1034 0.18
1035 0.19
1036 0.17
1037 0.16
1038 0.18
1039 0.19
1040 0.19
1041 0.18
1042 0.14
1043 0.15
1044 0.16
1045 0.17
1046 0.16
1047 0.16
1048 0.19
1049 0.2
1050 0.21
1051 0.18
1052 0.16
1053 0.16
1054 0.2
1055 0.19
1056 0.17
1057 0.23
1058 0.3
1059 0.36
1060 0.4
1061 0.42
1062 0.39
1063 0.4
1064 0.39
1065 0.4
1066 0.37
1067 0.34
1068 0.34
1069 0.3
1070 0.29
1071 0.28
1072 0.27
1073 0.21
1074 0.18
1075 0.13
1076 0.09
1077 0.09
1078 0.09
1079 0.09
1080 0.1
1081 0.11
1082 0.1
1083 0.11
1084 0.12
1085 0.12
1086 0.13
1087 0.14
1088 0.16
1089 0.17
1090 0.18
1091 0.17
1092 0.17
1093 0.17
1094 0.17
1095 0.16
1096 0.14
1097 0.12
1098 0.12
1099 0.12
1100 0.12
1101 0.11
1102 0.12
1103 0.11
1104 0.11
1105 0.13
1106 0.11
1107 0.11
1108 0.12
1109 0.13
1110 0.13
1111 0.13
1112 0.13
1113 0.11
1114 0.14
1115 0.15
1116 0.15
1117 0.14
1118 0.15
1119 0.17
1120 0.23
1121 0.27
1122 0.26
1123 0.29
1124 0.33
1125 0.37
1126 0.41
1127 0.4
1128 0.37
1129 0.41
1130 0.45
1131 0.45
1132 0.44
1133 0.44
1134 0.39
1135 0.39
1136 0.36
1137 0.28
1138 0.22
1139 0.18
1140 0.15
1141 0.13
1142 0.12
1143 0.1
1144 0.09
1145 0.09
1146 0.08
1147 0.09
1148 0.12
1149 0.11
1150 0.15
1151 0.19
1152 0.22
1153 0.27
1154 0.28
1155 0.28
1156 0.28
1157 0.34
1158 0.35
1159 0.4
1160 0.4
1161 0.42
1162 0.48
1163 0.49
1164 0.47
1165 0.43
1166 0.38
1167 0.29
1168 0.29
1169 0.27
1170 0.25
1171 0.24
1172 0.3
1173 0.36
1174 0.47
1175 0.56
1176 0.63
1177 0.68
1178 0.75
1179 0.84
1180 0.89
1181 0.92
1182 0.92
1183 0.92
1184 0.93
1185 0.92
1186 0.86
1187 0.79
1188 0.71
1189 0.62
1190 0.53
1191 0.43
1192 0.36
1193 0.29
1194 0.25
1195 0.26
1196 0.23
1197 0.22
1198 0.21
1199 0.23
1200 0.22
1201 0.22
1202 0.21
1203 0.16
1204 0.15
1205 0.14
1206 0.14
1207 0.14
1208 0.16
1209 0.16
1210 0.21
1211 0.26
1212 0.32
1213 0.37
1214 0.43
1215 0.42
1216 0.41
1217 0.42
1218 0.42
1219 0.44
1220 0.39
1221 0.35
1222 0.33
1223 0.31
1224 0.27
1225 0.26
1226 0.22
1227 0.18
1228 0.16
1229 0.15
1230 0.12
1231 0.13
1232 0.13
1233 0.13
1234 0.12
1235 0.09
1236 0.12
1237 0.12
1238 0.12
1239 0.12
1240 0.12
1241 0.1
1242 0.1
1243 0.11
1244 0.09
1245 0.09
1246 0.1
1247 0.09
1248 0.09
1249 0.1
1250 0.11
1251 0.1
1252 0.13
1253 0.14
1254 0.15
1255 0.15
1256 0.15
1257 0.16
1258 0.16
1259 0.22
1260 0.26
1261 0.25
1262 0.26
1263 0.29
1264 0.32
1265 0.37