Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3D319

Protein Details
Accession A0A0C3D319    Localization Confidence High Confidence Score 19.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-24SGNPNKQKMGKRKGATAKQQPDWHydrophilic
192-211ASSPKKPKVNTLKRKEHPDTHydrophilic
429-456LIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYRGGYIDVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
435-447KGFTKEKNKKKRG
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006594  LisH  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50896  LISH  
Amino Acid Sequences MSGNPNKQKMGKRKGATAKQQPDWLFPGAGDSSNDALAKKSGNNNPPANQSPPSELVGLVEAFLAENQYTNTSQTFAKENKARGQIESNINYAPSLSAIYNEWRQLKRGGPSAVEDASKQHVPLKSIKKDVSSSDSDSSSETSSDENDSDVEMADTRPINKEVGRKSSSSASSSSSSDSDADDENETPVIKASSPKKPKVNTLKRKEHPDTNSSSSDSDSDSTSESSSEDEAPKAKKAKTDASSSSEDSSDSSSASESDSDSSSENKTAKTKQVDPEPISSGSESSSESDSDSDSSTHSIAQKVPLPESDSVSTSDSDSDSDSDNEDNKQTSDTSATLSDHAKKSASSAESSSGASSSGSEIKPKVASKAEAAPLRKLSPPLPPNPVKDLPRKTNERFSRIPQNIQVDQRLASNAYVPYDYAQRAHEDLIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYRGGYIDVEGKKGIKFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.82
3 0.83
4 0.83
5 0.82
6 0.77
7 0.8
8 0.71
9 0.65
10 0.6
11 0.52
12 0.41
13 0.31
14 0.31
15 0.24
16 0.24
17 0.2
18 0.18
19 0.17
20 0.18
21 0.19
22 0.15
23 0.16
24 0.16
25 0.17
26 0.2
27 0.27
28 0.34
29 0.41
30 0.49
31 0.53
32 0.56
33 0.61
34 0.6
35 0.56
36 0.51
37 0.46
38 0.43
39 0.41
40 0.39
41 0.32
42 0.27
43 0.23
44 0.22
45 0.19
46 0.13
47 0.1
48 0.08
49 0.07
50 0.07
51 0.08
52 0.05
53 0.06
54 0.07
55 0.1
56 0.11
57 0.12
58 0.13
59 0.13
60 0.14
61 0.16
62 0.22
63 0.21
64 0.3
65 0.34
66 0.38
67 0.44
68 0.51
69 0.51
70 0.47
71 0.5
72 0.49
73 0.51
74 0.49
75 0.43
76 0.35
77 0.34
78 0.31
79 0.25
80 0.18
81 0.1
82 0.09
83 0.07
84 0.08
85 0.1
86 0.14
87 0.17
88 0.21
89 0.28
90 0.27
91 0.29
92 0.32
93 0.35
94 0.36
95 0.4
96 0.38
97 0.33
98 0.35
99 0.36
100 0.34
101 0.3
102 0.25
103 0.2
104 0.22
105 0.21
106 0.18
107 0.2
108 0.2
109 0.22
110 0.31
111 0.39
112 0.41
113 0.47
114 0.48
115 0.47
116 0.47
117 0.47
118 0.44
119 0.39
120 0.37
121 0.33
122 0.32
123 0.28
124 0.27
125 0.25
126 0.2
127 0.16
128 0.12
129 0.1
130 0.1
131 0.11
132 0.11
133 0.1
134 0.09
135 0.09
136 0.09
137 0.08
138 0.07
139 0.06
140 0.06
141 0.08
142 0.09
143 0.09
144 0.12
145 0.13
146 0.14
147 0.17
148 0.23
149 0.26
150 0.33
151 0.35
152 0.33
153 0.34
154 0.39
155 0.38
156 0.33
157 0.29
158 0.25
159 0.24
160 0.24
161 0.23
162 0.18
163 0.16
164 0.15
165 0.14
166 0.12
167 0.11
168 0.11
