Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q4WVJ3

Protein Details
Accession Q4WVJ3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
44-72EERARRNRESSYQRNRRRSRRLDVKIGHGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
58-63NRRRSR
Subcellular Location(s) cyto_nucl 14, nucl 13.5, cyto 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR002501  PsdUridine_synth_N  
IPR014780  tRNA_psdUridine_synth_TruB  
IPR032819  TruB_C  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0004730  F:pseudouridylate synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:1990481  P:mRNA pseudouridine synthesis  
GO:0006400  P:tRNA modification  
KEGG afm:AFUA_5G12310  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF16198  TruB_C_2  
PF01509  TruB_N  
Amino Acid Sequences MSGEKIYEGVFAVHKPQGVTSADVIRTLQHHFNPSKLFKPWLEEERARRNRESSYQRNRRRSRRLDVKIGHGGTLDPLATGVLVTGVGKGTKSLNDFLGCTKTYETVVLFGAETDTYDKLGKIVRRAPYEHITREAVEKALEQFRGKIMQRPPIFSALKVQGKKLYEYAREGKEPPIEIQSRPVEVSDLRILEWYEPGTHEYEWPREEAAGEEKEVAERLLAKDDTLPVAPAAETEVPAEDSGEQETSTGTKRKTPPPAEEPAKDEEDAPSATDTELAPSAAKKQKITANGDSAPAQDELSDGSSETVTASANEPSPQPPAVKITMTVSSGFYVRSLAHDLGKALGSCGLMSSLIRTRQADFELESDKVLEYKDLEAGEDVWGPKVKRFLEEWEKKRAEANTK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.2
3 0.2
4 0.23
5 0.23
6 0.25
7 0.24
8 0.28
9 0.27
10 0.27
11 0.27
12 0.24
13 0.24
14 0.26
15 0.29
16 0.26
17 0.34
18 0.35
19 0.4
20 0.46
21 0.49
22 0.49
23 0.47
24 0.49
25 0.42
26 0.47
27 0.5
28 0.48
29 0.52
30 0.54
31 0.58
32 0.64
33 0.71
34 0.69
35 0.65
36 0.61
37 0.59
38 0.62
39 0.63
40 0.63
41 0.66
42 0.72
43 0.78
44 0.86
45 0.9
46 0.91
47 0.92
48 0.9
49 0.89
50 0.9
51 0.88
52 0.88
53 0.82
54 0.79
55 0.77
56 0.68
57 0.58
58 0.47
59 0.38
60 0.28
61 0.25
62 0.17
63 0.08
64 0.07
65 0.07
66 0.06
67 0.06
68 0.04
69 0.03
70 0.03
71 0.04
72 0.04
73 0.05
74 0.05
75 0.06
76 0.07
77 0.08
78 0.11
79 0.14
80 0.15
81 0.18
82 0.19
83 0.2
84 0.21
85 0.24
86 0.21
87 0.2
88 0.19
89 0.18
90 0.17
91 0.18
92 0.16
93 0.13
94 0.13
95 0.12
96 0.1
97 0.09
98 0.09
99 0.07
100 0.08
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.09
105 0.09
106 0.1
107 0.15
108 0.17
109 0.21
110 0.27
111 0.32
112 0.35
113 0.38
114 0.42
115 0.45
116 0.48
117 0.44
118 0.42
119 0.37
120 0.34
121 0.33
122 0.29
123 0.22
124 0.17
125 0.16
126 0.16
127 0.17
128 0.18
129 0.16
130 0.16
131 0.17
132 0.23
133 0.23
134 0.26
135 0.27
136 0.34
137 0.36
138 0.38
139 0.39
140 0.4
141 0.4
142 0.33
143 0.35
144 0.33
145 0.38
146 0.35
147 0.34
148 0.31
149 0.32
150 0.33
151 0.32
152 0.3
153 0.26
154 0.31
155 0.36
156 0.34
157 0.35
158 0.35
159 0.34
160 0.31
161 0.29
162 0.25
163 0.25
164 0.24
165 0.22
166 0.26
167 0.25
168 0.23
169 0.22
170 0.21
171 0.16
172 0.14
173 0.17
174 0.13
175 0.12
176 0.11
177 0.11
178 0.12
179 0.11
180 0.11
181 0.09
182 0.07
183 0.07
184 0.08
185 0.09
186 0.09
187 0.11
188 0.13
189 0.15
190 0.15
191 0.15
192 0.14
193 0.13
194 0.13
195 0.11
196 0.13
197 0.11
198 0.11
199 0.11
200 0.1
201 0.11
202 0.11
203 0.09
204 0.05
205 0.06
206 0.06
207 0.1
208 0.1
209 0.1
210 0.1
211 0.11
212 0.12
213 0.11
214 0.1
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.06
219 0.07
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.08
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.05
233 0.06
234 0.07
235 0.1
236 0.14
237 0.14
238 0.21
239 0.27
240 0.34
241 0.44
242 0.48
243 0.53
244 0.54
245 0.63
246 0.61
247 0.58
248 0.54
249 0.48
250 0.45
251 0.38
252 0.32
253 0.23
254 0.2
255 0.18
256 0.15
257 0.11
258 0.1
259 0.09
260 0.1
261 0.09
262 0.08
263 0.09
264 0.08
265 0.08
266 0.08
267 0.16
268 0.2
269 0.23
270 0.22
271 0.26
272 0.31
273 0.38
274 0.44
275 0.42
276 0.43
277 0.42
278 0.43
279 0.38
280 0.34
281 0.29
282 0.22
283 0.17
284 0.1
285 0.09
286 0.09
287 0.1
288 0.09
289 0.07
290 0.08
291 0.08
292 0.08
293 0.08
294 0.07
295 0.06
296 0.07
297 0.08
298 0.09
299 0.1
300 0.11
301 0.12
302 0.14
303 0.16
304 0.17
305 0.17
306 0.17
307 0.2
308 0.22
309 0.21
310 0.21
311 0.21
312 0.22
313 0.22
314 0.22
315 0.18
316 0.17
317 0.17
318 0.16
319 0.13
320 0.11
321 0.1
322 0.12
323 0.15
324 0.16
325 0.17
326 0.18
327 0.19
328 0.19
329 0.21
330 0.18
331 0.14
332 0.15
333 0.13
334 0.11
335 0.11
336 0.1
337 0.08
338 0.08
339 0.12
340 0.15
341 0.19
342 0.22
343 0.23
344 0.25
345 0.29
346 0.31
347 0.29
348 0.26
349 0.26
350 0.26
351 0.25
352 0.23
353 0.2
354 0.18
355 0.16
356 0.15
357 0.13
358 0.12
359 0.13
360 0.16
361 0.15
362 0.15
363 0.15
364 0.16
365 0.16
366 0.17
367 0.16
368 0.17
369 0.21
370 0.21
371 0.23
372 0.3
373 0.29
374 0.3
375 0.33
376 0.39
377 0.46
378 0.56
379 0.57
380 0.61
381 0.62
382 0.58
383 0.62