Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q4WCA6

Protein Details
Accession Q4WCA6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-35EESEEKPPRPAKKSRHNSSSVDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027521  Usb1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000175  F:3'-5'-RNA exonuclease activity  
GO:0016829  F:lyase activity  
GO:1990838  F:poly(U)-specific exoribonuclease activity, producing 3' uridine cyclic phosphate ends  
GO:0034477  P:U6 snRNA 3'-end processing  
KEGG afm:AFUA_8G05110  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09749  HVSL  
Amino Acid Sequences MALVQYSGTESDTEESEEKPPRPAKKSRHNSSSVDDRVSSLPPLPTAFRDLYASSTRVSVRDDPSLHGGRKRVIPHVEGNWPTHIYLEWYPSKAELTVLDGILSQVEVKLGGDAGEIHSLLRSDLGVQLPLHISLSRPVVLRTEQRQPFMDMFQTALQESVVPAFSVSPCSLDWVSNYERTRWFLVLRVTKPTNDNLNRLLSLSNRSLAHFGQPSLYAGNPASPVHRLGRHENIKPHTQPEELSHCFHVSLAWSLIEPTTEQKERIDAVDIRRLRILSIHFDCVKVKIGNNISSIPLSTVQSFSVI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.16
3 0.21
4 0.28
5 0.28
6 0.35
7 0.41
8 0.46
9 0.53
10 0.61
11 0.65
12 0.7
13 0.79
14 0.81
15 0.83
16 0.81
17 0.77
18 0.75
19 0.74
20 0.67
21 0.59
22 0.5
23 0.43
24 0.39
25 0.36
26 0.31
27 0.23
28 0.2
29 0.19
30 0.2
31 0.2
32 0.19
33 0.23
34 0.22
35 0.2
36 0.22
37 0.21
38 0.23
39 0.25
40 0.24
41 0.2
42 0.22
43 0.21
44 0.2
45 0.24
46 0.25
47 0.25
48 0.3
49 0.31
50 0.31
51 0.37
52 0.41
53 0.39
54 0.37
55 0.37
56 0.34
57 0.38
58 0.39
59 0.39
60 0.37
61 0.38
62 0.39
63 0.41
64 0.45
65 0.42
66 0.41
67 0.37
68 0.34
69 0.3
70 0.25
71 0.21
72 0.17
73 0.16
74 0.2
75 0.19
76 0.19
77 0.2
78 0.2
79 0.2
80 0.17
81 0.16
82 0.1
83 0.12
84 0.12
85 0.12
86 0.11
87 0.11
88 0.1
89 0.09
90 0.09
91 0.05
92 0.03
93 0.04
94 0.03
95 0.03
96 0.04
97 0.04
98 0.04
99 0.04
100 0.04
101 0.05
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.05
110 0.05
111 0.07
112 0.07
113 0.09
114 0.08
115 0.1
116 0.1
117 0.1
118 0.1
119 0.08
120 0.08
121 0.08
122 0.1
123 0.11
124 0.11
125 0.11
126 0.12
127 0.14
128 0.19
129 0.2
130 0.28
131 0.29
132 0.31
133 0.31
134 0.32
135 0.31
136 0.27
137 0.24
138 0.15
139 0.14
140 0.13
141 0.12
142 0.09
143 0.08
144 0.07
145 0.06
146 0.06
147 0.05
148 0.05
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.05
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.1
158 0.11
159 0.11
160 0.11
161 0.13
162 0.15
163 0.2
164 0.21
165 0.21
166 0.22
167 0.25
168 0.26
169 0.23
170 0.22
171 0.2
172 0.26
173 0.31
174 0.3
175 0.35
176 0.34
177 0.34
178 0.36
179 0.36
180 0.38
181 0.34
182 0.36
183 0.32
184 0.33
185 0.31
186 0.3
187 0.27
188 0.19
189 0.2
190 0.19
191 0.19
192 0.18
193 0.18
194 0.2
195 0.19
196 0.22
197 0.19
198 0.18
199 0.16
200 0.16
201 0.16
202 0.15
203 0.15
204 0.12
205 0.1
206 0.11
207 0.11
208 0.11
209 0.12
210 0.12
211 0.15
212 0.17
213 0.21
214 0.24
215 0.28
216 0.38
217 0.43
218 0.48
219 0.53
220 0.54
221 0.57
222 0.56
223 0.54
224 0.48
225 0.42
226 0.38
227 0.36
228 0.4
229 0.35
230 0.35
231 0.33
232 0.3
233 0.29
234 0.27
235 0.22
236 0.15
237 0.15
238 0.13
239 0.12
240 0.11
241 0.12
242 0.12
243 0.12
244 0.11
245 0.12
246 0.18
247 0.2
248 0.21
249 0.21
250 0.24
251 0.25
252 0.25
253 0.28
254 0.25
255 0.28
256 0.36
257 0.37
258 0.36
259 0.37
260 0.36
261 0.3
262 0.3
263 0.29
264 0.29
265 0.32
266 0.36
267 0.35
268 0.36
269 0.37
270 0.35
271 0.37
272 0.31
273 0.28
274 0.3
275 0.35
276 0.38
277 0.39
278 0.39
279 0.35
280 0.33
281 0.32
282 0.26
283 0.22
284 0.2
285 0.19
286 0.19