169 0.11
170 0.11
171 0.1
172 0.1
173 0.1
174 0.08
175 0.08
176 0.07
177 0.06
178 0.12
179 0.17
180 0.26
181 0.33
182 0.39
183 0.46
184 0.48
185 0.57
186 0.63
187 0.69
188 0.7
189 0.73
190 0.77
191 0.76
192 0.83
193 0.78
194 0.74
195 0.67
196 0.62
197 0.57
198 0.52
199 0.48
200 0.4
201 0.36
202 0.29
203 0.25
204 0.21
205 0.15
206 0.11
207 0.1
208 0.09
209 0.09
210 0.09
211 0.08
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.09
216 0.09
217 0.09
218 0.12
219 0.13
220 0.16
221 0.2
222 0.2
223 0.21
224 0.24
225 0.31
226 0.32
227 0.36
228 0.36
229 0.37
230 0.39
231 0.37
232 0.34
233 0.26
234 0.23
235 0.18
236 0.16
237 0.12
238 0.09
239 0.08
240 0.07
241 0.07
242 0.07
243 0.07
244 0.06
245 0.07
246 0.07
247 0.08
248 0.08
249 0.1
250 0.1
251 0.13
252 0.14
253 0.14
254 0.18
255 0.2
256 0.26
257 0.3
258 0.34
259 0.36
260 0.44
261 0.49
262 0.48
263 0.48
264 0.44
265 0.4
266 0.35
267 0.3
268 0.22
269 0.15
270 0.14
271 0.11
272 0.1
273 0.1
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.09
278 0.1
279 0.1
280 0.08
281 0.08
282 0.09
283 0.09
284 0.11
285 0.12
286 0.13
287 0.13
288 0.15
289 0.2
290 0.2
291 0.21
292 0.2
293 0.22
294 0.21
295 0.24
296 0.22
297 0.18
298 0.19
299 0.19
300 0.18
301 0.15
302 0.15
303 0.12
304 0.11
305 0.11
306 0.1
307 0.1
308 0.1
309 0.11
310 0.12
311 0.13
312 0.14
313 0.14
314 0.14
315 0.13
316 0.14
317 0.13
318 0.13
319 0.14
320 0.13
321 0.13
322 0.14
323 0.15
324 0.15
325 0.18
326 0.23
327 0.22
328 0.23
329 0.22
330 0.2
331 0.21
332 0.25
333 0.24
334 0.2
335 0.2
336 0.21
337 0.22
338 0.23
339 0.21
340 0.15
341 0.13
342 0.11
343 0.1
344 0.1
345 0.13
346 0.13
347 0.16
348 0.16
349 0.19
350 0.23
351 0.24
352 0.27
353 0.26
354 0.27
355 0.28
356 0.34
357 0.38
358 0.39
359 0.4
360 0.4
361 0.39
362 0.4
363 0.39
364 0.35
365 0.31
366 0.35
367 0.39
368 0.4
369 0.46
370 0.49
371 0.51
372 0.56
373 0.61
374 0.57
375 0.61
376 0.64
377 0.64
378 0.67
379 0.71
380 0.69
381 0.73
382 0.75
383 0.73
384 0.68
385 0.67
386 0.69
387 0.65
388 0.65
389 0.61
390 0.61
391 0.59
392 0.59
393 0.56
394 0.46
395 0.42
396 0.38
397 0.33
398 0.27
399 0.21
400 0.2
401 0.18
402 0.18
403 0.17
404 0.16
405 0.16
406 0.19
407 0.2
408 0.18
409 0.19
410 0.2
411 0.22
412 0.22
413 0.23
414 0.2
415 0.2
416 0.25
417 0.27
418 0.24
419 0.24
420 0.28
421 0.28
422 0.34
423 0.37
424 0.41
425 0.49
426 0.59
427 0.68
428 0.75
429 0.82
430 0.84
431 0.9
432 0.91
433 0.9
434 0.9
435 0.88
436 0.87
437 0.85
438 0.8
439 0.7
440 0.61
441 0.59
442 0.49
443 0.43
444 0.34
445 0.28
446 0.25