Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3HIE2

Protein Details
Accession A0A0C3HIE2    Localization Confidence Low Confidence Score 7.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-53SILDEQRPRKRIKQDQGQLRHHLEQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 12.5, cyto_nucl 10.5, nucl 7.5, cysk 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR025696  rRNA_proc-arch_dom  
IPR016438  SKI2-like  
IPR012961  Ski2/MTR4_C  
IPR040801  Ski2_N  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0006401  P:RNA catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF08148  DSHCT  
PF00271  Helicase_C  
PF13234  rRNA_proc-arch  
PF17911  Ski2_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18795  SF2_C_Ski2  
Amino Acid Sequences MADSLISALERVRLENCASDGLADDWIDSILDEQRPRKRIKQDQGQLRHHLEQKYLTPSTSFSQEWLNRLQQRWEVTPNYTDLYKIAPTQTRTVTRFTREGLEGRVTGYKQVTVPANSATAKNSTSFLRKPGSRADFVRGAAGFFPFAPGGIEGVDEVSVLDEKVTQLDAVPENGPSKLDRIINFSGEGGLLEIPPGFKRGLDFSRNTTIDNEGEAKDIANVLAEDPGDDLARDAGETGDGTPASGETSEEDGEDDVDSLLPVEFPALEPRGALASSSANRAGREWAHMVDVKRDIPNFRALVPDMAREWPFELDTFQKEAVYHLENGDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAAKHMTKAIYTSPIKALSNQKFRDFREIFDEVGILTGDVQIAPESSCLIMTTEILRSMLYRERGVVWEEVIIMLPEHVTLILLSATVPNTYEFASWVGRTKRKDIYVISTPKRPVPLEHYLWADKGIYKIVGAEKKFLEKGWKDANDVLTGKNKTKEFSVSDQSSRGGGNQRGGRGQNQRGAQHRGGGQQRGGGQQRGGGQQRGRGVPPRASHTPGHMGRGGKLGGRTTAAQDKTLWVHLVQFLKKESLLPACIFVFSKKRCEENADALSNQDFCTATEKSAIHMVIEKSIARLKPEDRILPQIIRLRDLLGRGIAVHHGGLLPIVKEIVEMLFAQTLVKVLFATETFAMGLNLPTRTVVFSGYRKHDGHAFRNLLPGEYTQMAGRAGRRGLDTVGSVIIVAPGGGEAPPVTELRQMILGEPSKLRSQFRLTYNMILNLLRVEALKIEEMIKRSFSEHATQQLLPEHEKAVKISEADLAKIKREKCDICDTDLDICHQSAQDYRKLTLDLHFGLLATPVGKRMFTPKRLVVYNRDGVRTPGLLLREGATGGTAPIVHVLEIRTRRDQRDSTDLFPYLPKYRKLFTRLPQSKKHISTKVLHIPLADIECLTNTVVKGVIPEIFEGGDGYVHAKEELARLCSSWELKEWDELDFSRIKDLQLRDVLTKRFEVAATSQKADCLRCPEFIKHFAMCHDQWLIKENISQLRQLMSDQNLQLLPDYEQRIQVLKDLDFIDDGSRVQLKGKVACEIHSADELVLTELILDNVLAAYEPPEIVALLSAFVFQEKTDMVPNLTSNLEKGMKTIIEISEKVNERQTYHQVILSADDSNDFVSRPRFGLMEVVYEWAKGMSFKNITDLTDVLEGTIVRVITRLDETCREVKNAARIIGDPELFTKMQACQEMIKRDITAVASLYM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.23
3 0.23
4 0.21
5 0.21
6 0.19
7 0.19
8 0.17
9 0.17
10 0.14
11 0.12
12 0.1
13 0.1
14 0.1
15 0.08
16 0.09
17 0.12
18 0.16
19 0.21
20 0.28
21 0.37
22 0.44
23 0.51
24 0.58
25 0.63
26 0.7
27 0.76
28 0.8
29 0.81
30 0.85
31 0.89
32 0.88
33 0.85
34 0.81
35 0.78
36 0.73
37 0.66
38 0.59
39 0.54
40 0.52
41 0.52
42 0.47
43 0.4
44 0.35
45 0.34
46 0.34
47 0.34
48 0.28
49 0.21
50 0.3
51 0.32
52 0.35
53 0.38
54 0.44
55 0.45
56 0.47
57 0.52
58 0.47
59 0.49
60 0.51
61 0.52
62 0.47
63 0.44
64 0.44
65 0.41
66 0.38
67 0.33
68 0.28
69 0.22
70 0.22
71 0.2
72 0.2
