Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3GQ48

Protein Details
Accession A0A0C3GQ48    Localization Confidence High Confidence Score 22.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
89-115PDKSAADDKKERKKRQHDPNAPKRPLTBasic
231-255EPAPAPKTPKSNKRKSKGAKETPAAHydrophilic
267-317IVPPKTTEKEKSPDKKRKRPSKKPEEPEPEKETETPKGGAKPRKKKAKSDABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
97-106KKERKKRQHD
236-250PKTPKSNKRKSKGAK
274-315EKEKSPDKKRKRPSKKPEEPEPEKETETPKGGAKPRKKKAKS
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto 12
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MSHSKKSDKPREGATLSIDVDSFVRTRDKVVTGLATLQDAIQTLSSAYIKHTNAVLGEHGAGLDVEAALSRIGDNLLDGSLGDLHGASPDKSAADDKKERKKRQHDPNAPKRPLTPFFLYMQTARPIIAADLGSDFAKGAVSAEGTRRWGTMSAEDKLLWSNAYKDNLRLYNARVHSYKSGGNVNAKDMTDQEAASYADEHNIGSETTADAQLVGEANAGAAITEEPEAEEPAPAPKTPKSNKRKSKGAKETPAAPETIVPPSASTIVPPKTTEKEKSPDKKRKRPSKKPEEPEPEKETETPKGGAKPRKKKAKSDA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.49
3 0.42
4 0.38
5 0.3
6 0.22
7 0.2
8 0.19
9 0.14
10 0.11
11 0.14
12 0.14
13 0.17
14 0.21
15 0.23
16 0.23
17 0.25
18 0.25
19 0.22
20 0.25
21 0.23
22 0.19
23 0.16
24 0.15
25 0.12
26 0.11
27 0.1
28 0.07
29 0.07
30 0.06
31 0.09
32 0.09
33 0.09
34 0.12
35 0.18
36 0.18
37 0.19
38 0.2
39 0.19
40 0.19
41 0.2
42 0.18
43 0.13
44 0.12
45 0.11
46 0.1
47 0.09
48 0.08
49 0.06
50 0.05
51 0.04
52 0.03
53 0.03
54 0.04
55 0.04
56 0.04
57 0.04
58 0.04
59 0.04
60 0.04
61 0.05
62 0.05
63 0.05
64 0.05
65 0.05
66 0.05
67 0.05
68 0.05
69 0.05
70 0.04
71 0.04
72 0.06
73 0.07
74 0.07
75 0.08
76 0.08
77 0.08
78 0.09
79 0.14
80 0.15
81 0.21
82 0.3
83 0.37
84 0.48
85 0.58
86 0.65
87 0.72
88 0.79
89 0.82
90 0.85
91 0.88
92 0.88
93 0.89
94 0.92
95 0.93
96 0.84
97 0.75
98 0.67
99 0.63
100 0.55
101 0.5
102 0.42
103 0.34
104 0.34
105 0.35
106 0.33
107 0.27
108 0.26
109 0.22
110 0.18
111 0.16
112 0.13
113 0.11
114 0.1
115 0.1
116 0.08
117 0.06
118 0.06
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.06
123 0.05
124 0.05
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.05
129 0.05
130 0.07
131 0.08
132 0.1
133 0.1
134 0.1
135 0.1
136 0.11
137 0.11
138 0.16
139 0.18
140 0.18
141 0.18
142 0.18
143 0.18
144 0.17
145 0.16
146 0.1
147 0.07
148 0.09
149 0.11
150 0.15
151 0.15
152 0.16
153 0.19
154 0.2
155 0.22
156 0.21
157 0.2
158 0.24
159 0.25
160 0.27
161 0.24
162 0.24
163 0.24
164 0.25
165 0.24
166 0.2
167 0.22
168 0.21
169 0.25
170 0.23
171 0.24
172 0.24
173 0.22
174 0.2
175 0.17
176 0.19
177 0.15
178 0.15
179 0.12
180 0.11
181 0.12
182 0.11
183 0.12
184 0.07
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.06
189 0.07
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.05
194 0.06
195 0.07
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.05
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.05
214 0.06
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.11
220 0.12
221 0.12
222 0.15
223 0.17
224 0.26
225 0.35
226 0.45
227 0.52
228 0.61
229 0.71
230 0.76
231 0.83
232 0.84
233 0.87
234 0.88
235 0.88
236 0.86
237 0.8
238 0.79
239 0.74
240 0.66
241 0.55
242 0.44
243 0.36
244 0.28
245 0.27
246 0.2
247 0.14
248 0.13
249 0.14
250 0.16
251 0.14
252 0.14
253 0.18
254 0.2
255 0.22
256 0.24
257 0.27
258 0.32
259 0.39
260 0.43
261 0.43
262 0.49
263 0.57
264 0.66
265 0.72
266 0.76
267 0.81
268 0.86
269 0.9
270 0.92
271 0.93
272 0.94
273 0.95
274 0.95
275 0.95
276 0.94
277 0.94
278 0.93
279 0.9
280 0.87
281 0.83
282 0.76
283 0.68
284 0.62
285 0.56
286 0.5
287 0.46
288 0.4
289 0.37
290 0.41
291 0.47
292 0.54
293 0.6
294 0.65
295 0.72
296 0.8
297 0.83