73 0.24
74 0.27
75 0.3
76 0.36
77 0.42
78 0.46
79 0.47
80 0.51
81 0.51
82 0.5
83 0.51
84 0.47
85 0.46
86 0.41
87 0.42
88 0.4
89 0.38
90 0.32
91 0.31
92 0.34
93 0.28
94 0.29
95 0.27
96 0.25
97 0.22
98 0.26
99 0.29
100 0.26
101 0.28
102 0.25
103 0.28
104 0.26
105 0.27
106 0.24
107 0.22
108 0.21
109 0.2
110 0.21
111 0.21
112 0.27
113 0.28
114 0.32
115 0.37
116 0.39
117 0.41
118 0.49
119 0.52
120 0.5
121 0.51
122 0.52
123 0.48
124 0.46
125 0.47
126 0.37
127 0.32
128 0.27
129 0.24
130 0.18
131 0.14
132 0.15
133 0.1
134 0.1
135 0.1
136 0.09
137 0.09
138 0.08
139 0.08
140 0.06
141 0.07
142 0.07
143 0.06
144 0.05
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.08
152 0.08
153 0.07
154 0.07
155 0.12
156 0.13
157 0.15
158 0.15
159 0.16
160 0.17
161 0.17
162 0.18
163 0.14
164 0.15
165 0.18
166 0.22
167 0.21
168 0.27
169 0.29
170 0.3
171 0.3
172 0.28
173 0.23
174 0.19
175 0.17
176 0.11
177 0.09
178 0.07
179 0.07
180 0.07
181 0.07
182 0.08
183 0.1
184 0.09
185 0.09
186 0.11
187 0.17
188 0.24
189 0.29
190 0.31
191 0.35
192 0.44
193 0.44
194 0.44
195 0.39
196 0.35
197 0.3
198 0.3
199 0.27
200 0.18
201 0.19
202 0.18
203 0.16
204 0.13
205 0.13
206 0.1
207 0.08
208 0.08
209 0.07
210 0.08
211 0.08
212 0.07
213 0.07
214 0.08
215 0.08
216 0.07
217 0.07
218 0.06
219 0.07
220 0.06
221 0.06
222 0.05
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.07
230 0.07
231 0.08
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.1
236 0.1
237 0.1
238 0.1
239 0.1
240 0.1
241 0.1
242 0.08
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.1
254 0.11
255 0.11
256 0.11
257 0.12
258 0.13
259 0.13
260 0.12
261 0.09
262 0.12
263 0.13
264 0.16
265 0.19
266 0.19
267 0.19
268 0.2
269 0.23
270 0.2
271 0.23
272 0.23
273 0.2
274 0.22
275 0.25
276 0.25
277 0.26
278 0.28
279 0.26
280 0.27
281 0.28
282 0.27
283 0.26
284 0.31
285 0.27
286 0.25
287 0.26
288 0.24
289 0.27
290 0.26
291 0.26
292 0.2
293 0.23
294 0.23
295 0.2
296 0.2
297 0.16
298 0.16
299 0.14
300 0.15
301 0.15
302 0.17
303 0.19
304 0.17
305 0.17
306 0.17
307 0.18
308 0.19
309 0.18
310 0.17
311 0.15
312 0.15
313 0.14
314 0.14
315 0.14
316 0.1
317 0.07
318 0.06
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.06
325 0.06
326 0.07
327 0.07
328 0.06
329 0.07
330 0.07
331 0.07
332 0.07
333 0.06
334 0.06
335 0.07
336 0.07
337 0.06
338 0.05
339 0.07
340 0.07
341 0.08
342 0.08
343 0.07
344 0.08
345 0.1
346 0.11
347 0.18
348 0.19
349 0.21
350 0.23
351 0.26
352 0.26
353 0.3
354 0.38
355 0.38
356 0.46
357 0.47
358 0.52
359 0.54
360 0.55
361 0.61
362 0.52
363 0.45
364 0.42
365 0.41
366 0.34
367 0.29
368 0.27
369 0.16
370 0.16
371 0.14
372 0.06
373 0.05
374 0.05
375 0.04
376 0.04
377 0.04
378 0.04
379 0.04
380 0.05
381 0.05
382 0.05
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.06
387 0.06
388 0.06
389 0.08
390 0.08
391 0.09
392 0.09
393 0.08
394 0.08
395 0.11
396 0.15
397 0.15
398 0.15
399 0.16
400 0.17
401 0.18
402 0.2
403 0.18
404 0.14
405 0.12
406 0.12
407 0.11
408 0.09
409 0.08
410 0.05
411 0.05
412 0.04
413 0.04
414 0.04
415 0.03
416 0.03
417 0.03
418 0.04
419 0.03
420 0.04
421 0.04
422 0.05
423 0.05
424 0.05
425 0.06
426 0.06
427 0.07
428 0.07
429 0.07
430 0.07
431 0.09
432 0.1
433 0.1
434 0.16
435 0.21
436 0.26
437 0.28
438 0.33
439 0.37
440 0.37
441 0.41
442 0.37
443 0.38
444 0.42
445 0.49
446 0.47
447 0.47
448 0.46
449 0.43
450 0.45
451 0.39
452 0.32
453 0.31
454 0.35
455 0.33
456 0.35
457 0.36
458 0.33
459 0.33
460 0.31
461 0.24
462 0.17
463 0.14
464 0.13
465 0.09
466 0.08
467 0.1
468 0.14
469 0.18
470 0.18
471 0.21
472 0.2
473 0.23
474 0.24
475 0.23
476 0.26
477 0.22
478 0.27
479 0.32
480 0.33
481 0.32
482 0.35
483 0.35
484 0.31
485 0.31
486 0.27
487 0.25
488 0.25
489 0.26
490 0.28
491 0.27
492 0.24
493 0.25
494 0.28
495 0.25
496 0.28
497 0.33
498 0.31
499 0.32
500 0.32
501 0.31
502 0.28
503 0.23
504 0.21
505 0.19
506 0.17
507 0.21
508 0.23
509 0.24
510 0.26
511 0.27
512 0.31
513 0.33
514 0.35
515 0.35
516 0.36
517 0.39
518 0.41
519 0.46
520 0.4
521 0.36
522 0.34
523 0.36
524 0.36
525 0.34
526 0.29
527 0.25
528 0.26
529 0.28
530 0.28
531 0.22
532 0.19
533 0.19
534 0.22
535 0.24
536 0.25
537 0.23
538 0.22
539 0.24
540 0.28
541 0.27
542 0.26
543 0.27
544 0.27
545 0.29
546 0.3
547 0.33
548 0.32
549 0.34
550 0.33
551 0.3
552 0.36
553 0.32
554 0.33
555 0.3
556 0.27
557 0.25
558 0.27
559 0.24
560 0.16
561 0.16
562 0.14
563 0.12
564 0.12
565 0.12
566 0.12
567 0.18
568 0.17
569 0.17
570 0.16
571 0.17
572 0.17
573 0.18
574 0.16
575 0.09
576 0.1
577 0.13
578 0.17
579 0.16
580 0.16
581 0.16
582 0.17
583 0.17
584 0.16
585 0.14
586 0.12
587 0.13
588 0.12
589 0.13
590 0.12
591 0.13
592 0.12
593 0.12
594 0.18
595 0.17
596 0.24
597 0.24
598 0.27
599 0.27
600 0.33
601 0.34
602 0.34
603 0.38
604 0.33
605 0.31
606 0.29
607 0.28
608 0.23
609 0.19
610 0.13
611 0.08
612 0.07
613 0.11
614 0.11
615 0.1
616 0.14
617 0.14
618 0.13
619 0.16
620 0.16
621 0.12
622 0.15
623 0.14
624 0.12
625 0.12
626 0.12
627 0.1
628 0.13
629 0.14
630 0.12
631 0.14
632 0.14
633 0.19
634 0.21
635 0.23
636 0.22
637 0.26
638 0.27
639 0.25
640 0.28
641 0.28
642 0.25
643 0.24
644 0.23
645 0.19
646 0.18
647 0.18
648 0.15
649 0.1
650 0.1
651 0.08
652 0.08
653 0.07
654 0.06
655 0.05
656 0.05
657 0.04
658 0.04
659 0.05
660 0.04
661 0.04
662 0.04
663 0.04
664 0.04
665 0.04
666 0.04
667 0.04
668 0.04
669 0.04
670 0.04
671 0.05
672 0.05
673 0.05
674 0.05
675 0.05
676 0.04
677 0.05
678 0.04
679 0.04
680 0.04
681 0.04
682 0.06
683 0.05
684 0.06
685 0.06
686 0.06
687 0.06
688 0.06
689 0.07
690 0.07
691 0.07
692 0.06
693 0.06
694 0.06
695 0.07
696 0.07
697 0.08
698 0.1
699 0.13
700 0.19
701 0.23
702 0.28
703 0.28
704 0.28
705 0.33
706 0.35
707 0.36
708 0.39
709 0.38
710 0.33
711 0.37
712 0.36
713 0.3
714 0.26
715 0.22
716 0.16
717 0.13
718 0.13
719 0.08
720 0.09
721 0.09
722 0.1
723 0.1
724 0.11
725 0.11
726 0.11
727 0.12
728 0.12
729 0.12
730 0.12
731 0.11
732 0.09
733 0.09
734 0.07
735 0.07
736 0.06
737 0.05
738 0.04
739 0.03
740 0.02
741 0.02
742 0.03
743 0.03
744 0.03
745 0.02
746 0.03
747 0.05
748 0.05
749 0.06
750 0.07
751 0.08
752 0.08
753 0.11
754 0.1
755 0.1
756 0.14
757 0.14
758 0.14
759 0.15
760 0.16
761 0.17
762 0.19
763 0.2
764 0.19
765 0.24
766 0.29
767 0.31
768 0.37
769 0.35
770 0.38
771 0.38
772 0.36
773 0.32
774 0.25
775 0.22
776 0.15
777 0.13
778 0.09
779 0.07
780 0.06
781 0.05
782 0.06
783 0.06
784 0.07
785 0.09
786 0.11
787 0.13
788 0.14
789 0.14
790 0.14
791 0.15
792 0.17
793 0.17
794 0.19
795 0.19
796 0.23
797 0.25
798 0.24
799 0.24
800 0.26
801 0.25
802 0.23
803 0.22
804 0.19
805 0.17
806 0.18
807 0.17
808 0.16
809 0.15
810 0.13
811 0.13
812 0.16
813 0.15
814 0.15
815 0.2
816 0.18
817 0.21
818 0.26
819 0.26
820 0.25
821 0.31
822 0.32
823 0.32
824 0.42
825 0.4
826 0.39
827 0.4
828 0.37
829 0.35
830 0.33
831 0.3
832 0.21
833 0.19
834 0.16
835 0.13
836 0.13
837 0.14
838 0.17
839 0.2
840 0.21
841 0.22
842 0.23
843 0.24
844 0.24
845 0.22
846 0.23
847 0.19
848 0.18
849 0.17
850 0.15
851 0.14
852 0.14
853 0.11
854 0.07
855 0.06
856 0.08
857 0.08
858 0.09
859 0.09
860 0.18
861 0.26
862 0.3
863 0.36
864 0.38
865 0.43
866 0.47
867 0.5
868 0.48
869 0.47
870 0.49
871 0.46
872 0.43
873 0.39
874 0.36
875 0.35
876 0.28
877 0.22
878 0.18
879 0.16
880 0.15
881 0.15
882 0.15
883 0.13
884 0.12
885 0.11
886 0.08
887 0.07
888 0.06
889 0.06
890 0.05
891 0.04
892 0.06
893 0.06
894 0.06
895 0.07
896 0.08
897 0.14
898 0.18
899 0.22
900 0.28
901 0.33
902 0.36
903 0.42
904 0.45
905 0.44
906 0.5
907 0.5
908 0.45
909 0.45
910 0.42
911 0.36
912 0.34
913 0.33
914 0.3
915 0.31
916 0.33
917 0.32
918 0.36
919 0.41
920 0.47
921 0.51
922 0.51
923 0.58
924 0.63
925 0.66
926 0.71
927 0.72
928 0.75
929 0.74
930 0.74
931 0.69
932 0.65
933 0.63
934 0.63
935 0.65
936 0.59
937 0.52
938 0.44
939 0.38
940 0.35
941 0.31
942 0.22
943 0.13
944 0.1
945 0.1
946 0.1
947 0.1
948 0.09
949 0.07
950 0.08
951 0.08
952 0.08
953 0.08
954 0.09
955 0.11
956 0.1
957 0.1
958 0.1
959 0.1
960 0.1
961 0.09
962 0.08
963 0.06
964 0.05
965 0.07
966 0.07
967 0.07
968 0.07
969 0.07
970 0.08
971 0.12
972 0.15
973 0.16
974 0.16
975 0.16
976 0.17
977 0.2
978 0.21
979 0.18
980 0.18
981 0.2
982 0.2
983 0.25
984 0.25
985 0.23
986 0.23
987 0.22
988 0.22
989 0.21
990 0.2
991 0.2
992 0.2
993 0.2
994 0.24
995 0.26
996 0.29
997 0.31
998 0.33
999 0.34
1000 0.38
1001 0.4
1002 0.36
1003 0.35
1004 0.3
1005 0.27
1006 0.24
1007 0.21
1008 0.21
1009 0.27
1010 0.28
1011 0.29
1012 0.28
1013 0.29
1014 0.32
1015 0.32
1016 0.31
1017 0.3
1018 0.29
1019 0.31
1020 0.35
1021 0.38
1022 0.41
1023 0.45
1024 0.46
1025 0.4
1026 0.39
1027 0.37
1028 0.39
1029 0.33
1030 0.31
1031 0.3
1032 0.27
1033 0.25
1034 0.29
1035 0.28
1036 0.22
1037 0.24
1038 0.26
1039 0.29
1040 0.29
1041 0.3
1042 0.26
1043 0.26
1044 0.26
1045 0.25
1046 0.26
1047 0.22
1048 0.26
1049 0.25
1050 0.27
1051 0.25
1052 0.25
1053 0.24
1054 0.2
1055 0.19
1056 0.19
1057 0.23
1058 0.21
1059 0.23
1060 0.24
1061 0.26
1062 0.25
1063 0.27
1064 0.24
1065 0.2
1066 0.23
1067 0.22
1068 0.22
1069 0.19
1070 0.19
1071 0.17
1072 0.14
1073 0.14
1074 0.12
1075 0.13
1076 0.13
1077 0.15
1078 0.18
1079 0.21
1080 0.25
1081 0.27
1082 0.3
1083 0.3
1084 0.31
1085 0.33
1086 0.31
1087 0.29
1088 0.25
1089 0.24
1090 0.17
1091 0.17
1092 0.16
1093 0.13
1094 0.11
1095 0.08
1096 0.07
1097 0.07
1098 0.07
1099 0.06
1100 0.05
1101 0.04
1102 0.04
1103 0.04
1104 0.04
1105 0.04
1106 0.05
1107 0.06
1108 0.06
1109 0.06
1110 0.06
1111 0.07
1112 0.07
1113 0.07
1114 0.06
1115 0.06
1116 0.06
1117 0.06
1118 0.06
1119 0.07
1120 0.07
1121 0.06
1122 0.08
1123 0.08
1124 0.09
1125 0.14
1126 0.15
1127 0.16
1128 0.18
1129 0.19
1130 0.19
1131 0.21
1132 0.19
1133 0.15
1134 0.2
1135 0.21
1136 0.19
1137 0.2
1138 0.21
1139 0.2
1140 0.21
1141 0.24
1142 0.21
1143 0.23
1144 0.24
1145 0.25
1146 0.29
1147 0.32
1148 0.33
1149 0.37
1150 0.36
1151 0.35
1152 0.4
1153 0.45
1154 0.43
1155 0.42
1156 0.42
1157 0.36
1158 0.35
1159 0.34
1160 0.29
1161 0.23
1162 0.17
1163 0.15
1164 0.14
1165 0.14
1166 0.14
1167 0.11
1168 0.13
1169 0.14
1170 0.17
1171 0.17
1172 0.18
1173 0.17
1174 0.17
1175 0.23
1176 0.22
1177 0.22
1178 0.21
1179 0.23
1180 0.21
1181 0.21
1182 0.2
1183 0.14
1184 0.13
1185 0.11
1186 0.12
1187 0.18
1188 0.2
1189 0.21
1190 0.27
1191 0.28
1192 0.29
1193 0.29
1194 0.28
1195 0.23
1196 0.22
1197 0.22
1198 0.15
1199 0.15
1200 0.14
1201 0.12
1202 0.14
1203 0.11
1204 0.09
1205 0.1
1206 0.1
1207 0.11
1208 0.16
1209 0.17
1210 0.19
1211 0.24
1212 0.29
1213 0.35
1214 0.37
1215 0.38
1216 0.36
1217 0.39
1218 0.43
1219 0.44
1220 0.42
1221 0.37
1222 0.36
1223 0.38
1224 0.41
1225 0.37
1226 0.29
1227 0.25
1228 0.27
1229 0.25
1230 0.24
1231 0.21
1232 0.19
1233 0.23
1234 0.25
1235 0.25
1236 0.27
1237 0.35
1238 0.41
1239 0.41
1240 0.4
1241 0.36
1242 0.34
1243 0.36
1244 0.3
1245 0.25